| Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009901 |
| Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is 157962136
Identifier: 157962136
GI number: 157962136
Start: 2813885
End: 2819116
Strand: Reverse
Name: 157962136
Synonym: Spea_2315
Alternate gene names: NA
Gene position: 2819116-2813885 (Counterclockwise)
Preceding gene: 157962137
Following gene: 157962135
Centisome position: 54.48
GC content: 42.01
Gene sequence:
>5232_bases ATGCAGTATATGTCTTTAAAACAATTTAATGATTTTTTAGCTGAACAATTCCTAAATTGGGGACAGCATTCCATTAAGCC TGGCTATCGATATCAGTTTCAGTCTCCTGATAATGAAAATAGCATGAAACTGTTTGACTCGATTGTATCAAAAGCCGATG GCACGATTGATGTTAAAGGCACAAAGTTATCAATAGTCACATGCGGTCATTCTCGTCTTTTGCCGGTATTACATAGCGAA GACTCGAATACGGCACCTGGTTTTACAGAGAACTTCATCTCACACTTGCGCGATGAAGTTGCTGGGCAATTCGGTGAGTT TGAAGACTGTGCATTGCTAGTGATCCACAACAGCATGTTAGACACGCTGATTAATTCTGCTGAAAATGTGGCTCAGCCTG CAAGTATCTGGCACCCAGAGCAGATTAAACAAGCAATGTACAAGTTAATCGATGACGTTAACGGGACTCGCAAAGTCTCA GAATGTTTACTCGAGCATAGGTTTAATCAAATCGTCGATGATGGTGCAACCATGTTTGGTTTTGAAAAACTTTACAATGC ACTACTCGATGGCGATCTAAAGTTTAGCGAGCTGGGCTTATTAAATGACCCTGCAATTCTGACGTGGGATGGTAAGCCAG AACAAATCAATAAACGACTCGATGAGAACAAACGGCTATATGAAGATATTGAACGTATCACTCATCATTTCCCTAATGAA TTGGAAGAAAAGCTTGCTGAAAAAGATTTCGGTTCTAAGTTTGTTGAGCGAAATTTTGGCGGAGAAGGCCTTGAAAGCTG GAAAACCGAATTAGAATTTAGTGCATGTAAGCAAGAGCAGGAAGCAAACAGAAAAAACCTATTAGAGCTCGAAAGTGAGG TGATCCTCCAAGGAGAGCTAATAGCAAAGAATAAGTCAGAAACCAAGGCGGGTCGCAGAGAGCGCCATTTGATTTTGGTT 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CGAGTTACCTAACAGACTGATAAAAAACACCTTTCGGGGTGTTTTTTGCGATAGCGCATATTATTAGCACCAAATAAATG TATATAATCAAATAACTACA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1743; Mature: 1743
Protein sequence:
>1743_residues MQYMSLKQFNDFLAEQFLNWGQHSIKPGYRYQFQSPDNENSMKLFDSIVSKADGTIDVKGTKLSIVTCGHSRLLPVLHSE DSNTAPGFTENFISHLRDEVAGQFGEFEDCALLVIHNSMLDTLINSAENVAQPASIWHPEQIKQAMYKLIDDVNGTRKVS ECLLEHRFNQIVDDGATMFGFEKLYNALLDGDLKFSELGLLNDPAILTWDGKPEQINKRLDENKRLYEDIERITHHFPNE LEEKLAEKDFGSKFVERNFGGEGLESWKTELEFSACKQEQEANRKNLLELESEVILQGELIAKNKSETKAGRRERHLILV IEEDQQDFGFELTFIGGKIERKQCSILHNKTDLIEIANPVNSGGKRSRVTVTGAYTGKAMFFTLDLKREKTAERYKFKVL VIRSGDFYIDAFRNNFLIEPPTSSKKTARITLQTEDSSFVIGIDGGKEGTKAVLDEIGQVFDNETTSEINFEQIANESDE LHFVVKGQDSWLTFNVEGAIATDSLTLPLILDKDRFTRLYQDDYLGSFNRAKNKVLLDNKELSPKGKRLTLLQWEAEIVD GLLLTRRDEQQNPLSLNDIEATYPSLFVAYRALFDYYHEHRTLPSLCSWGPEYRVLAGQVVKQYNDAISAIGDDILLTAE QKQLINIGFATFSGQEFITPFHPMVIAYYLSLAEHVTLDQSHSFKTLPKVTLDRLNARGLLPFIYDPIHGFAFSQLEKEN SFWLELVPQQDTSFSYVRKLVKDKVGEFKNAFSALFNAGPKATLIINSVNNKSNHEIFMGLVDFVKANKDKVCQVHVNLY DDKLVYSEFDRFAETASYDELKNLYELDKGAVREQADMIIDLLRTRLTYSKFENGKIDGKQAYSHLSFFRNNSKVEPRDV NVDKQLSGVVCHGLMAGEAAANKQDSYFTAFGLKNVDTEGQAHLQIAQKLGGLIKPARLSSEPTGNSKSMALVVSDNFRA LLERSYVSSIWTTIIDPKVTLDFFENAKDMVLIHYSDNYTNSANYDAITVTRQTELYKKVLEQDEGGITEEFNAFNGEWL LKMITANANERKEKKGIIGAYKFVNCLLSQSDITWVPLSVAEMIRVTGNIGLKMSDSDFSRNVQGYKSGLISDDVLFVGF KDKQMYVLPLEVKTGIKQTHSKGVQQAKELKRYLCEDILGRNDFAGMLYRGLFIRQVLMQIDKYELYNLYSDTYFDGFLA DREWWLQGDYSIAELANYPDGFMLSHVENDTFFEADFNEVDDILKIQLPISYLKQLVSTPLRELMTDVRPEQLCHIPEKY LLVAANSSETRKQPEQDLPEPQTTTQQSTSTDTHTISSRAIELSDFLPTKDPIKDAELVEKDSDTAHSDLNVPSKTAGQT PVSQPEQDNEPIKILVGHDVRDNAEVYWEPTNTAKFMNTNSGIIGTMGTGKTQCTKSVVTQLYRQQARNVDGKAIGILIF DYKSDYVDEKFLTATNGKKFNLHKLPYNPLSLFGDTPMLPVHTARGFSETMGKAFGLGQKQQLKLRKLIGEAYELAGIKK GDQSTWSKPAPTISDIWALFEETEPTEDSLYAALESLYELEIFEDNHEKCTSLYELVDGITVVELAGYPSEIQNLVVALT MDLFYSQMQKQGKPEVQGDFRQVTKLLLVDEADNFMSQNFPSLRKVLKEGREYGVGVILSTQDITHFKTSENDYSSYILS WIVHRVSQIKNQDIKSIFNKDDKSDQENLMKSIRELDKHYSLYVDGDKKVQKIKDKAFWELLG
Sequences:
>Translated_1743_residues MQYMSLKQFNDFLAEQFLNWGQHSIKPGYRYQFQSPDNENSMKLFDSIVSKADGTIDVKGTKLSIVTCGHSRLLPVLHSE DSNTAPGFTENFISHLRDEVAGQFGEFEDCALLVIHNSMLDTLINSAENVAQPASIWHPEQIKQAMYKLIDDVNGTRKVS ECLLEHRFNQIVDDGATMFGFEKLYNALLDGDLKFSELGLLNDPAILTWDGKPEQINKRLDENKRLYEDIERITHHFPNE LEEKLAEKDFGSKFVERNFGGEGLESWKTELEFSACKQEQEANRKNLLELESEVILQGELIAKNKSETKAGRRERHLILV IEEDQQDFGFELTFIGGKIERKQCSILHNKTDLIEIANPVNSGGKRSRVTVTGAYTGKAMFFTLDLKREKTAERYKFKVL VIRSGDFYIDAFRNNFLIEPPTSSKKTARITLQTEDSSFVIGIDGGKEGTKAVLDEIGQVFDNETTSEINFEQIANESDE LHFVVKGQDSWLTFNVEGAIATDSLTLPLILDKDRFTRLYQDDYLGSFNRAKNKVLLDNKELSPKGKRLTLLQWEAEIVD GLLLTRRDEQQNPLSLNDIEATYPSLFVAYRALFDYYHEHRTLPSLCSWGPEYRVLAGQVVKQYNDAISAIGDDILLTAE QKQLINIGFATFSGQEFITPFHPMVIAYYLSLAEHVTLDQSHSFKTLPKVTLDRLNARGLLPFIYDPIHGFAFSQLEKEN SFWLELVPQQDTSFSYVRKLVKDKVGEFKNAFSALFNAGPKATLIINSVNNKSNHEIFMGLVDFVKANKDKVCQVHVNLY DDKLVYSEFDRFAETASYDELKNLYELDKGAVREQADMIIDLLRTRLTYSKFENGKIDGKQAYSHLSFFRNNSKVEPRDV NVDKQLSGVVCHGLMAGEAAANKQDSYFTAFGLKNVDTEGQAHLQIAQKLGGLIKPARLSSEPTGNSKSMALVVSDNFRA LLERSYVSSIWTTIIDPKVTLDFFENAKDMVLIHYSDNYTNSANYDAITVTRQTELYKKVLEQDEGGITEEFNAFNGEWL LKMITANANERKEKKGIIGAYKFVNCLLSQSDITWVPLSVAEMIRVTGNIGLKMSDSDFSRNVQGYKSGLISDDVLFVGF KDKQMYVLPLEVKTGIKQTHSKGVQQAKELKRYLCEDILGRNDFAGMLYRGLFIRQVLMQIDKYELYNLYSDTYFDGFLA DREWWLQGDYSIAELANYPDGFMLSHVENDTFFEADFNEVDDILKIQLPISYLKQLVSTPLRELMTDVRPEQLCHIPEKY LLVAANSSETRKQPEQDLPEPQTTTQQSTSTDTHTISSRAIELSDFLPTKDPIKDAELVEKDSDTAHSDLNVPSKTAGQT PVSQPEQDNEPIKILVGHDVRDNAEVYWEPTNTAKFMNTNSGIIGTMGTGKTQCTKSVVTQLYRQQARNVDGKAIGILIF DYKSDYVDEKFLTATNGKKFNLHKLPYNPLSLFGDTPMLPVHTARGFSETMGKAFGLGQKQQLKLRKLIGEAYELAGIKK GDQSTWSKPAPTISDIWALFEETEPTEDSLYAALESLYELEIFEDNHEKCTSLYELVDGITVVELAGYPSEIQNLVVALT MDLFYSQMQKQGKPEVQGDFRQVTKLLLVDEADNFMSQNFPSLRKVLKEGREYGVGVILSTQDITHFKTSENDYSSYILS WIVHRVSQIKNQDIKSIFNKDDKSDQENLMKSIRELDKHYSLYVDGDKKVQKIKDKAFWELLG >Mature_1743_residues MQYMSLKQFNDFLAEQFLNWGQHSIKPGYRYQFQSPDNENSMKLFDSIVSKADGTIDVKGTKLSIVTCGHSRLLPVLHSE DSNTAPGFTENFISHLRDEVAGQFGEFEDCALLVIHNSMLDTLINSAENVAQPASIWHPEQIKQAMYKLIDDVNGTRKVS ECLLEHRFNQIVDDGATMFGFEKLYNALLDGDLKFSELGLLNDPAILTWDGKPEQINKRLDENKRLYEDIERITHHFPNE LEEKLAEKDFGSKFVERNFGGEGLESWKTELEFSACKQEQEANRKNLLELESEVILQGELIAKNKSETKAGRRERHLILV IEEDQQDFGFELTFIGGKIERKQCSILHNKTDLIEIANPVNSGGKRSRVTVTGAYTGKAMFFTLDLKREKTAERYKFKVL VIRSGDFYIDAFRNNFLIEPPTSSKKTARITLQTEDSSFVIGIDGGKEGTKAVLDEIGQVFDNETTSEINFEQIANESDE LHFVVKGQDSWLTFNVEGAIATDSLTLPLILDKDRFTRLYQDDYLGSFNRAKNKVLLDNKELSPKGKRLTLLQWEAEIVD GLLLTRRDEQQNPLSLNDIEATYPSLFVAYRALFDYYHEHRTLPSLCSWGPEYRVLAGQVVKQYNDAISAIGDDILLTAE QKQLINIGFATFSGQEFITPFHPMVIAYYLSLAEHVTLDQSHSFKTLPKVTLDRLNARGLLPFIYDPIHGFAFSQLEKEN SFWLELVPQQDTSFSYVRKLVKDKVGEFKNAFSALFNAGPKATLIINSVNNKSNHEIFMGLVDFVKANKDKVCQVHVNLY DDKLVYSEFDRFAETASYDELKNLYELDKGAVREQADMIIDLLRTRLTYSKFENGKIDGKQAYSHLSFFRNNSKVEPRDV NVDKQLSGVVCHGLMAGEAAANKQDSYFTAFGLKNVDTEGQAHLQIAQKLGGLIKPARLSSEPTGNSKSMALVVSDNFRA LLERSYVSSIWTTIIDPKVTLDFFENAKDMVLIHYSDNYTNSANYDAITVTRQTELYKKVLEQDEGGITEEFNAFNGEWL LKMITANANERKEKKGIIGAYKFVNCLLSQSDITWVPLSVAEMIRVTGNIGLKMSDSDFSRNVQGYKSGLISDDVLFVGF KDKQMYVLPLEVKTGIKQTHSKGVQQAKELKRYLCEDILGRNDFAGMLYRGLFIRQVLMQIDKYELYNLYSDTYFDGFLA DREWWLQGDYSIAELANYPDGFMLSHVENDTFFEADFNEVDDILKIQLPISYLKQLVSTPLRELMTDVRPEQLCHIPEKY LLVAANSSETRKQPEQDLPEPQTTTQQSTSTDTHTISSRAIELSDFLPTKDPIKDAELVEKDSDTAHSDLNVPSKTAGQT PVSQPEQDNEPIKILVGHDVRDNAEVYWEPTNTAKFMNTNSGIIGTMGTGKTQCTKSVVTQLYRQQARNVDGKAIGILIF DYKSDYVDEKFLTATNGKKFNLHKLPYNPLSLFGDTPMLPVHTARGFSETMGKAFGLGQKQQLKLRKLIGEAYELAGIKK GDQSTWSKPAPTISDIWALFEETEPTEDSLYAALESLYELEIFEDNHEKCTSLYELVDGITVVELAGYPSEIQNLVVALT MDLFYSQMQKQGKPEVQGDFRQVTKLLLVDEADNFMSQNFPSLRKVLKEGREYGVGVILSTQDITHFKTSENDYSSYILS WIVHRVSQIKNQDIKSIFNKDDKSDQENLMKSIRELDKHYSLYVDGDKKVQKIKDKAFWELLG
Specific function: Unknown
COG id: COG0433
COG function: function code R; Predicted ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 198033; Mature: 198033
Theoretical pI: Translated: 4.96; Mature: 4.96
Prosite motif: PS00039 DEAD_ATP_HELICASE ; PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQYMSLKQFNDFLAEQFLNWGQHSIKPGYRYQFQSPDNENSMKLFDSIVSKADGTIDVKG CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECC TKLSIVTCGHSRLLPVLHSEDSNTAPGFTENFISHLRDEVAGQFGEFEDCALLVIHNSML CEEEEEEECCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHH DTLINSAENVAQPASIWHPEQIKQAMYKLIDDVNGTRKVSECLLEHRFNQIVDDGATMFG HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH FEKLYNALLDGDLKFSELGLLNDPAILTWDGKPEQINKRLDENKRLYEDIERITHHFPNE HHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH LEEKLAEKDFGSKFVERNFGGEGLESWKTELEFSACKQEQEANRKNLLELESEVILQGEL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHEEECHH IAKNKSETKAGRRERHLILVIEEDQQDFGFELTFIGGKIERKQCSILHNKTDLIEIANPV EECCCCHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCHHEEECCCC NSGGKRSRVTVTGAYTGKAMFFTLDLKREKTAERYKFKVLVIRSGDFYIDAFRNNFLIEP CCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCHHHCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCEEECC PTSSKKTARITLQTEDSSFVIGIDGGKEGTKAVLDEIGQVFDNETTSEINFEQIANESDE 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