| Definition | Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009707 |
| Length | 1,845,106 |
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The map label for this gene is 153951784
Identifier: 153951784
GI number: 153951784
Start: 49333
End: 53091
Strand: Direct
Name: 153951784
Synonym: JJD26997_0043
Alternate gene names: NA
Gene position: 49333-53091 (Clockwise)
Preceding gene: 153952296
Following gene: 153951314
Centisome position: 2.67
GC content: 29.74
Gene sequence:
>3759_bases ATGAAATTTGAAGCTATAAATGAAAAAGAATTTTTAAATCCCTACCACCGCAAAAAGCCTATCTTAGAAACAGAACTAAA CGAATTTATCAAAACTTTAAAAGACTATAAAATAAATTTAGAAAACAATCTCAAAAACAACGAAGATTCCCTTGTAGCAA ACGCTCTTAGCAAATTTTTTGAAAATTTATCTTTTCAATGCGAAGTCAAAAGCATACACAAAGGCAACAGCGGTATAGAC TTAGCCTTAAAAAAAGATGGCCTTACCCAAGTCATCATCGAAGCAAAATTGCCTAATTCTAGAGAATTTTTTAGCCCAAG TAGACCTAACTGCAAGGCTTTGCATGAGTGCGTTTTATACTATCTTCGCGAAAGAAAAGCGTTAAATTCATCGCTTAAGC ACATCATCATCACGGATTTTTATAGCTTTTTTATCTTTAAGGCGGATTTGTTTGAAGAACTTTTTAACAAAAACAAGTAT TTTAAAGAAGCTTTTGAAAATTTTGAAAGCAAAAACTCGCTTTTTAAAGGCAATACCGACGAAATTTATAAAGAATTTGA AAAAATTTTAAATGGCGATAGCACTTTAAAAGGGCTTTTTGTGGATTTAAAACCTATCTTAGAACAAGATAAATTAAGCT TTAGTAAGCTTAAGCCTTTGTTTAAAATTTTTAGCAAGGATTGTTTGCTAAGTGAGTTTAACCCCAACGATGCAAATTCA CTCAACAACGCTTTTTACAAAGAACTTTTATACATCTTAGGGCTTTGCGAAAGTAAACAAAACTCAAAACTCATCATCGC AAAAAGCGAAGAAAGCAAAGAAGAGCAAGGAACTTTCTACACCGCTATAAACTCTAAACTTAAAGAAGAAAATTTTGAAA CCATCTTAAAACTTTTGATCTTATGGCTTAATCGCATTTTGTTTTTAAAGCTTATAGAGTCAAATTTGGTGCGTTTTAAT GATGATAAAAATTTGAAATTTTTAAATTTCAAAAAAATCCCTGATTTTGACAAGCTTAGTGAACTTTTCTTTGAAGTTTT AGCCAAAGAAAAAAGCACAAGAAAGAAAAGCGAATTTGCCTATCTGCCTTATCTAAATTCTTCTTTGTTTGAAAAACAAA GCATAGAAAACACACTTGAAATTTCAAGCTTAAGCAATGACTTAAAGCTTTTTTACTATAAAAACACCGTGCTAAAAGAT GATAAATGCAAGGCTAAAAAAGGACAAGTGGGGCTTTTGGAATACTTGTTTGAATTTTTGGATAGCTTTGATTTTGGTAG TGATGATGAGCAAAGCGAAATTTTAAGCCAAAAAGAACTCATAAGCTCAAGCGTTTTGGGAAATGTGTTTGAAAAACTCA ATGGCTACAAAGAAGGAAGCTTTTACACGCCAAGCTTTATCACTTCTTATATGTGTAAAGAAAGCATCACAAAAGTTGTG CTTGATAAATTCAACGCTCAATTTGATCTTGATGCTAAAAATATAAGCGAGCTAAGAAATTTTTTAAGAAAAGAAGACAA AAAAGCACAAAAAGAGCTTTTAAATTCCATAAAAATTTGCGATCCTGCGGTGGGAAGTGGGCATTTTTTGGTTTCTGCTT TAAATGTTATGTTAAGCATTTATGATGAGCTAAATCTTTTTGATGAAGAGTTTTACCTAGAAGTGCAAAACGATGAAATT CTCATCACGGGTAGAAAAGGCAAGTTTATAGAGTATAAACGCCCAAACACGCCTAAAGATAAAGCCCATCTTATCCAACA AGAACTTTTTCACACCAAAAAAGACATCATAGAAAACAACCTTTTTGGCGTCGATATCAACCCCAACTCATGTGAGATCA CCAAGCTAAGGCTTTGGATAGAGCTTTTAAAACATAGCTTTTATCAAAGCTTTGATGATGAGAATTATCACGATCTTAAA ACCCTGCCAAATATCGATATAAACATAAAATGCGGAAATTCTTTGGTATCTTACTTTGAAACAGGCAAAAGTCTAAGCCA CTACCCTAACATCAAAGAACGTATGGGCAAATACAAACGCATAGTAAAAGACTATAAAGAAGGCTTTTATACAGATAAAA GCCACATCAACCAAGAGATAAAAAATCTCAAAATTTCTTTTAAAAATTTCTGCTTTGCGGATAAATTTAAAAAAGAAATG AAAGGCTTTAATGATAAATGCGAAAAATACTCTAAAAAATACGGAAATTTCTTAGCCGTAGATGATGAAAATTTGAAATT CTTTGTTAGTGCGAATTTGACTCTTTTTGATTTTGATGAAAAAGAAGCCACAAAAGAATTTGCAAATCTTAAAAAAGAAT ACGACAATATCTTCAACCTAGAAAGCAATCATCCTTTTGAATGGCGTTTTGAATTCCCTGAAATTTTGGACGATGATGGA AATTTCAAAGGCTTTGATCTCATCATCGGCAATCCACCTTATATAAAAGAAGCCGAAAATAAAGAACTTTTTGCTAATAC AAAAAAGCTAAGAACTTATCAAGGAAAAATGGATATTTGGTATCATTTTGTAGGGCGTGGATTTGATATGTTAAAAAATA ATGGATATTTAGCATTTATCGCTACTAATAATTGGATTACAAATTCAGGAGCTAAAAAACTACGCAATATAGTTTTAGAA GAATCCCAAATTTTAAGCCTTGTTGATTTTAGTTCTTTTATGGTGTTTGATTCTGCAAGTATACAAACGATGATAATGCA ATTTCAAAAAATAAAACCGCCTAAAAATTACGAATTTCATTTTGCTAAAATCACAACCCAAACTCCAATTTATGAAGATG CTCTAAGTCTTTTAAAAAATGAAAAAACCCAAAACAATGAAATTCTAAAGATAAATTTAACTCCAAAAAAATTCATAGAT AAAACTTTAAATTTTACAAAAAGTGATTATGAAGAACTTTTCAATAAAATTCAAAAATATGGGAAATTTTATCTTGAAGA AAGGGAAGTAGCAAATGGAATACATCCACATTATGATTTTATAAATAATAGAATTAATAGTAATCATAATTTTGCTTTTA AAACAGGGCAGGGTATTTTTGGTTTGAGCGAAGAGGAAAAAGAGAAACTAAAATTAACAAAATTAGAAAATAATCTTGTA AAACCTTATTATGATACTCAAAATTTTTTAAAGTTCTTTTTTAAAAAAAATAATCATCAATGGCTTATTTATACAAATTC ATCTTTTAAAAATCCAAATTCTATGGATAATTATCCGAATTTAAAAAAACATTTAGATAAATTTCAAAATGTTATCACTT CTGATAATAAACCTTATGGTTTGCACCGAGCAAGAGATGAAAAATTTTTTACAGGAAGTCCTAGAATAGTAGCACTTAGA AAATGCGTAGGTGAGCCTAAATTTAGCTATGTTGATTTTGATTGTTATGTGTCAGCAACTTTTTATGTGATTAAAACTCA AAGAATTAATGTTAAATATTTAACTGCTATTTTAAATTCAAAGCTTATAGCATTTTGGTTGAAACATAAAGGAAAAATGC AAGGCAATAATTATCAAATTGACAAAGAGCCTTTACTAAATATCCCTATAGTAACTATAAATTCCAAAAATCAAAAAATA GCTGATGAGTTTATAAATTTAGTCGATGAGATTTTAAAAGCCAAAGAACAAGACAAAAACGCAAATACCCAAGAGTTAGA AAACAAAATCAATTCTTTGGTTTATAAACTTTACAACCTAAACGAAGAAGAAATAAAAATCATAGAAAACAAGGAGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAATTATTTTTTTATAAAATTACAAAAAGTAACTTTTAAATTTTATACCAAACTTGAGATTTTTTTGCTAAAATATTTA AAATTTATTGAAAGTGCAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATGAAATTAGTAAAATGCAAGATTGAAAATTTTAGAAGTTATGAAAATACAGAATTTAATTTTTCAGATTTAGGTGTA ATTATTGGAAAAAACGATGT
Product: type II restriction-modification enzyme
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1252; Mature: 1252
Protein sequence:
>1252_residues MKFEAINEKEFLNPYHRKKPILETELNEFIKTLKDYKINLENNLKNNEDSLVANALSKFFENLSFQCEVKSIHKGNSGID LALKKDGLTQVIIEAKLPNSREFFSPSRPNCKALHECVLYYLRERKALNSSLKHIIITDFYSFFIFKADLFEELFNKNKY FKEAFENFESKNSLFKGNTDEIYKEFEKILNGDSTLKGLFVDLKPILEQDKLSFSKLKPLFKIFSKDCLLSEFNPNDANS LNNAFYKELLYILGLCESKQNSKLIIAKSEESKEEQGTFYTAINSKLKEENFETILKLLILWLNRILFLKLIESNLVRFN DDKNLKFLNFKKIPDFDKLSELFFEVLAKEKSTRKKSEFAYLPYLNSSLFEKQSIENTLEISSLSNDLKLFYYKNTVLKD DKCKAKKGQVGLLEYLFEFLDSFDFGSDDEQSEILSQKELISSSVLGNVFEKLNGYKEGSFYTPSFITSYMCKESITKVV LDKFNAQFDLDAKNISELRNFLRKEDKKAQKELLNSIKICDPAVGSGHFLVSALNVMLSIYDELNLFDEEFYLEVQNDEI LITGRKGKFIEYKRPNTPKDKAHLIQQELFHTKKDIIENNLFGVDINPNSCEITKLRLWIELLKHSFYQSFDDENYHDLK TLPNIDINIKCGNSLVSYFETGKSLSHYPNIKERMGKYKRIVKDYKEGFYTDKSHINQEIKNLKISFKNFCFADKFKKEM KGFNDKCEKYSKKYGNFLAVDDENLKFFVSANLTLFDFDEKEATKEFANLKKEYDNIFNLESNHPFEWRFEFPEILDDDG NFKGFDLIIGNPPYIKEAENKELFANTKKLRTYQGKMDIWYHFVGRGFDMLKNNGYLAFIATNNWITNSGAKKLRNIVLE ESQILSLVDFSSFMVFDSASIQTMIMQFQKIKPPKNYEFHFAKITTQTPIYEDALSLLKNEKTQNNEILKINLTPKKFID KTLNFTKSDYEELFNKIQKYGKFYLEEREVANGIHPHYDFINNRINSNHNFAFKTGQGIFGLSEEEKEKLKLTKLENNLV KPYYDTQNFLKFFFKKNNHQWLIYTNSSFKNPNSMDNYPNLKKHLDKFQNVITSDNKPYGLHRARDEKFFTGSPRIVALR KCVGEPKFSYVDFDCYVSATFYVIKTQRINVKYLTAILNSKLIAFWLKHKGKMQGNNYQIDKEPLLNIPIVTINSKNQKI ADEFINLVDEILKAKEQDKNANTQELENKINSLVYKLYNLNEEEIKIIENKE
Sequences:
>Translated_1252_residues MKFEAINEKEFLNPYHRKKPILETELNEFIKTLKDYKINLENNLKNNEDSLVANALSKFFENLSFQCEVKSIHKGNSGID LALKKDGLTQVIIEAKLPNSREFFSPSRPNCKALHECVLYYLRERKALNSSLKHIIITDFYSFFIFKADLFEELFNKNKY FKEAFENFESKNSLFKGNTDEIYKEFEKILNGDSTLKGLFVDLKPILEQDKLSFSKLKPLFKIFSKDCLLSEFNPNDANS LNNAFYKELLYILGLCESKQNSKLIIAKSEESKEEQGTFYTAINSKLKEENFETILKLLILWLNRILFLKLIESNLVRFN DDKNLKFLNFKKIPDFDKLSELFFEVLAKEKSTRKKSEFAYLPYLNSSLFEKQSIENTLEISSLSNDLKLFYYKNTVLKD DKCKAKKGQVGLLEYLFEFLDSFDFGSDDEQSEILSQKELISSSVLGNVFEKLNGYKEGSFYTPSFITSYMCKESITKVV LDKFNAQFDLDAKNISELRNFLRKEDKKAQKELLNSIKICDPAVGSGHFLVSALNVMLSIYDELNLFDEEFYLEVQNDEI LITGRKGKFIEYKRPNTPKDKAHLIQQELFHTKKDIIENNLFGVDINPNSCEITKLRLWIELLKHSFYQSFDDENYHDLK TLPNIDINIKCGNSLVSYFETGKSLSHYPNIKERMGKYKRIVKDYKEGFYTDKSHINQEIKNLKISFKNFCFADKFKKEM KGFNDKCEKYSKKYGNFLAVDDENLKFFVSANLTLFDFDEKEATKEFANLKKEYDNIFNLESNHPFEWRFEFPEILDDDG NFKGFDLIIGNPPYIKEAENKELFANTKKLRTYQGKMDIWYHFVGRGFDMLKNNGYLAFIATNNWITNSGAKKLRNIVLE ESQILSLVDFSSFMVFDSASIQTMIMQFQKIKPPKNYEFHFAKITTQTPIYEDALSLLKNEKTQNNEILKINLTPKKFID KTLNFTKSDYEELFNKIQKYGKFYLEEREVANGIHPHYDFINNRINSNHNFAFKTGQGIFGLSEEEKEKLKLTKLENNLV KPYYDTQNFLKFFFKKNNHQWLIYTNSSFKNPNSMDNYPNLKKHLDKFQNVITSDNKPYGLHRARDEKFFTGSPRIVALR KCVGEPKFSYVDFDCYVSATFYVIKTQRINVKYLTAILNSKLIAFWLKHKGKMQGNNYQIDKEPLLNIPIVTINSKNQKI ADEFINLVDEILKAKEQDKNANTQELENKINSLVYKLYNLNEEEIKIIENKE >Mature_1252_residues MKFEAINEKEFLNPYHRKKPILETELNEFIKTLKDYKINLENNLKNNEDSLVANALSKFFENLSFQCEVKSIHKGNSGID LALKKDGLTQVIIEAKLPNSREFFSPSRPNCKALHECVLYYLRERKALNSSLKHIIITDFYSFFIFKADLFEELFNKNKY FKEAFENFESKNSLFKGNTDEIYKEFEKILNGDSTLKGLFVDLKPILEQDKLSFSKLKPLFKIFSKDCLLSEFNPNDANS LNNAFYKELLYILGLCESKQNSKLIIAKSEESKEEQGTFYTAINSKLKEENFETILKLLILWLNRILFLKLIESNLVRFN DDKNLKFLNFKKIPDFDKLSELFFEVLAKEKSTRKKSEFAYLPYLNSSLFEKQSIENTLEISSLSNDLKLFYYKNTVLKD DKCKAKKGQVGLLEYLFEFLDSFDFGSDDEQSEILSQKELISSSVLGNVFEKLNGYKEGSFYTPSFITSYMCKESITKVV LDKFNAQFDLDAKNISELRNFLRKEDKKAQKELLNSIKICDPAVGSGHFLVSALNVMLSIYDELNLFDEEFYLEVQNDEI LITGRKGKFIEYKRPNTPKDKAHLIQQELFHTKKDIIENNLFGVDINPNSCEITKLRLWIELLKHSFYQSFDDENYHDLK TLPNIDINIKCGNSLVSYFETGKSLSHYPNIKERMGKYKRIVKDYKEGFYTDKSHINQEIKNLKISFKNFCFADKFKKEM KGFNDKCEKYSKKYGNFLAVDDENLKFFVSANLTLFDFDEKEATKEFANLKKEYDNIFNLESNHPFEWRFEFPEILDDDG NFKGFDLIIGNPPYIKEAENKELFANTKKLRTYQGKMDIWYHFVGRGFDMLKNNGYLAFIATNNWITNSGAKKLRNIVLE ESQILSLVDFSSFMVFDSASIQTMIMQFQKIKPPKNYEFHFAKITTQTPIYEDALSLLKNEKTQNNEILKINLTPKKFID KTLNFTKSDYEELFNKIQKYGKFYLEEREVANGIHPHYDFINNRINSNHNFAFKTGQGIFGLSEEEKEKLKLTKLENNLV KPYYDTQNFLKFFFKKNNHQWLIYTNSSFKNPNSMDNYPNLKKHLDKFQNVITSDNKPYGLHRARDEKFFTGSPRIVALR KCVGEPKFSYVDFDCYVSATFYVIKTQRINVKYLTAILNSKLIAFWLKHKGKMQGNNYQIDKEPLLNIPIVTINSKNQKI ADEFINLVDEILKAKEQDKNANTQELENKINSLVYKLYNLNEEEIKIIENKE
Specific function: Unknown
COG id: COG1002
COG function: function code V; Type II restriction enzyme, methylase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the N(4)/N(6)-methyltransferase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003356 - InterPro: IPR002052 - InterPro: IPR002296 - InterPro: IPR011639 [H]
Pfam domain/function: PF07669 Eco57I; PF02384 N6_Mtase [H]
EC number: =2.1.1.72 [H]
Molecular weight: Translated: 146923; Mature: 146923
Theoretical pI: Translated: 8.24; Mature: 8.24
Prosite motif: PS00092 N6_MTASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKFEAINEKEFLNPYHRKKPILETELNEFIKTLKDYKINLENNLKNNEDSLVANALSKFF CCCCCCCCHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ENLSFQCEVKSIHKGNSGIDLALKKDGLTQVIIEAKLPNSREFFSPSRPNCKALHECVLY HCCCEEEEEHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH YLRERKALNSSLKHIIITDFYSFFIFKADLFEELFNKNKYFKEAFENFESKNSLFKGNTD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH EIYKEFEKILNGDSTLKGLFVDLKPILEQDKLSFSKLKPLFKIFSKDCLLSEFNPNDANS HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH LNNAFYKELLYILGLCESKQNSKLIIAKSEESKEEQGTFYTAINSKLKEENFETILKLLI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHCCCEEEHHHHHHHHCHHHHHHHHHH LWLNRILFLKLIESNLVRFNDDKNLKFLNFKKIPDFDKLSELFFEVLAKEKSTRKKSEFA HHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEE YLPYLNSSLFEKQSIENTLEISSLSNDLKLFYYKNTVLKDDKCKAKKGQVGLLEYLFEFL ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH DSFDFGSDDEQSEILSQKELISSSVLGNVFEKLNGYKEGSFYTPSFITSYMCKESITKVV 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]