| Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 31758, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009708 |
| Length | 4,723,306 |
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The map label for this gene is yuaQ [H]
Identifier: 153949324
GI number: 153949324
Start: 785383
End: 798558
Strand: Direct
Name: yuaQ [H]
Synonym: YpsIP31758_0673
Alternate gene names: 153949324
Gene position: 785383-798558 (Clockwise)
Preceding gene: 153950491
Following gene: 153950041
Centisome position: 16.63
GC content: 53.85
Gene sequence:
>13176_bases TTGTTAAGGCTATGTATGAATGCAATATTTAAGGTGATTTGGAATATATCTCTGAATGTCTGGGTTGCCGTAGGTGAATT CGCCAAAGGAAAACAAAAATCAAAAACAACCTGTGCGATTCCTCCATCTCAACATACCTCTGCAGTAATAAATAAATTTT CGTTTCCCCGGTTGGGCTTCTTGGCGATAGCTATTATAGGCGTCTTGGGGGGGCAGAATGCTTATGCTATCGATGCCCAA GGTTGTACGGACCTTGGATCAAGCTGTGTCACGGTGAGTACTGATGCGGAATTGAGGAGTGCGCTCACCAGTGGGACGGC GACCACTATTTTAATGCTCAATGACATTACGTTAGCGTCTAATATTTCCGTCAATCAGGGCACGAGCAACCGGAAAGATT TGGTCATTGATGGCGGTGGATTTAAGCTGAACACCGGGGGCGCTCAATTTATATTCACTAACCAAACTAACGTAAGTTGG GGTGGGGCGGCAGGGTCATTTACCTTATCTAATCTGGCAGAACTGAATTCTGCTACAGGGAATGATAACACTGTTTTCTC TATGGATGGTGGTAACAGTGCGATTAATATTATTGTCAATAATATTGGTACGATGACCAACAGTATGCTGGCGGTACTGG GGGGTATGGGCTCCGGTGGCGCACCAAACTTAAATAGCCAGTTGGTATTAGGCAACTTTACTGATCCGTTATCATTAACC TTTGGAACCAATCACCAGCTTGCGCAAGCCAGTAATATAAAATTTACCGGGCATTTTGATTTAACGGCGACGACAGGTGC ATATCCTGCCGTATTTTGGACTAATGCGGCAGATGCTAATAGCCGCATGTATTTTAGCAGCACGGCAAATGTATCTATTA CCACACCGCTCTTTGCCAGTGGTCCTGGGGCATATGGTAATTATCAATATACGTTAGAAGACGGTGCCCAGTTTGCGCTT 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Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTATCGTCAGGTAATTAACGACTAACGACATGATGGTGATCAACGGCGCATATTGCAGGACAGAATATGCGCCGTTTT TTATGGGGTAACGGGCCGTA
Product: autotransporter protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 4391; Mature: 4391
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell outer membrane; Peripheral membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 autotransporter (TC 1.B.12) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788565, Length=498, Percent_Identity=29.3172690763052, Blast_Score=194, Evalue=8e-50,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005546 - InterPro: IPR013425 - InterPro: IPR006315 - InterPro: IPR012332 - InterPro: IPR011050 - InterPro: IPR004899 [H]
Pfam domain/function: PF03797 Autotransporter; PF03212 Pertactin [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 435662; Mature: 435662
Theoretical pI: Translated: 3.88; Mature: 3.88
Prosite motif: PS50065 HMG_COA_REDUCTASE_4
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLRLCMNAIFKVIWNISLNVWVAVGEFAKGKQKSKTTCAIPPSQHTSAVINKFSFPRLGF CHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCHHH LAIAIIGVLGGQNAYAIDAQGCTDLGSSCVTVSTDAELRSALTSGTATTILMLNDITLAS HHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHCCCCEEEEECCHHHHHHHCCCCEEEEEEEECEEEEE NISVNQGTSNRKDLVIDGGGFKLNTGGAQFIFTNQTNVSWGGAAGSFTLSNLAELNSATG CCEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCCCEEEEEECCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCC NDNTVFSMDGGNSAINIIVNNIGTMTNSMLAVLGGMGSGGAPNLNSQLVLGNFTDPLSLT CCCEEEEECCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEE FGTNHQLAQASNIKFTGHFDLTATTGAYPAVFWTNAADANSRMYFSSTANVSITTPLFAS ECCCCCEEECCCEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCCEEEECCEEEC GPGAYGNYQYTLEDGAQFALNSDQNVFGSVNGGLLIGTYSAGVFGSGAVLQLANTAGTAY CCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCEE STGNAITNGGNINAMGNGVTQSGDVIYNLAAGSKLAVSGANSIGILATKTGPTNSGGIYI ECCCEEECCCCEEECCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCEEE SSGAAINAAGIGISASHGGSAPIVLENKNSGVITATTGISATNTGSGSTDVTNHGVITAA 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