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The map label for this gene is 15669382

Identifier: 15669382

GI number: 15669382

Start: 1139044

End: 1140144

Strand: Reverse

Name: 15669382

Synonym: MJ1196

Alternate gene names: NA

Gene position: 1140144-1139044 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15669385

Following gene: 15669381

Centisome position: 68.48

GC content: 30.61

Gene sequence:

>1101_bases
ATGGGGCATCTAACACTCAAAGATGCGGTATTTTTAACGATAACGTCCATTGTTGGTGGAGGGATTTTTGTTCTATCTCC
ATTAACCTATTTGCTGTTTGGAAAATCTATAATATGGGGTTGGGCTTTACTAATATTTGTGTCTCTAATTATGGCTTCTC
CTTTTGCCTATGCTTCCACTAAAATAAGTGAGAGTGGAGGGGTTTATAAATTTGTAATGAAAATTTTAGGGAGAGAAATT
GGAGTTTTTTCAGCCTATATATTATGGCTCTCTGGAGTTTTTGCTCTATCTGGAGTTGTGTCATTCTTTGAAATAGTTTT
TAATACAAAATTTAACGTTTCTTATGTTGGATTATGTTTGATTGTTATTTTAACAGCTTTAATATTGGGAGGGTTGAGGA
TTGTGGGAAACTTTGTCAGAATCTTTGGAATTTTAACGATAACGATTATTTTATATATCGTATTTTCAAATGGAATAAAA
ATTGACAGCATTGGAGAGTTTAATTTAAAAAATGCTATTTTGACAATATATTTTGGATTATGGACTGCTACTGGTTGGGA
AGGTATAACAATGCCATTGTCAGCATTTAAAAATCAAAAAGCTATAGCTTATGGACTCTTGGTAGGGACTTTTATCATTG
GAGTTTTGTATCTCCTGTTTTCCTTGACCATAGTATCTTTAAATGTAAAAACAAACAACTTAGATGAGATATTAAAGATA
CTGATTGGAGATAACCTATTTTTATTGGCTGGGATGTTATTAATAATTTCCAGCTGTGCGTTTAGTGTTTTATTTACTTT
ATCATATATGCCTTATGGGATGGGAAAAGATAGGATATTCCCAAAGGCATTTATAAAATTAAGGAAGGAGATTCCATACT
ATGGAGTTATTTTAAATACTTTATTAGTTATAATCCTATTAATTTTTGATGCAAAGACTTTGGTGGATATGAGTATGTTT
TCTACATTAATAGCCTATTTTCTGCTATATTTGGCAGTGTTTAAAGAATCTTCAGGTAAAATAAAAGCTATATCATTAAT
CTCTATGCTGATAACTGGATTGTTGATATTATTTAGGGTTTATAACTTTATTATTCTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATATTATCCCTCAATTAAATTTTAGATAAAGATAATTATAAAAGAAAAAGATATATTAAATATTTTTGCTTTGTTTAAT
CAATTTATAAGGGTGTAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGATGAATTAAATGAACTTTAATCTATCATTTTGAAAGGTTAAGTTATAGCGTTTTAATGATATATCTGATTAGGTAAA
ATTTTTATAACATCCCATCA

Product: asoB protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 366; Mature: 365

Protein sequence:

>366_residues
MGHLTLKDAVFLTITSIVGGGIFVLSPLTYLLFGKSIIWGWALLIFVSLIMASPFAYASTKISESGGVYKFVMKILGREI
GVFSAYILWLSGVFALSGVVSFFEIVFNTKFNVSYVGLCLIVILTALILGGLRIVGNFVRIFGILTITIILYIVFSNGIK
IDSIGEFNLKNAILTIYFGLWTATGWEGITMPLSAFKNQKAIAYGLLVGTFIIGVLYLLFSLTIVSLNVKTNNLDEILKI
LIGDNLFLLAGMLLIISSCAFSVLFTLSYMPYGMGKDRIFPKAFIKLRKEIPYYGVILNTLLVIILLIFDAKTLVDMSMF
STLIAYFLLYLAVFKESSGKIKAISLISMLITGLLILFRVYNFIIL

Sequences:

>Translated_366_residues
MGHLTLKDAVFLTITSIVGGGIFVLSPLTYLLFGKSIIWGWALLIFVSLIMASPFAYASTKISESGGVYKFVMKILGREI
GVFSAYILWLSGVFALSGVVSFFEIVFNTKFNVSYVGLCLIVILTALILGGLRIVGNFVRIFGILTITIILYIVFSNGIK
IDSIGEFNLKNAILTIYFGLWTATGWEGITMPLSAFKNQKAIAYGLLVGTFIIGVLYLLFSLTIVSLNVKTNNLDEILKI
LIGDNLFLLAGMLLIISSCAFSVLFTLSYMPYGMGKDRIFPKAFIKLRKEIPYYGVILNTLLVIILLIFDAKTLVDMSMF
STLIAYFLLYLAVFKESSGKIKAISLISMLITGLLILFRVYNFIIL
>Mature_365_residues
GHLTLKDAVFLTITSIVGGGIFVLSPLTYLLFGKSIIWGWALLIFVSLIMASPFAYASTKISESGGVYKFVMKILGREIG
VFSAYILWLSGVFALSGVVSFFEIVFNTKFNVSYVGLCLIVILTALILGGLRIVGNFVRIFGILTITIILYIVFSNGIKI
DSIGEFNLKNAILTIYFGLWTATGWEGITMPLSAFKNQKAIAYGLLVGTFIIGVLYLLFSLTIVSLNVKTNNLDEILKIL
IGDNLFLLAGMLLIISSCAFSVLFTLSYMPYGMGKDRIFPKAFIKLRKEIPYYGVILNTLLVIILLIFDAKTLVDMSMFS
TLIAYFLLYLAVFKESSGKIKAISLISMLITGLLILFRVYNFIIL

Specific function: Unknown

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y1196_METJA (Q58596)

Other databases:

- EMBL:   L77117
- PIR:   C64449
- RefSeq:   NP_248191.1
- ProteinModelPortal:   Q58596
- GeneID:   1452091
- GenomeReviews:   L77117_GR
- KEGG:   mja:MJ_1196
- NMPDR:   fig|243232.1.peg.1228
- TIGR:   MJ1196
- OMA:   IAANACS
- ProtClustDB:   CLSK2517700
- BioCyc:   MJAN243232:MJ_1196-MONOMER
- InterPro:   IPR004841
- InterPro:   IPR002293
- InterPro:   IPR001463
- PANTHER:   PTHR11785
- PRINTS:   PR00175

Pfam domain/function: PF00324 AA_permease

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 40471; Mature: 40340

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xe2e87d8)-; HASH(0xe3fd360)-; HASH(0xe296a8c)-; HASH(0xdf765c8)-; HASH(0xdc17030)-; HASH(0xb278c48)-; HASH(0xe3d0648)-; HASH(0xddcdf98)-; HASH(0xd7244a8)-; HASH(0xde0bc2c)-; HASH(0xd9caba4)-;

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGHLTLKDAVFLTITSIVGGGIFVLSPLTYLLFGKSIIWGWALLIFVSLIMASPFAYAST
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHC
KISESGGVYKFVMKILGREIGVFSAYILWLSGVFALSGVVSFFEIVFNTKFNVSYVGLCL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
IVILTALILGGLRIVGNFVRIFGILTITIILYIVFSNGIKIDSIGEFNLKNAILTIYFGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
WTATGWEGITMPLSAFKNQKAIAYGLLVGTFIIGVLYLLFSLTIVSLNVKTNNLDEILKI
HHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHH
LIGDNLFLLAGMLLIISSCAFSVLFTLSYMPYGMGKDRIFPKAFIKLRKEIPYYGVILNT
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LLVIILLIFDAKTLVDMSMFSTLIAYFLLYLAVFKESSGKIKAISLISMLITGLLILFRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNFIIL
HHHHCH
>Mature Secondary Structure 
GHLTLKDAVFLTITSIVGGGIFVLSPLTYLLFGKSIIWGWALLIFVSLIMASPFAYAST
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHC
KISESGGVYKFVMKILGREIGVFSAYILWLSGVFALSGVVSFFEIVFNTKFNVSYVGLCL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
IVILTALILGGLRIVGNFVRIFGILTITIILYIVFSNGIKIDSIGEFNLKNAILTIYFGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
WTATGWEGITMPLSAFKNQKAIAYGLLVGTFIIGVLYLLFSLTIVSLNVKTNNLDEILKI
HHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHH
LIGDNLFLLAGMLLIISSCAFSVLFTLSYMPYGMGKDRIFPKAFIKLRKEIPYYGVILNT
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LLVIILLIFDAKTLVDMSMFSTLIAYFLLYLAVFKESSGKIKAISLISMLITGLLILFRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNFIIL
HHHHCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087