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The map label for this gene is yoeA [H]

Identifier: 15594818

GI number: 15594818

Start: 492588

End: 493952

Strand: Direct

Name: yoeA [H]

Synonym: BB0473

Alternate gene names: 15594818

Gene position: 492588-493952 (Clockwise)

Preceding gene: 15594817

Following gene: 15594819

Centisome position: 54.09

GC content: 28.21

Gene sequence:

>1365_bases
ATGTCTACAGATAAGAGTAAGACTAGGGAATTAATATTAAATGGCAATTTATACAAGGTTCTTTTTTTAATAAGTTTTCC
TATTGTTATAACCAATATTATTCAAGCTTTTTATGATCTTACTGATATGTTTTATGTTGGTAAACTTGGAGCCATGCCTT
TGTCAGCGCTTTCACTTGCTGGTCCTGTAAATTTTTTTATTATAGCTATTGCTATGGGAATGGCTACGGGAAGCATTTCT
TTGATGTCAAAATGCATAGGAGAGGGAAATTTTTCTCGTTTTTCAAGATATGCAGGGCAACTTATTGTTTTAAACTTTGT
TTTATCCTTATTTGTTACTATTTGTGCTTTTTTTTTTATTGATCATCTTTTAGATTTGTTGGGTGTAAAAGGGGAGCTTA
AAGAACTCTCAAGAGTTTATTTTTATGTGACAATTTTTGCAATACCTATCATGTTTTTAAGTATTTCAATTACATATATT
TTAAATGCTCAAGGAGAAACTATCCTTTCAATGACAATAGTTTTATTTGCCAATATTGTTAATTTTATTCTTGATCCAAT
TTTAATATTTAGTTTTAATATGGGCATTACTGGAGCTGCTTGGGCCACTTTATTTTCAAAATTGTTAACCGTTGTCTTTT
ATTTATTTTTGACTTACAGGCTAAATTATGGATTAAAAATTCATCTGAAGGATTTAGTGATAGATATAAGATCCATTAAA
GAAATTGTTAATCTGGGATTGCCTTCAACTTTTGGGCAAATAATGGTTTCGTTGTCTTTTTTTATTTTCAATTATATAGT
TATTGAGATTAGTCCAAAATTTTTGGCGGCTTATGGACTTACAAACACCATTATTTCTTTTTTATTTCTTCCTGCTATGG
GAATTGGTACTGGAATTATTTCAATTGTTGGTCAAAATCTTGGCGCTAAGAAAGTCAATAGGGTGGAAGAAGTTTTGAAA
AAAGGTTTTTTTATTTCTTTGGCAATTTTATTGATAATAAATTCGATTGTTATTTTTAATAAACAGTTTATACTAAGGTT
ATTTACAAATGATTTAGAAGTTTTAAATTATGCTAATAATTATTTATTGTTAACAACTATTGGTACTTTTGGATATGGAC
TCCAACAAGTATTTTTTGGGGGACTTATTGGGTCTGGCAGGACAAAAATTGCAATGATTGTTATTTTTATTAGGCTGTGG
CTTATTCGTCTTCCAGTAGTTTTTATTTTTCAATATTTTGGCATAATGGAAAATTCTTTAGGTTATGCTTTTATAATTTC
AAATTATTTGGCAATTATAATTTTAATTGCTTTTACTTGCACTCGTTATTGGGTTAAGCCTATTTTAATTAAAAAATACA
AATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAATTTTTGAAATTAAAAATTAAATACTTGTTTATTACTGATGAATAAATTTGATTTTAAATTTTTTATAAAAAATGTT
TTAGATGAGGATAAAATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATTAAGATTTATTTTATATTTACATTTTGCCAAAAAATGGCTTATTTGTTTTTAATAAATTTAATGTTTTTGGCCTTA
AAAATAGATTTTAGATTCTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 454; Mature: 453

Protein sequence:

>454_residues
MSTDKSKTRELILNGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLAGPVNFFIIAIAMGMATGSIS
LMSKCIGEGNFSRFSRYAGQLIVLNFVLSLFVTICAFFFIDHLLDLLGVKGELKELSRVYFYVTIFAIPIMFLSISITYI
LNAQGETILSMTIVLFANIVNFILDPILIFSFNMGITGAAWATLFSKLLTVVFYLFLTYRLNYGLKIHLKDLVIDIRSIK
EIVNLGLPSTFGQIMVSLSFFIFNYIVIEISPKFLAAYGLTNTIISFLFLPAMGIGTGIISIVGQNLGAKKVNRVEEVLK
KGFFISLAILLIINSIVIFNKQFILRLFTNDLEVLNYANNYLLLTTIGTFGYGLQQVFFGGLIGSGRTKIAMIVIFIRLW
LIRLPVVFIFQYFGIMENSLGYAFIISNYLAIIILIAFTCTRYWVKPILIKKYK

Sequences:

>Translated_454_residues
MSTDKSKTRELILNGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLAGPVNFFIIAIAMGMATGSIS
LMSKCIGEGNFSRFSRYAGQLIVLNFVLSLFVTICAFFFIDHLLDLLGVKGELKELSRVYFYVTIFAIPIMFLSISITYI
LNAQGETILSMTIVLFANIVNFILDPILIFSFNMGITGAAWATLFSKLLTVVFYLFLTYRLNYGLKIHLKDLVIDIRSIK
EIVNLGLPSTFGQIMVSLSFFIFNYIVIEISPKFLAAYGLTNTIISFLFLPAMGIGTGIISIVGQNLGAKKVNRVEEVLK
KGFFISLAILLIINSIVIFNKQFILRLFTNDLEVLNYANNYLLLTTIGTFGYGLQQVFFGGLIGSGRTKIAMIVIFIRLW
LIRLPVVFIFQYFGIMENSLGYAFIISNYLAIIILIAFTCTRYWVKPILIKKYK
>Mature_453_residues
STDKSKTRELILNGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLAGPVNFFIIAIAMGMATGSISL
MSKCIGEGNFSRFSRYAGQLIVLNFVLSLFVTICAFFFIDHLLDLLGVKGELKELSRVYFYVTIFAIPIMFLSISITYIL
NAQGETILSMTIVLFANIVNFILDPILIFSFNMGITGAAWATLFSKLLTVVFYLFLTYRLNYGLKIHLKDLVIDIRSIKE
IVNLGLPSTFGQIMVSLSFFIFNYIVIEISPKFLAAYGLTNTIISFLFLPAMGIGTGIISIVGQNLGAKKVNRVEEVLKK
GFFISLAILLIINSIVIFNKQFILRLFTNDLEVLNYANNYLLLTTIGTFGYGLQQVFFGGLIGSGRTKIAMIVIFIRLWL
IRLPVVFIFQYFGIMENSLGYAFIISNYLAIIILIAFTCTRYWVKPILIKKYK

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI153792564, Length=440, Percent_Identity=21.1363636363636, Blast_Score=68, Evalue=1e-11,
Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=422, Percent_Identity=21.563981042654, Blast_Score=71, Evalue=1e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51030; Mature: 50899

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTDKSKTRELILNGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLA
CCCCHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHC
GPVNFFIIAIAMGMATGSISLMSKCIGEGNFSRFSRYAGQLIVLNFVLSLFVTICAFFFI
CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DHLLDLLGVKGELKELSRVYFYVTIFAIPIMFLSISITYILNAQGETILSMTIVLFANIV
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
NFILDPILIFSFNMGITGAAWATLFSKLLTVVFYLFLTYRLNYGLKIHLKDLVIDIRSIK
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
EIVNLGLPSTFGQIMVSLSFFIFNYIVIEISPKFLAAYGLTNTIISFLFLPAMGIGTGII
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIVGQNLGAKKVNRVEEVLKKGFFISLAILLIINSIVIFNKQFILRLFTNDLEVLNYANN
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YLLLTTIGTFGYGLQQVFFGGLIGSGRTKIAMIVIFIRLWLIRLPVVFIFQYFGIMENSL
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GYAFIISNYLAIIILIAFTCTRYWVKPILIKKYK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
STDKSKTRELILNGNLYKVLFLISFPIVITNIIQAFYDLTDMFYVGKLGAMPLSALSLA
CCCHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHC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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]