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The map label for this gene is tuaB [H]

Identifier: 157369834

GI number: 157369834

Start: 1737697

End: 1739136

Strand: Direct

Name: tuaB [H]

Synonym: Spro_1591

Alternate gene names: 157369834

Gene position: 1737697-1739136 (Clockwise)

Preceding gene: 157369833

Following gene: 157369835

Centisome position: 31.89

GC content: 32.92

Gene sequence:

>1440_bases
ATGAATGATAACATAAAAAAAAATACGATATCAGGACTGCTCTGGAGTGCGGTGGAGCGATTTTCTGTCCAGGGATTTCA
GTTTATAGTCAGTATTGTTCTTGCCCGTATTATCTCTCCAGCAGAGTTTGGTTTAGTCGGTATAATCTTGGTATTCATTC
TTATATCTGACATTATAATAAATAGTGGTTTTTCCCAAGCTTTGATTCAAAAGAAAAATAGGAATAACACAGACCTATCT
ACTGTGTTTTATTTTAATATCGTAATTGGAATTGTTTTATATATTTTACTTTTTGCATTGTCACCAAGTATTTCAAGTTA
TTATAATAAACCAGAATTGGAAGGCATTCTTAAAATGCTATCGATTGTGGTTATGATTAAACCACTATACTTAGTGCAAA
TGACTATATTGTCTATAAAACTGAACTTTAAGCTTAGAACTAAAATAAATCTCATTAGTGCATTAATTAGTGGGGTTGTA
GCTATTATCTTGGCAAATAAAGGTTTTGGAGTATATTCCCTTGTTTGGCAACAGATAATTAATAACTCACTGATTGTGTT
GCTCTCATTTGTTTTTATCAGATGGTTCCCTGCATTAGTTTTTTCACTTGACTCACTTGTTAGTCTGTTTGGATTTGGTT
CCAAGTTGCTTATCGCAGGTTTGGTTAGAAGCATAGTAGATAATGGATATGCAATATTGATTGGTAGATATCTCTCAATT
AAAGATGTGGGTCTTTATACACAAGGGAGAAATATTCCTGATCTTATATCAATGAATCTATTTACTATACTGCAAAATGT
TTTCTTTCCGGTAATGTCCAGTTTGCAAAATGATCGAGAATCGTTGATTAAATTTTATCACCGCGGAATTGAAGGTGTCG
CTTTCATTATAATTCCTGTGATGGTAGGTTTAATGTTAATATCAGAGCCATTCGTCAGGTATTTTCTTTCAGCTCAGTGG
GAGGGAGCTATTATCGTGATGCAATGGATAGCGTTATCACGACTTATAATTCCTATTAGTGCATTAAATTGTAGTTTGAT
TAATGCTGTCGGTCGTTCTGATGCTTACTTGAGAATCGATCTTGCTAAATTGCCTATTACTATCGCGGCATTATTATTGA
CCGTACCATACGGTTTAAAAGTTGTAGTTATAGGGAGTGCGCTTGTATCGTTTATTTGCTTTTTTATCAATGCATACTAT
CCTGGAAAATGGTTTGGATATGGGGCGTTTAAGCAAATAAAAACCATGGCACCTATTGTTTTCTGTGCTTTAGTTATGGC
CCTATCGATATACTTTATTCATTTAGAAAATGGTTTATATGAGATTTTAATTAAAGTTTTTTTGGGGGCCGCTGTATATT
ATTTTTGCGCATTAATCATGAAAATAAAAACCTGCCAAGAAATAAACTCTGTTTTTTTGAAAAGAATTTTCAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTATCGAATGTAAGTCTATTTGCATTGTAATTATTTGAATGTGATTTAAATGTTAGAGAGGATGTTTTATGTTAAT
GCCATCAAGAGAAAGATGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTATTAAGACAGTTTCGTGAATAAGAGGTTACGTCTTGAAGAATATAGTCTTTATCATGCCGTATTTAGGATGGAC
AGGTGCTGAGCGCGTTGTTT

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 479; Mature: 479

Protein sequence:

>479_residues
MNDNIKKNTISGLLWSAVERFSVQGFQFIVSIVLARIISPAEFGLVGIILVFILISDIIINSGFSQALIQKKNRNNTDLS
TVFYFNIVIGIVLYILLFALSPSISSYYNKPELEGILKMLSIVVMIKPLYLVQMTILSIKLNFKLRTKINLISALISGVV
AIILANKGFGVYSLVWQQIINNSLIVLLSFVFIRWFPALVFSLDSLVSLFGFGSKLLIAGLVRSIVDNGYAILIGRYLSI
KDVGLYTQGRNIPDLISMNLFTILQNVFFPVMSSLQNDRESLIKFYHRGIEGVAFIIIPVMVGLMLISEPFVRYFLSAQW
EGAIIVMQWIALSRLIIPISALNCSLINAVGRSDAYLRIDLAKLPITIAALLLTVPYGLKVVVIGSALVSFICFFINAYY
PGKWFGYGAFKQIKTMAPIVFCALVMALSIYFIHLENGLYEILIKVFLGAAVYYFCALIMKIKTCQEINSVFLKRIFKK

Sequences:

>Translated_479_residues
MNDNIKKNTISGLLWSAVERFSVQGFQFIVSIVLARIISPAEFGLVGIILVFILISDIIINSGFSQALIQKKNRNNTDLS
TVFYFNIVIGIVLYILLFALSPSISSYYNKPELEGILKMLSIVVMIKPLYLVQMTILSIKLNFKLRTKINLISALISGVV
AIILANKGFGVYSLVWQQIINNSLIVLLSFVFIRWFPALVFSLDSLVSLFGFGSKLLIAGLVRSIVDNGYAILIGRYLSI
KDVGLYTQGRNIPDLISMNLFTILQNVFFPVMSSLQNDRESLIKFYHRGIEGVAFIIIPVMVGLMLISEPFVRYFLSAQW
EGAIIVMQWIALSRLIIPISALNCSLINAVGRSDAYLRIDLAKLPITIAALLLTVPYGLKVVVIGSALVSFICFFINAYY
PGKWFGYGAFKQIKTMAPIVFCALVMALSIYFIHLENGLYEILIKVFLGAAVYYFCALIMKIKTCQEINSVFLKRIFKK
>Mature_479_residues
MNDNIKKNTISGLLWSAVERFSVQGFQFIVSIVLARIISPAEFGLVGIILVFILISDIIINSGFSQALIQKKNRNNTDLS
TVFYFNIVIGIVLYILLFALSPSISSYYNKPELEGILKMLSIVVMIKPLYLVQMTILSIKLNFKLRTKINLISALISGVV
AIILANKGFGVYSLVWQQIINNSLIVLLSFVFIRWFPALVFSLDSLVSLFGFGSKLLIAGLVRSIVDNGYAILIGRYLSI
KDVGLYTQGRNIPDLISMNLFTILQNVFFPVMSSLQNDRESLIKFYHRGIEGVAFIIIPVMVGLMLISEPFVRYFLSAQW
EGAIIVMQWIALSRLIIPISALNCSLINAVGRSDAYLRIDLAKLPITIAALLLTVPYGLKVVVIGSALVSFICFFINAYY
PGKWFGYGAFKQIKTMAPIVFCALVMALSIYFIHLENGLYEILIKVFLGAAVYYFCALIMKIKTCQEINSVFLKRIFKK

Specific function: Might be involved in the translocation of teichuronic acid repeating units from the inner to the outer surface of the membrane [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788359, Length=365, Percent_Identity=27.3972602739726, Blast_Score=130, Evalue=1e-31,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53649; Mature: 53649

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNDNIKKNTISGLLWSAVERFSVQGFQFIVSIVLARIISPAEFGLVGIILVFILISDIII
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSGFSQALIQKKNRNNTDLSTVFYFNIVIGIVLYILLFALSPSISSYYNKPELEGILKML
CCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHH
SIVVMIKPLYLVQMTILSIKLNFKLRTKINLISALISGVVAIILANKGFGVYSLVWQQII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
NNSLIVLLSFVFIRWFPALVFSLDSLVSLFGFGSKLLIAGLVRSIVDNGYAILIGRYLSI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHCE
KDVGLYTQGRNIPDLISMNLFTILQNVFFPVMSSLQNDRESLIKFYHRGIEGVAFIIIPV
EECCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
MVGLMLISEPFVRYFLSAQWEGAIIVMQWIALSRLIIPISALNCSLINAVGRSDAYLRID
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE
LAKLPITIAALLLTVPYGLKVVVIGSALVSFICFFINAYYPGKWFGYGAFKQIKTMAPIV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FCALVMALSIYFIHLENGLYEILIKVFLGAAVYYFCALIMKIKTCQEINSVFLKRIFKK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNDNIKKNTISGLLWSAVERFSVQGFQFIVSIVLARIISPAEFGLVGIILVFILISDIII
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSGFSQALIQKKNRNNTDLSTVFYFNIVIGIVLYILLFALSPSISSYYNKPELEGILKML
CCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHH
SIVVMIKPLYLVQMTILSIKLNFKLRTKINLISALISGVVAIILANKGFGVYSLVWQQII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
NNSLIVLLSFVFIRWFPALVFSLDSLVSLFGFGSKLLIAGLVRSIVDNGYAILIGRYLSI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHCE
KDVGLYTQGRNIPDLISMNLFTILQNVFFPVMSSLQNDRESLIKFYHRGIEGVAFIIIPV
EECCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
MVGLMLISEPFVRYFLSAQWEGAIIVMQWIALSRLIIPISALNCSLINAVGRSDAYLRID
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE
LAKLPITIAALLLTVPYGLKVVVIGSALVSFICFFINAYYPGKWFGYGAFKQIKTMAPIV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FCALVMALSIYFIHLENGLYEILIKVFLGAAVYYFCALIMKIKTCQEINSVFLKRIFKK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 10048024; 9384377 [H]