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The map label for this gene is 158338776

Identifier: 158338776

GI number: 158338776

Start: 5750849

End: 5753824

Strand: Direct

Name: 158338776

Synonym: AM1_5687

Alternate gene names: NA

Gene position: 5750849-5753824 (Clockwise)

Preceding gene: 158338775

Following gene: 158338778

Centisome position: 88.42

GC content: 41.3

Gene sequence:

>2976_bases
ATGCTATCCAACAACCACAAGAACTATGAGTACCAAGTCGGGGGTAGCCTCAGCATTGATTCTCCAAGTTATGTTGAACG
TGAAGCAGATTCTTTATTATTTGACGCCCTTGTGAGAGGTGATTTCTGCTACGTCTTTAATTCACGTCAAATGGGTAAAT
CTAGTTTACGAGTGCGTGTTAGACACAGACTTCGACAAGCTGGTTATAATTCGGTATCGATCGATATCACGAGCATTGGT
AGCGAAAGGACTTCACCTGAACAGTGGTATAAAGGAGTCGCCAATGAAATATTTTACGGATTCAATTTACAGGAAACACT
TCACTTCAATCATTGGTGGAAACAGCAATATGGCTTGACTCCTGTTCAAAAGCTGAGTCTTTTTATTGAAAATGTACTGT
TGACCCATATTGTAGGTGAGAAGATCTTCATCTTCATCGATGAAATCGATAGTATCCTTAGCCTCGATTTCCCGATGGAT
GATTTTTTTGCACTCATCCGGTCATGTTATAACCAACGAGCAGATAATCCTCAATATAATCGCCTGGCCTTTGCCCTGTT
TGGGGTTTCCACACCCTCAGACTTAATCCAAGATCGAAATCGCACCCCCTTTAACACTGGCCAAGCCATTGAATTAAATG
GGTTCCATTTAGAAGAATGCCATTCTCTTGTGCAAGGGATGGTAGATAAGTACGATCGCCCCGGTAGATTTTTGGAAGAA
ATTCTATTTTGGACAAATGGACAACCTTTCTTAACTCAAAAGCTCTGTCAAATTGTTGTCCAGCATGTTGAAGTTGAAGA
AAAATGCAACTGTCCACCAGCTCTTTTATCTGACTCTCAATATTCTATTAAGGATTTTATTGAGCATATTGTTCAGTCCC
ATATCATTCAAAATTGGAAATCTCAAGATAACCCCGAACATCTTCGTACTATTCATACTCGACTGCTAAGAAACGAACAT
AAAGCCACCCGACTATTAGGAATGTATCAGCATATTCTCCAGGATGGAGTTTTAGCTGAAACGAATAGCGATACTCAAGT
GGAATTATTACTTTCAGGCTTAGTTGTTAAGCGAAATGGTTTATTGAAAGTTTCAAACCGCATTTACAAGTTCGTTTTTG
ATCAGATGTGGGTTCAAGACCAACTGGAAGAATTAAGGCCGTACTCGGAAGCATTGACTGCTTGGATGAATTCTGGTGCT
CAGGATGAATCTCGGTTGCTTCGAGGTCAGGCATTAGCAGATGCTCAAGCTTGGTCTTTAGGAAGAAGTTTAACCAATCA
AGACTATCAATTCCTTGCCGCGAGCCAAGCCTTAGATAAGCAACTTGTTGAAGAACGTTTAGCCTTAGAAAGCGCTAAGA
ACATAGAGCAAAAACGACGAGAAGACGCCTTGCGTTTAATTATGGAAGGTACCGCTGCCAAAATTGGAGATGAATTCTTC
TACTCCTGTGTGCGCTGCCTTGCTGAAATTTTAGATGTTGAGTACGCTCTCATTGCTGTCTTGGATGATAAAAACCACAC
CCATGCCATGACTTTGGCTTACAGTGGTGATGATGAGTTAGGCAATTGCTGGGAGTATGAGATTGCTGGAACTCCCTGTG
AGCAGGTTATTCAACGGCTTGAAATCTGCCATTACCCTCACTCTCTCCAAACCCTATTCCCTAACGATCCCTATTTAATC
CCTTTAAATGCTCATAGCTATCTCGGCATACCTATCTTAGATAGCCAGGGAGACTATTTAGGCCATTTGGCTGTGATGGA
TACAAAGCCGTCTAAAGAAAATATTTCAGATGAGATTGTTATTCTAAAAATTTTTGCTGCTCGTGCGGGAGCAGAACTAA
CGAGGAAGAAAACGGAAGCAGCGTTAGCAAAGCATTTAGAGCAAGTATTGCTCTTGGAGCATATTACTCAGAAAATCCGA
CAGAGTCTTGATACAACACAGATATTGCAAACCACGGCAAATCAAATTGGCAAAGTCTTCCAAGCCAATCGTTGTTTAAT
TTATACTTATTTACCTAATCCAACTGCTCAACTACCATGGGCTGCTGAATACTGTGAAACAGGGTTCACCTCTTTGCTGG
ATTGGAGTCGTTCCATCATTGATATCCCTTTTGTACGAGAGAGTTTAGCAAACGATGAAGCCATTTCTCTTCCAGATGTA
CATACAAATTCTCTGATGGAACCTCTGCCAGATGGGGTTAATATTACTGGCTTGAAGTCAATGATTGCCATTCGAACGTC
CTGTCACGGCGAACCCAATGGATTGATCCTGATCCAACAATGTGATCGATTTAGGCATTGGACTCAAGAAGAAATTGAAT
TGTCTGAATCTGTAGCATTGAGGGTAGGAATTGCTCTGGCGCAAGCTAAGCTCATTGAAAAGGGAAAGGAGCAAATGCTC
CAATTGGATCGACAGAATCATCAACTCCATCAGGAAATCTCTGAACGTAAATGGATTCAAGACTTCGTGGATGGACAGAA
TAAGGTATTAAACTTGATTGCCAAGGGAGCAGCCCTTTTGGAAACCTTAAATCTTCTGGCTAAGATGATTGAGGATCTTT
CAGATCAGTCTTTATGTTCTATTCTCTTGTTAGATAATTTTACTGGCAAGCTACATCATGGGGCAGCTCCAAGCCTACCT
GAAGCTTACAACCAAGCCATTGATGGTTTAAAAATTGGACCCATGGTTGGTTCCTGTGGGACGGCTGCCTATTCAAAACA
AACCGTTACAATTACGGATATTGCTACTGATCCTCGTTGTCAATCAGTCAAGGATGTAGTTTTACAGTATGGACTCAGAG
CATGTTGGTCTACTCCAATCATCATCAATGATGAAGTTGTAGCCACCTTTGCTATGTATTATCGAGAACCTAGAGCACCT
GGTTCGAGAGATATAGATTTAGTTGCTAAAGCCACCGATCTAGTCAAAGTTGCGATAGAGCGTTACAGAGCTCTAGAGAA
TTTAGCTTGTATATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATTCGATTTGAAAAAGATCAAGTGGTACCAATGTGCGAGTTATATAGACGATATTTTCGCAATTGCACAAGTCAATTTT
AGGAAATTTGGTTTAGGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGAAAACTCGCAGTTATTTCCTTGGAGGTATTCCGAGATGTTGAGATTCGCTACAACCCCCTCGACTAATAAGCTAAATT
TCTAAATTTTGGTATGAAAT

Product: GAF domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 991; Mature: 991

Protein sequence:

>991_residues
MLSNNHKNYEYQVGGSLSIDSPSYVEREADSLLFDALVRGDFCYVFNSRQMGKSSLRVRVRHRLRQAGYNSVSIDITSIG
SERTSPEQWYKGVANEIFYGFNLQETLHFNHWWKQQYGLTPVQKLSLFIENVLLTHIVGEKIFIFIDEIDSILSLDFPMD
DFFALIRSCYNQRADNPQYNRLAFALFGVSTPSDLIQDRNRTPFNTGQAIELNGFHLEECHSLVQGMVDKYDRPGRFLEE
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QLDRQNHQLHQEISERKWIQDFVDGQNKVLNLIAKGAALLETLNLLAKMIEDLSDQSLCSILLLDNFTGKLHHGAAPSLP
EAYNQAIDGLKIGPMVGSCGTAAYSKQTVTITDIATDPRCQSVKDVVLQYGLRACWSTPIIINDEVVATFAMYYREPRAP
GSRDIDLVAKATDLVKVAIERYRALENLACI

Sequences:

>Translated_991_residues
MLSNNHKNYEYQVGGSLSIDSPSYVEREADSLLFDALVRGDFCYVFNSRQMGKSSLRVRVRHRLRQAGYNSVSIDITSIG
SERTSPEQWYKGVANEIFYGFNLQETLHFNHWWKQQYGLTPVQKLSLFIENVLLTHIVGEKIFIFIDEIDSILSLDFPMD
DFFALIRSCYNQRADNPQYNRLAFALFGVSTPSDLIQDRNRTPFNTGQAIELNGFHLEECHSLVQGMVDKYDRPGRFLEE
ILFWTNGQPFLTQKLCQIVVQHVEVEEKCNCPPALLSDSQYSIKDFIEHIVQSHIIQNWKSQDNPEHLRTIHTRLLRNEH
KATRLLGMYQHILQDGVLAETNSDTQVELLLSGLVVKRNGLLKVSNRIYKFVFDQMWVQDQLEELRPYSEALTAWMNSGA
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YSCVRCLAEILDVEYALIAVLDDKNHTHAMTLAYSGDDELGNCWEYEIAGTPCEQVIQRLEICHYPHSLQTLFPNDPYLI
PLNAHSYLGIPILDSQGDYLGHLAVMDTKPSKENISDEIVILKIFAARAGAELTRKKTEAALAKHLEQVLLLEHITQKIR
QSLDTTQILQTTANQIGKVFQANRCLIYTYLPNPTAQLPWAAEYCETGFTSLLDWSRSIIDIPFVRESLANDEAISLPDV
HTNSLMEPLPDGVNITGLKSMIAIRTSCHGEPNGLILIQQCDRFRHWTQEEIELSESVALRVGIALAQAKLIEKGKEQML
QLDRQNHQLHQEISERKWIQDFVDGQNKVLNLIAKGAALLETLNLLAKMIEDLSDQSLCSILLLDNFTGKLHHGAAPSLP
EAYNQAIDGLKIGPMVGSCGTAAYSKQTVTITDIATDPRCQSVKDVVLQYGLRACWSTPIIINDEVVATFAMYYREPRAP
GSRDIDLVAKATDLVKVAIERYRALENLACI
>Mature_991_residues
MLSNNHKNYEYQVGGSLSIDSPSYVEREADSLLFDALVRGDFCYVFNSRQMGKSSLRVRVRHRLRQAGYNSVSIDITSIG
SERTSPEQWYKGVANEIFYGFNLQETLHFNHWWKQQYGLTPVQKLSLFIENVLLTHIVGEKIFIFIDEIDSILSLDFPMD
DFFALIRSCYNQRADNPQYNRLAFALFGVSTPSDLIQDRNRTPFNTGQAIELNGFHLEECHSLVQGMVDKYDRPGRFLEE
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QDESRLLRGQALADAQAWSLGRSLTNQDYQFLAASQALDKQLVEERLALESAKNIEQKRREDALRLIMEGTAAKIGDEFF
YSCVRCLAEILDVEYALIAVLDDKNHTHAMTLAYSGDDELGNCWEYEIAGTPCEQVIQRLEICHYPHSLQTLFPNDPYLI
PLNAHSYLGIPILDSQGDYLGHLAVMDTKPSKENISDEIVILKIFAARAGAELTRKKTEAALAKHLEQVLLLEHITQKIR
QSLDTTQILQTTANQIGKVFQANRCLIYTYLPNPTAQLPWAAEYCETGFTSLLDWSRSIIDIPFVRESLANDEAISLPDV
HTNSLMEPLPDGVNITGLKSMIAIRTSCHGEPNGLILIQQCDRFRHWTQEEIELSESVALRVGIALAQAKLIEKGKEQML
QLDRQNHQLHQEISERKWIQDFVDGQNKVLNLIAKGAALLETLNLLAKMIEDLSDQSLCSILLLDNFTGKLHHGAAPSLP
EAYNQAIDGLKIGPMVGSCGTAAYSKQTVTITDIATDPRCQSVKDVVLQYGLRACWSTPIIINDEVVATFAMYYREPRAP
GSRDIDLVAKATDLVKVAIERYRALENLACI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 11 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 112326; Mature: 112326

Theoretical pI: Translated: 5.28; Mature: 5.28

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLSNNHKNYEYQVGGSLSIDSPSYVEREADSLLFDALVRGDFCYVFNSRQMGKSSLRVRV
CCCCCCCCEEEEECCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH
RHRLRQAGYNSVSIDITSIGSERTSPEQWYKGVANEIFYGFNLQETLHFNHWWKQQYGLT
HHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PVQKLSLFIENVLLTHIVGEKIFIFIDEIDSILSLDFPMDDFFALIRSCYNQRADNPQYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
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HEEEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
ILFWTNGQPFLTQKLCQIVVQHVEVEEKCNCPPALLSDSQYSIKDFIEHIVQSHIIQNWK
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCC
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HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSCVRCLAEILDVEYALIAVLDDKNHTHAMTLAYSGDDELGNCWEYEIAGTPCEQVIQRL
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EICHYPHSLQTLFPNDPYLIPLNAHSYLGIPILDSQGDYLGHLAVMDTKPSKENISDEIV
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ETLNLLAKMIEDLSDQSLCSILLLDNFTGKLHHGAAPSLPEAYNQAIDGLKIGPMVGSCG
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GSRDIDLVAKATDLVKVAIERYRALENLACI
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>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCEEEEECCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH
RHRLRQAGYNSVSIDITSIGSERTSPEQWYKGVANEIFYGFNLQETLHFNHWWKQQYGLT
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PVQKLSLFIENVLLTHIVGEKIFIFIDEIDSILSLDFPMDDFFALIRSCYNQRADNPQYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
RLAFALFGVSTPSDLIQDRNRTPFNTGQAIELNGFHLEECHSLVQGMVDKYDRPGRFLEE
HEEEEEECCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
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CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCC
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHCCCCHHHHCCCCCCEEEEECCCCEECCEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEE
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EEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HCCCEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHCCCCCCCCCCC
HTNSLMEPLPDGVNITGLKSMIAIRTSCHGEPNGLILIQQCDRFRHWTQEEIELSESVAL
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
ETLNLLAKMIEDLSDQSLCSILLLDNFTGKLHHGAAPSLPEAYNQAIDGLKIGPMVGSCG
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEECCCCCCCC
TAAYSKQTVTITDIATDPRCQSVKDVVLQYGLRACWSTPIIINDEVVATFAMYYREPRAP
CHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCCCCC
GSRDIDLVAKATDLVKVAIERYRALENLACI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]