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The map label for this gene is 15669399

Identifier: 15669399

GI number: 15669399

Start: 1156527

End: 1159583

Strand: Reverse

Name: 15669399

Synonym: MJ1214

Alternate gene names: NA

Gene position: 1159583-1156527 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15669400

Following gene: 15669398

Centisome position: 69.65

GC content: 27.18

Gene sequence:

>3057_bases
GTGAATAAAATGCCGATTCCGGAGATTTACGTCCATAATGATATAGAAGAGAATTTAAATAAATTAGGTTGGAAAGAATT
GGAGGGATATGAAGGGGAGGCATTTAGCAACTACATAATAAAACCAATATTAGAGGAGCAACTAAAAATTATAAACGACC
ACATAGGAGAATATAAAGATGAATTTATTGAGAAAGCAATAAATAAACTAATAAATGAACCAAAACCAGAGGAGATTTTA
GATTATATTAAAAATGGAATATTAATAACCTTAGATAAGGGAAGAAAAGGGCAAGTTTCTAATAGAGTTAAATTAATTGA
TTATAAAAATATTGAGAAAAATATCTTCAATTATGCCCACGAATTGAAATTTAAAGGAAACGACAACATTATCCCAGATT
TTACCCTATTTATTAATGGAATTCCCATAATTATTATAGAGGCAAAAAGAGAATTTTCTGAAAAAGAAACTTATGAAGAG
GCGATAAATCAAATAAATAGATATGAAAGGGAAGCTCCTAAACTATTCAACTATGTGCAGTTTGCCATTGTTTATGGAGA
TGAAAAACTTTATATCCCAACATATCCAAACGAAGAAAAAGAAGATAGATTTAAAAAGCCATACAAATGGAAAAATGAGA
AAAAAGAGGAAGATATTTGGGATTTATTAAAAAGGGAGAGAGTTTTAGATACAATAAAGAACTTTATATTTTTTAGTAAA
GACAGGGCTGGAAGAAAAACTAAAATTATCCCGAGATATATGCAATATTGGGCAGTAAAAAAAGCTTATGAAAGAATAAC
CAACTACCTAAACAACAAAGATTATAAAAATAGGGGATTAGTTTGGCATTGGCAAGGTAGTGGAAAAACCTTCGAAATTT
TATATTTGGCGGAGTTATTTTATAATGAATTTAAAAACAAAGACCCTATTGTTTTTATAATGGTGGATAGGAGAGAGTTA
GAGACTCAATTTAATGATGATATCATTGCCTTACAAAATGCGAATTTTAAAGATTGCTTCAAAAAAATTAACAGTGTTGA
AGAACTTAAAGGAGTTTTAGAGGACATAAAAGAGTCAGAAAATAACCCAAATATTTCAGAGAAGGGCGTTTATTTGGTTA
TGATGCACAAATTTGATAAAAATAAATTAAAGGACTTTATAGAATCTTTTGGCTCAATTGATAAAAAAGAAATTTTGATT
TTGAGGGATGAAGCTCATAGAACTGAATCAGGTAAATTTGCCACCCTAAGAAACAAAATTTTAAAAAACGCCATTGCCAT
TGGTTTTACTGGAACTCCCGTTCATAAAAAAGATATGAGCACATTTAAAGAATATGCCTATCCACAAGAAGGAGAGTTTT
ATTTAGATAGGTTTTTTATTGAGGAATCGATAAAAGAGGGCTTTACTTTGCCTTTAATCTGGAGAGTTGTTAAACCAGAG
GATATAAAAGATATCTCAGAGGAAGAAATAAAAAACATTATAGAAAAATTGTTTGTTGATGAAGAAGATGCTGATAAGAT
TGTTGTATCCAAAAAAGAAATTGCCGAGAAAATAAAATTATCTGATTTATTAAAAAGTGAAAGCAGTATAAAAGAGGCAT
CAAAATACATAGCAGAGCATATTTTAGAAGACACTGAAAACTTTAAATTCAAAGCCATGGTTGTAGCTCAAGATAGAAAA
TCATGCATTTTGTTTAAAAAATATTTAGACGAATATCTTAAGGAAAAAATAAAAAACTACAATGAGAACTGGACTCAGGT
TGTTATTACATATATTCACAATGATGATGTAGAAATTGAGAATTATAAAAAAGAGATTGAAAAAAAATATGGTAAAAATG
TAGATGAATTAAACAAAAAATGGACTGAAGATTTTATAAATAAAGAAAATCCAAAAATTTTAATTGTCAATAAAAAACTA
TTGACCGGTTTTGATGCTCCAATATTAAAAACTATCTACATCCACCAATTTCTTAAAGATTATCTCTTACTTCAAGCATC
TGCAAGGGCAAACAGACCAGCAAAAAATAAAAAATATGGACTTATTGTTGATTTAACAGGAATATTAATTGAAAACTACA
AAAAGGCAATTGAGAACTATAACCTATACAGAGATGAAGCAATAAATAAGGATATTTTAAACAACTTATTTGTTGAAACA
TCAAAAATCTGGGAGAGCTTTTTAACGAAGTTAAATGAGTTTAAAGAGTTGTTTAAGTTAATTGTAGGGATTGAGTTTGA
TGATTTCATTGTAAATCTAAAAAAACAGAAAAACTCAAAAGAATTTAAAAAAATTATAAGCAAAATTATCCTAAGTGATA
AATTTGACTATTTCTATGCAAAACTTAGAGAACTTATTCAATTATTTGAGGCTGTTGGGGCTTATGGAGAAAAGTTAAAT
TATTACGAAACCTATGAATGGCTAAAAATAATATCTGCTGGAATAAATAAGCAGATGAGACCTAAAAGTTATAAAATTCC
TTACAATCAAATAAAAAAGGAAGTAATAAAATATTTAGAGTTTGATACTTATGCAGACATTGCTTCAACCTCAATAAATC
CTCAACTATTGGAGAATTTAAAAAATAAAGATGAAATTAATGTAATAGTTGCAGATATGATCTATTATGCTTTAGATACA
CTTCAAAATAAAAAAGAGCCAATATATAGGATGATATACGACAGAATAAACGAGTTAAAAAACGCATATATTTCAAAAAC
TAAAAAAAATGAGTATGTGATTAATGAACTAATAAATTGCTTAAATGCATTAAAAACCTACGAAGAGGAGGAAAAAACAT
TATCAAAATCAGAAAAGGCAATAAAAAATATGCTGTTTTATTTAAAGAATGTAGAGAACTGCAATATTAAAAAACTTCCA
CTAACTGAAAAGACCTTAAAAAATTTGGAAGATAAAAAATTAATAAAACCAAGTGATTTTGATAAAATTAAGAAATTCTT
ATTTGTTGATTTGAAAAATGCTATTAAAGAAACTGAAAAAAGAAGAAAAGTATCAAATAAAATAGTTGAAGAAATTATTA
AACCAATTTTTATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGAATATTTTAAATATCAAAGTTGATTTAATTACAAAAAACTCAATTTAAAATCCATACATTAAAAAATCCATTGAGGA
AGATTTAATTTTTATTTCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTGATATAATGAAAGATAGAAAAATATTAAACGAAATATTGAGTAATACAATAAATGAACTAAACCTAAATGACAAAAA
AGCAAACATAAAAATCAAAA

Product: type I restriction-modification enzyme 1 subunit R

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1018; Mature: 1018

Protein sequence:

>1018_residues
MNKMPIPEIYVHNDIEENLNKLGWKELEGYEGEAFSNYIIKPILEEQLKIINDHIGEYKDEFIEKAINKLINEPKPEEIL
DYIKNGILITLDKGRKGQVSNRVKLIDYKNIEKNIFNYAHELKFKGNDNIIPDFTLFINGIPIIIIEAKREFSEKETYEE
AINQINRYEREAPKLFNYVQFAIVYGDEKLYIPTYPNEEKEDRFKKPYKWKNEKKEEDIWDLLKRERVLDTIKNFIFFSK
DRAGRKTKIIPRYMQYWAVKKAYERITNYLNNKDYKNRGLVWHWQGSGKTFEILYLAELFYNEFKNKDPIVFIMVDRREL
ETQFNDDIIALQNANFKDCFKKINSVEELKGVLEDIKESENNPNISEKGVYLVMMHKFDKNKLKDFIESFGSIDKKEILI
LRDEAHRTESGKFATLRNKILKNAIAIGFTGTPVHKKDMSTFKEYAYPQEGEFYLDRFFIEESIKEGFTLPLIWRVVKPE
DIKDISEEEIKNIIEKLFVDEEDADKIVVSKKEIAEKIKLSDLLKSESSIKEASKYIAEHILEDTENFKFKAMVVAQDRK
SCILFKKYLDEYLKEKIKNYNENWTQVVITYIHNDDVEIENYKKEIEKKYGKNVDELNKKWTEDFINKENPKILIVNKKL
LTGFDAPILKTIYIHQFLKDYLLLQASARANRPAKNKKYGLIVDLTGILIENYKKAIENYNLYRDEAINKDILNNLFVET
SKIWESFLTKLNEFKELFKLIVGIEFDDFIVNLKKQKNSKEFKKIISKIILSDKFDYFYAKLRELIQLFEAVGAYGEKLN
YYETYEWLKIISAGINKQMRPKSYKIPYNQIKKEVIKYLEFDTYADIASTSINPQLLENLKNKDEINVIVADMIYYALDT
LQNKKEPIYRMIYDRINELKNAYISKTKKNEYVINELINCLNALKTYEEEEKTLSKSEKAIKNMLFYLKNVENCNIKKLP
LTEKTLKNLEDKKLIKPSDFDKIKKFLFVDLKNAIKETEKRRKVSNKIVEEIIKPIFI

Sequences:

>Translated_1018_residues
MNKMPIPEIYVHNDIEENLNKLGWKELEGYEGEAFSNYIIKPILEEQLKIINDHIGEYKDEFIEKAINKLINEPKPEEIL
DYIKNGILITLDKGRKGQVSNRVKLIDYKNIEKNIFNYAHELKFKGNDNIIPDFTLFINGIPIIIIEAKREFSEKETYEE
AINQINRYEREAPKLFNYVQFAIVYGDEKLYIPTYPNEEKEDRFKKPYKWKNEKKEEDIWDLLKRERVLDTIKNFIFFSK
DRAGRKTKIIPRYMQYWAVKKAYERITNYLNNKDYKNRGLVWHWQGSGKTFEILYLAELFYNEFKNKDPIVFIMVDRREL
ETQFNDDIIALQNANFKDCFKKINSVEELKGVLEDIKESENNPNISEKGVYLVMMHKFDKNKLKDFIESFGSIDKKEILI
LRDEAHRTESGKFATLRNKILKNAIAIGFTGTPVHKKDMSTFKEYAYPQEGEFYLDRFFIEESIKEGFTLPLIWRVVKPE
DIKDISEEEIKNIIEKLFVDEEDADKIVVSKKEIAEKIKLSDLLKSESSIKEASKYIAEHILEDTENFKFKAMVVAQDRK
SCILFKKYLDEYLKEKIKNYNENWTQVVITYIHNDDVEIENYKKEIEKKYGKNVDELNKKWTEDFINKENPKILIVNKKL
LTGFDAPILKTIYIHQFLKDYLLLQASARANRPAKNKKYGLIVDLTGILIENYKKAIENYNLYRDEAINKDILNNLFVET
SKIWESFLTKLNEFKELFKLIVGIEFDDFIVNLKKQKNSKEFKKIISKIILSDKFDYFYAKLRELIQLFEAVGAYGEKLN
YYETYEWLKIISAGINKQMRPKSYKIPYNQIKKEVIKYLEFDTYADIASTSINPQLLENLKNKDEINVIVADMIYYALDT
LQNKKEPIYRMIYDRINELKNAYISKTKKNEYVINELINCLNALKTYEEEEKTLSKSEKAIKNMLFYLKNVENCNIKKLP
LTEKTLKNLEDKKLIKPSDFDKIKKFLFVDLKNAIKETEKRRKVSNKIVEEIIKPIFI
>Mature_1018_residues
MNKMPIPEIYVHNDIEENLNKLGWKELEGYEGEAFSNYIIKPILEEQLKIINDHIGEYKDEFIEKAINKLINEPKPEEIL
DYIKNGILITLDKGRKGQVSNRVKLIDYKNIEKNIFNYAHELKFKGNDNIIPDFTLFINGIPIIIIEAKREFSEKETYEE
AINQINRYEREAPKLFNYVQFAIVYGDEKLYIPTYPNEEKEDRFKKPYKWKNEKKEEDIWDLLKRERVLDTIKNFIFFSK
DRAGRKTKIIPRYMQYWAVKKAYERITNYLNNKDYKNRGLVWHWQGSGKTFEILYLAELFYNEFKNKDPIVFIMVDRREL
ETQFNDDIIALQNANFKDCFKKINSVEELKGVLEDIKESENNPNISEKGVYLVMMHKFDKNKLKDFIESFGSIDKKEILI
LRDEAHRTESGKFATLRNKILKNAIAIGFTGTPVHKKDMSTFKEYAYPQEGEFYLDRFFIEESIKEGFTLPLIWRVVKPE
DIKDISEEEIKNIIEKLFVDEEDADKIVVSKKEIAEKIKLSDLLKSESSIKEASKYIAEHILEDTENFKFKAMVVAQDRK
SCILFKKYLDEYLKEKIKNYNENWTQVVITYIHNDDVEIENYKKEIEKKYGKNVDELNKKWTEDFINKENPKILIVNKKL
LTGFDAPILKTIYIHQFLKDYLLLQASARANRPAKNKKYGLIVDLTGILIENYKKAIENYNLYRDEAINKDILNNLFVET
SKIWESFLTKLNEFKELFKLIVGIEFDDFIVNLKKQKNSKEFKKIISKIILSDKFDYFYAKLRELIQLFEAVGAYGEKLN
YYETYEWLKIISAGINKQMRPKSYKIPYNQIKKEVIKYLEFDTYADIASTSINPQLLENLKNKDEINVIVADMIYYALDT
LQNKKEPIYRMIYDRINELKNAYISKTKKNEYVINELINCLNALKTYEEEEKTLSKSEKAIKNMLFYLKNVENCNIKKLP
LTEKTLKNLEDKKLIKPSDFDKIKKFLFVDLKNAIKETEKRRKVSNKIVEEIIKPIFI

Specific function: Unknown

COG id: COG0610

COG function: function code V; Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y1214_METJA (Q58611)

Other databases:

- EMBL:   L77117
- PIR:   E64451
- RefSeq:   NP_248209.1
- ProteinModelPortal:   Q58611
- REBASE:   3903
- GeneID:   1452110
- GenomeReviews:   L77117_GR
- KEGG:   mja:MJ_1214
- NMPDR:   fig|243232.1.peg.1246
- TIGR:   MJ1214
- HOGENOM:   HBG321554
- OMA:   INRYERE
- ProtClustDB:   CLSK2517702
- BioCyc:   MJAN243232:MJ_1214-MONOMER
- InterPro:   IPR014001
- InterPro:   IPR004473
- InterPro:   IPR006935
- InterPro:   IPR007409
- SMART:   SM00487
- TIGRFAMs:   TIGR00348

Pfam domain/function: PF04313 HSDR_N; PF04851 ResIII

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 120994; Mature: 120994

Theoretical pI: Translated: 8.77; Mature: 8.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKMPIPEIYVHNDIEENLNKLGWKELEGYEGEAFSNYIIKPILEEQLKIINDHIGEYKD
CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFIEKAINKLINEPKPEEILDYIKNGILITLDKGRKGQVSNRVKLIDYKNIEKNIFNYAH
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
ELKFKGNDNIIPDFTLFINGIPIIIIEAKREFSEKETYEEAINQINRYEREAPKLFNYVQ
HEEECCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAIVYGDEKLYIPTYPNEEKEDRFKKPYKWKNEKKEEDIWDLLKRERVLDTIKNFIFFSK
EEEEECCCEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECC
DRAGRKTKIIPRYMQYWAVKKAYERITNYLNNKDYKNRGLVWHWQGSGKTFEILYLAELF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEHHHHHHHH
YNEFKNKDPIVFIMVDRRELETQFNDDIIALQNANFKDCFKKINSVEELKGVLEDIKESE
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NNPNISEKGVYLVMMHKFDKNKLKDFIESFGSIDKKEILILRDEAHRTESGKFATLRNKI
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HHHCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
KLRELIQLFEAVGAYGEKLNYYETYEWLKIISAGINKQMRPKSYKIPYNQIKKEVIKYLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
NAYISKTKKNEYVINELINCLNALKTYEEEEKTLSKSEKAIKNMLFYLKNVENCNIKKLP
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LTEKTLKNLEDKKLIKPSDFDKIKKFLFVDLKNAIKETEKRRKVSNKIVEEIIKPIFI
CCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCEEECCCHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFIEKAINKLINEPKPEEILDYIKNGILITLDKGRKGQVSNRVKLIDYKNIEKNIFNYAH
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FAIVYGDEKLYIPTYPNEEKEDRFKKPYKWKNEKKEEDIWDLLKRERVLDTIKNFIFFSK
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NYKKEIEKKYGKNVDELNKKWTEDFINKENPKILIVNKKLLTGFDAPILKTIYIHQFLKD
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HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECC
LTEKTLKNLEDKKLIKPSDFDKIKKFLFVDLKNAIKETEKRRKVSNKIVEEIIKPIFI
CCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087