Definition Rickettsia akari str. Hartford, complete genome.
Accession NC_009881
Length 1,231,060

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The map label for this gene is 157825130

Identifier: 157825130

GI number: 157825130

Start: 2912

End: 5983

Strand: Direct

Name: 157825130

Synonym: A1C_00025

Alternate gene names: NA

Gene position: 2912-5983 (Clockwise)

Preceding gene: 157825129

Following gene: 157825133

Centisome position: 0.24

GC content: 32.0

Gene sequence:

>3072_bases
ATGAAACTTGGTTTTAATCTAGATTTTAATGAATTAGATTTAACCGGACTTAAAAAATTAGATCAAATATTTTTAGATTA
TCTCTTTAAAGCCGATAAATCTCTGCATAAAGATTTAATGTTATTTAGATCAACTCCTCTCTATATTATTCCACAAGATT
ATTCCGAATTTTTGCTAAAAATTTCTCCTCAGTTAGACGATTTTTTAGCAGAGTTATTTTGTATTTCAAAAGAAATAACG
ATATCAAGACTGAAACATAAAGATTTTGATATTATTTATGAATGTAAAAGAAAATTTGTTCAGCGTGTTGCCATAAAAAA
ATATCCACCGGAAAAAATAAAAGATATTGATTTTGAAGATGTGTATTTAAAGCTAACTAATTTAATAGGTACGAATTTCA
CTTCTAGAGAATTTGCGAAGCAAATTATTATATGGCAACAGGATGAAGAGAATTTTGCAGAAGAATTAGACATAGCAACT
AGGTATGCAGCGTGCAGGGTTTATGATCACTGTCATTCCTCTTCATTGTGCCATTCACGCGAAAGCTGGAATCTAGAAAA
ATTAAGTCTGGATCCACGTTTTCACAGGGATGACATAAGAAACGATGACATCCTATTCAACATCCACCAAAAACTAGATA
AAGAAAATCTAATAGATGATAATAAAATATTAAGATATCAAAAAAATGAGAGAGTAGATTTTGACTATACAGATTCTTTT
TTAAATCTAGATGAAGCATTAAACGATTCTCATTATTGTATTTATTGTCATAAGCAGGGTAAGGATTCTTGCTCCAAAGG
GATAAGTGTCATTCCGCGACTTGATCACGGGATGATAACCGGTGGCTGCCCGTTAAAACAAAAAATTTCTGAAATGAATT
ATGTTAAAGCACAGGGTTTTAATCTAAGTGCTCTTGCAATCATTGTTATTGATAATCCGATGGTAGCGGCAACGGGTCAT
AGAATTTGTAATGATTGCTCTAAAGCTTGTATTTATCAAAAGCAAGATCCGGTAAATATTCCATTAATAGAAACAAATAT
TTTAGAAGAAACGCTTAAATTACCTTACGGTTTAGAGATATATCTACTTCTTACTCGTTGGAATCCGCTTAATATTTATG
CACCTCTACCACAAGAATCTACTAATTATAATATTTTAGTTACCGGTCTTGGTCCTGCAGGTTTTAGCCTTAGCTATTAT
TTATTACGATCAGGTCACAATGTCACGGCTATTGACGGTCTTAAAATTACCCCTTTATCTTTTGATGTTTATAAGCCTAT
AAAATTTTGGCATGAATATAAAAATTTGTTATCGGAAAGAATACCGAGAGGATTTGGTGGGGTAGCAGAATATGGGATTA
CAGTTCGATGGGATAAAAACAATCTTGATATATTGCGGTTAATATTAGAGAGAAATAATAATTTCAAATATTATGACGGA
GTAGCTTTAGATTTTAATATAACGAAAAAACAAGTTCTAGATTTAGGTTTTGACCATATAGCTTTTTGCATTGGAGCAGG
TCAGCCGAAAGTCTTAGATATAGAAAATTTTGAAGCTAAAGGCGTAAAAACGGCTTCTGATTTCTTAATGACTTTGCAAA
GCGGAGGGGCATTTTTGAAAAATTCTAATACTAATATGCTAATTAGGATGCCGATTGCGATAATAGGCGGTGGTCTTACT
TCCTTAGATGCAGCAACGGAAAGTTTATATTACTATAAAAAGCAAGTAGAGGAATTTGCTAAATATTATATAGAAAAAGA
TTTAGAGGAAGAAGATAAAGAAATAGCTGAGGAATTTATTGCTCATGCAAGATTATTTAAAGAAGCTAAGAATAATGAAG
AATTAAGAAAGGTTTTTAAAAAGATTGGAGGAGCTACTGTTTATTATCGTGGAAAACTACAAGATTCGCCAGCGTATAAA
TTAAATCACAAGGAGTTAATATATACATTAGCACTTGGTGTTGATTTTAAAGAAAATATGCAACCTTTAAGGATTAATGT
TGATAAATACGGTCATGTGGAAGGGGTGGAATTCAGTGTTATCCAGTGGCTTGACCACAGGATCCATCAAGAAGCACATT
GTAATAATGATTTTCTAGATCCCATGGTCAAGCCACTGGATGACACTGTGGTACTTAAAGCCAAAACCGTGATTATGGCA
ATCGGTATAGAAAATAACACTCAATTCGATGAAAATAAATATAGTTATTTCGGTGATTGTAATCCTCAATATTCGGGTAG
TGTAGTGAAAGCTATTGCCAGTAGCAAAGAAGGGTATGATGCTATTAACAAAAGGCTTATAAATAATAATCCTAGCTTTA
AAGGTAGTTACAAAGACTTTATAACGCAGCTTGATTATTTGCTCACTTCTAGGGTTAATAAAATAAATATTCTAGATGAT
AAAGCTTTTGAGTTGATAATTCACTCGCCGCTTGCTGCTAAAAATTTTAAGTTTGGACAGTTTTTTCGCTTACAAAATTA
TTCTGAAGATGCTTCTAAGTTAATAGAGCCGGTAGCCTTAAGCCCTGTAGATATTGATGTAGAAAAAGGTTTAATTAGAT
TTGTAATTTATGAAGTCGGTAATTCTACTAGCTTATGTAAAACATTATCCGAAAATGAGAAAGTAGTATTAATGGGACCG
ACAGGCTTGCCGCTAGAAATACCTCAAAATAAAAAAATAATTATTGTTGATTCTGAAGCCGGTAATATAGGCTTATTAAA
AGTTCTAAAAGAAAATAATAATGAAGTTATATTTGTTACCTATCCTGATATAAAGAATCGTAAGTTAACTTCTGTAGATA
TAGTAATAATTAATGATTCACCTGAAGTAGCTGAAGAGTTACAAGAGTTAAAAATATTTGATGAGAATACGGAGCTAATA
GTTAGCGTTAATGCATCGATGCAATGTATGATGAAAGGGATTTGCGGACAATGTATTCAAAAAGTCAAAGGAGAGCAGGA
ATATATTTTTGCATGTAGCAGGCATAATCAAAATGCAGAAATAGTGGATTTTAAGAGCTTGAAAACTCGTTTACGCCAAA
ATTCTTTACAAGAGAAAATGTTTCGTCATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATGATGTTAATAGTTAAGTCCGTTATAGTCGCATTCATTACTGTTTGTATCAGTTATTTAATTTATAGACAATTTTCT
AAAAAAGTTATTTATTATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAGGAAAAACTGTAAGTTTTGACGAAGCAATCTAAAGTTACTTCTCAAAACGACAAAATGCTCTACTACTATCTTGATTA
AGAAAATCGATAATTTGCAT

Product: putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1023; Mature: 1023

Protein sequence:

>1023_residues
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VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLKNSNTNMLIRMPIAIIGGGLT
SLDAATESLYYYKKQVEEFAKYYIEKDLEEEDKEIAEEFIAHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYK
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TGLPLEIPQNKKIIIVDSEAGNIGLLKVLKENNNEVIFVTYPDIKNRKLTSVDIVIINDSPEVAEELQELKIFDENTELI
VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKMFRH

Sequences:

>Translated_1023_residues
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ISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFEDVYLKLTNLIGTNFTSREFAKQIIIWQQDEENFAEELDIAT
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VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLKNSNTNMLIRMPIAIIGGGLT
SLDAATESLYYYKKQVEEFAKYYIEKDLEEEDKEIAEEFIAHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYK
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IGIENNTQFDENKYSYFGDCNPQYSGSVVKAIASSKEGYDAINKRLINNNPSFKGSYKDFITQLDYLLTSRVNKINILDD
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VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKMFRH
>Mature_1023_residues
MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLKISPQLDDFLAELFCISKEIT
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VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLKNSNTNMLIRMPIAIIGGGLT
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VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKMFRH

Specific function: Unknown

COG id: COG0493

COG function: function code ER; NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013027
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR017938 [H]

Pfam domain/function: PF07992 Pyr_redox_2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 117412; Mature: 117412

Theoretical pI: Translated: 6.14; Mature: 6.14

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLK
CEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHEE
ISPQLDDFLAELFCISKEITISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFED
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EEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEECCEEEECCC
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VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLK
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VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKM
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRH
HCC
>Mature Secondary Structure
MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLK
CEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHEE
ISPQLDDFLAELFCISKEITISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFED
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AHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYKLNHKELIYTLALGVDFKENM
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CEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEE
IGIENNTQFDENKYSYFGDCNPQYSGSVVKAIASSKEGYDAINKRLINNNPSFKGSYKDF
EEECCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH
ITQLDYLLTSRVNKINILDDKAFELIIHSPLAAKNFKFGQFFRLQNYSEDASKLIEPVAL
HHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCC
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GNIGLLKVLKENNNEVIFVTYPDIKNRKLTSVDIVIINDSPEVAEELQELKIFDENTELI
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VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKM
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRH
HCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]