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The map label for this gene is yfcC [C]

Identifier: 153936259

GI number: 153936259

Start: 1504606

End: 1506126

Strand: Direct

Name: yfcC [C]

Synonym: CLC_1446

Alternate gene names: 153936259

Gene position: 1504606-1506126 (Clockwise)

Preceding gene: 153935449

Following gene: 153936568

Centisome position: 40.01

GC content: 31.43

Gene sequence:

>1521_bases
GTGACAAAAAAGAAAAAGAAAATAAGCTTTCCGACAGCTTTTACGGTATTGTTTATTGTATTAATTATTGCAGCTATACT
TACTTATGTAGTTCCAGCTGGATCTTATTCAAAATTAAGTTATGATAACGATAGTAAAGTTTTTGTTGTAACTAAACCAG
ATGAATCGACAAATGAATTACCAGCAACACAAAAGACTTTGGATAAACTTAAGATTAAAGTAAGTGTAGAAAAATTTAAA
GATGGTAGTATTAATAAGCCTGTAGCTATTCCAGATACTTATGAACAGGTAGAACAGAAACCTCAAGGGTTTTTTGAAGT
AATTGAAGCACCTATTAAAGGGGTGTATGATACTATCGATATTATAATGTTTGTACTTATTTTAGGAGGAGTTATTGGTG
TAGTAAATAGTAGTGGAGCATTTGATGCAGGTATTGCCAAACTTTCTGTAGCTACTAAGGGTAAAGAATACCTATTAATA
GTTATTATCACTACATTAATTGCTTTAGGTGGAACTACTTTTGGACTAGCAGAAGAAACCATTGCATTATATCCAATACT
GGTTCCAGTTTTTATAGCAGCAGGATATGATGCTTTAGTTTGTATTGCAGCCTTGTATATGGGATCATCTATAGGTACTA
TGTTCGCTACGGTAAATCCTTTTTCTGTTGTTATAGCATCTAATACTTCAGGAATATCTATTGCTTCAGGATTTATATTT
AGAATTGTAGGACTTATTTTAGCAGTAGCTATAACTATTGTTTACATTGTAAAATATGGAGTTAAGGTTAAAAAAGATCC
AAGCAAATCTATAATATATGAACAAAGGAAAGAAATACAAGAGAAGTTTTTAAAAGATTATAGTAAGGATGATGTTACTC
TAAAATTTTCTTTAGGTCGTAAGCTAATGTTAATAATATTCGCATTAACATTCGTAGTTATGATTTGGGGTGTAGCTTAT
AAAAAATGGTGGTTTACTGAGATGACAGCTCTGTTCCTTGTTGTAGGGATTATTTTAGGTGTAATCTCACGAATGGGAGA
AAAGAATTTTGTAGATAAGTTTGTAGCTGGTTCAGCTGATTTGGTAGGAGTTGCATTAGTAATTGGAGTTGCAAGATCTA
TTAATCTTGTTATGGAAAATGGAATGATTTCTGATACAATTTTGTATCATTCTTCAAATATGATATCAGGGATGAATTCT
AGTGTATTTATAATATTTATGTTAATTGTATTTATAGGACTTGGATTTTTTATACCATCATCTTCAGGACTTGCAGTGCT
TTCAATGCCTATTATGGCACCTCTAGCAGACAGTGTAGGATTGCCAAGAGAGACTATAGTAAATGCTTATATGTTTGGCC
AGGGATTAATTTCATTCATAACTCCAACAGGGCTTATATTAGCTACATTAGCTATGGTAGATGTTACTTATGATAAATGG
ATTAAATTTATAATGCCACTTATGGGATATATAGCAGCCTTATCAGCTATAATGTTATTAATACAAAGCTTTGTTGCTTA
G

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTTGCTTAAAGCAATATCTATACACTTAAAATATTATGCTTTAAGTGTATAGATAAGAAGCGATGCTTGAAATATAT
TAAAAATGGGGGGGATTGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTAATAAAAAATTCAAAAGCTATGAATTGAAAAATTTTATTATATTTCAATTCATAGCTTTTATTGCTTATTATAAGTT
AAAAGGTAAAAATAAATTCA

Product: C4-dicarboxylate transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 506; Mature: 505

Protein sequence:

>506_residues
MTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVSVEKFK
DGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLI
VIITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIASGFIF
RIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMIWGVAY
KKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNS
SVFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDVTYDKW
IKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA

Sequences:

>Translated_506_residues
MTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVSVEKFK
DGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLI
VIITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIASGFIF
RIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMIWGVAY
KKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNS
SVFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDVTYDKW
IKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA
>Mature_505_residues
TKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVSVEKFKD
GSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLIV
IITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIASGFIFR
IVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMIWGVAYK
KWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNSS
VFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDVTYDKWI
KFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA

Specific function: Unknown

COG id: COG1288

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis ycgA [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082082, Length=519, Percent_Identity=30.2504816955684, Blast_Score=235, Evalue=5e-63,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018387
- InterPro:   IPR018385 [H]

Pfam domain/function: PF03606 DcuC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54919; Mature: 54788

Theoretical pI: Translated: 9.38; Mature: 9.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNEL
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC
PATQKTLDKLKIKVSVEKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTID
CCHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLIVIITTLIALGGTTFGLAEET
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
IALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIASGFIF
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHH
RIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCH
KLMLIIFALTFVVMIWGVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCH
LVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNSSVFIIFMLIVFIGLGFFIPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDVTYDKW
CCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNEL
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC
PATQKTLDKLKIKVSVEKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTID
CCHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLIVIITTLIALGGTTFGLAEET
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
IALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIASGFIF
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHH
RIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCH
KLMLIIFALTFVVMIWGVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCH
LVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNSSVFIIFMLIVFIGLGFFIPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDVTYDKW
CCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]