| Definition | Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002663 |
| Length | 2,257,487 |
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The map label for this gene is 15603333
Identifier: 15603333
GI number: 15603333
Start: 1658315
End: 1660336
Strand: Reverse
Name: 15603333
Synonym: PM1468
Alternate gene names: NA
Gene position: 1660336-1658315 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15603335
Following gene: 15603328
Centisome position: 73.55
GC content: 41.69
Gene sequence:
>2022_bases TTGTTTTTTTTAATGATTCCCTTATTATGCTCAAACAAAAATCACATTGTTTACTGTTATATCCTATATATGATCGAAAA ATACCCTTTAAACGAAAACAATATTCTCCCTTTTTTGACCACACAGATTGAGCAACAAAATGCCTTTACTTTGTTAAATG CCGCTTGTCAGTGGATGCGTGCCGGAGGCAAAAAAGAGGCAGCACAACGTTTTCATTACATCACGCAACTATTTTATGAT GACAAGGTATTGGCGCAGAAAACCGCCAGTCTTTTGTGTCAATGGATTTGCCAACTTCGTTTATATCCCCTGTTTATTAG TTGTGGGATTTTAGGCAGAGAAGGCTTTGGACGCGAAATTCAAAAACGTTTATATGAACGATTAAACCCCTCTTTCAAAG ATTTAAACGATTTACGTGATATTTTCTTTGTCCTCTTTTGTGAAGAAAAGGATGCTGACTGGTTACAAGCAGTCGCCATT CAAGACTGGGTGAGGTTATTGGACGTATTACAACAGCACTGTACGGATCGTGATCGGGAAAATGTGCATAACCACTTGCG TTATGAGGGCTTGTTCGCCATTGAAATGCTTGCCATTTGGATTGCGGCGGAAGAATTAGAGCCTGAATTGATGCGCTTAG ATCCTTCGTTATTGGATGCCGATTCGCCTTTCGTCGCATTACAACGCGAAGTATCACACTGGGTCAGCGCACGTCGTCAA CACTGTCATTATGATGATGCACATTTACAAGTGATGTTTACACAATGTCGTGAACAAATCGATCGCTTACATAAGCGTGG TTCAAGTGCAGGATCCACCCTCGGTGTTGCTCATTTATTAACCCGTTTAGATCAAACGCTCGATCGTTTAGCTACACTGA TGGATCTCTTTCAACAGGATCAGCTTCCGCCACGACGTATTTTGATGTTTACCGGTGAATTAGCCGTGGCATCGGCACAA ACTCACAGTGCAGTGGATTTATGGAAACAAAGTGTCAAAATGCTCGCACGCAGTATTACGCAAAATAAAAGTGATCATGG AGAACACTATATTACGCGCGATGCAAAAGAATACCGTGCGATGTTTTTTTCGGCGGCTGGTGGGGGCATTTTAATTGCCT TAATGGCGTTATTTAAACTGTATTTAGGTGATCTGATTGAAGATCGTGTCTGGCGAGGTATTGCTGAAGGGCTGAATTAC GGTATTGGTTTTACCTTGATTTTTATGTTGCATTGTACTGTGGCGACCAAACAGCCCGCAATGACTGCAGCACGTTTTGC AGAAACGGTGGATAATGGACAAGGCAAATCCGTTAATCTGCAATTAGCTCAACTGCTGATCGATGTGTTTCGCTCGCAAA CAGTGGCAGTCTTGGGTAATGTCACTTTAGCGATTTCTGTGGCTTGTTTGCTTGCGCTAGGCTATCAACATTATGTTGGT ACACCTTTATTGAGTGAGGCAGAGATTGCCTACCAACAAAAATCCCTTGATCCGATGAAAGGGTCCTTATGGTTTGCCGC CATTGCGGGTTTCTGGTTATTCTTTTCTGGGATTATTTCTGGTTATTTTGATAATCGCAGCAATTATTTGAATCTAAAAA TGCGACTACGCAATCACCCTATTTTACGCCGTCTGTTGACCCGTAATATGCGCTACAAATTTGCAGAATACTGGCATGAT AATTACGGTTCGATTATGGGAAATCTGTGTTTTGGTTTATTGCTTGGTTTAACGGGGTTAGTCGGGTACTTGCTTAATTT ACCGTTGGATATTCGCCATGTGGCGTTTTCTTCTGCGAATTTGGGCTATATGGCGATCAGTGGCGCGTTCACTTGGCAGA TGTTCTTACAAGGTTTAGTGTTCGTGTTATTGATTGGTATTGTGAATTTGATTGTCAGTTTCTTTATCGCGTTATGGGTT GCGCTGCGTTCTTTAGAAACAGAAATTGAGAGTTGGTGTGATATCGCGCAATGTGTTTGGAAATTGATTAAACAACGTCC ACTATCGTTGTTTTTCCCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GCGATTTTTTTCAATTAAAGTCGCGAAGCGTCAGTAACAGGTGTGTTTGATTTACATGCAATAAACTGGCACTTTTTATA CATAATAGACATCTACAACT
Downstream 100 bases:
>100_bases CACTGAAAAAGTAAGAAAAAATGACCGCACTGATTGGGTGCGGTTGTTGATTTTATTGAGGATAATGGTTGCGTAGTGCA TGGATTGCCTGTGTCGGGAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Site-Specific Recombinase Transmembrane Protein; Site-Specific Recombinase Gcr; Site-Specific Recombinase Prophage Insertion; Site-Specific Recombinase-Like Protein; Site-Specific Recombinase Protein Gcr; Adventurous Gliding Motility Protein AgmG; Adventurous Gliding Motility Protein
Number of amino acids: Translated: 673; Mature: 673
Protein sequence:
>673_residues MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMRAGGKKEAAQRFHYITQLFYD DKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREIQKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAI QDWVRLLDVLQQHCTDRDRENVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQDQLPPRRILMFTGELAVASAQ THSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRAMFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNY GIGFTLIFMLHCTVATKQPAMTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHPILRRLLTRNMRYKFAEYWHD NYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSANLGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWV ALRSLETEIESWCDIAQCVWKLIKQRPLSLFFP
Sequences:
>Translated_673_residues MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMRAGGKKEAAQRFHYITQLFYD DKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREIQKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAI QDWVRLLDVLQQHCTDRDRENVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQDQLPPRRILMFTGELAVASAQ THSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRAMFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNY GIGFTLIFMLHCTVATKQPAMTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHPILRRLLTRNMRYKFAEYWHD NYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSANLGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWV ALRSLETEIESWCDIAQCVWKLIKQRPLSLFFP >Mature_673_residues MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMRAGGKKEAAQRFHYITQLFYD DKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREIQKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAI QDWVRLLDVLQQHCTDRDRENVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQDQLPPRRILMFTGELAVASAQ THSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRAMFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNY GIGFTLIFMLHCTVATKQPAMTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHPILRRLLTRNMRYKFAEYWHD NYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSANLGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWV ALRSLETEIESWCDIAQCVWKLIKQRPLSLFFP
Specific function: Unknown
COG id: COG4389
COG function: function code L; Site-specific recombinase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 77132; Mature: 77132
Theoretical pI: Translated: 7.53; Mature: 7.53
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.2 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 5.2 %Cys+Met (Translated Protein) 2.2 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMR CCEEEEEHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGGKKEAAQRFHYITQLFYDDKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH QKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAIQDWVRLLDVLQQHCTDRDRE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH NVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQD CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC QLPPRRILMFTGELAVASAQTHSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRA CCCCHHEEEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHH MFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNYGIGFTLIFMLHCTVATKQPA HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH MTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHP CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHCCH ILRRLLTRNMRYKFAEYWHDNYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSAN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCC LGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWVALRSLETEIESWCDIAQCVW CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLIKQRPLSLFFP HHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFFLMIPLLCSNKNHIVYCYILYMIEKYPLNENNILPFLTTQIEQQNAFTLLNAACQWMR CCEEEEEHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AGGKKEAAQRFHYITQLFYDDKVLAQKTASLLCQWICQLRLYPLFISCGILGREGFGREI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH QKRLYERLNPSFKDLNDLRDIFFVLFCEEKDADWLQAVAIQDWVRLLDVLQQHCTDRDRE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH NVHNHLRYEGLFAIEMLAIWIAAEELEPELMRLDPSLLDADSPFVALQREVSHWVSARRQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH HCHYDDAHLQVMFTQCREQIDRLHKRGSSAGSTLGVAHLLTRLDQTLDRLATLMDLFQQD CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC QLPPRRILMFTGELAVASAQTHSAVDLWKQSVKMLARSITQNKSDHGEHYITRDAKEYRA CCCCHHEEEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHH MFFSAAGGGILIALMALFKLYLGDLIEDRVWRGIAEGLNYGIGFTLIFMLHCTVATKQPA HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCH MTAARFAETVDNGQGKSVNLQLAQLLIDVFRSQTVAVLGNVTLAISVACLLALGYQHYVG HHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC TPLLSEAEIAYQQKSLDPMKGSLWFAAIAGFWLFFSGIISGYFDNRSNYLNLKMRLRNHP CCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHCCH ILRRLLTRNMRYKFAEYWHDNYGSIMGNLCFGLLLGLTGLVGYLLNLPLDIRHVAFSSAN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCC LGYMAISGAFTWQMFLQGLVFVLLIGIVNLIVSFFIALWVALRSLETEIESWCDIAQCVW CCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLIKQRPLSLFFP HHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA