Definition Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome.
Accession NC_009901
Length 5,174,581

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The map label for this gene is 157962136

Identifier: 157962136

GI number: 157962136

Start: 2813885

End: 2819116

Strand: Reverse

Name: 157962136

Synonym: Spea_2315

Alternate gene names: NA

Gene position: 2819116-2813885 (Counterclockwise)

Preceding gene: 157962137

Following gene: 157962135

Centisome position: 54.48

GC content: 42.01

Gene sequence:

>5232_bases
ATGCAGTATATGTCTTTAAAACAATTTAATGATTTTTTAGCTGAACAATTCCTAAATTGGGGACAGCATTCCATTAAGCC
TGGCTATCGATATCAGTTTCAGTCTCCTGATAATGAAAATAGCATGAAACTGTTTGACTCGATTGTATCAAAAGCCGATG
GCACGATTGATGTTAAAGGCACAAAGTTATCAATAGTCACATGCGGTCATTCTCGTCTTTTGCCGGTATTACATAGCGAA
GACTCGAATACGGCACCTGGTTTTACAGAGAACTTCATCTCACACTTGCGCGATGAAGTTGCTGGGCAATTCGGTGAGTT
TGAAGACTGTGCATTGCTAGTGATCCACAACAGCATGTTAGACACGCTGATTAATTCTGCTGAAAATGTGGCTCAGCCTG
CAAGTATCTGGCACCCAGAGCAGATTAAACAAGCAATGTACAAGTTAATCGATGACGTTAACGGGACTCGCAAAGTCTCA
GAATGTTTACTCGAGCATAGGTTTAATCAAATCGTCGATGATGGTGCAACCATGTTTGGTTTTGAAAAACTTTACAATGC
ACTACTCGATGGCGATCTAAAGTTTAGCGAGCTGGGCTTATTAAATGACCCTGCAATTCTGACGTGGGATGGTAAGCCAG
AACAAATCAATAAACGACTCGATGAGAACAAACGGCTATATGAAGATATTGAACGTATCACTCATCATTTCCCTAATGAA
TTGGAAGAAAAGCTTGCTGAAAAAGATTTCGGTTCTAAGTTTGTTGAGCGAAATTTTGGCGGAGAAGGCCTTGAAAGCTG
GAAAACCGAATTAGAATTTAGTGCATGTAAGCAAGAGCAGGAAGCAAACAGAAAAAACCTATTAGAGCTCGAAAGTGAGG
TGATCCTCCAAGGAGAGCTAATAGCAAAGAATAAGTCAGAAACCAAGGCGGGTCGCAGAGAGCGCCATTTGATTTTGGTT
ATAGAAGAAGACCAACAAGATTTTGGTTTTGAGTTGACATTTATTGGCGGGAAAATCGAACGTAAGCAGTGTTCAATTCT
GCACAATAAAACGGACTTAATTGAAATCGCAAATCCAGTGAACTCAGGCGGAAAACGCAGCCGAGTGACGGTTACTGGCG
CCTATACTGGCAAAGCGATGTTTTTCACTCTAGATCTAAAAAGAGAGAAAACAGCGGAACGCTATAAGTTTAAAGTGTTA
GTCATTAGAAGCGGCGATTTCTATATTGATGCCTTTAGAAATAACTTCCTAATCGAACCACCAACTTCATCCAAGAAGAC
CGCGCGGATCACACTGCAAACAGAAGACAGCAGTTTTGTGATTGGCATAGACGGTGGCAAAGAGGGCACTAAAGCAGTAC
TCGATGAGATTGGACAGGTTTTCGACAATGAAACGACAAGCGAGATTAATTTCGAGCAGATAGCGAATGAATCTGACGAG
CTACATTTTGTGGTTAAAGGTCAAGATTCATGGCTAACGTTTAATGTTGAGGGCGCAATCGCAACAGACTCACTAACACT
GCCACTGATCTTAGATAAAGACAGATTTACGCGACTATATCAAGATGATTATCTTGGTAGCTTTAATCGCGCAAAGAATA
AAGTCTTACTCGATAACAAAGAACTTTCACCCAAGGGCAAACGCTTAACCCTATTGCAGTGGGAAGCTGAAATTGTTGAC
GGTTTGCTGCTCACTAGACGCGATGAGCAACAAAATCCGTTATCTCTCAACGATATTGAGGCGACATACCCTTCGTTGTT
TGTTGCTTATCGAGCATTATTTGACTATTACCATGAACACCGTACATTGCCTAGCCTCTGTAGTTGGGGGCCGGAGTATC
GTGTTTTAGCGGGGCAGGTTGTAAAACAATACAATGATGCTATTAGCGCTATCGGCGATGATATTTTGCTTACGGCAGAG
CAAAAGCAGTTGATTAATATCGGATTTGCGACCTTTAGTGGCCAAGAATTTATTACGCCATTCCACCCTATGGTCATTGC
TTACTATTTATCACTAGCTGAGCATGTAACCCTAGATCAAAGCCATAGTTTTAAGACACTGCCAAAAGTGACGCTTGATA
GACTAAATGCCCGTGGATTATTACCTTTTATCTACGACCCTATTCATGGTTTTGCCTTTAGTCAGTTAGAGAAAGAAAAT
AGCTTTTGGTTAGAACTCGTACCACAACAAGATACGAGCTTTTCTTATGTGCGTAAGCTAGTAAAAGATAAAGTCGGTGA
ATTTAAAAATGCCTTCTCGGCACTGTTTAATGCAGGCCCGAAAGCGACATTGATTATTAACTCAGTTAATAACAAATCAA
ACCACGAAATTTTTATGGGGTTGGTTGATTTTGTTAAGGCGAATAAAGATAAGGTCTGCCAAGTTCATGTGAATCTGTAT
GACGATAAACTTGTCTATAGCGAATTCGATCGCTTCGCCGAGACGGCGAGTTACGATGAGCTGAAAAACTTATATGAACT
AGATAAAGGCGCTGTACGTGAGCAAGCGGATATGATTATCGACTTGTTACGCACTCGACTCACTTATAGTAAGTTTGAGA
ATGGCAAAATTGATGGCAAACAAGCTTATTCACACCTTAGCTTCTTTCGAAATAACAGCAAGGTAGAGCCAAGAGATGTC
AATGTCGATAAACAGCTAAGTGGAGTGGTTTGTCATGGTCTAATGGCGGGTGAAGCAGCTGCAAATAAACAAGACAGCTA
CTTTACAGCATTCGGCCTTAAGAATGTCGATACCGAAGGGCAAGCACATCTACAAATTGCCCAAAAGCTTGGCGGCCTCA
TCAAGCCTGCGCGTCTATCTAGCGAGCCGACTGGTAACTCAAAGTCGATGGCGCTGGTGGTGAGTGATAACTTTAGAGCC
TTACTAGAGCGTTCTTATGTCAGTTCCATCTGGACGACCATTATTGACCCTAAGGTGACCTTAGATTTTTTCGAGAATGC
AAAAGATATGGTGTTGATCCACTATTCGGATAACTACACCAACTCGGCGAATTACGACGCAATTACCGTTACTCGCCAAA
CCGAGCTTTATAAGAAGGTGCTTGAACAGGACGAAGGCGGGATAACTGAAGAGTTTAATGCCTTTAATGGTGAGTGGCTG
CTTAAGATGATCACCGCTAATGCCAACGAGCGTAAAGAGAAAAAGGGCATTATTGGTGCGTATAAATTTGTAAACTGCTT
ACTGTCGCAATCTGATATTACTTGGGTACCGCTTTCGGTTGCCGAGATGATCCGTGTAACCGGTAACATCGGTCTTAAGA
TGTCTGATAGTGACTTCTCGCGTAACGTCCAAGGTTACAAGTCAGGCCTCATCTCTGATGATGTACTGTTTGTCGGCTTT
AAAGATAAACAGATGTACGTGTTACCACTTGAAGTGAAAACCGGCATCAAACAAACCCACAGTAAAGGTGTGCAGCAAGC
TAAAGAGCTTAAACGTTACCTGTGTGAAGACATATTGGGCCGTAATGACTTTGCTGGCATGTTATATCGTGGCCTGTTCA
TCAGACAGGTGCTGATGCAGATCGACAAGTATGAGCTATATAATCTCTATTCAGATACTTACTTTGACGGATTCTTAGCT
GATCGAGAATGGTGGTTACAAGGTGACTACAGTATTGCTGAGCTAGCAAATTATCCAGACGGTTTTATGCTCTCTCATGT
TGAAAACGATACTTTCTTTGAAGCAGATTTTAATGAAGTCGACGACATCTTAAAAATTCAGCTGCCTATTAGTTATTTGA
AACAACTTGTTAGTACACCGCTGCGAGAGTTAATGACGGATGTTCGTCCCGAGCAACTTTGCCATATTCCAGAAAAATAT
TTGCTTGTTGCAGCTAATTCAAGTGAAACGAGAAAACAACCAGAGCAGGATTTACCTGAGCCACAAACAACTACTCAACA
AAGCACAAGTACAGATACTCATACGATCTCAAGTCGGGCTATCGAGCTCAGTGATTTTTTACCGACTAAAGATCCAATAA
AAGACGCCGAGCTTGTAGAAAAGGATTCAGATACAGCACATAGCGATTTGAATGTGCCTTCCAAAACCGCGGGGCAAACT
CCTGTTAGTCAACCTGAGCAAGATAATGAGCCTATAAAAATTCTAGTGGGTCATGACGTGCGTGATAATGCAGAAGTATA
TTGGGAGCCAACCAATACCGCTAAGTTTATGAACACCAACTCAGGCATTATTGGCACCATGGGTACAGGCAAAACGCAGT
GTACCAAGTCGGTAGTGACTCAGTTGTATCGTCAGCAAGCGCGTAATGTGGATGGTAAAGCTATTGGTATTCTGATCTTC
GATTACAAGTCAGATTATGTCGATGAGAAGTTTTTAACAGCCACTAACGGTAAAAAGTTTAACCTGCATAAACTGCCATA
TAATCCACTTAGTTTATTTGGTGATACACCTATGCTGCCTGTGCATACGGCGCGTGGTTTCTCTGAGACCATGGGTAAAG
CATTTGGTTTAGGGCAGAAGCAACAACTAAAACTGCGAAAGCTGATTGGCGAAGCTTATGAGCTAGCTGGTATTAAAAAG
GGCGATCAAAGTACTTGGAGCAAACCGGCGCCAACAATTAGTGATATTTGGGCGCTATTTGAAGAGACGGAGCCAACTGA
AGATTCACTCTATGCTGCGCTGGAAAGTTTGTATGAGCTGGAGATCTTCGAAGATAACCATGAAAAGTGCACTAGCTTAT
ATGAGCTGGTGGACGGCATAACAGTGGTTGAATTAGCAGGTTACCCATCAGAAATTCAAAATCTGGTTGTGGCATTGACG
ATGGACTTGTTCTATTCGCAGATGCAAAAGCAAGGCAAACCTGAAGTGCAGGGCGACTTTAGACAAGTCACTAAGCTATT
GCTTGTTGATGAAGCCGATAACTTTATGTCGCAAAACTTCCCAAGCCTCCGCAAGGTACTAAAAGAGGGCCGAGAATATG
GAGTGGGGGTGATTTTGTCAACGCAAGATATTACCCACTTTAAGACCAGCGAAAATGATTATTCGTCTTACATCTTAAGC
TGGATTGTGCACCGTGTATCGCAGATTAAAAACCAAGACATTAAGTCAATCTTCAACAAGGATGATAAGTCAGACCAAGA
AAACCTGATGAAGAGCATTCGTGAGCTAGATAAGCACTACAGCTTGTATGTGGATGGCGATAAGAAAGTGCAGAAGATCA
AAGATAAAGCGTTTTGGGAGCTGCTTGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCGAAGCAAGAGGTGTCTTTTTTGACAAGCAAAGCCAACAGGCTTTAATCGAATTTTACGAACGCATCGGCAATGTTGA
GCGTATGAGTGACAGTGGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGAGTTACCTAACAGACTGATAAAAAACACCTTTCGGGGTGTTTTTTGCGATAGCGCATATTATTAGCACCAAATAAATG
TATATAATCAAATAACTACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1743; Mature: 1743

Protein sequence:

>1743_residues
MQYMSLKQFNDFLAEQFLNWGQHSIKPGYRYQFQSPDNENSMKLFDSIVSKADGTIDVKGTKLSIVTCGHSRLLPVLHSE
DSNTAPGFTENFISHLRDEVAGQFGEFEDCALLVIHNSMLDTLINSAENVAQPASIWHPEQIKQAMYKLIDDVNGTRKVS
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LEEKLAEKDFGSKFVERNFGGEGLESWKTELEFSACKQEQEANRKNLLELESEVILQGELIAKNKSETKAGRRERHLILV
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WIVHRVSQIKNQDIKSIFNKDDKSDQENLMKSIRELDKHYSLYVDGDKKVQKIKDKAFWELLG

Sequences:

>Translated_1743_residues
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>Mature_1743_residues
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MDLFYSQMQKQGKPEVQGDFRQVTKLLLVDEADNFMSQNFPSLRKVLKEGREYGVGVILSTQDITHFKTSENDYSSYILS
WIVHRVSQIKNQDIKSIFNKDDKSDQENLMKSIRELDKHYSLYVDGDKKVQKIKDKAFWELLG

Specific function: Unknown

COG id: COG0433

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 198033; Mature: 198033

Theoretical pI: Translated: 4.96; Mature: 4.96

Prosite motif: PS00039 DEAD_ATP_HELICASE ; PS00217 SUGAR_TRANSPORT_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQYMSLKQFNDFLAEQFLNWGQHSIKPGYRYQFQSPDNENSMKLFDSIVSKADGTIDVKG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECC
TKLSIVTCGHSRLLPVLHSEDSNTAPGFTENFISHLRDEVAGQFGEFEDCALLVIHNSML
CEEEEEEECCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHH
DTLINSAENVAQPASIWHPEQIKQAMYKLIDDVNGTRKVSECLLEHRFNQIVDDGATMFG
HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
FEKLYNALLDGDLKFSELGLLNDPAILTWDGKPEQINKRLDENKRLYEDIERITHHFPNE
HHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH
LEEKLAEKDFGSKFVERNFGGEGLESWKTELEFSACKQEQEANRKNLLELESEVILQGEL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHEEECHH
IAKNKSETKAGRRERHLILVIEEDQQDFGFELTFIGGKIERKQCSILHNKTDLIEIANPV
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NSGGKRSRVTVTGAYTGKAMFFTLDLKREKTAERYKFKVLVIRSGDFYIDAFRNNFLIEP
CCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCHHHCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCEEECC
PTSSKKTARITLQTEDSSFVIGIDGGKEGTKAVLDEIGQVFDNETTSEINFEQIANESDE
CCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCC
LHFVVKGQDSWLTFNVEGAIATDSLTLPLILDKDRFTRLYQDDYLGSFNRAKNKVLLDNK
EEEEEECCCCEEEEEECCEEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCEEECCC
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CCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTLPSLCSWGPEYRVLAGQVVKQYNDAISAIGDDILLTAEQKQLINIGFATFSGQEFITP
CCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHEEEEEEEEECCCCCCCC
FHPMVIAYYLSLAEHVTLDQSHSFKTLPKVTLDRLNARGLLPFIYDPIHGFAFSQLEKEN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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CEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHH
LVDFVKANKDKVCQVHVNLYDDKLVYSEFDRFAETASYDELKNLYELDKGAVREQADMII
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HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH
ANKQDSYFTAFGLKNVDTEGQAHLQIAQKLGGLIKPARLSSEPTGNSKSMALVVSDNFRA
CCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHH
LLERSYVSSIWTTIIDPKVTLDFFENAKDMVLIHYSDNYTNSANYDAITVTRQTELYKKV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHH
LEQDEGGITEEFNAFNGEWLLKMITANANERKEKKGIIGAYKFVNCLLSQSDITWVPLSV
HHCCCCCCCHHHCCCCCCEEEHEECCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECHHH
AEMIRVTGNIGLKMSDSDFSRNVQGYKSGLISDDVLFVGFKDKQMYVLPLEVKTGIKQTH
HHHHHHHCCCCEEECCCHHHCCHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHH
SKGVQQAKELKRYLCEDILGRNDFAGMLYRGLFIRQVLMQIDKYELYNLYSDTYFDGFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DREWWLQGDYSIAELANYPDGFMLSHVENDTFFEADFNEVDDILKIQLPISYLKQLVSTP
CCCEEECCCCCHHHHCCCCCCCEEEECCCCCEEECCHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
LRELMTDVRPEQLCHIPEKYLLVAANSSETRKQPEQDLPEPQTTTQQSTSTDTHTISSRA
HHHHHHHCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHE
IELSDFLPTKDPIKDAELVEKDSDTAHSDLNVPSKTAGQTPVSQPEQDNEPIKILVGHDV
EEHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCC
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CCCCEEEECCCCCEEEEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEE
DYKSDYVDEKFLTATNGKKFNLHKLPYNPLSLFGDTPMLPVHTARGFSETMGKAFGLGQK
ECCCCCCCCCCEEECCCCEEEEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEE
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EEECCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
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WIVHRVSQIKNQDIKSIFNKDDKSDQENLMKSIRELDKHYSLYVDGDKKVQKIKDKAFWE
HHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
LLG
HCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECC
TKLSIVTCGHSRLLPVLHSEDSNTAPGFTENFISHLRDEVAGQFGEFEDCALLVIHNSML
CEEEEEEECCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHH
DTLINSAENVAQPASIWHPEQIKQAMYKLIDDVNGTRKVSECLLEHRFNQIVDDGATMFG
HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
FEKLYNALLDGDLKFSELGLLNDPAILTWDGKPEQINKRLDENKRLYEDIERITHHFPNE
HHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH
LEEKLAEKDFGSKFVERNFGGEGLESWKTELEFSACKQEQEANRKNLLELESEVILQGEL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHEEECHH
IAKNKSETKAGRRERHLILVIEEDQQDFGFELTFIGGKIERKQCSILHNKTDLIEIANPV
EECCCCHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCHHEEECCCC
NSGGKRSRVTVTGAYTGKAMFFTLDLKREKTAERYKFKVLVIRSGDFYIDAFRNNFLIEP
CCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCHHHCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCEEECC
PTSSKKTARITLQTEDSSFVIGIDGGKEGTKAVLDEIGQVFDNETTSEINFEQIANESDE
CCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCC
LHFVVKGQDSWLTFNVEGAIATDSLTLPLILDKDRFTRLYQDDYLGSFNRAKNKVLLDNK
EEEEEECCCCEEEEEECCEEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCEEECCC
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CCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHEEEEEEEEECCCCCCCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SFWLELVPQQDTSFSYVRKLVKDKVGEFKNAFSALFNAGPKATLIINSVNNKSNHEIFMG
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