| Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 31758, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009708 |
| Length | 4,723,306 |
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The map label for this gene is 153950559
Identifier: 153950559
GI number: 153950559
Start: 3429631
End: 3430974
Strand: Reverse
Name: 153950559
Synonym: YpsIP31758_3046
Alternate gene names: NA
Gene position: 3430974-3429631 (Counterclockwise)
Preceding gene: 153948004
Following gene: 153948952
Centisome position: 72.64
GC content: 31.1
Gene sequence:
>1344_bases ATGAAAATAAATTATCAAATGGTATGGGGGTTATTAAATCAAGGATGTAATATATTCATTCCATTTGTAATAATGTTTAT GTCTTATAAGTATCTCCCCTTAGAAACGGCTAGTGTATGGGTTATATTCTTATCGATGATATCACTAATTACTTTGTTTG ATTTTGGTTTGTCACCAGCAATAGTCAGAAATGTTAGCTATGTGATATCTGGAGCGCAAAATCTAGTTAAAAGAGGAATA GATGATATTATTATAAAAGATGTAATATCCTACCCTCTTCTATCTAGATTGTTATTTGATATAAAACGGATTTATTTATA CCTATCTATAATAGCGTTTTTTATTATAGTCATTGGCGGTCTTTGGTATTTTTATTATATATCACCTCTGGATATAAAAA ACGAAGTTGCATATTCTTGGCTTTTGTTTTCAAGTACGCTAATCATAAATCTTATTTATTTATATTACGTTCCTGTATTA ACTGGCTTGGGTGAAATTGAAAGTTCGTATAAGGCAAATGTATTAGGACGAATCACTTGGTTAATATTAACTTTATTAGC ACTAACCTTGTTGCCCTCAATTTTAATTTTATCTTTATGCTTTTCTTTTTCAGTATTAATTAATAGATATATATGCTATT TTTTCTATAGAAGAAATTTCCATATAAAAAACCTAGATAAAATAGATACGGGAGTAGTTTCTACAATACCGTTCATTGGT CACAATGCGGCTAAACTAGGTGTGGTTAGCTTGGGCGCATTTTTGATAAATCGTTCGACTACTTTGATTGTAGGCATTGT TTGTCCCATCGTCACAGCTGGTCAATTTGTACTAAGTATGCAGGTTTTCTTTGCTTTAATGGCTATAAGTAATATTTTAT TAAGTATAAAAATCCCTGAAATATCGCAGGCCGTAGCCAAAAGGGAACACTATATTGTAAAGATTCTGATATATAAAGTG GTTGCTTTCTCTTCGAGTATTTATCTCTTGGGATTTGTAACATTTTTAATCTTGGCAGAATATGTACTTCCTACGATTGG AGTGAGTTTATCGTTTCTCCCACTCGACTACCTTCTCATTCTTGGATTAATCTATTTTTTAGAAATGAATCACTCCATTT GCGCCACAATAATAACCAGTAAAAATAATGTCCCATTCGTTTTTGCATCGCTATTTTCTGGTGGATTGATAATACTTTCA TCTATAATATTATCAATCCATTTTAAATATGGCGTGGTCGGATTAATTTTGTCTCAAGGGATTGTCCAGTTGATGTATAA TAATTGGAAGTGGCCATTAATGGTTTATCGTGAGTTTATTAAAAATAATATAGAGGATAGGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGTTAAAAGTTAAAAGTTAAAAGTTAAAAGTTAAAAGTTAAAAGTTAATATACCATGATTAATTTTCTTTAAAGTTAAAA ATAAATAATTGCAGGCTAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGTAGCTTTATGAAAAGTAATATTATAATTGATAATAGTAACTCAGATGATGTTCTATTGACTATAGCAATACCCACAT ATAAGAGATTTGGTTTATTA
Product: O-unit flippase protein Wzx
Products: NA
Alternate protein names: O-Unit Flippase-Like Protein
Number of amino acids: Translated: 447; Mature: 447
Protein sequence:
>447_residues MKINYQMVWGLLNQGCNIFIPFVIMFMSYKYLPLETASVWVIFLSMISLITLFDFGLSPAIVRNVSYVISGAQNLVKRGI DDIIIKDVISYPLLSRLLFDIKRIYLYLSIIAFFIIVIGGLWYFYYISPLDIKNEVAYSWLLFSSTLIINLIYLYYVPVL TGLGEIESSYKANVLGRITWLILTLLALTLLPSILILSLCFSFSVLINRYICYFFYRRNFHIKNLDKIDTGVVSTIPFIG HNAAKLGVVSLGAFLINRSTTLIVGIVCPIVTAGQFVLSMQVFFALMAISNILLSIKIPEISQAVAKREHYIVKILIYKV VAFSSSIYLLGFVTFLILAEYVLPTIGVSLSFLPLDYLLILGLIYFLEMNHSICATIITSKNNVPFVFASLFSGGLIILS SIILSIHFKYGVVGLILSQGIVQLMYNNWKWPLMVYREFIKNNIEDR
Sequences:
>Translated_447_residues MKINYQMVWGLLNQGCNIFIPFVIMFMSYKYLPLETASVWVIFLSMISLITLFDFGLSPAIVRNVSYVISGAQNLVKRGI DDIIIKDVISYPLLSRLLFDIKRIYLYLSIIAFFIIVIGGLWYFYYISPLDIKNEVAYSWLLFSSTLIINLIYLYYVPVL TGLGEIESSYKANVLGRITWLILTLLALTLLPSILILSLCFSFSVLINRYICYFFYRRNFHIKNLDKIDTGVVSTIPFIG HNAAKLGVVSLGAFLINRSTTLIVGIVCPIVTAGQFVLSMQVFFALMAISNILLSIKIPEISQAVAKREHYIVKILIYKV VAFSSSIYLLGFVTFLILAEYVLPTIGVSLSFLPLDYLLILGLIYFLEMNHSICATIITSKNNVPFVFASLFSGGLIILS SIILSIHFKYGVVGLILSQGIVQLMYNNWKWPLMVYREFIKNNIEDR >Mature_447_residues MKINYQMVWGLLNQGCNIFIPFVIMFMSYKYLPLETASVWVIFLSMISLITLFDFGLSPAIVRNVSYVISGAQNLVKRGI DDIIIKDVISYPLLSRLLFDIKRIYLYLSIIAFFIIVIGGLWYFYYISPLDIKNEVAYSWLLFSSTLIINLIYLYYVPVL TGLGEIESSYKANVLGRITWLILTLLALTLLPSILILSLCFSFSVLINRYICYFFYRRNFHIKNLDKIDTGVVSTIPFIG HNAAKLGVVSLGAFLINRSTTLIVGIVCPIVTAGQFVLSMQVFFALMAISNILLSIKIPEISQAVAKREHYIVKILIYKV VAFSSSIYLLGFVTFLILAEYVLPTIGVSLSFLPLDYLLILGLIYFLEMNHSICATIITSKNNVPFVFASLFSGGLIILS SIILSIHFKYGVVGLILSQGIVQLMYNNWKWPLMVYREFIKNNIEDR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50747; Mature: 50747
Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKINYQMVWGLLNQGCNIFIPFVIMFMSYKYLPLETASVWVIFLSMISLITLFDFGLSPA CCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH IVRNVSYVISGAQNLVKRGIDDIIIKDVISYPLLSRLLFDIKRIYLYLSIIAFFIIVIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWYFYYISPLDIKNEVAYSWLLFSSTLIINLIYLYYVPVLTGLGEIESSYKANVLGRITW HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILTLLALTLLPSILILSLCFSFSVLINRYICYFFYRRNFHIKNLDKIDTGVVSTIPFIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCHHHHCCCCC HNAAKLGVVSLGAFLINRSTTLIVGIVCPIVTAGQFVLSMQVFFALMAISNILLSIKIPE CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCH ISQAVAKREHYIVKILIYKVVAFSSSIYLLGFVTFLILAEYVLPTIGVSLSFLPLDYLLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LGLIYFLEMNHSICATIITSKNNVPFVFASLFSGGLIILSSIILSIHFKYGVVGLILSQG HHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVQLMYNNWKWPLMVYREFIKNNIEDR HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MKINYQMVWGLLNQGCNIFIPFVIMFMSYKYLPLETASVWVIFLSMISLITLFDFGLSPA CCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH IVRNVSYVISGAQNLVKRGIDDIIIKDVISYPLLSRLLFDIKRIYLYLSIIAFFIIVIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWYFYYISPLDIKNEVAYSWLLFSSTLIINLIYLYYVPVLTGLGEIESSYKANVLGRITW HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILTLLALTLLPSILILSLCFSFSVLINRYICYFFYRRNFHIKNLDKIDTGVVSTIPFIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCHHHHCCCCC HNAAKLGVVSLGAFLINRSTTLIVGIVCPIVTAGQFVLSMQVFFALMAISNILLSIKIPE CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCH ISQAVAKREHYIVKILIYKVVAFSSSIYLLGFVTFLILAEYVLPTIGVSLSFLPLDYLLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH LGLIYFLEMNHSICATIITSKNNVPFVFASLFSGGLIILSSIILSIHFKYGVVGLILSQG HHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVQLMYNNWKWPLMVYREFIKNNIEDR HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA