| Definition | Rickettsia akari str. Hartford, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009881 |
| Length | 1,231,060 |
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The map label for this gene is 157825130
Identifier: 157825130
GI number: 157825130
Start: 2912
End: 5983
Strand: Direct
Name: 157825130
Synonym: A1C_00025
Alternate gene names: NA
Gene position: 2912-5983 (Clockwise)
Preceding gene: 157825129
Following gene: 157825133
Centisome position: 0.24
GC content: 32.0
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1023; Mature: 1023
Protein sequence:
>1023_residues MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLKISPQLDDFLAELFCISKEIT ISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFEDVYLKLTNLIGTNFTSREFAKQIIIWQQDEENFAEELDIAT RYAACRVYDHCHSSSLCHSRESWNLEKLSLDPRFHRDDIRNDDILFNIHQKLDKENLIDDNKILRYQKNERVDFDYTDSF LNLDEALNDSHYCIYCHKQGKDSCSKGISVIPRLDHGMITGGCPLKQKISEMNYVKAQGFNLSALAIIVIDNPMVAATGH RICNDCSKACIYQKQDPVNIPLIETNILEETLKLPYGLEIYLLLTRWNPLNIYAPLPQESTNYNILVTGLGPAGFSLSYY LLRSGHNVTAIDGLKITPLSFDVYKPIKFWHEYKNLLSERIPRGFGGVAEYGITVRWDKNNLDILRLILERNNNFKYYDG VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLKNSNTNMLIRMPIAIIGGGLT SLDAATESLYYYKKQVEEFAKYYIEKDLEEEDKEIAEEFIAHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYK LNHKELIYTLALGVDFKENMQPLRINVDKYGHVEGVEFSVIQWLDHRIHQEAHCNNDFLDPMVKPLDDTVVLKAKTVIMA IGIENNTQFDENKYSYFGDCNPQYSGSVVKAIASSKEGYDAINKRLINNNPSFKGSYKDFITQLDYLLTSRVNKINILDD KAFELIIHSPLAAKNFKFGQFFRLQNYSEDASKLIEPVALSPVDIDVEKGLIRFVIYEVGNSTSLCKTLSENEKVVLMGP TGLPLEIPQNKKIIIVDSEAGNIGLLKVLKENNNEVIFVTYPDIKNRKLTSVDIVIINDSPEVAEELQELKIFDENTELI VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKMFRH
Sequences:
>Translated_1023_residues MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLKISPQLDDFLAELFCISKEIT ISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFEDVYLKLTNLIGTNFTSREFAKQIIIWQQDEENFAEELDIAT RYAACRVYDHCHSSSLCHSRESWNLEKLSLDPRFHRDDIRNDDILFNIHQKLDKENLIDDNKILRYQKNERVDFDYTDSF LNLDEALNDSHYCIYCHKQGKDSCSKGISVIPRLDHGMITGGCPLKQKISEMNYVKAQGFNLSALAIIVIDNPMVAATGH RICNDCSKACIYQKQDPVNIPLIETNILEETLKLPYGLEIYLLLTRWNPLNIYAPLPQESTNYNILVTGLGPAGFSLSYY LLRSGHNVTAIDGLKITPLSFDVYKPIKFWHEYKNLLSERIPRGFGGVAEYGITVRWDKNNLDILRLILERNNNFKYYDG VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLKNSNTNMLIRMPIAIIGGGLT SLDAATESLYYYKKQVEEFAKYYIEKDLEEEDKEIAEEFIAHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYK LNHKELIYTLALGVDFKENMQPLRINVDKYGHVEGVEFSVIQWLDHRIHQEAHCNNDFLDPMVKPLDDTVVLKAKTVIMA IGIENNTQFDENKYSYFGDCNPQYSGSVVKAIASSKEGYDAINKRLINNNPSFKGSYKDFITQLDYLLTSRVNKINILDD KAFELIIHSPLAAKNFKFGQFFRLQNYSEDASKLIEPVALSPVDIDVEKGLIRFVIYEVGNSTSLCKTLSENEKVVLMGP TGLPLEIPQNKKIIIVDSEAGNIGLLKVLKENNNEVIFVTYPDIKNRKLTSVDIVIINDSPEVAEELQELKIFDENTELI VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKMFRH >Mature_1023_residues MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLKISPQLDDFLAELFCISKEIT ISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFEDVYLKLTNLIGTNFTSREFAKQIIIWQQDEENFAEELDIAT RYAACRVYDHCHSSSLCHSRESWNLEKLSLDPRFHRDDIRNDDILFNIHQKLDKENLIDDNKILRYQKNERVDFDYTDSF LNLDEALNDSHYCIYCHKQGKDSCSKGISVIPRLDHGMITGGCPLKQKISEMNYVKAQGFNLSALAIIVIDNPMVAATGH RICNDCSKACIYQKQDPVNIPLIETNILEETLKLPYGLEIYLLLTRWNPLNIYAPLPQESTNYNILVTGLGPAGFSLSYY LLRSGHNVTAIDGLKITPLSFDVYKPIKFWHEYKNLLSERIPRGFGGVAEYGITVRWDKNNLDILRLILERNNNFKYYDG VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLKNSNTNMLIRMPIAIIGGGLT SLDAATESLYYYKKQVEEFAKYYIEKDLEEEDKEIAEEFIAHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYK LNHKELIYTLALGVDFKENMQPLRINVDKYGHVEGVEFSVIQWLDHRIHQEAHCNNDFLDPMVKPLDDTVVLKAKTVIMA IGIENNTQFDENKYSYFGDCNPQYSGSVVKAIASSKEGYDAINKRLINNNPSFKGSYKDFITQLDYLLTSRVNKINILDD KAFELIIHSPLAAKNFKFGQFFRLQNYSEDASKLIEPVALSPVDIDVEKGLIRFVIYEVGNSTSLCKTLSENEKVVLMGP TGLPLEIPQNKKIIIVDSEAGNIGLLKVLKENNNEVIFVTYPDIKNRKLTSVDIVIINDSPEVAEELQELKIFDENTELI VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKMFRH
Specific function: Unknown
COG id: COG0493
COG function: function code ER; NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013027 - InterPro: IPR016040 - InterPro: IPR017938 [H]
Pfam domain/function: PF07992 Pyr_redox_2 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 117412; Mature: 117412
Theoretical pI: Translated: 6.14; Mature: 6.14
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.0 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 2.0 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLK CEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHEE ISPQLDDFLAELFCISKEITISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFED CCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHH VYLKLTNLIGTNFTSREFAKQIIIWQQDEENFAEELDIATRYAACRVYDHCHSSSLCHSR HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCC ESWNLEKLSLDPRFHRDDIRNDDILFNIHQKLDKENLIDDNKILRYQKNERVDFDYTDSF CCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHCCHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHH LNLDEALNDSHYCIYCHKQGKDSCSKGISVIPRLDHGMITGGCPLKQKISEMNYVKAQGF HCHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHCCEEEECCC NLSALAIIVIDNPMVAATGHRICNDCSKACIYQKQDPVNIPLIETNILEETLKLPYGLEI CEEEEEEEEECCCEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCEE YLLLTRWNPLNIYAPLPQESTNYNILVTGLGPAGFSLSYYLLRSGHNVTAIDGLKITPLS EEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEECCEEEECCC FDVYKPIKFWHEYKNLLSERIPRGFGGVAEYGITVRWDKNNLDILRLILERNNNFKYYDG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECC VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLK EEEEECCCHHHHHHCCHHHHEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEE NSNTNMLIRMPIAIIGGGLTSLDAATESLYYYKKQVEEFAKYYIEKDLEEEDKEIAEEFI CCCCCEEEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH AHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYKLNHKELIYTLALGVDFKENM HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHEEEEEEECCCHHHCC QPLRINVDKYGHVEGVEFSVIQWLDHRIHQEAHCNNDFLDPMVKPLDDTVVLKAKTVIMA CEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEE IGIENNTQFDENKYSYFGDCNPQYSGSVVKAIASSKEGYDAINKRLINNNPSFKGSYKDF EEECCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH ITQLDYLLTSRVNKINILDDKAFELIIHSPLAAKNFKFGQFFRLQNYSEDASKLIEPVAL HHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCC SPVDIDVEKGLIRFVIYEVGNSTSLCKTLSENEKVVLMGPTGLPLEIPQNKKIIIVDSEA CCCEEEHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCEEEEEECCC GNIGLLKVLKENNNEVIFVTYPDIKNRKLTSVDIVIINDSPEVAEELQELKIFDENTELI CCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCEEECCCCEEE VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKM EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH FRH HCC >Mature Secondary Structure MKLGFNLDFNELDLTGLKKLDQIFLDYLFKADKSLHKDLMLFRSTPLYIIPQDYSEFLLK CEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHEE ISPQLDDFLAELFCISKEITISRLKHKDFDIIYECKRKFVQRVAIKKYPPEKIKDIDFED CCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHH VYLKLTNLIGTNFTSREFAKQIIIWQQDEENFAEELDIATRYAACRVYDHCHSSSLCHSR HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCC ESWNLEKLSLDPRFHRDDIRNDDILFNIHQKLDKENLIDDNKILRYQKNERVDFDYTDSF CCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHCCHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHH LNLDEALNDSHYCIYCHKQGKDSCSKGISVIPRLDHGMITGGCPLKQKISEMNYVKAQGF HCHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHCCCEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHCCEEEECCC NLSALAIIVIDNPMVAATGHRICNDCSKACIYQKQDPVNIPLIETNILEETLKLPYGLEI CEEEEEEEEECCCEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCCCCEE YLLLTRWNPLNIYAPLPQESTNYNILVTGLGPAGFSLSYYLLRSGHNVTAIDGLKITPLS EEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCEEEECCEEEECCC FDVYKPIKFWHEYKNLLSERIPRGFGGVAEYGITVRWDKNNLDILRLILERNNNFKYYDG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCEEEECC VALDFNITKKQVLDLGFDHIAFCIGAGQPKVLDIENFEAKGVKTASDFLMTLQSGGAFLK EEEEECCCHHHHHHCCHHHHEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEE NSNTNMLIRMPIAIIGGGLTSLDAATESLYYYKKQVEEFAKYYIEKDLEEEDKEIAEEFI CCCCCEEEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH AHARLFKEAKNNEELRKVFKKIGGATVYYRGKLQDSPAYKLNHKELIYTLALGVDFKENM HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHEEEEEEECCCHHHCC QPLRINVDKYGHVEGVEFSVIQWLDHRIHQEAHCNNDFLDPMVKPLDDTVVLKAKTVIMA CEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEE IGIENNTQFDENKYSYFGDCNPQYSGSVVKAIASSKEGYDAINKRLINNNPSFKGSYKDF EEECCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHH ITQLDYLLTSRVNKINILDDKAFELIIHSPLAAKNFKFGQFFRLQNYSEDASKLIEPVAL HHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCC SPVDIDVEKGLIRFVIYEVGNSTSLCKTLSENEKVVLMGPTGLPLEIPQNKKIIIVDSEA CCCEEEHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCEEEEEECCC GNIGLLKVLKENNNEVIFVTYPDIKNRKLTSVDIVIINDSPEVAEELQELKIFDENTELI CCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCEEECCCCEEE VSVNASMQCMMKGICGQCIQKVKGEQEYIFACSRHNQNAEIVDFKSLKTRLRQNSLQEKM EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH FRH HCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
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Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9823893 [H]