| Definition | Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009707 |
| Length | 1,845,106 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is cstA [H]
Identifier: 153951850
GI number: 153951850
Start: 796055
End: 798166
Strand: Direct
Name: cstA [H]
Synonym: JJD26997_0897
Alternate gene names: 153951850
Gene position: 796055-798166 (Clockwise)
Preceding gene: 153951274
Following gene: 153951104
Centisome position: 43.14
GC content: 34.66
Gene sequence:
>2112_bases ATGACTCAGTTAAGTACTAAAATTTTATGGTTGTTTGTTGCAACTTTAGGCGCTATTTGTTTTGGTTATTTAGCTTTACA AAATGGTGAAAGTGTATCAGCGATTTATTTGGTGGTCGCTGCTGTATGTATTTATATGATAGGATATAGATTTTATGGGC GTTTTGTAGCTTATAAAGTTTTAGAACTTGATAAAAATCGTGCAACACCAGCACTTGTAGAAAATGATGGGCGTGATTTT GTGCCTACAAATAAAGCTGTATTATTTGGACATCATTTTGCTGCTATTGCAGGAGCGGGTCCATTAGTAGGACCTATCTT GGCTGCTCAAATGGGATATTTACCTTCTATGCTTTGGATTTTAATAGGAGGAGTTTTAGCAGGTGCTGTGCATGATTTTG TTGTTCTTTTTATATCTACTCGTAGAAAAGGTAGAAGTCTTGGCGAGATGATTAAGGATGAGATGGGTAAATTTGCAGGT GGAATTGCTATGGTGGCGATTTTTGGCATTATGCTTATTATTATTGCCATTTTAGCTATGGTGGTTGTAAAAGCTTTAGC AGAATCTCCATGGGGTTTATTTACTATCGCAATGACTATTCCTATAGCAATATTTATGGGAATTTATATGCGTTTTATTC GCCCAGGTAGAGTAGGGGAGGCCTCTATAATAGGTTTTGTGCTTTTAATTTTAGCTATTCATTATGGTAGCGTTATAGCT GCTGATCCTTATTGGGCTAAAATATTTACTTTAGAAGCTCCAACTTTGGCAATTGTTATGATGGCTTATGGTTTCATTGC TTCTGTTTTACCTGTGTGGTTTTTACTTGCTCCAAGAGATTATCTTTCAACTTTTTTGAAAATTGGTGTTATTGTGGTAA TGGCTGTAGCTATTGTTTTGGTTGCTCCTGATTTGCAAATGCCAAAAGCAAATACTCAGTATTTTGATGGAACAGGTCCA GTATTTGCAGGTGGAATATTTCCATTTTTATTTATTACCATTGCTTGTGGTGCGATCAGTGGTTTTCATGCTTTGATTTC TAGTGGAACTACTCCTAAAATGCTTGAAAACGAAACTCATGCTTTAACTGTTGGATATGGATCTATGCTTGCTGAAAGCG CTGTGGCGATTATGGCTTTAATTTGTGCTTGTATTTTACATCCAGGTCTTTATTTTGCTATAAATTCAAGCTCTGCTTCG ATAGGAACAGATGTTGTAAATGTAGCACAAACTATTTCAAATTGGGGATTTAGTATTACTCCTGAAGAAATTACTACTTT AACCACAAATATAGGAGAGCATACTATACTTTCAAGAACAGGTGGAGCTCCAACTTTTGCTATAGGTGTAGCTTTGATCT TGCATGAACTTTTTGGTGGCGTGGATTTAATGGCTTTTTGGTATCATTTTGCTATATTGTTTGAAGCTTTATTTATTTTA ACAGCGGTGGATGCTGGAACAAGGGCTTGTCGTTTTATGGTACAAGATATATTGGGTAATGTTTATAAACCTTTAGGAAA TACACATAACTATCCAGCTGGACTTTTAGCCACTGCTTTAAGTGTTGCGGGTTGGGGATATTTTCTTTATCAAGGTGCCA TTGATCCTAAGGGAGGAATTTATACACTTTGGCCTCTTTTTGGAGTGAGCAATCAAATGCTTGCGGGTATGGCTTTACTT CTTGCTACAACTATACTTGTAAAAATGGGCAAGGCAAGATATACTTGGGTTACTTTAATACCTGCGGTATTTGTCTTAGT GGCAACTCTATATGGAGGAATTCAAAAAATTATGCCTTATGAAGAAGGCAATAAAGTAGCAAATGCGGTAAGTCATGTAG CCACCGTTAGCATACAAAGTCAAAAAATTAAAGATTTAGAATTTAAATTAAATAATACTAAAGATGAAAAAGAAATTTCT GCAATTAAAAAAGAAATTTCAATAGCCACTCAAAGTAAAGTTGGAAATTTAATTAATGCAATTCTTTGTGTGTTCTTTAT GATAGCTACCTTGCTTGTTATAATTTCTTGTATAGGAGTTTGCTTAGGTAAAATTAAAATTCCTCTTAAAGAAACTAAGT ATATTAAGATTGATGAATTTCAAAAAATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATATTTTTTTAAAAATGTGAAAAAACTAAACATCTTTCTATGCAATTTAATCTATAAATCTGCTATTCTTTGAAAGTAT TTTATTTTCTTAGGAGAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTATTATTATGAAAAAGCCGAAAGGTTTTTTCATCCCTTGGTGGGACTTTCTAGTTATGATAAGTATTTAGAACACATGA AACAAAAACATCCAGGAAAA
Product: carbon starvation protein A
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 703; Mature: 702
Protein sequence:
>703_residues MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDF VPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILIGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFAG GIAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA ADPYWAKIFTLEAPTLAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGP VFAGGIFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALTVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSAS IGTDVVNVAQTISNWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGNTHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALL LATTILVKMGKARYTWVTLIPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVATVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEIS AIKKEISIATQSKVGNLINAILCVFFMIATLLVIISCIGVCLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI
Sequences:
>Translated_703_residues MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDF VPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILIGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFAG GIAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA ADPYWAKIFTLEAPTLAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGP VFAGGIFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALTVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSAS IGTDVVNVAQTISNWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGNTHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALL LATTILVKMGKARYTWVTLIPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVATVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEIS AIKKEISIATQSKVGNLINAILCVFFMIATLLVIISCIGVCLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI >Mature_702_residues TQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKVLELDKNRATPALVENDGRDFV PTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWILIGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFAGG IAMVAIFGIMLIIIAILAMVVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIAA DPYWAKIFTLEAPTLAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVLVAPDLQMPKANTQYFDGTGPV FAGGIFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETHALTVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSASI GTDVVNVAQTISNWGFSITPEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFILT AVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGNTHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGIYTLWPLFGVSNQMLAGMALLL ATTILVKMGKARYTWVTLIPAVFVLVATLYGGIQKIMPYEEGNKVANAVSHVATVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISA IKKEISIATQSKVGNLINAILCVFFMIATLLVIISCIGVCLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI
Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]
COG id: COG1966
COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the CstA family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=707, Percent_Identity=55.8698727015559, Blast_Score=765, Evalue=0.0, Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=722, Percent_Identity=51.8005540166205, Blast_Score=728, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003706 [H]
Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75797; Mature: 75666
Theoretical pI: Translated: 8.55; Mature: 8.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 3.7 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LELDKNRATPALVENDGRDFVPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWI HHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFAGGIAMVAIFGIMLIIIAILAM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE ADPYWAKIFTLEAPTLAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVL CCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAPDLQMPKANTQYFDGTGPVFAGGIFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETH HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCC ALTVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSASIGTDVVNVAQTISNWGFSIT EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC PEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL HHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGNTHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCE YTLWPLFGVSNQMLAGMALLLATTILVKMGKARYTWVTLIPAVFVLVATLYGGIQKIMPY EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EEGNKVANAVSHVATVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISAIKKEISIATQSKVGNLINA CCCHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILCVFFMIATLLVIISCIGVCLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHCCCCC >Mature Secondary Structure TQLSTKILWLFVATLGAICFGYLALQNGESVSAIYLVVAAVCIYMIGYRFYGRFVAYKV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LELDKNRATPALVENDGRDFVPTNKAVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPSMLWI HHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIGGVLAGAVHDFVVLFISTRRKGRSLGEMIKDEMGKFAGGIAMVAIFGIMLIIIAILAM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVVKALAESPWGLFTIAMTIPIAIFMGIYMRFIRPGRVGEASIIGFVLLILAIHYGSVIA HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE ADPYWAKIFTLEAPTLAIVMMAYGFIASVLPVWFLLAPRDYLSTFLKIGVIVVMAVAIVL CCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAPDLQMPKANTQYFDGTGPVFAGGIFPFLFITIACGAISGFHALISSGTTPKMLENETH HCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCC ALTVGYGSMLAESAVAIMALICACILHPGLYFAINSSSASIGTDVVNVAQTISNWGFSIT EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC PEEITTLTTNIGEHTILSRTGGAPTFAIGVALILHELFGGVDLMAFWYHFAILFEALFIL HHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAVDAGTRACRFMVQDILGNVYKPLGNTHNYPAGLLATALSVAGWGYFLYQGAIDPKGGI HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCE YTLWPLFGVSNQMLAGMALLLATTILVKMGKARYTWVTLIPAVFVLVATLYGGIQKIMPY EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EEGNKVANAVSHVATVSIQSQKIKDLEFKLNNTKDEKEISAIKKEISIATQSKVGNLINA CCCHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILCVFFMIATLLVIISCIGVCLGKIKIPLKETKYIKIDEFQKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9923682 [H]