Definition Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70, complete genome.
Accession NC_002663
Length 2,257,487

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The map label for this gene is 15603333

Identifier: 15603333

GI number: 15603333

Start: 1658315

End: 1660336

Strand: Reverse

Name: 15603333

Synonym: PM1468

Alternate gene names: NA

Gene position: 1660336-1658315 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15603335

Following gene: 15603328

Centisome position: 73.55

GC content: 41.69

Gene sequence:

>2022_bases
TTGTTTTTTTTAATGATTCCCTTATTATGCTCAAACAAAAATCACATTGTTTACTGTTATATCCTATATATGATCGAAAA
ATACCCTTTAAACGAAAACAATATTCTCCCTTTTTTGACCACACAGATTGAGCAACAAAATGCCTTTACTTTGTTAAATG
CCGCTTGTCAGTGGATGCGTGCCGGAGGCAAAAAAGAGGCAGCACAACGTTTTCATTACATCACGCAACTATTTTATGAT
GACAAGGTATTGGCGCAGAAAACCGCCAGTCTTTTGTGTCAATGGATTTGCCAACTTCGTTTATATCCCCTGTTTATTAG
TTGTGGGATTTTAGGCAGAGAAGGCTTTGGACGCGAAATTCAAAAACGTTTATATGAACGATTAAACCCCTCTTTCAAAG
ATTTAAACGATTTACGTGATATTTTCTTTGTCCTCTTTTGTGAAGAAAAGGATGCTGACTGGTTACAAGCAGTCGCCATT
CAAGACTGGGTGAGGTTATTGGACGTATTACAACAGCACTGTACGGATCGTGATCGGGAAAATGTGCATAACCACTTGCG
TTATGAGGGCTTGTTCGCCATTGAAATGCTTGCCATTTGGATTGCGGCGGAAGAATTAGAGCCTGAATTGATGCGCTTAG
ATCCTTCGTTATTGGATGCCGATTCGCCTTTCGTCGCATTACAACGCGAAGTATCACACTGGGTCAGCGCACGTCGTCAA
CACTGTCATTATGATGATGCACATTTACAAGTGATGTTTACACAATGTCGTGAACAAATCGATCGCTTACATAAGCGTGG
TTCAAGTGCAGGATCCACCCTCGGTGTTGCTCATTTATTAACCCGTTTAGATCAAACGCTCGATCGTTTAGCTACACTGA
TGGATCTCTTTCAACAGGATCAGCTTCCGCCACGACGTATTTTGATGTTTACCGGTGAATTAGCCGTGGCATCGGCACAA
ACTCACAGTGCAGTGGATTTATGGAAACAAAGTGTCAAAATGCTCGCACGCAGTATTACGCAAAATAAAAGTGATCATGG
AGAACACTATATTACGCGCGATGCAAAAGAATACCGTGCGATGTTTTTTTCGGCGGCTGGTGGGGGCATTTTAATTGCCT
TAATGGCGTTATTTAAACTGTATTTAGGTGATCTGATTGAAGATCGTGTCTGGCGAGGTATTGCTGAAGGGCTGAATTAC
GGTATTGGTTTTACCTTGATTTTTATGTTGCATTGTACTGTGGCGACCAAACAGCCCGCAATGACTGCAGCACGTTTTGC
AGAAACGGTGGATAATGGACAAGGCAAATCCGTTAATCTGCAATTAGCTCAACTGCTGATCGATGTGTTTCGCTCGCAAA
CAGTGGCAGTCTTGGGTAATGTCACTTTAGCGATTTCTGTGGCTTGTTTGCTTGCGCTAGGCTATCAACATTATGTTGGT
ACACCTTTATTGAGTGAGGCAGAGATTGCCTACCAACAAAAATCCCTTGATCCGATGAAAGGGTCCTTATGGTTTGCCGC
CATTGCGGGTTTCTGGTTATTCTTTTCTGGGATTATTTCTGGTTATTTTGATAATCGCAGCAATTATTTGAATCTAAAAA
TGCGACTACGCAATCACCCTATTTTACGCCGTCTGTTGACCCGTAATATGCGCTACAAATTTGCAGAATACTGGCATGAT
AATTACGGTTCGATTATGGGAAATCTGTGTTTTGGTTTATTGCTTGGTTTAACGGGGTTAGTCGGGTACTTGCTTAATTT
ACCGTTGGATATTCGCCATGTGGCGTTTTCTTCTGCGAATTTGGGCTATATGGCGATCAGTGGCGCGTTCACTTGGCAGA
TGTTCTTACAAGGTTTAGTGTTCGTGTTATTGATTGGTATTGTGAATTTGATTGTCAGTTTCTTTATCGCGTTATGGGTT
GCGCTGCGTTCTTTAGAAACAGAAATTGAGAGTTGGTGTGATATCGCGCAATGTGTTTGGAAATTGATTAAACAACGTCC
ACTATCGTTGTTTTTCCCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCGATTTTTTTCAATTAAAGTCGCGAAGCGTCAGTAACAGGTGTGTTTGATTTACATGCAATAAACTGGCACTTTTTATA
CATAATAGACATCTACAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACTGAAAAAGTAAGAAAAAATGACCGCACTGATTGGGTGCGGTTGTTGATTTTATTGAGGATAATGGTTGCGTAGTGCA
TGGATTGCCTGTGTCGGGAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Site-Specific Recombinase Transmembrane Protein; Site-Specific Recombinase Gcr; Site-Specific Recombinase Prophage Insertion; Site-Specific Recombinase-Like Protein; Site-Specific Recombinase Protein Gcr; Adventurous Gliding Motility Protein AgmG; Adventurous Gliding Motility Protein

Number of amino acids: Translated: 673; Mature: 673

Protein sequence:

>673_residues
MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMRAGGKKEAAQRFHYITQLFYD
DKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREIQKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAI
QDWVRLLDVLQQHCTDRDRENVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ
HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQDQLPPRRILMFTGELAVASAQ
THSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRAMFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNY
GIGFTLIFMLHCTVATKQPAMTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG
TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHPILRRLLTRNMRYKFAEYWHD
NYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSANLGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWV
ALRSLETEIESWCDIAQCVWKLIKQRPLSLFFP

Sequences:

>Translated_673_residues
MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMRAGGKKEAAQRFHYITQLFYD
DKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREIQKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAI
QDWVRLLDVLQQHCTDRDRENVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ
HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQDQLPPRRILMFTGELAVASAQ
THSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRAMFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNY
GIGFTLIFMLHCTVATKQPAMTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG
TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHPILRRLLTRNMRYKFAEYWHD
NYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSANLGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWV
ALRSLETEIESWCDIAQCVWKLIKQRPLSLFFP
>Mature_673_residues
MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMRAGGKKEAAQRFHYITQLFYD
DKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREIQKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAI
QDWVRLLDVLQQHCTDRDRENVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ
HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQDQLPPRRILMFTGELAVASAQ
THSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRAMFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNY
GIGFTLIFMLHCTVATKQPAMTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG
TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHPILRRLLTRNMRYKFAEYWHD
NYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSANLGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWV
ALRSLETEIESWCDIAQCVWKLIKQRPLSLFFP

Specific function: Unknown

COG id: COG4389

COG function: function code L; Site-specific recombinase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77132; Mature: 77132

Theoretical pI: Translated: 7.53; Mature: 7.53

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMR
CCEEEEEHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGGKKEAAQRFHYITQLFYDDKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH
QKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAIQDWVRLLDVLQQHCTDRDRE
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
NVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQD
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QLPPRRILMFTGELAVASAQTHSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRA
CCCCHHEEEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHH
MFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNYGIGFTLIFMLHCTVATKQPA
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
MTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG
HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHP
CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHCCH
ILRRLLTRNMRYKFAEYWHDNYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCC
LGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWVALRSLETEIESWCDIAQCVW
CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLIKQRPLSLFFP
HHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMR
CCEEEEEHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGGKKEAAQRFHYITQLFYDDKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREI
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NVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ
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HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQD
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QLPPRRILMFTGELAVASAQTHSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRA
CCCCHHEEEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHH
MFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNYGIGFTLIFMLHCTVATKQPA
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
MTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG
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TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHP
CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHCCH
ILRRLLTRNMRYKFAEYWHDNYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSAN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCC
LGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWVALRSLETEIESWCDIAQCVW
CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLIKQRPLSLFFP
HHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA