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The map label for this gene is greA

Identifier: 15594477

GI number: 15594477

Start: 127427

End: 130132

Strand: Reverse

Name: greA

Synonym: BB0132

Alternate gene names: 15594477

Gene position: 130132-127427 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15594478

Following gene: 15594476

Centisome position: 14.29

GC content: 28.12

Gene sequence:

>2706_bases
ATGTCTAATGTTACTACCATAGAGAAATTAGATAGTATTTTACAAGAAGATAAGTGGACAAGAATAGTTGTTAATAATTA
TTCTCTTGCCAAAATAAAAGAATTGGATGATTTAATAAATAATATAATTGATGAGGGGTTAACAGAGGATGTGCTTGATA
TTTGTGGCAGGCATTTAAAGGACGTTAAAAAAAGCATAGCAGGTCTTTATATTTCTGGAATGCTTATATATAGTAGGCGA
CCTTTAAATGATATGAATTTACTTGCTGTTATTGATTTGTTTTCTCAAAATTTAAAATGGGCTCTTGTTGAGCATATATG
TAATGAAATGCTTTTAATTTCTGAGAATAAGCACGCTCTTTATACTCTTGCAAAAATATATGCTCAGAACAATGAAAATG
ATAAGCTTCCAGGTATTTGGACTAGAATTGTTGAAGCAGATATTGACGACACTGTGTTTGTTAGGCAACTTGCTACTTAT
TATGAAACTATTGATTTGCAAAAATCAATTTTCTATTTTAGAAAAGCTATTTATCGTTTTATTGATAAAAAACAAATGTC
AGGAATCAGAGAAGTATGGGCCAAGCTTATTCATTATGTTTCAGATGATTTTGATTCTTTTTTGCTTATTTTGCAAAAAA
TTGAAAAAGATCTTGGATTTAAAAAGGCCATAGTTCTTTATGAGGATTTATTTGATCATTATTCTTTGACTGACAATGTT
GACGAGACAATAGAAATTTTAAAAGGCATTTTAAAACTTGATAACAAAAATCATAAGGCAAGAGAAAATTTAGTTAAATT
TTTAAGAGAAAGATATAAAGATGTTAAAAATATTGAGGATTATCTTGTAAAGTCTGATATTGAAAACTTAGATAAAAATT
TTGTTGATGTATATTTAGACTTTGAAAAATATTTGTTTTTTGCAAAGGGTAATTTTGTTTATCATCAGACTTGGTCTGTT
GGAATAGTAAGAGATGTAAATGATAACGGCATTACGGTTGATTTTGTTTCCAAAAGAGGTCATTTTATTGGTTTTGATAT
GGCCATGTCGGCTTTATCTCCCCTTAGCAGAGAGGATATTAGAGTATTAAAGGCTGTAACACCTAAAGAAGAACTTGCAG
ATAGAGTAAAAAAAGATATTGAGTGGGCCATAAAGGTTATTATAAAAAGTTATAAAGCTATTGATTTAAAGGGAATAAAA
AAAGAGTTAGTGCCAAGCTTGATGACTCAAAGTTCGTGGAATTCATGGAGCTTGAAAGCAAAGCAAATTTTAAAGGATAA
TCCCCATTTTGTTATGGATTCTGGCAAGCTTGATTGTTATATATATAATGAGAGATCTTCCAATTTGAATGAAAAAATGT
ATGATAAATTTAAGATTGAGAAAGATTTTTATAAAAGATACGAGATATTTATAAACTATTGCAATGTTAAGGGAATTGTT
AAGGATTTGCATATTGAAGAAGAGATGCTTAACTATTTTTTAATTTATGTTAACAATTTTACAAAGGTTGATCATCATGT
TGTAAGTTCTTACGTTATTCTTAAATCTTTAGGTAATTTTTCTGAAGAATTGTCATCAAAAGTTAATATAGAAAAAGATG
TTAATTTAGAATCTCTTTTAAAAGAGTATCCAAAAGGAATAGTGGATCTTTTTGATTCAATTTTGAATGCAGAAATTAAA
AAAGAATTAGTTGTTTTAATTAAAGAAGAACTTAGTAATTGGATTTTATACTACAAAGAACTTTTTCCTCATTCTGTTAA
TAAGAGATTGGTTGAATCACTTTACAAAGAAGATCCCAGAGAGGTGGAAAAATTATTTAATTATGTTATAAAAAATTATA
AGATCTATAAAGATGCTTATATTTGGATTTTGAAGCACTGTAAAGCTTATTCTATAGAGCTGAGTTATTCGGATTCGGAT
CTTTTGTCCAATTTGATTAAAATTTTAACAGATAGTGTTATCAAAATTAATAATAAAAATAATTCTGTTGCAAGTAAAAG
AATTTATAAAATGGTAATTAATCTTTTAGTTAAAGATGGATATCTTAAATCGGTCTTAGAGGTCGTGAGAGATGAAGAAC
TTGCAAAAAGAGTTTATATGACTTGTTTTTATGTAAAAGATTTCCCCCCAAAGGATCTTTTAGAGATTAAATCTATAATA
AGACAATTATTTGATTCGGTTGAGTTTGAAGATGAAAAGATGCAACTTGCAGGCGAGAGAATGGAAATTGGATTTTTAAC
CATATTAAGCTCTTTGAATAAAAAACAAAAAGAGCTTAAATATTTAAAGGAAGTTGAAATTCCAGAAAATTCAAAAGAAA
TTGGAAAAGCTCGTGAACTTGGTGATTTAAAAGAAAATGCCGAATATCATTCTGCTAAGGAAAAACAACAGTTTTTGACA
AAAAGATTAAACTCCTTAATGCTGGAAATAGAGAATGCAAAAGTTATAGATACTAAGGATCTTCAAAGTTCTGTTGTTGG
TTTTGGGACCAAGGTTGTCATTTTAAATGAAGTTACAGGCAAAGATGAATCTTATTTAATACTTGGGCCTTGGGAATCAA
ACCCCGATGAAGGCATTATTTCATATAAATCGCCTTTTGGAGAAAATTTGCTTGATTCTAGGGAAGGGGATAGTCTTAAT
TTTGTTATAAATAATACTAATTTTAAATATTTTGTAAAAAAAATAGAACCCATAAAATTTAGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATGAGATTTTGTTATACATAAAAGAAATAGACCTAGGTATTTATCAACAGTATGTAAATTAGTTGCTTGATGCTAAAAA
ATCGATATTAGGAGAGTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAAAATTTAAGAATGTCAAAGTTAAAGGAAAAAAGAGAAAAAGCTGTTGTTGGCATAGAAAGGGCAAGTAAAGAGGAAG
CTATTGAGCTTGCAAGAGTT

Product: transcript cleavage factor

Products: NA

Alternate protein names: Transcript cleavage factor greA

Number of amino acids: Translated: 901; Mature: 900

Protein sequence:

>901_residues
MSNVTTIEKLDSILQEDKWTRIVVNNYSLAKIKELDDLINNIIDEGLTEDVLDICGRHLKDVKKSIAGLYISGMLIYSRR
PLNDMNLLAVIDLFSQNLKWALVEHICNEMLLISENKHALYTLAKIYAQNNENDKLPGIWTRIVEADIDDTVFVRQLATY
YETIDLQKSIFYFRKAIYRFIDKKQMSGIREVWAKLIHYVSDDFDSFLLILQKIEKDLGFKKAIVLYEDLFDHYSLTDNV
DETIEILKGILKLDNKNHKARENLVKFLRERYKDVKNIEDYLVKSDIENLDKNFVDVYLDFEKYLFFAKGNFVYHQTWSV
GIVRDVNDNGITVDFVSKRGHFIGFDMAMSALSPLSREDIRVLKAVTPKEELADRVKKDIEWAIKVIIKSYKAIDLKGIK
KELVPSLMTQSSWNSWSLKAKQILKDNPHFVMDSGKLDCYIYNERSSNLNEKMYDKFKIEKDFYKRYEIFINYCNVKGIV
KDLHIEEEMLNYFLIYVNNFTKVDHHVVSSYVILKSLGNFSEELSSKVNIEKDVNLESLLKEYPKGIVDLFDSILNAEIK
KELVVLIKEELSNWILYYKELFPHSVNKRLVESLYKEDPREVEKLFNYVIKNYKIYKDAYIWILKHCKAYSIELSYSDSD
LLSNLIKILTDSVIKINNKNNSVASKRIYKMVINLLVKDGYLKSVLEVVRDEELAKRVYMTCFYVKDFPPKDLLEIKSII
RQLFDSVEFEDEKMQLAGERMEIGFLTILSSLNKKQKELKYLKEVEIPENSKEIGKARELGDLKENAEYHSAKEKQQFLT
KRLNSLMLEIENAKVIDTKDLQSSVVGFGTKVVILNEVTGKDESYLILGPWESNPDEGIISYKSPFGENLLDSREGDSLN
FVINNTNFKYFVKKIEPIKFS

Sequences:

>Translated_901_residues
MSNVTTIEKLDSILQEDKWTRIVVNNYSLAKIKELDDLINNIIDEGLTEDVLDICGRHLKDVKKSIAGLYISGMLIYSRR
PLNDMNLLAVIDLFSQNLKWALVEHICNEMLLISENKHALYTLAKIYAQNNENDKLPGIWTRIVEADIDDTVFVRQLATY
YETIDLQKSIFYFRKAIYRFIDKKQMSGIREVWAKLIHYVSDDFDSFLLILQKIEKDLGFKKAIVLYEDLFDHYSLTDNV
DETIEILKGILKLDNKNHKARENLVKFLRERYKDVKNIEDYLVKSDIENLDKNFVDVYLDFEKYLFFAKGNFVYHQTWSV
GIVRDVNDNGITVDFVSKRGHFIGFDMAMSALSPLSREDIRVLKAVTPKEELADRVKKDIEWAIKVIIKSYKAIDLKGIK
KELVPSLMTQSSWNSWSLKAKQILKDNPHFVMDSGKLDCYIYNERSSNLNEKMYDKFKIEKDFYKRYEIFINYCNVKGIV
KDLHIEEEMLNYFLIYVNNFTKVDHHVVSSYVILKSLGNFSEELSSKVNIEKDVNLESLLKEYPKGIVDLFDSILNAEIK
KELVVLIKEELSNWILYYKELFPHSVNKRLVESLYKEDPREVEKLFNYVIKNYKIYKDAYIWILKHCKAYSIELSYSDSD
LLSNLIKILTDSVIKINNKNNSVASKRIYKMVINLLVKDGYLKSVLEVVRDEELAKRVYMTCFYVKDFPPKDLLEIKSII
RQLFDSVEFEDEKMQLAGERMEIGFLTILSSLNKKQKELKYLKEVEIPENSKEIGKARELGDLKENAEYHSAKEKQQFLT
KRLNSLMLEIENAKVIDTKDLQSSVVGFGTKVVILNEVTGKDESYLILGPWESNPDEGIISYKSPFGENLLDSREGDSLN
FVINNTNFKYFVKKIEPIKFS
>Mature_900_residues
SNVTTIEKLDSILQEDKWTRIVVNNYSLAKIKELDDLINNIIDEGLTEDVLDICGRHLKDVKKSIAGLYISGMLIYSRRP
LNDMNLLAVIDLFSQNLKWALVEHICNEMLLISENKHALYTLAKIYAQNNENDKLPGIWTRIVEADIDDTVFVRQLATYY
ETIDLQKSIFYFRKAIYRFIDKKQMSGIREVWAKLIHYVSDDFDSFLLILQKIEKDLGFKKAIVLYEDLFDHYSLTDNVD
ETIEILKGILKLDNKNHKARENLVKFLRERYKDVKNIEDYLVKSDIENLDKNFVDVYLDFEKYLFFAKGNFVYHQTWSVG
IVRDVNDNGITVDFVSKRGHFIGFDMAMSALSPLSREDIRVLKAVTPKEELADRVKKDIEWAIKVIIKSYKAIDLKGIKK
ELVPSLMTQSSWNSWSLKAKQILKDNPHFVMDSGKLDCYIYNERSSNLNEKMYDKFKIEKDFYKRYEIFINYCNVKGIVK
DLHIEEEMLNYFLIYVNNFTKVDHHVVSSYVILKSLGNFSEELSSKVNIEKDVNLESLLKEYPKGIVDLFDSILNAEIKK
ELVVLIKEELSNWILYYKELFPHSVNKRLVESLYKEDPREVEKLFNYVIKNYKIYKDAYIWILKHCKAYSIELSYSDSDL
LSNLIKILTDSVIKINNKNNSVASKRIYKMVINLLVKDGYLKSVLEVVRDEELAKRVYMTCFYVKDFPPKDLLEIKSIIR
QLFDSVEFEDEKMQLAGERMEIGFLTILSSLNKKQKELKYLKEVEIPENSKEIGKARELGDLKENAEYHSAKEKQQFLTK
RLNSLMLEIENAKVIDTKDLQSSVVGFGTKVVILNEVTGKDESYLILGPWESNPDEGIISYKSPFGENLLDSREGDSLNF
VINNTNFKYFVKKIEPIKFS

Specific function: Necessary for efficient RNA polymerase transcription elongation past template-encoded arresting sites. The arresting sites in DNA have the property of trapping a certain fraction of elongating RNA polymerases that pass through, resulting in locked ternary

COG id: COG1747

COG function: function code S; Uncharacterized N-terminal domain of the transcription elongation factor GreA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 GRAD2 (greA associated 2) domain

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082225, Length=149, Percent_Identity=36.9127516778523, Blast_Score=89, Evalue=1e-18,

Paralogues:

None

Copy number: 259 Molecules/Cell In: Growth Phase, Glucose-minimal MOPS Media. [C]

Swissprot (AC and ID): GREA_BORBU (O51157)

Other databases:

- EMBL:   AE000783
- PIR:   D70116
- RefSeq:   NP_212266.1
- ProteinModelPortal:   O51157
- SMR:   O51157
- EnsemblBacteria:   EBBORT00000009097
- GeneID:   1194967
- GenomeReviews:   AE000783_GR
- KEGG:   bbu:BB0132
- NMPDR:   fig|224326.1.peg.516
- TIGR:   BB_0132
- GeneTree:   EBGT00050000007220
- HOGENOM:   HBG354558
- OMA:   EYKFALE
- ProtClustDB:   PRK14720
- BioCyc:   BBUR224326:BB_0132-MONOMER
- GO:   GO:0006350
- HAMAP:   MF_00105
- InterPro:   IPR018151
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR006359
- InterPro:   IPR001437
- InterPro:   IPR022691
- Gene3D:   G3DSA:1.10.287.180
- Gene3D:   G3DSA:3.10.50.30
- Gene3D:   G3DSA:1.25.40.10
- TIGRFAMs:   TIGR01462

Pfam domain/function: PF01272 GreA_GreB; PF03449 GreA_GreB_N; SSF46557 GreA_GreB

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105316; Mature: 105185

Theoretical pI: Translated: 6.29; Mature: 6.29

Prosite motif: PS00829 GREAB_1; PS00830 GREAB_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNVTTIEKLDSILQEDKWTRIVVNNYSLAKIKELDDLINNIIDEGLTEDVLDICGRHLK
CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
DVKKSIAGLYISGMLIYSRRPLNDMNLLAVIDLFSQNLKWALVEHICNEMLLISENKHAL
HHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHH
YTLAKIYAQNNENDKLPGIWTRIVEADIDDTVFVRQLATYYETIDLQKSIFYFRKAIYRF
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDKKQMSGIREVWAKLIHYVSDDFDSFLLILQKIEKDLGFKKAIVLYEDLFDHYSLTDNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
DETIEILKGILKLDNKNHKARENLVKFLRERYKDVKNIEDYLVKSDIENLDKNFVDVYLD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEE
FEKYLFFAKGNFVYHQTWSVGIVRDVNDNGITVDFVSKRGHFIGFDMAMSALSPLSREDI
HHHEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHCCCCHHHH
RVLKAVTPKEELADRVKKDIEWAIKVIIKSYKAIDLKGIKKELVPSLMTQSSWNSWSLKA
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
KQILKDNPHFVMDSGKLDCYIYNERSSNLNEKMYDKFKIEKDFYKRYEIFINYCNVKGIV
HHHHCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
KDLHIEEEMLNYFLIYVNNFTKVDHHVVSSYVILKSLGNFSEELSSKVNIEKDVNLESLL
HHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH
KEYPKGIVDLFDSILNAEIKKELVVLIKEELSNWILYYKELFPHSVNKRLVESLYKEDPR
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
EVEKLFNYVIKNYKIYKDAYIWILKHCKAYSIELSYSDSDLLSNLIKILTDSVIKINNKN
HHHHHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCC
NSVASKRIYKMVINLLVKDGYLKSVLEVVRDEELAKRVYMTCFYVKDFPPKDLLEIKSII
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHH
RQLFDSVEFEDEKMQLAGERMEIGFLTILSSLNKKQKELKYLKEVEIPENSKEIGKAREL
HHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
GDLKENAEYHSAKEKQQFLTKRLNSLMLEIENAKVIDTKDLQSSVVGFGTKVVILNEVTG
CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCC
KDESYLILGPWESNPDEGIISYKSPFGENLLDSREGDSLNFVINNTNFKYFVKKIEPIKF
CCCCEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHHCCCCCC
S
C
>Mature Secondary Structure 
SNVTTIEKLDSILQEDKWTRIVVNNYSLAKIKELDDLINNIIDEGLTEDVLDICGRHLK
CCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
DVKKSIAGLYISGMLIYSRRPLNDMNLLAVIDLFSQNLKWALVEHICNEMLLISENKHAL
HHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHH
YTLAKIYAQNNENDKLPGIWTRIVEADIDDTVFVRQLATYYETIDLQKSIFYFRKAIYRF
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDKKQMSGIREVWAKLIHYVSDDFDSFLLILQKIEKDLGFKKAIVLYEDLFDHYSLTDNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
DETIEILKGILKLDNKNHKARENLVKFLRERYKDVKNIEDYLVKSDIENLDKNFVDVYLD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEE
FEKYLFFAKGNFVYHQTWSVGIVRDVNDNGITVDFVSKRGHFIGFDMAMSALSPLSREDI
HHHEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHCCCCHHHH
RVLKAVTPKEELADRVKKDIEWAIKVIIKSYKAIDLKGIKKELVPSLMTQSSWNSWSLKA
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
KQILKDNPHFVMDSGKLDCYIYNERSSNLNEKMYDKFKIEKDFYKRYEIFINYCNVKGIV
HHHHCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
KDLHIEEEMLNYFLIYVNNFTKVDHHVVSSYVILKSLGNFSEELSSKVNIEKDVNLESLL
HHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH
KEYPKGIVDLFDSILNAEIKKELVVLIKEELSNWILYYKELFPHSVNKRLVESLYKEDPR
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
EVEKLFNYVIKNYKIYKDAYIWILKHCKAYSIELSYSDSDLLSNLIKILTDSVIKINNKN
HHHHHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCC
NSVASKRIYKMVINLLVKDGYLKSVLEVVRDEELAKRVYMTCFYVKDFPPKDLLEIKSII
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHH
RQLFDSVEFEDEKMQLAGERMEIGFLTILSSLNKKQKELKYLKEVEIPENSKEIGKAREL
HHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
GDLKENAEYHSAKEKQQFLTKRLNSLMLEIENAKVIDTKDLQSSVVGFGTKVVILNEVTG
CCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEEEHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCC
KDESYLILGPWESNPDEGIISYKSPFGENLLDSREGDSLNFVINNTNFKYFVKKIEPIKF
CCCCEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEHHHHCCCCCC
S
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: DNA [C]

Specific reaction: Protein + DNA = Protein-DNA [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685