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The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15645098

GI number: 15645098

Start: 490975

End: 492711

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: HP0470

Alternate gene names: 15645098

Gene position: 492711-490975 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15645099

Following gene: 15645097

Centisome position: 29.54

GC content: 38.57

Gene sequence:

>1737_bases
ATGAAAGAGCAAGAATGGGATTTAAGCGCTTTATTTGAAAATAAAGAAAGCGCAGAAGAATTTTTAAAAACCTTACAAAC
AGAAGCACAAGAATTTGAGAGTGCTTATCAAAATAACCTTAAGAATTTAGACGCTACAGGATTTGCCAACGCTCTTAAAC
ATTACGAAAATTTGTCAGAAAAGATTTCTAGGGTGATGGCTTACGCTCAATTGCTTTTTGCTAAGAACACCAAAGAAGCG
AAGTTTTATTCGCAATGCGAAATGGCTTGCGCGAATATCCAACAACACCTTTTATTCTTTGAAATTGAATTCAAGAACTT
AGACGCCAAAAAACAGCTCGCTTTCATTAAAAAATGCAAAGACCATGCTTTTTATTTGAACAATCTCATAGAAAGGAAAA
AGCACACCCTAAATTTAGATGAAGAAAAGATCGCTCTAGCCCTTTCACCTGTGGGAGTGGGTGCGTTTAGCCGTCTTTTT
GATGAGCATTTTTCTTCTTTGAAAATCCCTTTTGAAGAGCAAAATTTAAGCGAGGAAGAAATTTTAGCCCTCTTGCACAA
CCCCAAACGCAAGATCCGTAAAAAATCTCAAAAAGCTTTCAGTAAAGCGTTAGAAAAATCCCGCCCTTTGCTCACTTACA
TTTTAAACATGGTGCGTAAAGATTTGCTCATTGAAACTAGGCTGAGAAAATACGATAAAAAAGAGAGTTTCCGCCACATT
GACAACCAGATCTCCCAAGAGAGCGTGGATAGCATGATAGAGATCGTGAACGCTAATTTTTCTTTAGTGCATCGTTATTA
TCATCAAAAAGCGCAAATTTTAGGGCATAAACTCAAAGATTATGACCGCTACGCCCCTTTAAACGATGAGAGCATCACCA
TGACTTACTCTCAAGCTTTAGAAGAAGTGCTTAAAACCCTTAAAGCCTTTAGCCCTGAATTTCACAAAATCGCTTCTAAA
GCGATCAAAGAGGGCTGGGTGGATTCACACCCTAAAGACTTTAAGCAAGGTGGGGCTTTTAGCCATGGCGGGGTGCCTAG
CGCTCACCCTTATGTGCTGTTAAACTACACAGGAAATCGCCGAGACGCTTTCACTATCGCTCATGAATTCGGGCATATGA
TCCACCAAGAATTGTCTAAAAAACAAGGCGTATTGAACATGGATACGCCCTTAACCACCGCAGAAACCGCTTCTGTCTTT
TCTGAAATGCTGTTTTTTGAGCATTTAAAAAAGGGTTTAAAATCTGATGAACTCCTTTTCATGCTGGCCGGCAAGTTAGA
AGATATTTTTTCTACCCTTTTTAGGCAAGTGGTGATGACGAATTTTGAAAGAAGAATCCATGAAATGGATGAAGAATTAG
ACACCAAAGATTTTGATCGAATCTGGTTTGAAGAAAATCAAAGAATGTTTGAAAAGAGCGTGAAACTCACTAAAAACTAC
CATTTGTGGTGGAGCTATATCCCCCATTTTATCCATTCGCCTTTTTATTGCTACGCTTATAGTTACGGGCAGCTTTTAAC
TTTGGCGCTTTATGGGCTTTATAAAAAAAGCGACGCTAAAGAGTTTGTTAAAACTTACACGGAATTTTTGAGCTTAGGAG
GGTCAAAAAGCCCTAAAGAATTAGTGTCCATGTTTGGCTTTGACATTGATAGCAAAGAATTTTGGGAAATTGGCATGCAA
GAGGTGCGCCATTTGTTAGAAGAATTTGAAAGGTTGCTCGCATGCAAAGAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATGGCGCAAAAACCAAATGATAAGTTTGCTTGTATTGTGAGTGTTATGTTAAAATACAAGCATATTTTAACTCCAAAT
TGATATAAAAAGGGGATTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCTTTTAAATAACAAGCATTGCATGGAATACTTGCAATTTCTGTCCAAAAACCATTTGAGTTTTAACCTTTTGTGCGAA
AGAGATGCGATTGATTTTTC

Product: oligoendopeptidase F (pepF)

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 578; Mature: 578

Protein sequence:

>578_residues
MKEQEWDLSALFENKESAEEFLKTLQTEAQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYENLSEKISRVMAYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLNDESITMTYSQALEEVLKTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKSDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEMDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN

Sequences:

>Translated_578_residues
MKEQEWDLSALFENKESAEEFLKTLQTEAQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYENLSEKISRVMAYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLNDESITMTYSQALEEVLKTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKSDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEMDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN
>Mature_578_residues
MKEQEWDLSALFENKESAEEFLKTLQTEAQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYENLSEKISRVMAYAQLLFAKNTKEA
KFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCKDHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLF
DEHFSSLKIPFEEQNLSEEEILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLNDESITMTYSQALEEVLKTLKAFSPEFHKIASK
AIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNRRDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVF
SEMLFFEHLKKGLKSDELLFMLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEMDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKELVSMFGFDIDSKEFWEIGMQ
EVRHLLEEFERLLACKEN

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67706; Mature: 67706

Theoretical pI: Translated: 7.04; Mature: 7.04

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKEQEWDLSALFENKESAEEFLKTLQTEAQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYENLSE
CCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KISRVMAYAQLLFAKNTKEAKFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
DHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLFDEHFSSLKIPFEEQNLSEEE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHH
ILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLNDESITMTYSQAL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHH
EEVLKTLKAFSPEFHKIASKAIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNR
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
RDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVFSEMLFFEHLKKGLKSDELLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
MLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEMDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKE
HHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LVSMFGFDIDSKEFWEIGMQEVRHLLEEFERLLACKEN
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKEQEWDLSALFENKESAEEFLKTLQTEAQEFESAYQNNLKNLDATGFANALKHYENLSE
CCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KISRVMAYAQLLFAKNTKEAKFYSQCEMACANIQQHLLFFEIEFKNLDAKKQLAFIKKCK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
DHAFYLNNLIERKKHTLNLDEEKIALALSPVGVGAFSRLFDEHFSSLKIPFEEQNLSEEE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHH
ILALLHNPKRKIRKKSQKAFSKALEKSRPLLTYILNMVRKDLLIETRLRKYDKKESFRHI
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DNQISQESVDSMIEIVNANFSLVHRYYHQKAQILGHKLKDYDRYAPLNDESITMTYSQAL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHH
EEVLKTLKAFSPEFHKIASKAIKEGWVDSHPKDFKQGGAFSHGGVPSAHPYVLLNYTGNR
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCC
RDAFTIAHEFGHMIHQELSKKQGVLNMDTPLTTAETASVFSEMLFFEHLKKGLKSDELLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
MLAGKLEDIFSTLFRQVVMTNFERRIHEMDEELDTKDFDRIWFEENQRMFEKSVKLTKNY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
HLWWSYIPHFIHSPFYCYAYSYGQLLTLALYGLYKKSDAKEFVKTYTEFLSLGGSKSPKE
HHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LVSMFGFDIDSKEFWEIGMQEVRHLLEEFERLLACKEN
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685 [H]