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The map label for this gene is 158338694

Identifier: 158338694

GI number: 158338694

Start: 5662919

End: 5665537

Strand: Reverse

Name: 158338694

Synonym: AM1_5602

Alternate gene names: NA

Gene position: 5665537-5662919 (Counterclockwise)

Preceding gene: 158338695

Following gene: 158338693

Centisome position: 87.11

GC content: 52.69

Gene sequence:

>2619_bases
ATGACCGCAGCCTTAGAACCCCAAAGAGAACCTCAAAGTTCCAATCGGCCCCTGTGGCGAATGGCTTGGCGACGGTTTCA
GCAGCGCTCCTTGCAGTATCTTCTCTGTTTGCTGGGGGTAGCCTTGGGTGTGGCCATGCTGGTGTCCATTGATCTGGCCA
ATGGGTCCGCTCAAACGGCCTTTGAATTATCTACAGATGCGATCGCAGGTCGCGCTACCCACCAAATTGAATCCATTGCT
CCCGCGGGTATCGATGAGTCGGTTTATCTGCAAATTCGCCAACAGGCGGGCCTCACTAAAACGGCCCCAATTGTGGATGG
CTATGTCTTAGCCCCTGATTTGGGCAACCAACCCTTGCGCCTCGTCGGTGTGGATCTATTTTCGGAACCACCCTTTCGCA
ATTACTTTGCCTCCGAGAATCAAACCGTGGGGTTGGCAGGATTGCAAACGTTTCTCACTGAACCCAATACCATTGTCCTT
TCTACAGATGTGGCCCGGCGCTATCAGGTGGACTTAGGCGATACCCTGACCCTCGATTTAGCAGGACGGCTAGTTCCTGT
GCGCTTAGTGGGCAAGGTGCAGCCAGAGAGCACCACCACCCAGCGGGCCTTAAGCAGCCTAATTTTTACGGACATTGCCA
CGGCTCAAGAAATCTTGCAGAGGTCAGGGCATCTCAGCCATATTGATCTGATTGCCGAATCTGAGGAAGACTTGGATGCG
ATCGCAACCTTACTACCCGAAGACGCCAAACTAGAAACCGCTGCTGCTCAGAAAAATGCTGTGCGGCAGATGACGGCAGC
CTTTCGGTTGAACCTGACGGCTCTCAGTCTGCTAGCCCTTGTGGTAGGTATGTTTTTGATCTACAACACCGTTACCTTTA
GCGTGGTCCAGCGGCGTCCTCTATTTGGGGTGCTGCGCTGCCTAGGCACCACTCCCAGACAGCTGTTTACCCTAATTATG
GGTGAAACGGCCATTCTGGGAATTCTCGGATCAGTTCTGGGGCTGGGATTAGGGATTGTATTGGCCCGCAGTATTGTCGG
TCTGATTACTCAAACCATTAACGACTTTTACTTTGTGGTCAGTGTGCAGCAGGTGGCAATCCCGCCCGTCTTGCTGGTGA
AGGGAATGCTGATTGGCATCAGTTCTGCTCTGCTGGCCGCTTTGGTGCCTGCCATAGAAGCCATGCGCACTAGCCCCCAA
ACCATCTTGCAGCGCTCCTCATTGGAAAATAAGGTGCAAAAGCTTCTGCCCTGGCTTTTTCTCAGTTGGGTAGTGATTAC
AGTGATTGGCATTGGCCTATTGCGACTGAAAGCGGGATTAGTGGTGGCCTTTGCGGGGCTATTTGCCATTGTCCTGGGAT
CCGCTTTGCTGACGCCTCCCGTTACTGCTGCTTTGATGAAGTTGGTCCAGCCCCTTACCCAGTCCCTGGGAGTGTTGGGA
CGGTTGGCCCCTCGGGATATTGTTCGATCTTTGAGCCGGACTTCAGTTGCGATCGCAGCTCTAATGGTGGCGGTCTCAGT
GATTGTTGGTGTCTCGATTATGGTGGGGTCCTTCCGGGTTACCGTGGTCCAGTGGCTGGATCAAACCCTGCAGGCGGATA
TCTATGTCACACCCCCCAGTACCACCGCTAACCGAGTTTTAGGCCAACTCGATCCAGCTGTGGTGGCCGAAATGAAACGC
TGGCCAGGGTTAGAGGATGTGGTCACCTATAACGATACCGATGCCACCGTCACTGCCTTTACCTATGGTGACCAAACCTT
AGAAATCGAACGATCTATCAAACTGATTTCCGCTGAAGGCGATGTCTCCCATGGTCAGCGTCCGTACTCCTGGCGGCAGG
ATTCCATTGATCCATGGCCTGCCCTAAATCGGGGTGAAGGCGTGATTGTCTCCGAAGCTCTACTTCTAAAAGCCAATCTC
AGCGATCCACCCACTTCAATTACCATCGACAGCCCCCAAGGTCCACAGACCTTCCCTGTCTTGGCAGTGTTTTATGATTA
TTCCTCGGATCAAGGCACGGTGATTTTGGACAACGATCCGTTTATCCAGATCTGGGGGGATGAAGGGATTGCTTCTATGG
GCTTGTTTACTGCCCCCGATATTGACCTAGATACCGTAGTGGAGGATCTAAGGGAACGATATCAGGGCCGCACGGACGTG
GTGGTGCAATCCACCCGTAGCCTTCGGGACGGCTCCCTAGAAATCTTTGATCGTACCTTTGCTATTACTCAAGCCCTGCG
CTTACTAGCCGTAATCGTAGCCTTTATCGGGGTGCTTAGTGCTTTGATGAGCCTGCAGCTAGAGCGTACCCGCGAAATCG
GTATTCTCCGGGCCACAGGTATGACGCCTCAACAGCTCTGGTGGATGACCTTACTGGAAACAGGACTTATGGGCAATGTG
GCTGGTTTTCTGGCCATGCCTCTCGGCTATGTTCTGGCCTGGATTTTGATCTATGTAATTAATGTCCGGTCGTTCGGCTG
GACCCTGCAAATGCAGCTCAATCCTAGCTATTTCTGGCAGGCATGGTTAGTAGCAATTGTGGCTGCTTTATTAGCAGGCA
TTTATCCGGCTTGGCGATTAAGTCGAGTCACAGTGGCAAGTGCAATTCGGGAGGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATGGCCACCCATAACCCCGAAATCGCCAAGCTGGCTGACCGCGTAGTGCGGATGCAGGATGGGCATCTGGTGGAAGAC
ACTCGACTGGGAGTGGCCTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCATGCAGAGATGGCTTGGCTGGTTGATCAGTCTGATTCTGGGGCTGTTGATCATCGGCAGCCCCGCTTGGGCAATGGAA
CAGGGCACGGTGGAATGGGC

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 872; Mature: 871

Protein sequence:

>872_residues
MTAALEPQREPQSSNRPLWRMAWRRFQQRSLQYLLCLLGVALGVAMLVSIDLANGSAQTAFELSTDAIAGRATHQIESIA
PAGIDESVYLQIRQQAGLTKTAPIVDGYVLAPDLGNQPLRLVGVDLFSEPPFRNYFASENQTVGLAGLQTFLTEPNTIVL
STDVARRYQVDLGDTLTLDLAGRLVPVRLVGKVQPESTTTQRALSSLIFTDIATAQEILQRSGHLSHIDLIAESEEDLDA
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TILQRSSLENKVQKLLPWLFLSWVVITVIGIGLLRLKAGLVVAFAGLFAIVLGSALLTPPVTAALMKLVQPLTQSLGVLG
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SDPPTSITIDSPQGPQTFPVLAVFYDYSSDQGTVILDNDPFIQIWGDEGIASMGLFTAPDIDLDTVVEDLRERYQGRTDV
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AGFLAMPLGYVLAWILIYVINVRSFGWTLQMQLNPSYFWQAWLVAIVAALLAGIYPAWRLSRVTVASAIREE

Sequences:

>Translated_872_residues
MTAALEPQREPQSSNRPLWRMAWRRFQQRSLQYLLCLLGVALGVAMLVSIDLANGSAQTAFELSTDAIAGRATHQIESIA
PAGIDESVYLQIRQQAGLTKTAPIVDGYVLAPDLGNQPLRLVGVDLFSEPPFRNYFASENQTVGLAGLQTFLTEPNTIVL
STDVARRYQVDLGDTLTLDLAGRLVPVRLVGKVQPESTTTQRALSSLIFTDIATAQEILQRSGHLSHIDLIAESEEDLDA
IATLLPEDAKLETAAAQKNAVRQMTAAFRLNLTALSLLALVVGMFLIYNTVTFSVVQRRPLFGVLRCLGTTPRQLFTLIM
GETAILGILGSVLGLGLGIVLARSIVGLITQTINDFYFVVSVQQVAIPPVLLVKGMLIGISSALLAALVPAIEAMRTSPQ
TILQRSSLENKVQKLLPWLFLSWVVITVIGIGLLRLKAGLVVAFAGLFAIVLGSALLTPPVTAALMKLVQPLTQSLGVLG
RLAPRDIVRSLSRTSVAIAALMVAVSVIVGVSIMVGSFRVTVVQWLDQTLQADIYVTPPSTTANRVLGQLDPAVVAEMKR
WPGLEDVVTYNDTDATVTAFTYGDQTLEIERSIKLISAEGDVSHGQRPYSWRQDSIDPWPALNRGEGVIVSEALLLKANL
SDPPTSITIDSPQGPQTFPVLAVFYDYSSDQGTVILDNDPFIQIWGDEGIASMGLFTAPDIDLDTVVEDLRERYQGRTDV
VVQSTRSLRDGSLEIFDRTFAITQALRLLAVIVAFIGVLSALMSLQLERTREIGILRATGMTPQQLWWMTLLETGLMGNV
AGFLAMPLGYVLAWILIYVINVRSFGWTLQMQLNPSYFWQAWLVAIVAALLAGIYPAWRLSRVTVASAIREE
>Mature_871_residues
TAALEPQREPQSSNRPLWRMAWRRFQQRSLQYLLCLLGVALGVAMLVSIDLANGSAQTAFELSTDAIAGRATHQIESIAP
AGIDESVYLQIRQQAGLTKTAPIVDGYVLAPDLGNQPLRLVGVDLFSEPPFRNYFASENQTVGLAGLQTFLTEPNTIVLS
TDVARRYQVDLGDTLTLDLAGRLVPVRLVGKVQPESTTTQRALSSLIFTDIATAQEILQRSGHLSHIDLIAESEEDLDAI
ATLLPEDAKLETAAAQKNAVRQMTAAFRLNLTALSLLALVVGMFLIYNTVTFSVVQRRPLFGVLRCLGTTPRQLFTLIMG
ETAILGILGSVLGLGLGIVLARSIVGLITQTINDFYFVVSVQQVAIPPVLLVKGMLIGISSALLAALVPAIEAMRTSPQT
ILQRSSLENKVQKLLPWLFLSWVVITVIGIGLLRLKAGLVVAFAGLFAIVLGSALLTPPVTAALMKLVQPLTQSLGVLGR
LAPRDIVRSLSRTSVAIAALMVAVSVIVGVSIMVGSFRVTVVQWLDQTLQADIYVTPPSTTANRVLGQLDPAVVAEMKRW
PGLEDVVTYNDTDATVTAFTYGDQTLEIERSIKLISAEGDVSHGQRPYSWRQDSIDPWPALNRGEGVIVSEALLLKANLS
DPPTSITIDSPQGPQTFPVLAVFYDYSSDQGTVILDNDPFIQIWGDEGIASMGLFTAPDIDLDTVVEDLRERYQGRTDVV
VQSTRSLRDGSLEIFDRTFAITQALRLLAVIVAFIGVLSALMSLQLERTREIGILRATGMTPQQLWWMTLLETGLMGNVA
GFLAMPLGYVLAWILIYVINVRSFGWTLQMQLNPSYFWQAWLVAIVAALLAGIYPAWRLSRVTVASAIREE

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94910; Mature: 94779

Theoretical pI: Translated: 4.92; Mature: 4.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTAALEPQREPQSSNRPLWRMAWRRFQQRSLQYLLCLLGVALGVAMLVSIDLANGSAQTA
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCE
FELSTDAIAGRATHQIESIAPAGIDESVYLQIRQQAGLTKTAPIVDGYVLAPDLGNQPLR
EEECHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCEE
LVGVDLFSEPPFRNYFASENQTVGLAGLQTFLTEPNTIVLSTDVARRYQVDLGDTLTLDL
EEEEHHHCCCCCCHHCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHEEECCCCEEEEEC
AGRLVPVRLVGKVQPESTTTQRALSSLIFTDIATAQEILQRSGHLSHIDLIAESEEDLDA
CCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHEEECCCHHHHH
IATLLPEDAKLETAAAQKNAVRQMTAAFRLNLTALSLLALVVGMFLIYNTVTFSVVQRRP
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
LFGVLRCLGTTPRQLFTLIMGETAILGILGSVLGLGLGIVLARSIVGLITQTINDFYFVV
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
SVQQVAIPPVLLVKGMLIGISSALLAALVPAIEAMRTSPQTILQRSSLENKVQKLLPWLF
EEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSWVVITVIGIGLLRLKAGLVVAFAGLFAIVLGSALLTPPVTAALMKLVQPLTQSLGVLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLAPRDIVRSLSRTSVAIAALMVAVSVIVGVSIMVGSFRVTVVQWLDQTLQADIYVTPPS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCC
TTANRVLGQLDPAVVAEMKRWPGLEDVVTYNDTDATVTAFTYGDQTLEIERSIKLISAEG
CHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCEEEEECCEEEEECCC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCCE
LAVFYDYSSDQGTVILDNDPFIQIWGDEGIASMGLFTAPDIDLDTVVEDLRERYQGRTDV
EEEEEECCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHH
VVQSTRSLRDGSLEIFDRTFAITQALRLLAVIVAFIGVLSALMSLQLERTREIGILRATG
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECC
MTPQQLWWMTLLETGLMGNVAGFLAMPLGYVLAWILIYVINVRSFGWTLQMQLNPSYFWQ
CCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHH
AWLVAIVAALLAGIYPAWRLSRVTVASAIREE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TAALEPQREPQSSNRPLWRMAWRRFQQRSLQYLLCLLGVALGVAMLVSIDLANGSAQTA
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCE
FELSTDAIAGRATHQIESIAPAGIDESVYLQIRQQAGLTKTAPIVDGYVLAPDLGNQPLR
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EEEEHHHCCCCCCHHCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHEEECCCCEEEEEC
AGRLVPVRLVGKVQPESTTTQRALSSLIFTDIATAQEILQRSGHLSHIDLIAESEEDLDA
CCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHEEECCCHHHHH
IATLLPEDAKLETAAAQKNAVRQMTAAFRLNLTALSLLALVVGMFLIYNTVTFSVVQRRP
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LFGVLRCLGTTPRQLFTLIMGETAILGILGSVLGLGLGIVLARSIVGLITQTINDFYFVV
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE
SVQQVAIPPVLLVKGMLIGISSALLAALVPAIEAMRTSPQTILQRSSLENKVQKLLPWLF
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MTPQQLWWMTLLETGLMGNVAGFLAMPLGYVLAWILIYVINVRSFGWTLQMQLNPSYFWQ
CCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHH
AWLVAIVAALLAGIYPAWRLSRVTVASAIREE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA