Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ykcF

Identifier: 15672982

GI number: 15672982

Start: 1027714

End: 1029315

Strand: Direct

Name: ykcF

Synonym: L27464

Alternate gene names: NA

Gene position: 1027714-1029315 (Clockwise)

Preceding gene: 15672981

Following gene: 15672983

Centisome position: 43.44

GC content: 34.39

Gene sequence:

>1602_bases
ATGAATAATATAGTATTTATTAAGTATAAAAAAGGATTCTGTCTTGCATTAATGATAGGAATCTTTCTTTTAATTAACGG
GATTGCTATTTCTTTGACGCAAGTGTTGAACGCAGATCACATCATTGCGCTTTTGTTAGGAAATATTCTTTTAATAGCAG
CCTATTTTTATTTTGTTGGAATTTATAAATTATCGAAAAAACTTTTTGACTCGAAGAATAAAAATGAAACTACTGACAAG
TCTGTCAGTAAAATTGAGTTACTTACAGACTTGTCAGTAACAAAATATTATCGAATAAGCTTTTGGTTAGTAGCTTTGTT
AACTTTTATCTTGCCGTTTCTTTTTATGATTCATGTGCCTGATAGTAAGCATGCTTGGGACTATTTCGTTATATTTAATT
CTACGACAGAACTCCATGGTCAATCTTTTGGACTGTTACCTGAAACTGCTTCGCGTTTAGGATATTTTCTTCGTTATCCA
AATAATCAATTTTTAGGGATTTTATTTAATCAAGTTTTCTCACCATTTGCAGGAAGTGTTGAACTAAAAATGTGGGTTGT
GACAGCAGTGTCTGCACTGTTGACAAGTCTCGGAGTTTTAGCTGGAACCTTAAGTGTTAAGGCTTTGAGCGGGAAAAGAC
ATGCGCTCTTATACAATGTTTGTGCTCTCGGGTTCTTACCTTTTTACGTTTATGGTGCACAACTCTATAGTGATACGATT
ACACTTCCTTTTGTATCCTTTAGTTTGTTGTTCTTTATATATGCCATTAAATCACAAAAAATAACTCAACAAGTTCTATG
GTATTTTTTGGCAACAGTATTGGCAGTTATAGGTTATGAATTTAAGCCAACAGTGTTAATTGTGCTTATTGCTGTTTTGA
TTTTCCTTGGACTTAATAAAAAATGGAAACAACTTTTGCTTTTACTCCCAATGTTTGCTATTTTATTTGTTGGGGGACAT
TTCATGGTTAAAGCAACTATTGCGACCGAGCCAGCTTTTTCTCAAGAGGCTAATGAACGTCGTAATCTTCCGATGATGCA
CTGGATTGCTATGTCTTGGTCGCCAACTAATAAAACGGGTGGATTCAATAAGAAAGTGAGGCTTTATTCTGAATCTTTCC
CAACTTATGAAGCGAAAAAAGAGGCTGATAAACAACTCTTCATAGACAATCTTAAGAAGATGGGACCTGTCGGAGTTGTG
CGACAAATTGGACGTAAGTTGGCCTATACTTGGTTATATGGTGATTTGAACAGTTCGTTTTATACTTATCATCATGAAAA
TAAATTTATTAATCGTTACTTTGATTATTTATCAGGAACCTCATTTTCTTTGGATGGCCCTGGTAATATAACAGGTTGGT
TTATGCTAAAGGCTGTTCAAACCCTTTATTGGATTGGCCTAGTTGTTTTACTGTGGCGTCAAATCTGGCGAATTTTAATC
AGCAAGAGAAATTGGTCAAATCCCTGGTTTATTCCAGCTTTGGCCTTTGTTGGATTGAGTTTTTTCCTTATTCTATGGGA
AACAAATTCACGTTACCTTTATCAATTTGCCCCTGTTATGATTGCTTTAGCAAGTTTAGGTTTAATAGATAAGCAGTTTT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAGTGTAGTTTATAAATGCGAAGTAAAAAATGAGAAATTATCATCTAAAAATTAAGGTTATTGTAAGAAACAAAAGCCA
AGCTATGGTAAAATGGTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGAAAAAAATTAAGGAGTGAATATGACTAAGATTCTTTATATGGTCGTGCCATGTTACAATGAAGAACTGGTACTTGAT
GAAACTTCCGAACGTCTCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 533; Mature: 533

Protein sequence:

>533_residues
MNNIVFIKYKKGFCLALMIGIFLLINGIAISLTQVLNADHIIALLLGNILLIAAYFYFVGIYKLSKKLFDSKNKNETTDK
SVSKIELLTDLSVTKYYRISFWLVALLTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYP
NNQFLGILFNQVFSPFAGSVELKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHALLYNVCALGFLPFYVYGAQLYSDTI
TLPFVSFSLLFFIYAIKSQKITQQVLWYFLATVLAVIGYEFKPTVLIVLIAVLIFLGLNKKWKQLLLLLPMFAILFVGGH
FMVKATIATEPAFSQEANERRNLPMMHWIAMSWSPTNKTGGFNKKVRLYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNLKKMGPVGVV
RQIGRKLAYTWLYGDLNSSFYTYHHENKFINRYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIWRILI
SKRNWSNPWFIPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDKQF

Sequences:

>Translated_533_residues
MNNIVFIKYKKGFCLALMIGIFLLINGIAISLTQVLNADHIIALLLGNILLIAAYFYFVGIYKLSKKLFDSKNKNETTDK
SVSKIELLTDLSVTKYYRISFWLVALLTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYP
NNQFLGILFNQVFSPFAGSVELKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHALLYNVCALGFLPFYVYGAQLYSDTI
TLPFVSFSLLFFIYAIKSQKITQQVLWYFLATVLAVIGYEFKPTVLIVLIAVLIFLGLNKKWKQLLLLLPMFAILFVGGH
FMVKATIATEPAFSQEANERRNLPMMHWIAMSWSPTNKTGGFNKKVRLYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNLKKMGPVGVV
RQIGRKLAYTWLYGDLNSSFYTYHHENKFINRYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIWRILI
SKRNWSNPWFIPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDKQF
>Mature_533_residues
MNNIVFIKYKKGFCLALMIGIFLLINGIAISLTQVLNADHIIALLLGNILLIAAYFYFVGIYKLSKKLFDSKNKNETTDK
SVSKIELLTDLSVTKYYRISFWLVALLTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYP
NNQFLGILFNQVFSPFAGSVELKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHALLYNVCALGFLPFYVYGAQLYSDTI
TLPFVSFSLLFFIYAIKSQKITQQVLWYFLATVLAVIGYEFKPTVLIVLIAVLIFLGLNKKWKQLLLLLPMFAILFVGGH
FMVKATIATEPAFSQEANERRNLPMMHWIAMSWSPTNKTGGFNKKVRLYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNLKKMGPVGVV
RQIGRKLAYTWLYGDLNSSFYTYHHENKFINRYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIWRILI
SKRNWSNPWFIPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDKQF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60995; Mature: 60995

Theoretical pI: Translated: 10.09; Mature: 10.09

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNIVFIKYKKGFCLALMIGIFLLINGIAISLTQVLNADHIIALLLGNILLIAAYFYFVG
CCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYKLSKKLFDSKNKNETTDKSVSKIELLTDLSVTKYYRISFWLVALLTFILPFLFMIHVP
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
DSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYPNNQFLGILFNQVFSPFAGSV
CCCCCEEEEEEEECCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCE
ELKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHALLYNVCALGFLPFYVYGAQLYSDTI
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TLPFVSFSLLFFIYAIKSQKITQQVLWYFLATVLAVIGYEFKPTVLIVLIAVLIFLGLNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KWKQLLLLLPMFAILFVGGHFMVKATIATEPAFSQEANERRNLPMMHWIAMSWSPTNKTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCC
GFNKKVRLYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNLKKMGPVGVVRQIGRKLAYTWLYGDLNSSF
CCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCE
YTYHHENKFINRYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIWRILI
EEEECCHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKRNWSNPWFIPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDKQF
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNNIVFIKYKKGFCLALMIGIFLLINGIAISLTQVLNADHIIALLLGNILLIAAYFYFVG
CCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IYKLSKKLFDSKNKNETTDKSVSKIELLTDLSVTKYYRISFWLVALLTFILPFLFMIHVP
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
DSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYPNNQFLGILFNQVFSPFAGSV
CCCCCEEEEEEEECCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCE
ELKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHALLYNVCALGFLPFYVYGAQLYSDTI
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TLPFVSFSLLFFIYAIKSQKITQQVLWYFLATVLAVIGYEFKPTVLIVLIAVLIFLGLNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
KWKQLLLLLPMFAILFVGGHFMVKATIATEPAFSQEANERRNLPMMHWIAMSWSPTNKTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCC
GFNKKVRLYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNLKKMGPVGVVRQIGRKLAYTWLYGDLNSSF
CCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCE
YTYHHENKFINRYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIWRILI
EEEECCHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKRNWSNPWFIPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDKQF
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA