Definition Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome.
Accession NC_002662
Length 2,365,589

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The map label for this gene is yuhH

Identifier: 15673979

GI number: 15673979

Start: 2075482

End: 2077335

Strand: Reverse

Name: yuhH

Synonym: L58914

Alternate gene names: NA

Gene position: 2077335-2075482 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15673982

Following gene: 15673978

Centisome position: 87.81

GC content: 32.79

Gene sequence:

>1854_bases
ATGAAAATTATTCTTCTGTTTAGAGAAAGTATGGGGGAGTTTAGGAGTATGGTGAGAAAAAAAGCTAAGAAGAAAAAGAA
TGCTAATCGGCCACTTGGTTTGATTTTTAAATATTTGCGAGAGTTTTCTAAGTTTTGGTTTGAATATCTTTCGATTTTTG
TTGGGGCAACTATAGTCATCACACTTGTTATTATTCCACTTTTAGAATCCATTTCTGAGCTTATTATGCGAGTTAGTGGA
ATTCCTTATGTTTCTTATAATAATCTTGGAAACTTGCTTCAGCAGCATTTCTTAGGAGTTTTGGGGCTCGTAGTTGTCTT
GTTTGTGCTCATATTTTTGGTTTATCTGCAATTCATCGTTCAGTTTCAAGGAATTCGTTTGATTCAGGCGAGAACTTTTA
GTTTAAAAAGTTTATTTAGGCAAGTTATTTCGGATCTTAAAAATGTCAGAATTCAACAATTAGTCTTTTTCGTATTTTAT
TTTCTATTAATTATTCCTTTTGGACGTTATGTTTTTAGTACGCCACTTTTGTCGAAAATTAAAATTCCTGTTTTTACATT
TGAATTTTTCTTTAAAAGTTGGCAAAATATGCTAATTTTGTTCCTATTTTATGCTATAACATTTTGGATTAGTACCCGTT
TAATTTTGACTCTTCCACTGATGATTTTAAAAGGTCAATCATTGAAAGTAGCAATAAAAGAAAGTTTAAAACGAACAAAA
GGAGTTAGAAATTTTTTCAGACTATCTGTTTATTTTGGACTTATCGGTTTATTTAGTATAATAATGCAGGGGCTTCTTTT
TATGGGCGGCTACTTTGCCCAAGATTATTTGGATAAAACTTCTTTTGCCCTTGTGGGAGCAGTGTCAATACTGGATTTGA
TTTGGTTGGGAAGCTCTATTATATCTACCTTGAGTTTGGTCATGCTTTTTAGTTACTTGATGAGAGAAGCTGACTTGGAA
GCCTTTGAAATTTCAGAAGTAGTAAAAAAATCTCCGAAAGTTAGAAGAAAATATAAAATAATTTTTTCTACTTTAGCTGT
TTTAATTTTTGCTTTAGTGAGCTGGACTTATGTTGAAGGATTTATGGATACTGTCCCTTTAACCATTTCACATCGGGGAG
TTGATGAAGAAAATGGGGTGCAAAATACAATTCCAGCCATGGAAGCTACGGCTAAATCAAAACCAGATTATGTTGAAATG
GATATTCAGGAAACAAAAGACCATCAATTTGTTGTTTTCCATGATCCAACTTTAAAAGATTTAGCTGGAATTGATATTCC
GCCACAAAAACTTACCTTAGCAGAATTGACGAATACAGTTGTTTCGGAAAATGGGAAAAAGGCTTTAATCTCAAGTTTTG
ATGATTATTTAGCGGCTGCAGAAAAATTTAACCAAAAATTACTGGTTGAGATTAAAGTTTCTCCATTTGATTCTCCAAAG
ATGGTTGAAAATTTTAGTAAAAAATATGGTGCACGGCTTTTAAAAGATAAGGCTATGATCCATTCTTTAGATTATAATGC
CCTTTTAATTGAACAAAAAATTAATCCTAAGATTAAAGTGAGTTTCATCCTTCCCTTCAACTTACTTTTCCCACAAACTA
AGATGTCGGCCTATACCATGGAGGCCACAACACTCAATAGTAGTTTTGTGGATAAAGCTCAGGCAAGAAAGCAGATGGTT
TTTGCTTGGACGGTCAATGACGAAACGGATATGAGAGAACAGATGTTCAATGGAGTAGATGGAATTATTACAGATAATCT
TGATGACTTAAAAGAAGTTATCGCCGAGGATGATGATAATCCGAGCTATGCGCAACGTATTTTAAGAATGACTTCAATAA
TAAATATAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCCGAAAAAGGGAAATTCAAATATGTTATAATAAATAAAACTTTTATTTATTATAACTTAAATTTAAGCATTTTTTATTT
TATAAATTTGATATAATGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTGAAAAGAGGAATGTATGTTAAAAGTAACAAATCTAACAGGTGGCTATTTGGGGCATCCTGTCTTAAAAGACCTTAA
TTTTGAAATTAAAGAAGGAG

Product: hypothetical protein

Products: alcohol; sn-glycerol 3-phosphate

Alternate protein names: Glycerophosphodiester Phosphodiesterase; Glycerophosphoryl Diester Phosphodiesterase Family Protein; Glycerophosphodiester Phosphodiesterase Family Protein; Periplasmic Glycerophosphoryl Diester Phosphodiesterase; Glycerophosphodiesterase; GLPQ Related Phosphodiesterase; Ypothetical Protein SMU.

Number of amino acids: Translated: 617; Mature: 617

Protein sequence:

>617_residues
MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVITLVIIPLLESISELIMRVSG
IPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIVQFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFY
FLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK
GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSIISTLSLVMLFSYLMREADLE
AFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEM
DIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK
MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLNSSFVDKAQARKQMV
FAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDNPSYAQRILRMTSIINIE

Sequences:

>Translated_617_residues
MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVITLVIIPLLESISELIMRVSG
IPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIVQFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFY
FLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK
GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSIISTLSLVMLFSYLMREADLE
AFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEM
DIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK
MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLNSSFVDKAQARKQMV
FAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDNPSYAQRILRMTSIINIE
>Mature_617_residues
MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVITLVIIPLLESISELIMRVSG
IPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIVQFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFY
FLLIIPFGRYVFSTPLLSKIKIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK
GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSIISTLSLVMLFSYLMREADLE
AFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEGFMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEM
DIQETKDHQFVVFHDPTLKDLAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK
MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTMEATTLNSSFVDKAQARKQMV
FAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDNPSYAQRILRMTSIINIE

Specific function: Unknown

COG id: COG4781

COG function: function code C; Membrane domain of membrane-anchored glycerophosphoryl diester phosphodiesterase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: 3.1.4.46

Molecular weight: Translated: 70862; Mature: 70862

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVI
CEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLVIIPLLESISELIMRVSGIPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKI
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
KIPVFTFEFFFKSWQNMLILFLFYAITFWISTRLILTLPLMILKGQSLKVAIKESLKRTK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISTLSLVMLFSYLMREADLEAFEISEVVKKSPKVRRKYKIIFSTLAVLIFALVSWTYVEG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FMDTVPLTISHRGVDEENGVQNTIPAMEATAKSKPDYVEMDIQETKDHQFVVFHDPTLKD
HHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHCCHHHHHCCCCCCEEEECHHCCCCCEEEEEECCCHHH
LAGIDIPPQKLTLAELTNTVVSENGKKALISSFDDYLAAAEKFNQKLLVEIKVSPFDSPK
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCHH
MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHCCCHHHHHEEE
EATTLNSSFVDKAQARKQMVFAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDN
EHHHCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCC
PSYAQRILRMTSIINIE
HHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKIILLFRESMGEFRSMVRKKAKKKKNANRPLGLIFKYLREFSKFWFEYLSIFVGATIVI
CEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLVIIPLLESISELIMRVSGIPYVSYNNLGNLLQQHFLGVLGLVVVLFVLIFLVYLQFIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFQGIRLIQARTFSLKSLFRQVISDLKNVRIQQLVFFVFYFLLIIPFGRYVFSTPLLSKI
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
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GVRNFFRLSVYFGLIGLFSIIMQGLLFMGGYFAQDYLDKTSFALVGAVSILDLIWLGSSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCEEEECCCCCCCCCCCHHCCHHHHHCCCCCCEEEECHHCCCCCEEEEEECCCHHH
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HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCHH
MVENFSKKYGARLLKDKAMIHSLDYNALLIEQKINPKIKVSFILPFNLLFPQTKMSAYTM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECHHHHCCCHHHHHEEE
EATTLNSSFVDKAQARKQMVFAWTVNDETDMREQMFNGVDGIITDNLDDLKEVIAEDDDN
EHHHCCHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCC
PSYAQRILRMTSIINIE
HHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: glycerophosphodiester; H2O

Specific reaction: A glycerophosphodiester + H2O = an alcohol + sn-glycerol 3-phosphate

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA