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The map label for this gene is recC [H]

Identifier: 15602826

GI number: 15602826

Start: 1132693

End: 1136067

Strand: Reverse

Name: recC [H]

Synonym: PM0961

Alternate gene names: 15602826

Gene position: 1136067-1132693 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15602827

Following gene: 15602823

Centisome position: 50.32

GC content: 40.24

Gene sequence:

>3375_bases
GTGTTTACAATTTATTATTCTAATGATCTTGATGTACAAAAAAATATTTTGCTCACGTTAATGCAAGATACACTGGATGA
TCCCTTTCAGTCAGACGTGATTTTAGTTCAAAGTCCAGGCATGGCACAGTGGTTGCAATGGAAAATTGCGGAGCAGCAAG
GGATTTCGAGTAATATTAAGTTTCCTATGCCTGCGAGCTTTATTTGGCAACAATACGTAGACAATTTACCGAATACAGAG
GAACAAAGCCAATTTAATAAAGCGTCGATGACATGGCGTTTAATGCGTTTAATTCCCGAACATCTTGAACAAGTCGAATT
TCAATCACTTCGTCATTATTTATCTTCTTCTCATCAAACAGAACAACAAAAGTTGTACCAATTAGCCTACCAAATTGCTG
ATTTATTTGACCAATATCTTGTTTACCGCCCAGAATGGATCGCTTGTTGGGAGCGTGGTGATGAAGCCACTATGATGGCA
CAGTTAGAACGCAAGCTAAAAGATACACGCCTACCAATAGGCAACGCTTTTTCTCAAGATGTTAAATGGCAAGCGATACT
ATGGCGTGCTCTAGTGGCGGATATTTTGGCTGAAAGCGGTCAGACTGTTCCCTTACATCGTGCTTATTTACAAACACAAT
TTTTGCAGTTCTTACAGACCCAGCATCCTGTCAATTTACCTCCACGTCTTTTCATTTTTGGTATCTCAGCGTTGCCAAAA
GGCTATTTAGAAATTTTTTATGCCATGAGTCAGTATTGTGAAGTACATTTATTTTTTACCAATGGCTGTCGTGAATATTG
GGGTGATTTAATTGATCCGCGTTTTATGCAACGCTTAAGCCAAATGCAACGAACTGGCTACCATACCGCTTTACCTATAC
CTGTTTTTCACCATACAGATAATGCCCGATTTGAATCAAGTTATGATCATGAGCATTTATTTGAGGGGCATCCTTTGCTG
TCAAGCTGGGGGAAATTGGGACGAGATTTTTTATATTTATTAACAGAATTAGAACAGCTCGAAGGCGTACGAAGTATTGA
TGCGTACACCGAGTTAACTTCCCAACATCTCTTATCTCAGGTACAAGCGCGTATTTTACATTTAGAAGGCAAGCAAGGTT
TAAATTTGGCTGAAAATGACCGCTCTTTAACGTTCCATTCTTGCCATAGCCCTATGCGTGAAGTTGAAGTTTTACATGAC
TATTTGCTTCATTTATTTCAGCAAGACTCGACACTTACTCCAAAAGATATTGTGGTGATGGTAGCGGATATTGATAAATA
TACACCCTATATTCAAGCTGTATTTGGACAGTACAATCAGGTCGCACAGCGGCAGATTCCTTTTTCTATTTCGGATAACC
GTCTTTCTGAAAATGACGTGTTAATAGCAAGTTTTATTCACTTACTTGCTTTAAAAGAGAGTCAGTTTAGCGCAGAAGAT
ATCTTAGCTTTATTAGATATTCCTGCGATTCGGAATAGGTTTCAGATTGAGTTAATGGAGTTAGAGCAGATTCGGCATTG
GGTCGCACATGCTGGCATACGTTTTGGTGTAGAAAAAGAACAAGGTAAACAAGAAAAGAACACTAACTCATGGCAAGCTG
GGCTGGAGCGGATGCTGCTTGGTTATGCGATGCGTGAGGAAAATGGGATTTGGCAAGGGAATTTAGGCTTTGATCCTTGT
TATGGACTACAAGGGCAATTAGCCGGACGCTTGGCGGAGTTTATTGCAAGATTATCAGCATGGTATCAGTTTTTACAAAC
GCCTCAGCCTATTGAAAAATGGCAACAGCATTTACTTACGCTTTTAACAGATTTCTTCGCTGAGGATGAAACGAATATTA
CCACTTTGCGATATATTCAAGAAACGATAGTGCAAATGGTAACAGATATTCAACAAACACATTTTGATCAACCGTTAAGT
AGTGAAGTGGTTTCTGATGTCCTGTCGGCATTATTAGAAGATGATCCGAATAGCATGAAGTTTCTGGCAGGGAAAGTGAA
TTTCTGCACCTTGCTACCGATGCGTTCGATTCCCTTTAAAGTAGTGTGTTTACTGGGGATGAATGAAGGTGATTATCCTC
GTCAACAAACGCCAAATAGCTTTGATTTGATGCAATATGATCGACGTAAAGCCGACCGTTTTCGCCGTGACGATGATTGT
TATTTGTTCCTTGAAGCGCTGCTGTCAGCACAAGAGGCATTTTATGTGAGTTTTGTGGGACGTTCCATTGTGGATAACCA
AAGCAAACCTCCGTCTGTGTTAGTCAGTCAATTGATTGACTATTTAGTAGATAAGTTATCAAGCGCTGAAACACAAGATT
GGCAGGCTCGATTAATTGAACAGCATCCGATGACAGCATTTAGTCCAGATAATTTCCGAGGAGAAAACGGATCTTTTGCT
AACCAATGGTTACCCCTAGCAAATATTCAGAAACAAGAGAGGGCGGATTTTGTCCAACCTATCGCACAAACAGTGTTAGC
CGAGGATCGTGAAATTGTGTTAGCGGATTTAATTGCCTTTATTCAGCACCCTGTTGCGTTTTTCTTTAAACGTCATTTAG
GCGTTTCTTTTGCTAAACAAGAAGAACGTATTGAAGACAGCGAAAATTTTACTTTAGATGGCTTAATGCGCTATCAAATT
AATGAGCAATTGCTTTATTGTGATGAGGAAAAAAGCGCGGAGGTTCTCGCTCAATTAAAAGTAAAAGGTATGCTACCGCG
TGGTGAATTTGCCCAGATCTTTGCGTTACAACAACAAGAAGACATTGCCGCGTTAAAAACAACCGTTGCCGATTATTTAA
AACAAGAGGCGCATGTCGTCGAAGTGGATTTGACTATCCCGAGTGGCTATGGCGATATTCGTCTGATTGGGCTGCTAGAT
CAGTTGTATGCACAGCGTAGAGTGATGTGGCGAGTGGGACAAATTCAGGAAAAACATTTAATTGAAAATTGGGTGTATTA
CCTTATTCAATGTGCAATGTTAGCACAGCATGAACCTCCTATTTATTATGGTAAGAATGGGCAAGCGACCTTTCAAGCGT
TGTGTGCTAGCGAGTCGTTAAGTGTAAAAGAAATCGCGTTAGCACAATTACAAATCTATGTTGAAAGTTATTTGCAGGGC
TATCAGCAGATGCAAATGGTTCCGATGAAAAATATTCAACGTTATTTAGAAGCATATGGACATACTGAGACGCCAGATTT
TGAGATGATTCGGACATTGTTACATCATCTAGCGGAAGGGGATTATGCTTCGGATGGGGATATTTATTGGCAACGAGTAC
TTGCACAACAAGTACTCGATGAGGAGAGGCTCAACGCGATAGGCGAACGGACAACATCGTGGTTTAAGCTTATGTTTGAG
CAGCTTGAAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTACGTCCTTGGCGGAGATTAGCTTGTAAAAGACTTGCGGTAGAACACAAAGTGGGGAACAATAGTCAAACTGATTGTTT
CGATGTGGATAAGGCGACCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCGCATTTTTGTATGTCACTGATAGTGAACGAAATGAGCTTTATAGATAGCGCGCCATCACAATCGCATTTTCACGTTG
ACCATGAGGCGTGGGGTAAT

Product: RecC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1124; Mature: 1124

Protein sequence:

>1124_residues
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QLEK

Sequences:

>Translated_1124_residues
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YQQMQMVPMKNIQRYLEAYGHTETPDFEMIRTLLHHLAEGDYASDGDIYWQRVLAQQVLDEERLNAIGERTTSWFKLMFE
QLEK
>Mature_1124_residues
MFTIYYSNDLDVQKNILLTLMQDTLDDPFQSDVILVQSPGMAQWLQWKIAEQQGISSNIKFPMPASFIWQQYVDNLPNTE
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SSWGKLGRDFLYLLTELEQLEGVRSIDAYTELTSQHLLSQVQARILHLEGKQGLNLAENDRSLTFHSCHSPMREVEVLHD
YLLHLFQQDSTLTPKDIVVMVADIDKYTPYIQAVFGQYNQVAQRQIPFSISDNRLSENDVLIASFIHLLALKESQFSAED
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NEQLLYCDEEKSAEVLAQLKVKGMLPRGEFAQIFALQQQEDIAALKTTVADYLKQEAHVVEVDLTIPSGYGDIRLIGLLD
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YQQMQMVPMKNIQRYLEAYGHTETPDFEMIRTLLHHLAEGDYASDGDIYWQRVLAQQVLDEERLNAIGERTTSWFKLMFE
QLEK

Specific function: Exhibits a wide variety of catalytic activities including ATP-dependent exonuclease, ATP-stimulated endonuclease, ATP-dependent helicase and DNA-dependent ATPase activities [H]

COG id: COG1330

COG function: function code L; Exonuclease V gamma subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789186, Length=1166, Percent_Identity=37.9931389365352, Blast_Score=729, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006697
- InterPro:   IPR011335 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: =3.1.11.5 [H]

Molecular weight: Translated: 130522; Mature: 130522

Theoretical pI: Translated: 4.80; Mature: 4.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFTIYYSNDLDVQKNILLTLMQDTLDDPFQSDVILVQSPGMAQWLQWKIAEQQGISSNIK
CEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
FPMPASFIWQQYVDNLPNTEEQSQFNKASMTWRLMRLIPEHLEQVEFQSLRHYLSSSHQT
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VQARILHLEGKQGLNLAENDRSLTFHSCHSPMREVEVLHDYLLHLFQQDSTLTPKDIVVM
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DYASDGDIYWQRVLAQQVLDEERLNAIGERTTSWFKLMFEQLEK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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SVKEIALAQLQIYVESYLQGYQQMQMVPMKNIQRYLEAYGHTETPDFEMIRTLLHHLAEG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
DYASDGDIYWQRVLAQQVLDEERLNAIGERTTSWFKLMFEQLEK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]