Definition Shewanella sediminis HAW-EB3, complete genome.
Accession NC_009831
Length 5,517,674

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Identifier: 157375931

GI number:

Start: 3369703

End: 3376164

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: Ssed_2796

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 157375932

Following gene: 157375930

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>6462_bases
GTGAATGGAGTTGCATTAGCTGATGCCGATGGTGATTTAGCGGCCAGCGCCGGAGTCACCGAGCCGATCGCTTTACCCAC
AACAGTCACCACCACAGGTGCGGCGGTTGATATCTTTGATTTTACTTTATCCGATGGCGGCGGCGGTGACGGATTGGCGA
TGGATATCAGCCAAATAGTGGTCAATGTCACCGGTACCGGTGATGAAAACAAAGTCGTGTTTCGCTTAAACGGCCCGGAT
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TGAAGTCTATACGGTTAATGCTTATTACGGTGACAACACCGGCTTAACGGAAGGGCAAACGTATATTCTGTCGGTGGATG
GTGACACCGATGTCACCAGTGCCGGCGGCACTACGATGGGTGCCACCACGGCCGTGAACAACGGCAGTGGTACAACGGTC
GATGTCACCGCGACACAGTTGGTGTTCACTGCTCAGCCCAGTGCTTCAGTGGTAACCAGTGTCAATATGGGACCCGTTAC
CCTGCAGGCTCAGGATACGGCGGGCAATGTCGATACCAACTTTATTGAGACCGTTACGTTAACTGATGAAAACCAGGGCG
CTGAAACGGATGCAACGGGTACACTATCGACGACGTCGAATGGTAACAGCCTGGCTGTTGCCGCCACTGCCGGTCAGGTG
TCCTGGGCTGATTTGACCTATAACGTCATTGCTGCAATCAATATCGATGCAAATTCAACCAGCTTTAATGTGGAAAGCAG
TAACGTCTCGGTCACGGGAAATACCGATGGCGATTTAACCGCCAGCGCCGGAGTTACTGAGCCGATCGCCTTACCGACTA
CTGTCACCACTACAGGAGCGGCGGTTGATATCTTTGATTTTACTTTAACCGATGGCGGCGGCGGTGACGGATTGGCGATG
GATATCAGCCAAATAGTGGTCAATGTCACCGGTACCGGTGATGAAAACAAAGTCGTGTTTCGCTTAAACGGCCCGGATGT
AACCAATGTCGTCGGCACCGTTGGCGCTGATACTATCACTTTCAGTGGCCTGTCGATTTCAGTCGCCGATGGACTTTCCG
AAGTCTATACGGTTAATGCTTATTACGGTGACAACACCGGCTTAACGGAAGGGCAAACGTATATTCTGTCGGTGGATGGT
GACACCGATGTCACCAGTGCCGGCGGCACCACGATGGGCGCCACCACGGCGGTGAACAACGGCGGTGGTACAACGGTCGA
TGTCACCGCGACACAGCTGGTGTTCAGTGTTCAGCCCAGTGCTACAGTAGCGACCAGTGTCAATATGGGACCCGTTACCC
TGCAGGCTCAGGATGCGGCGGGCAATGTCGATACCGACTTTACTGAAACCATTACGTTAACCGATGAAAACCAGGGCGCT
GAAACCAATGCGTTGGGGACACTATCGACGACGTCGAACGGTAACAGCCTGGCTGTTGCCGCCACTGCCGGTCAGGTGTC
CTGGGCTGATTTGACCTATAACGTCATTGCCGCAATCAATATCGATGCAAATTCAACCAGCTTTAATGTGGAAAGCAGTA
ACGTCTCGGTCACGGGAAATATCGATGGCGATTTAACCGCCAGCGCCGGAGTTACTGAGCCGATCGCCTTACCGACTACT
GTCACCACTACAGGAGCGGCGGTTGATATCTTTGATTTTACTTTAACCGATGGTGGCAGCAGTGATGGGTTGACCATGGA
TATCAGCCAAATCGTGGTCAATGTTACCGGTACCGGTGATGAAAACAAAGTCGTGTTTCGTTTAAACGGCCCGGATGTAA
CCAATGTCGTCGGCACCGTTGGCGCTGATACTATCACTTTCAGTGGCCTGTCGATTTCAGTCGCCGATGGACTTTCCGAA
GTCTATACGGTTAATGCTTATTACGGTGACAACACCGGCTTAACGGAAGGGCAAACGTATATTCTGTCGGTGGATGGTGA
CACCGATGTCACCAGTGCCGGCGGCACCACGATGGGCGCCACCACGGCGGTGAACAACGGCGGTGGTACAACGGTCGATG
TCACCGCGACACAGCTGGTGTTCAGTGTTCAGCCCAGTGCTACAGTAGCGACCAGTGTCAATATGGGACCCGTTACCCTG
CAGGCTCAGGATGCGGCGGGCAATGTCGATACCGACTTTACTGAAACCATTACGTTAACCGATGAAAACCAGGGCGCTGA
AACCAATGCGTTGGGGACACTATCGACGACGTCGAACGGTAACAGCCTGGCTGTTGCCGCCACTGCCGGTCAGGTGTCCT
GGGCTGATTTGACCTATAACGTCATTGCCGCAATCAATATCGATGCAAATTCAACCAGCTTTAATGTGGAAAGCAGTAAC
GTCTCGGTCACGGGAAATATCGATGGCGATTTAACCGCCAGCGCCGGAGTTACTGAGCCGATCGCCTTACCGACTACTGT
CACCACTACAGGAGCGGCGGTTGATATCTTTGATTTTACTTTAACCGATGGTGGCAGCAGTGATGGGTTGACCATGGATA
TCAGCCAAATCGTGGTCAATGTTACCGGTACCGGTGATGAAAACAAAGTCGTGTTTCGTTTAAACGGCCCGGATGTAACC
AATGTCGTCGGCACCGTTGGCGCTGATACTATCACTTTCAGTGGCCTGTCGATTTCAGTCGCCGATGGACTTTCCGAAGT
CTATACGGTTAATGCTTATTACGGTGACAACACCGGCTTAACGGAAGGGCAAACGTATATTCTGTCGGTGGATGGTGATA
CCAATGTCACCAGCGCCGGTGGCACCACCATGGGCGCCACCACTGCGGTGAACAATGGCAGTGGTACAACGGTCGATGTC
ACCGCGACACAGCTGGTGTTTACAGCTCAACCAGTATCTGCCGTGATTCAAGGTGCCAATATGGGACCCGTTACCCTGCA
GGCTCAGGACGCGGCGGGCAATGTCGATACCGACTTTACTGAAACCATTACGTTAACCGATGAAAACCAGGGCGCAGAAA
CCAATGCGTTGGGGACACTATCGACGACGTCGAACGGTAACAGCCTGGCTGTTGCTGCCACTGCCGGTCAAGTGTCCTGG
GCTAACTTGACCTATAACGCCATTGCTGCGATCAATATTGATGCAAACTCAACCAGCTTTAATGTGGAAAGTGGCTTTGT
TACGGTTTCTACGAATAATACCGCACCTGTAATAACTCAAGGCACTTCAACAGCCGTAACTATGGATGAAGACGGAAGCC
CTACAAGTTTTTCTCTTACTTTGAATGCAACGGATGCTCAGGGGAATACCCTAATATGGAGTATTCAAACGCCAGCTATT
AATGGTACTGCAAGTGTTTCAGGTACTGGCACATCTAAAGTAATTGGCTATACTCCAAACCAAGATTTTAACGGCAGCGA
TAGTTTTGCTGTTAAAGTTGATGATGGCAATGGACTGAGTGATAGCATCACTGTCAACCTTGCTATCGCCCCTATAAATG
ACGTCACGGTTATTACCGATCAAGCTGTAAGCACTGGCGAAGAGGTTGCACTGGCGATTACTTTATCTGGTACCGATGCT
GACGGTGATGCTTTAACTTATTCTGTCGTTAGTCAACCATCACATGGCGTACTCAGCGGAGAAGCCCCCAGCTTAACTTA
TACGCCTAATGTTGATTTTGTCGGTTTAGATAGTTTCACATTTAAAGCCAACGATGGCTTTGTTGATTCCGATATTGCTA
CAGTTAGCATTACTGTCAGTAATGATAATGATGCTCCGGTTATTACCAACCAAGTTGTAAGTACTGATGAAGAAGTCACA
TTGGCAATTACATTAACGGGAACTGATGCTGACGGAGACACATTAACTTATTCTGTCATTAGTCAACCATCACATGGTGT
ACTCAGCGGTGAAGCTCCCAGCTTAACTTATACGCCTGATGATGATTTTGCTGGCGAAGATAGCTTCACCTATAAGGCCA
ATGATGGCAAGTTGGATTCCAATAACGGAACAATTAGTATTACTGTCAGTAATGATAATGATGACCCGGTGGCGGTTGAT
GATGAGGTCACCTTACTGTCTGGTGAATCGATAGAAATCTTGGTATTGGGCAATGATACTGACGCTGACGGAGACACGTT
AACAGTTGTAGCATCTTCTGCTGATCTAGGTGCTACCACTGTCCAAAATAATAGTACCGTTTTATACCAATCATTGGCCG
GCTTTGTAGGTGATACAGTCGTTCAATATGGTATTACCGATGGAAATGATGGCAACGCGACCGCAGAAATATTGATCCAC
GTATTAGCTATGGATGATGAAAGCCTTCCCGTTATTACTCTGCCCGAAAATATTGATATTAATGCCAGCGGATTCCTAAC
TCAGGTTGATTTGGGAGTTGCTGTTGCTGTAGATAGCAGCGGCAACCCCGTTCCAGTTACTTTATTAGATGACACTAACT
ATTTCACACCAGGTAGGCATTTTGTGTATTGGCAAGCCGTTGACGCCAAGGGGAATAGTGTGACAGCCGCACAAATGGTT
AAAGTAAACCCGGTGATTTATTTGTCTCAGGAGCAAACGGTTGCAGAAGGCCAAAATGTAACAGTTGATATTCTTCTTAA
CGGGGCTTCTCCTGATTATCCTTTAGAGATCAATTACAGCTTATTGGGCAGTGCTGATGTCAGTGACCATGATTTAACCG
ATACAGTTTTGGTTATTGAATCTGGTATTGAGGGGCATATTGAATTCAGAACCTATGATGATGAGATTTCAGAAGGGGAC
GAATTATTACAATTGACTTTAGATCCGTTACTGAATTCAAATTCAATAACTCATAATATAATTATTACTGAAAATAATAT
TGCTCCTATTGTGTCACTTGATGTTCAGCAAGATGGAATTTCAAGCATACTATTATCTCAACGCGGAGGAGATGTAGTTG
TTATCTCGACACTGTTTGATGGTAACAAAGACGACAATCATATATACGATTGGAGCGCTAGTTCGGAAGAGTTAATAGAT
TTAGATATTGATGAACTTCGCTTTACTTTTTCCCCTCTTGAATTAAACAGTGGTACCTATGAAGTCAAACTGTTAGTCAG
TGATGATGGAGTACAACCACTAAGCCATGAAGTCAGTCTGTTTATTGAAATCATAGACAACTTGCCAGTATTGACCAATG
ATGACTCTGACGGTGATGGCATTCCGGATATTCGCGAAGGCTTTGGGGATGATGATGCTGATGGTGTTCCTGATTACCTG
GATAATATTGCTGCCTGTAATATCTTGGTAGAGCAAGTTGATCAAAACTCAAACTTTTTAATAGAAGGGGATAACAGTGG
TTGTTTATCTTTGGGAGCGGCAGTTATGGGAGGAGAAAGCGGTGGAGCCATTCTTTCTGATGGCAGCGTACAAAGTAATT
CGATTCCCGAAGACAGTGAGACAATAAATATTGGTGGCATTTTTGATTTTATTATCTCTCAAATTATCAAAGGACAGGTG
TACCCTATTACTTTGCCACAACTACAACCAATTCCCACGGATGCTGTTTACAGAAAGTATCTTCCTGGTATTGGCTGGAC
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GTAGCAAATGGGATGATTTTCGACCCTGGTGGGGTTGTGATTTTTGCTTCTGCTAACACTTTCCCTGTTGCTAATGATGA
TGCAGTCGAAATTGGCAAGAATGAAACGGTTACTATAGAAGTACTTGAAAACGATAGTGACACTGATGGTGATATATTGA
GCATATTGAGTGCGACAGCTCAGCATGGCAATGTGGAAATTAGTAACGATACATTAATCTATTCAGCTCCTGAAGGTTAT
TTAGGCGATGATGAAATTAGCTATGTTATTTCAGATAATAATGGTGGTAACGATAATGCCAGAGTCGCCATTCAAATTCG
AAATAGATCGCCAATAGTTAACAATGACTTAGCTTATACAAACTCAGGGGTTACTATAATAATTGATGTTCTGGGCAATG
ATACTGATGCAGATAATGATCAGCTCACAATAGTGTCTGCAACAGCTGAGTTTGGTTTTGTCAGTATTAATGAAGAGCAA
ACATTAAAATATACGTCATCAGCATCTTTTATCGGAACTGATACAATTGAGTATCTGGTTAGTGATGGTGTTGGGGGGAC
TGGCCAAGGAACGGTTGAAGTTATTGTTTTTGCCACTCCCTCTACCTCTACCAAATCTAGTGGTGGGGGAGCTCTCAACT
TTTATTGGATATTATTAATTCTTATCTATTTATATGGAGTACGGAGTAAGGTGAACTCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTCGCAGGCATCTCAATATGTTATTCAGCTCATTCCCTCAGAAAACCAGAGTTTTCGCTTGGTTATTTAAGATATTGC
TAATTATTTCTTCTTTGGCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGTTAGTGTTATTTTGTAGTGGTCAAGTCATATTGACCACTGCAAATATGCTGGTGTTAGGAATACTCAATAGGAAGAT
GAGGTTGTGAATCGTATCGG

Product: fibronectin type III domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>2153_residues
MNGVALADADGDLAASAGVTEPIALPTTVTTTGAAVDIFDFTLSDGGGGDGLAMDISQIVVNVTGTGDENKVVFRLNGPD
ATNVVGTVGVDTITFSGLTISVADGLSEVYTVNAYYGDNTGLTEGQTYILSVDGDTDVTSAGGTTMGATTAVNNGSGTTV
DVTATQLVFTAQPSASVVTSVNMGPVTLQAQDTAGNVDTNFIETVTLTDENQGAETDATGTLSTTSNGNSLAVAATAGQV
SWADLTYNVIAAINIDANSTSFNVESSNVSVTGNTDGDLTASAGVTEPIALPTTVTTTGAAVDIFDFTLTDGGGGDGLAM
DISQIVVNVTGTGDENKVVFRLNGPDVTNVVGTVGADTITFSGLSISVADGLSEVYTVNAYYGDNTGLTEGQTYILSVDG
DTDVTSAGGTTMGATTAVNNGGGTTVDVTATQLVFSVQPSATVATSVNMGPVTLQAQDAAGNVDTDFTETITLTDENQGA
ETNALGTLSTTSNGNSLAVAATAGQVSWADLTYNVIAAINIDANSTSFNVESSNVSVTGNIDGDLTASAGVTEPIALPTT
VTTTGAAVDIFDFTLTDGGSSDGLTMDISQIVVNVTGTGDENKVVFRLNGPDVTNVVGTVGADTITFSGLSISVADGLSE
VYTVNAYYGDNTGLTEGQTYILSVDGDTDVTSAGGTTMGATTAVNNGGGTTVDVTATQLVFSVQPSATVATSVNMGPVTL
QAQDAAGNVDTDFTETITLTDENQGAETNALGTLSTTSNGNSLAVAATAGQVSWADLTYNVIAAINIDANSTSFNVESSN
VSVTGNIDGDLTASAGVTEPIALPTTVTTTGAAVDIFDFTLTDGGSSDGLTMDISQIVVNVTGTGDENKVVFRLNGPDVT
NVVGTVGADTITFSGLSISVADGLSEVYTVNAYYGDNTGLTEGQTYILSVDGDTNVTSAGGTTMGATTAVNNGSGTTVDV
TATQLVFTAQPVSAVIQGANMGPVTLQAQDAAGNVDTDFTETITLTDENQGAETNALGTLSTTSNGNSLAVAATAGQVSW
ANLTYNAIAAINIDANSTSFNVESGFVTVSTNNTAPVITQGTSTAVTMDEDGSPTSFSLTLNATDAQGNTLIWSIQTPAI
NGTASVSGTGTSKVIGYTPNQDFNGSDSFAVKVDDGNGLSDSITVNLAIAPINDVTVITDQAVSTGEEVALAITLSGTDA
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DEVTLLSGESIEILVLGNDTDADGDTLTVVASSADLGATTVQNNSTVLYQSLAGFVGDTVVQYGITDGNDGNATAEILIH
VLAMDDESLPVITLPENIDINASGFLTQVDLGVAVAVDSSGNPVPVTLLDDTNYFTPGRHFVYWQAVDAKGNSVTAAQMV
KVNPVIYLSQEQTVAEGQNVTVDILLNGASPDYPLEINYSLLGSADVSDHDLTDTVLVIESGIEGHIEFRTYDDEISEGD
ELLQLTLDPLLNSNSITHNIIITENNIAPIVSLDVQQDGISSILLSQRGGDVVVISTLFDGNKDDNHIYDWSASSEELID
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DNIAACNILVEQVDQNSNFLIEGDNSGCLSLGAAVMGGESGGAILSDGSVQSNSIPEDSETINIGGIFDFIISQIIKGQV
YPITLPQLQPIPTDAVYRKYLPGIGWTNFVEDANNQIASAQGEAGYCPSPDSEDYQLGLTEGYWCVRLMIEDGGPNDADG
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LGDDEISYVISDNNGGNDNARVAIQIRNRSPIVNNDLAYTNSGVTIIIDVLGNDTDADNDQLTIVSATAEFGFVSINEEQ
TLKYTSSASFIGTDTIEYLVSDGVGGTGQGTVEVIVFATPSTSTKSSGGGALNFYWILLILIYLYGVRSKVNS

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA