| Definition | Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002662 |
| Length | 2,365,589 |
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The map label for this gene is yuhH
Identifier: 15673979
GI number: 15673979
Start: 2075482
End: 2077335
Strand: Reverse
Name: yuhH
Synonym: L58914
Alternate gene names: NA
Gene position: 2077335-2075482 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15673982
Following gene: 15673978
Centisome position: 87.81
GC content: 32.79
Gene sequence:
>1854_bases ATGAAAATTATTCTTCTGTTTAGAGAAAGTATGGGGGAGTTTAGGAGTATGGTGAGAAAAAAAGCTAAGAAGAAAAAGAA TGCTAATCGGCCACTTGGTTTGATTTTTAAATATTTGCGAGAGTTTTCTAAGTTTTGGTTTGAATATCTTTCGATTTTTG TTGGGGCAACTATAGTCATCACACTTGTTATTATTCCACTTTTAGAATCCATTTCTGAGCTTATTATGCGAGTTAGTGGA ATTCCTTATGTTTCTTATAATAATCTTGGAAACTTGCTTCAGCAGCATTTCTTAGGAGTTTTGGGGCTCGTAGTTGTCTT GTTTGTGCTCATATTTTTGGTTTATCTGCAATTCATCGTTCAGTTTCAAGGAATTCGTTTGATTCAGGCGAGAACTTTTA GTTTAAAAAGTTTATTTAGGCAAGTTATTTCGGATCTTAAAAATGTCAGAATTCAACAATTAGTCTTTTTCGTATTTTAT TTTCTATTAATTATTCCTTTTGGACGTTATGTTTTTAGTACGCCACTTTTGTCGAAAATTAAAATTCCTGTTTTTACATT TGAATTTTTCTTTAAAAGTTGGCAAAATATGCTAATTTTGTTCCTATTTTATGCTATAACATTTTGGATTAGTACCCGTT TAATTTTGACTCTTCCACTGATGATTTTAAAAGGTCAATCATTGAAAGTAGCAATAAAAGAAAGTTTAAAACGAACAAAA GGAGTTAGAAATTTTTTCAGACTATCTGTTTATTTTGGACTTATCGGTTTATTTAGTATAATAATGCAGGGGCTTCTTTT TATGGGCGGCTACTTTGCCCAAGATTATTTGGATAAAACTTCTTTTGCCCTTGTGGGAGCAGTGTCAATACTGGATTTGA TTTGGTTGGGAAGCTCTATTATATCTACCTTGAGTTTGGTCATGCTTTTTAGTTACTTGATGAGAGAAGCTGACTTGGAA GCCTTTGAAATTTCAGAAGTAGTAAAAAAATCTCCGAAAGTTAGAAGAAAATATAAAATAATTTTTTCTACTTTAGCTGT TTTAATTTTTGCTTTAGTGAGCTGGACTTATGTTGAAGGATTTATGGATACTGTCCCTTTAACCATTTCACATCGGGGAG TTGATGAAGAAAATGGGGTGCAAAATACAATTCCAGCCATGGAAGCTACGGCTAAATCAAAACCAGATTATGTTGAAATG GATATTCAGGAAACAAAAGACCATCAATTTGTTGTTTTCCATGATCCAACTTTAAAAGATTTAGCTGGAATTGATATTCC GCCACAAAAACTTACCTTAGCAGAATTGACGAATACAGTTGTTTCGGAAAATGGGAAAAAGGCTTTAATCTCAAGTTTTG ATGATTATTTAGCGGCTGCAGAAAAATTTAACCAAAAATTACTGGTTGAGATTAAAGTTTCTCCATTTGATTCTCCAAAG ATGGTTGAAAATTTTAGTAAAAAATATGGTGCACGGCTTTTAAAAGATAAGGCTATGATCCATTCTTTAGATTATAATGC CCTTTTAATTGAACAAAAAATTAATCCTAAGATTAAAGTGAGTTTCATCCTTCCCTTCAACTTACTTTTCCCACAAACTA AGATGTCGGCCTATACCATGGAGGCCACAACACTCAATAGTAGTTTTGTGGATAAAGCTCAGGCAAGAAAGCAGATGGTT TTTGCTTGGACGGTCAATGACGAAACGGATATGAGAGAACAGATGTTCAATGGAGTAGATGGAATTATTACAGATAATCT TGATGACTTAAAAGAAGTTATCGCCGAGGATGATGATAATCCGAGCTATGCGCAACGTATTTTAAGAATGACTTCAATAA TAAATATAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCCGAAAAAGGGAAATTCAAATATGTTATAATAAATAAAACTTTTATTTATTATAACTTAAATTTAAGCATTTTTTATTT TATAAATTTGATATAATGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases GATTGAAAAGAGGAATGTATGTTAAAAGTAACAAATCTAACAGGTGGCTATTTGGGGCATCCTGTCTTAAAAGACCTTAA TTTTGAAATTAAAGAAGGAG
Product: hypothetical protein
Products: alcohol; sn-glycerol 3-phosphate
Alternate protein names: Glycerophosphodiester Phosphodiesterase; Glycerophosphoryl Diester Phosphodiesterase Family Protein; Glycerophosphodiester Phosphodiesterase Family Protein; Periplasmic Glycerophosphoryl Diester Phosphodiesterase; Glycerophosphodiesterase; GLPQ Related Phosphodiesterase; Ypothetical Protein SMU.
Number of amino acids: Translated: 617; Mature: 617
Protein sequence:
>617_residues MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVITLVIIPLLESISELIMRVSG IPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIVQFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFY FLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSIISTLSLVMLFSYLMREADLE AFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEM DIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLNSSFVDKAQARKQMV FAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDNPSYAQRILRMTSIINIE
Sequences:
>Translated_617_residues MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVITLVIIPLLESISELIMRVSG IPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIVQFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFY FLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSIISTLSLVMLFSYLMREADLE AFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEM DIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLNSSFVDKAQARKQMV FAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDNPSYAQRILRMTSIINIE >Mature_617_residues MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVITLVIIPLLESISELIMRVSG IPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIVQFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFY FLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSIISTLSLVMLFSYLMREADLE AFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEM DIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLNSSFVDKAQARKQMV FAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDNPSYAQRILRMTSIINIE
Specific function: Unknown
COG id: COG4781
COG function: function code C; Membrane domain of membrane-anchored glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: 3.1.4.46
Molecular weight: Translated: 70862; Mature: 70862
Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVI CEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLVIIPLLESISELIMRVSGIPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKI HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH KIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTLSLVMLFSYLMREADLEAFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEMDIQETKDHQFVVFHDPTLKD HHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHCCHHHHHCCCCCCEEEECHHCCCCCEEEEEECCCHHH LAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCHH MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHCCCHHHHHEEE EATTLNSSFVDKAQARKQMVFAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDN EHHHCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCC PSYAQRILRMTSIINIE HHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVI CEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLVIIPLLESISELIMRVSGIPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKI HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH KIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTLSLVMLFSYLMREADLEAFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEMDIQETKDHQFVVFHDPTLKD HHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHCCHHHHHCCCCCCEEEECHHCCCCCEEEEEECCCHHH LAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCHH MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHCCCHHHHHEEE EATTLNSSFVDKAQARKQMVFAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDN EHHHCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCC PSYAQRILRMTSIINIE HHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: glycerophosphodiester; H2O
Specific reaction: A glycerophosphodiester + H2O = an alcohol + sn-glycerol 3-phosphate
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA