Definition Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome.
Accession NC_002662
Length 2,365,589

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The map label for this gene is yihD

Identifier: 15672834

GI number: 15672834

Start: 873509

End: 876700

Strand: Direct

Name: yihD

Synonym: L73264

Alternate gene names: NA

Gene position: 873509-876700 (Clockwise)

Preceding gene: 15672832

Following gene: 15672835

Centisome position: 36.93

GC content: 38.63

Gene sequence:

>3192_bases
ATGAAAAAAATACGGCCAGAAGTGACTACTGTTACCTCCAAGTCTCATTTTCGAACTTGGAAATCAGGGAAAAGTTGGTT
ATTTGCTACTTCAGCATTAGCTATAATTATCGTTTCCGGAACGATTACTGACCAAAATGTAAAAGCGGACACAGCAATTG
ATAGTAGTCAGCAAATTAGTGGTATTACTGAGGTAACAAGTTATTCAGCACTAGCTTCATCGACAAATAGTGATGTAGCT
GCTAGTCAAAATCAAGTTGCTTACGAACAAGCTAGTGACCAAAGTTCTAATAAATCACTGGCTAACACAGTAGAAACTGA
TACTGAGGGAATAACTTCAAATGTGTCAGATAGTAGCAACTCAATTAATGAAAGCCAAAATACGACAAGTACGGTGGTTA
TTCAAACTCCTACAAACAATATCGTATCGCTTGCAGATTCAAGCTCATCAAATGATAATGGCAGCAATTCTATATTAAGT
TCTTCTAATGCTGCAGACAGTGTTGATTCGGCAGTTGGGTCTCAAAGTTCAACAAGTTCATCAGGAGTTTTGAGTGAAAG
TTCAGCAATTGATAGTGGTATTGCATCAGTTTCTCAAAGTTCGGAAATGAATCTTGTGGGAAATAGTAGTGCTAGTGCTT
CGAGTGCTGCTGTCGCTTCTTTTACAGCTATTCTAGCGACTAATCCGTCCATGGTGCCAATGCTTACTCAGGCACTAGCT
GCAGCAGCGCCTGCTACAACAAGTGGTTCAGCTATTCTTAACACAACACTTGGAGATCTTGTAAATCAAGCAATTTCGAC
AGTGGGAATTAGTGGTTTAGCAAATATTTTTAGCACTCTTGGAACTTTTAATATTCCAGGAATGACTACAGCCGCGGCAG
CTCTTAATGGTGTTGAACAAATCGTCAATATTGTTGGAAATATTCAGGAAGCAGCTGCTAATCCTGGAGCCTTTCTATTA
AATGAAATAAAATCTGCAGGTTTAGATGTTAGCCAAATTCCATTAGTTGGAGGGCAAATTGCGGCGGCATTTAATGCTAT
CCCATCAATGAGCCCTGCTGCTATGCTTACTTTTCTTGAAAATCCAACAATTCCAGGACTTTCAAGTATTCCGGGGGCAA
GTCTAGTACTAAGCCCAGTACTTAGCGCAATAAGTACTGTAACAAGTGGGATTGTTAATCAACTTAATACGACAACTTCC
AATGCCTTGGGTGGTGTTAATTTTGATTTAGACACACTTGTCTCTCTTCAAGGAAATGATCTTGTCAACTACTTGGCTGG
TTTAGTAGTTAATTCAGCGATTAATCGAGTAGGTCAAATTGCTTGGAGTCAATTATCTCCAACTATTAGTAATATTCCAC
TTGTAGGTACTACAGTTAATAATGTTTTAAGCCCAACATTAAATAATCTTACTGGAGCATCTTTGGGAGAAGTTGCGAAT
TTAACGGGAGTTTCCAGCCTTCTTGACCAAGTAAATAATAGTTTGGGTAATCTTATAAGCCTTGGTTCAACAGCCTTAGC
CACGATTGAGAACACGCTCCAAAATAGTCTAAACTCATTTGGTAATCTTCCTGCTGGTGCTTCGGATATTCTTAACCAAG
TGCTCAATCAATTGCAAAATGCGATCAATAATATTGTTGAAAGTGCGACGGGGATTGTAAATAATTTACCAGGTCTTGGA
GCTATCGAAAATGGTCTTTCGAACACTATTAGTCAAATACCAAATAATATTAATAATTTCGTTAATAATGCACTTAATGG
AATAACGACAATTATCAATTCTTTAACTCCAAGTGTTGGTGCTTCAACAGTTAATCCAAATTCTAGTGCTAATAGTAGCC
AATCAAGCAGTAGTGCCAGTTCTTCATCAAGTGCAGCTAGTAGTTCAACTTCATCTTCAAATGTATCAAGCAACACGAGT
TCTAATTCTAGTGAAGCAAATACTTCAAGTTCGACTTCTAATGCTTCAAGTTCAAGCTCAAGCTCAGAGGGTTCAAGTGC
TTCAAGTTCAAATTCCAGTGAAAGTAGTGTTGCCAGTTCATCTTCGGTAGACTCGAGTCAGTCAAGTTCAGCTGGGGTAA
ATAGCTCAAGTTCAAGCGCAGAAGGTTCAAGTGCTTCAAGTTCAAATTCCAGTGAAAGTAGTGTTGCCAGTTCATCTTCG
GTAGACTCGAGTCAGTCAAGTTCAGCTGGAGTAAATGGCTCAAGTTCAAGCTCAGAGAGTTCAAGTGCTTCAAGTTCAAA
TTCCAGTGAAGGTAGTGTTGCCAGTTCATCTTCGGTGGACTCGAGTCAGTCAAGTTCAGCTGGGGTAAATAGCTCAAGTT
CAAGCGCAGAAGGTTCAAGTGCTTCAAGTTCAAATTCCAGCGAAAGTAGTATTGCCAGTTCATCTTCTGTGGGCTCAAGT
CAGTCAAGTTCTACTGGGGTAAGTAGCTCAAGTTCAAGCGCAGAAGGTTCAAGTGCTTCAAGTTCAAATTCCAGTGAAAG
TAGTGTTGCCAGTTCATCTTCGGTAGACTCGAGTCAGTCAAGTTCAGCTGGGGTAAATAGCTCAAGTTCAAGCTCAGAAG
GTTCAAGTGCTTCAAGTTCAAATTTCAGTGAAAGTAGTATTGGCAGTTCATCTTCGGTAGACTCAAGTCAATCAAGTTCA
AGCACAGAAGGTTCAAGTGCTTCAAGCTTAAGTTCAAGTGAAAGTAGTATGACAAGTTCTGGTGGGACAAGTGATTCAAA
TTCAAACACTGGTCAAACTAGTACTACAAGTTCATCTTCTAAAAATTCAAGTCATTCGAGTCTGAGTTCAAATGAATCAA
GTAGTGCAAGTTTGACTTCATCTGAGTCAAGTGGTTCAACAACATCTTCAAGTATGTTGACTAATCCAAATTTACAATCT
AATGATAAAAATGGCTCAAGTCTAACTTCAAATAGTTCGTATACTTCAGAAGTGAAACTAAATAACTTGAGTCACTCAAA
TTTATCTTCAAATGAAGCAAAAGTTTCGACTTTAATTTCTAAGGTATCAAGTAGTCCAAGTCTTTCAAGTTCATTAAGCG
CAATGAGCTTGCAACTTGTACCAACTGTAACGAAAGAAGAGCTTCCCAAAACAGGTGCTGATGATGATTTAAGTTTAGTA
TTAGCAGAATTGAGATTGGGATTAGTGGCAACGTTAACTATTGGAAAAGTTAAATATAAAAAAAGGTTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAATAATAACTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAG
TATCGGCAAGGAGAGAATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAGTATATTTTAATTAAGGACTTCTTTTCTTTGGAAAGAAGTTTCTTTTTAATTTGGAATTATTCCTTTATTAAAAATT
ACGAACAATTTAAAATAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1063; Mature: 1063

Protein sequence:

>1063_residues
MKKIRPEVTTVTSKSHFRTWKSGKSWLFATSALAIIIVSGTITDQNVKADTAIDSSQQISGITEVTSYSALASSTNSDVA
ASQNQVAYEQASDQSSNKSLANTVETDTEGITSNVSDSSNSINESQNTTSTVVIQTPTNNIVSLADSSSSNDNGSNSILS
SSNAADSVDSAVGSQSSTSSSGVLSESSAIDSGIASVSQSSEMNLVGNSSASASSAAVASFTAILATNPSMVPMLTQALA
AAAPATTSGSAILNTTLGDLVNQAISTVGISGLANIFSTLGTFNIPGMTTAAAALNGVEQIVNIVGNIQEAAANPGAFLL
NEIKSAGLDVSQIPLVGGQIAAAFNAIPSMSPAAMLTFLENPTIPGLSSIPGASLVLSPVLSAISTVTSGIVNQLNTTTS
NALGGVNFDLDTLVSLQGNDLVNYLAGLVVNSAINRVGQIAWSQLSPTISNIPLVGTTVNNVLSPTLNNLTGASLGEVAN
LTGVSSLLDQVNNSLGNLISLGSTALATIENTLQNSLNSFGNLPAGASDILNQVLNQLQNAINNIVESATGIVNNLPGLG
AIENGLSNTISQIPNNINNFVNNALNGITTIINSLTPSVGASTVNPNSSANSSQSSSSASSSSSAASSSTSSSNVSSNTS
SNSSEANTSSSTSNASSSSSSSEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSS
VDSSQSSSAGVNGSSSSSESSSASSSNSSEGSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSSASSSNSSESSIASSSSVGSS
QSSSTGVSSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSSEGSSASSSNFSESSIGSSSSVDSSQSSS
STEGSSASSLSSSESSMTSSGGTSDSNSNTGQTSTTSSSSKNSSHSSLSSNESSSASLTSSESSGSTTSSSMLTNPNLQS
NDKNGSSLTSNSSYTSEVKLNNLSHSNLSSNEAKVSTLISKVSSSPSLSSSLSAMSLQLVPTVTKEELPKTGADDDLSLV
LAELRLGLVATLTIGKVKYKKRF

Sequences:

>Translated_1063_residues
MKKIRPEVTTVTSKSHFRTWKSGKSWLFATSALAIIIVSGTITDQNVKADTAIDSSQQISGITEVTSYSALASSTNSDVA
ASQNQVAYEQASDQSSNKSLANTVETDTEGITSNVSDSSNSINESQNTTSTVVIQTPTNNIVSLADSSSSNDNGSNSILS
SSNAADSVDSAVGSQSSTSSSGVLSESSAIDSGIASVSQSSEMNLVGNSSASASSAAVASFTAILATNPSMVPMLTQALA
AAAPATTSGSAILNTTLGDLVNQAISTVGISGLANIFSTLGTFNIPGMTTAAAALNGVEQIVNIVGNIQEAAANPGAFLL
NEIKSAGLDVSQIPLVGGQIAAAFNAIPSMSPAAMLTFLENPTIPGLSSIPGASLVLSPVLSAISTVTSGIVNQLNTTTS
NALGGVNFDLDTLVSLQGNDLVNYLAGLVVNSAINRVGQIAWSQLSPTISNIPLVGTTVNNVLSPTLNNLTGASLGEVAN
LTGVSSLLDQVNNSLGNLISLGSTALATIENTLQNSLNSFGNLPAGASDILNQVLNQLQNAINNIVESATGIVNNLPGLG
AIENGLSNTISQIPNNINNFVNNALNGITTIINSLTPSVGASTVNPNSSANSSQSSSSASSSSSAASSSTSSSNVSSNTS
SNSSEANTSSSTSNASSSSSSSEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSS
VDSSQSSSAGVNGSSSSSESSSASSSNSSEGSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSSASSSNSSESSIASSSSVGSS
QSSSTGVSSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSSEGSSASSSNFSESSIGSSSSVDSSQSSS
STEGSSASSLSSSESSMTSSGGTSDSNSNTGQTSTTSSSSKNSSHSSLSSNESSSASLTSSESSGSTTSSSMLTNPNLQS
NDKNGSSLTSNSSYTSEVKLNNLSHSNLSSNEAKVSTLISKVSSSPSLSSSLSAMSLQLVPTVTKEELPKTGADDDLSLV
LAELRLGLVATLTIGKVKYKKRF
>Mature_1063_residues
MKKIRPEVTTVTSKSHFRTWKSGKSWLFATSALAIIIVSGTITDQNVKADTAIDSSQQISGITEVTSYSALASSTNSDVA
ASQNQVAYEQASDQSSNKSLANTVETDTEGITSNVSDSSNSINESQNTTSTVVIQTPTNNIVSLADSSSSNDNGSNSILS
SSNAADSVDSAVGSQSSTSSSGVLSESSAIDSGIASVSQSSEMNLVGNSSASASSAAVASFTAILATNPSMVPMLTQALA
AAAPATTSGSAILNTTLGDLVNQAISTVGISGLANIFSTLGTFNIPGMTTAAAALNGVEQIVNIVGNIQEAAANPGAFLL
NEIKSAGLDVSQIPLVGGQIAAAFNAIPSMSPAAMLTFLENPTIPGLSSIPGASLVLSPVLSAISTVTSGIVNQLNTTTS
NALGGVNFDLDTLVSLQGNDLVNYLAGLVVNSAINRVGQIAWSQLSPTISNIPLVGTTVNNVLSPTLNNLTGASLGEVAN
LTGVSSLLDQVNNSLGNLISLGSTALATIENTLQNSLNSFGNLPAGASDILNQVLNQLQNAINNIVESATGIVNNLPGLG
AIENGLSNTISQIPNNINNFVNNALNGITTIINSLTPSVGASTVNPNSSANSSQSSSSASSSSSAASSSTSSSNVSSNTS
SNSSEANTSSSTSNASSSSSSSEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSS
VDSSQSSSAGVNGSSSSSESSSASSSNSSEGSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSSASSSNSSESSIASSSSVGSS
QSSSTGVSSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSSEGSSASSSNFSESSIGSSSSVDSSQSSS
STEGSSASSLSSSESSMTSSGGTSDSNSNTGQTSTTSSSSKNSSHSSLSSNESSSASLTSSESSGSTTSSSMLTNPNLQS
NDKNGSSLTSNSSYTSEVKLNNLSHSNLSSNEAKVSTLISKVSSSPSLSSSLSAMSLQLVPTVTKEELPKTGADDDLSLV
LAELRLGLVATLTIGKVKYKKRF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 104548; Mature: 104548

Theoretical pI: Translated: 3.85; Mature: 3.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
0.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
0.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKIRPEVTTVTSKSHFRTWKSGKSWLFATSALAIIIVSGTITDQNVKADTAIDSSQQIS
CCCCCCCHHEECCHHHHHHHHCCCCEEEHHHCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHCCCHHHHC
GITEVTSYSALASSTNSDVAASQNQVAYEQASDQSSNKSLANTVETDTEGITSNVSDSSN
CHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
SINESQNTTSTVVIQTPTNNIVSLADSSSSNDNGSNSILSSSNAADSVDSAVGSQSSTSS
CCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC
SGVLSESSAIDSGIASVSQSSEMNLVGNSSASASSAAVASFTAILATNPSMVPMLTQALA
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
AAAPATTSGSAILNTTLGDLVNQAISTVGISGLANIFSTLGTFNIPGMTTAAAALNGVEQ
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
IVNIVGNIQEAAANPGAFLLNEIKSAGLDVSQIPLVGGQIAAAFNAIPSMSPAAMLTFLE
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHC
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CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHHEECCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AINNIVESATGIVNNLPGLGAIENGLSNTISQIPNNINNFVNNALNGITTIINSLTPSVG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
SSEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCC
VDSSQSSSAGVNGSSSSSESSSASSSNSSEGSVASSSSVDSSQSSSAGVNSSSSSAEGSS
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
ASSSNSSESSIASSSSVGSSQSSSTGVSSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQS
CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCC
SSAGVNSSSSSSEGSSASSSNFSESSIGSSSSVDSSQSSSSTEGSSASSLSSSESSMTSS
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHCC
GGTSDSNSNTGQTSTTSSSSKNSSHSSLSSNESSSASLTSSESSGSTTSSSMLTNPNLQS
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
NDKNGSSLTSNSSYTSEVKLNNLSHSNLSSNEAKVSTLISKVSSSPSLSSSLSAMSLQLV
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHEEEEC
PTVTKEELPKTGADDDLSLVLAELRLGLVATLTIGKVKYKKRF
CCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCHHEECCHHHHHHHHCCCCEEEHHHCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHCCCHHHHC
GITEVTSYSALASSTNSDVAASQNQVAYEQASDQSSNKSLANTVETDTEGITSNVSDSSN
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CCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCC
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ASSSNSSESSIASSSSVGSSQSSSTGVSSSSSSAEGSSASSSNSSESSVASSSSVDSSQS
CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCC
SSAGVNSSSSSSEGSSASSSNFSESSIGSSSSVDSSQSSSSTEGSSASSLSSSESSMTSS
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHHHHCC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
NDKNGSSLTSNSSYTSEVKLNNLSHSNLSSNEAKVSTLISKVSSSPSLSSSLSAMSLQLV
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHEEEEC
PTVTKEELPKTGADDDLSLVLAELRLGLVATLTIGKVKYKKRF
CCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA