Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 157961764

Identifier: 157961764

GI number: 157961764

Start: 2355585

End: 2357888

Strand: Direct

Name: 157961764

Synonym: Spea_1941

Alternate gene names: NA

Gene position: 2355585-2357888 (Clockwise)

Preceding gene: 157961763

Following gene: 157961765

Centisome position: 45.52

GC content: 43.45

Gene sequence:

>2304_bases
ATGTTAGATAAATTAGTTAATGGATTCGAATCTTATCTATTCCGTCATAGAGCTTTCGTTATATTACTGTTTGCGGTAAC
GACTATCTTCCTTGGAATTCAAGCGAGTAACCTGAAAATGGATGCCGCATTTGTTAAAAACATTCCACTTAACCACAACT
ACATGCAAACCTATCTGAAGCACCAGAAACAGTTTGGTGGTGCCAACAGCATCATGGTGGCAGTAGAAGATACGAGCGGG
AACATTTTCAATCCAAATTTCTTTGATGCACTTAAAAATGTACATGATCAGCTATTTTTTATACCTGGTGTAGACAGAGC
ACAAGTTAAATCACTGTTCTCGCCATCTACGCGCTTTACTGAAGTCGTTGAAGACGGCTTTGCTGGTGGTCCTGTCATTC
CCGCGGATTTTTCTACCACAGAGCAAGGCTTAAAAACTGTTCGAGGTAATATCGAAAAAGCAGGTATTGTCGGCCGTTTG
ATTGCTGAAGACTACTCGGCAGCCATGGTGAGTACGCAGTTAATGGATTTCGATCCGCAAACTGGCGAACCCTTAGATAC
TTTGGCGTTTGCAGCACAGTTAGAAGAGCAGTTACGTGAACAGTATGAAACCGATGAAATAAAAATTCATATCATTGGTT
TTGCTAAGATGGCCGGAGATGTTGCCGACGGTGCAAAAGGAGTGCTGCTGTTTTTCCTTATTGCTATCTTAGTGACTGCA
GTGATGGTTTACTTTTTCTCTAAGTCGGTAGCGCTAACAATTTTGCCGTTAGTATGTAGTTTGATTGCAGTTGTTTGGCA
ATTAGGGTTATTAACCGTCATCGGATTTGGTTTAGACCCTATGTCTATTCTTATTCCATTTTTGGTGTTTGCCATTGGTG
TAAGTCACAGCGTACAGATGATTAATGCGGTAAGACGACGCGTTACCGATGGACAAACGACAAAGGCAGCCGCGGCACTG
GCATTTAGAAGTCTGCTTATTCCAGGTGGTGTTGCGCTGTTGTCTGACACCATAGGTTTTATGACGCTATTAGCCATCGA
CATTGGTATCATTCGAGAGCTCGCGATTTCAGCTTCTTTAGGTGTTGCTGTGATAATTTTAACAAACCTAATCTTATTGC
CGCTGGTGATCTCTTTTACAACAGTGACGCCTCGTAAAGATAATAAGCCAAACCCTGTAAATAACATCTGGCTTAAGCTA
TCTAATTTCGCTACGCCAAAATACGCGATTTGGGTCTTGATTGTGACAGGATTGCTCTATGCGGTTGGCTTACAGCAAGC
GAATAAGATGAAAATTGGCGATCTACAAGGCGGAGCTCCCGCGCTGCATTTAGACTCTCGTTATAATCAAGACACTTTCT
TTATTACTGATAAGTTCTCTATTACAACAGATGTGATGACAGTGATTGTTGAGGCATTCCCTGAAGCCTGTACGTATCAT
TCTGTATTGACTCAAATTGATGAGTTTGAGTGGCAGGTTAGTAACACACCTGGAGTCGAGGCTACGGCGAGTTTGGCATC
GGTGGCAAAGCGTGTAAATTCTGGCTTTAATGAAGGCAATCCAAAGTGGAGTGTTTTGCCACGCACCACAGCAAGCTTGG
TTCAGGCGGTTGGTCGCGTACCGACAACTTCAGGGTTACTCAATAGCGATTGCTCTGTGATGCCGGTTTATCTGTTCCTA
AAAGATCATAAAGCTGAAACCATTGAATTGGTTATCGATAAGGTTAATAAGTTACAAAAAGAGCTCGATAACGACAAAAT
CCAGTTTAAGTTAGCATCGGGCCCTGTCGGCGTCATGGCGGCAACCAATGAAGCAGTTGCAGAAGCACAGCTACCTATGA
TGCTTTATGTCTACGGCGCGGTGTTTATTCTATGTCTTATCAGTTTCCGGTCACTAAGAGCGACGATAGCAGTGATTTTG
CCTCTGTATGTGGTGTCCACATTGGCGCAGGCGTTAATGACTCAGCTCGATATTGGACTGGCCGTGAGTACCTTACCCGT
GATTGCGCTAGGTGTGGGTATTGGTGTTGATTACGGTATTTATATCTTATCGACCATGGCTGTACGTCTAAGAGATGGGA
TGCCGGTACAAAAAGCTTATTATGAGGCACTAGTCGAACGTGGAAGTGCGGTGATTTTCACTGGACTGACATTAGCGATT
GGTGTGAGTACTTGGTTCTTCTCGGCTCTTAAGTTCCAAATGGATATGGGGATTTTGCTTACATTCATGTTTTTGGTAAA
TATGTTGGGGGCAATAATTATCCTACCAGCCATAGCTGCCATGTTTTGGCGGCAGCCCAAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAACTTAGTCGCTATTGCTAAAGACTCAGAAGGAAACTTATGGGTTTCTGGTAATAAAGGTCTCATCAAATTAGAAC
AAAAATAATAGGACCTTACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATCAACGAAAGGGGAGCATTAGCTCCTCTTTTTTTATGAATAAAAACACGTTATATACGATTGTTATGTCAACAGTGTG
AATAAAATCGGTGCGAGGTT

Product: Patched family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 767; Mature: 767

Protein sequence:

>767_residues
MLDKLVNGFESYLFRHRAFVILLFAVTTIFLGIQASNLKMDAAFVKNIPLNHNYMQTYLKHQKQFGGANSIMVAVEDTSG
NIFNPNFFDALKNVHDQLFFIPGVDRAQVKSLFSPSTRFTEVVEDGFAGGPVIPADFSTTEQGLKTVRGNIEKAGIVGRL
IAEDYSAAMVSTQLMDFDPQTGEPLDTLAFAAQLEEQLREQYETDEIKIHIIGFAKMAGDVADGAKGVLLFFLIAILVTA
VMVYFFSKSVALTILPLVCSLIAVVWQLGLLTVIGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHSVQMINAVRRRVTDGQTTKAAAAL
AFRSLLIPGGVALLSDTIGFMTLLAIDIGIIRELAISASLGVAVIILTNLILLPLVISFTTVTPRKDNKPNPVNNIWLKL
SNFATPKYAIWVLIVTGLLYAVGLQQANKMKIGDLQGGAPALHLDSRYNQDTFFITDKFSITTDVMTVIVEAFPEACTYH
SVLTQIDEFEWQVSNTPGVEATASLASVAKRVNSGFNEGNPKWSVLPRTTASLVQAVGRVPTTSGLLNSDCSVMPVYLFL
KDHKAETIELVIDKVNKLQKELDNDKIQFKLASGPVGVMAATNEAVAEAQLPMMLYVYGAVFILCLISFRSLRATIAVIL
PLYVVSTLAQALMTQLDIGLAVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMAVRLRDGMPVQKAYYEALVERGSAVIFTGLTLAI
GVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFLVNMLGAIIILPAIAAMFWRQPK

Sequences:

>Translated_767_residues
MLDKLVNGFESYLFRHRAFVILLFAVTTIFLGIQASNLKMDAAFVKNIPLNHNYMQTYLKHQKQFGGANSIMVAVEDTSG
NIFNPNFFDALKNVHDQLFFIPGVDRAQVKSLFSPSTRFTEVVEDGFAGGPVIPADFSTTEQGLKTVRGNIEKAGIVGRL
IAEDYSAAMVSTQLMDFDPQTGEPLDTLAFAAQLEEQLREQYETDEIKIHIIGFAKMAGDVADGAKGVLLFFLIAILVTA
VMVYFFSKSVALTILPLVCSLIAVVWQLGLLTVIGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHSVQMINAVRRRVTDGQTTKAAAAL
AFRSLLIPGGVALLSDTIGFMTLLAIDIGIIRELAISASLGVAVIILTNLILLPLVISFTTVTPRKDNKPNPVNNIWLKL
SNFATPKYAIWVLIVTGLLYAVGLQQANKMKIGDLQGGAPALHLDSRYNQDTFFITDKFSITTDVMTVIVEAFPEACTYH
SVLTQIDEFEWQVSNTPGVEATASLASVAKRVNSGFNEGNPKWSVLPRTTASLVQAVGRVPTTSGLLNSDCSVMPVYLFL
KDHKAETIELVIDKVNKLQKELDNDKIQFKLASGPVGVMAATNEAVAEAQLPMMLYVYGAVFILCLISFRSLRATIAVIL
PLYVVSTLAQALMTQLDIGLAVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMAVRLRDGMPVQKAYYEALVERGSAVIFTGLTLAI
GVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFLVNMLGAIIILPAIAAMFWRQPK
>Mature_767_residues
MLDKLVNGFESYLFRHRAFVILLFAVTTIFLGIQASNLKMDAAFVKNIPLNHNYMQTYLKHQKQFGGANSIMVAVEDTSG
NIFNPNFFDALKNVHDQLFFIPGVDRAQVKSLFSPSTRFTEVVEDGFAGGPVIPADFSTTEQGLKTVRGNIEKAGIVGRL
IAEDYSAAMVSTQLMDFDPQTGEPLDTLAFAAQLEEQLREQYETDEIKIHIIGFAKMAGDVADGAKGVLLFFLIAILVTA
VMVYFFSKSVALTILPLVCSLIAVVWQLGLLTVIGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHSVQMINAVRRRVTDGQTTKAAAAL
AFRSLLIPGGVALLSDTIGFMTLLAIDIGIIRELAISASLGVAVIILTNLILLPLVISFTTVTPRKDNKPNPVNNIWLKL
SNFATPKYAIWVLIVTGLLYAVGLQQANKMKIGDLQGGAPALHLDSRYNQDTFFITDKFSITTDVMTVIVEAFPEACTYH
SVLTQIDEFEWQVSNTPGVEATASLASVAKRVNSGFNEGNPKWSVLPRTTASLVQAVGRVPTTSGLLNSDCSVMPVYLFL
KDHKAETIELVIDKVNKLQKELDNDKIQFKLASGPVGVMAATNEAVAEAQLPMMLYVYGAVFILCLISFRSLRATIAVIL
PLYVVSTLAQALMTQLDIGLAVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMAVRLRDGMPVQKAYYEALVERGSAVIFTGLTLAI
GVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFLVNMLGAIIILPAIAAMFWRQPK

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83536; Mature: 83536

Theoretical pI: Translated: 6.26; Mature: 6.26

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLDKLVNGFESYLFRHRAFVILLFAVTTIFLGIQASNLKMDAAFVKNIPLNHNYMQTYLK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
HQKQFGGANSIMVAVEDTSGNIFNPNFFDALKNVHDQLFFIPGVDRAQVKSLFSPSTRFT
HHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCEEECCCCCHHHHHHHHCCCHHHH
EVVEDGFAGGPVIPADFSTTEQGLKTVRGNIEKAGIVGRLIAEDYSAAMVSTQLMDFDPQ
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TGEPLDTLAFAAQLEEQLREQYETDEIKIHIIGFAKMAGDVADGAKGVLLFFLIAILVTA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VMVYFFSKSVALTILPLVCSLIAVVWQLGLLTVIGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHSVQM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INAVRRRVTDGQTTKAAAALAFRSLLIPGGVALLSDTIGFMTLLAIDIGIIRELAISASL
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVAVIILTNLILLPLVISFTTVTPRKDNKPNPVNNIWLKLSNFATPKYAIWVLIVTGLLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AVGLQQANKMKIGDLQGGAPALHLDSRYNQDTFFITDKFSITTDVMTVIVEAFPEACTYH
HHHHHHCCCCEECCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVLTQIDEFEWQVSNTPGVEATASLASVAKRVNSGFNEGNPKWSVLPRTTASLVQAVGRV
HHHHHHHHCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCC
PTTSGLLNSDCSVMPVYLFLKDHKAETIELVIDKVNKLQKELDNDKIQFKLASGPVGVMA
CCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEE
ATNEAVAEAQLPMMLYVYGAVFILCLISFRSLRATIAVILPLYVVSTLAQALMTQLDIGL
ECCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMAVRLRDGMPVQKAYYEALVERGSAVIFTGLTLAI
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHH
GVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFLVNMLGAIIILPAIAAMFWRQPK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MLDKLVNGFESYLFRHRAFVILLFAVTTIFLGIQASNLKMDAAFVKNIPLNHNYMQTYLK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
HQKQFGGANSIMVAVEDTSGNIFNPNFFDALKNVHDQLFFIPGVDRAQVKSLFSPSTRFT
HHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCEEECCCCCHHHHHHHHCCCHHHH
EVVEDGFAGGPVIPADFSTTEQGLKTVRGNIEKAGIVGRLIAEDYSAAMVSTQLMDFDPQ
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TGEPLDTLAFAAQLEEQLREQYETDEIKIHIIGFAKMAGDVADGAKGVLLFFLIAILVTA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VMVYFFSKSVALTILPLVCSLIAVVWQLGLLTVIGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHSVQM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INAVRRRVTDGQTTKAAAALAFRSLLIPGGVALLSDTIGFMTLLAIDIGIIRELAISASL
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVAVIILTNLILLPLVISFTTVTPRKDNKPNPVNNIWLKLSNFATPKYAIWVLIVTGLLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AVGLQQANKMKIGDLQGGAPALHLDSRYNQDTFFITDKFSITTDVMTVIVEAFPEACTYH
HHHHHHCCCCEECCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVLTQIDEFEWQVSNTPGVEATASLASVAKRVNSGFNEGNPKWSVLPRTTASLVQAVGRV
HHHHHHHHCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCC
PTTSGLLNSDCSVMPVYLFLKDHKAETIELVIDKVNKLQKELDNDKIQFKLASGPVGVMA
CCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCEEEEE
ATNEAVAEAQLPMMLYVYGAVFILCLISFRSLRATIAVILPLYVVSTLAQALMTQLDIGL
ECCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMAVRLRDGMPVQKAYYEALVERGSAVIFTGLTLAI
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHH
GVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFLVNMLGAIIILPAIAAMFWRQPK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]