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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 153935627

GI number: 153935627

Start: 369056

End: 370918

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: CLC_0380

Alternate gene names: 153935627

Gene position: 369056-370918 (Clockwise)

Preceding gene: 153937494

Following gene: 153935907

Centisome position: 9.81

GC content: 25.34

Gene sequence:

>1863_bases
ATGAATTTTAGAGAATTTTCCACCAAAAATGTAGTAAGAAATATTAGAGCATATTTTGCATATTTATTAAGCAGTACTAT
ATCAGCAGCTTTATTATTTTCATTCACTATGCTTGTATTACATCCTAATTTAGATGTAACTACATTTCCAATATATTTAC
AGAAGGCATTTAATATAACAACAATAATTGCATATCTATTTTTATGTCTATTTATATTTTATTCTGTAAGTGTATTTATA
AAGAGTAGGTTTAAAGAGTTCGGTATATTATATATTTTAGGATCTTCGGATAAACAAATTAAAAAGATGATTGCAATTGA
AAATGTATTAATTAGTTCACTATCTGGAATATTTGGGGTTATATTAGGATTAGTTTTTTCTAAAATATTTTTAATACTTA
GTGGAAGACTTTTAGGGTATAATGCTTTACGATTCTATTTGCCAGTTAAAGCAATTATAATAACTTTTTTAGCCTTTGTT
TTAATGGGAATTTTAATTTCTATCTTTACTACATATATGATAAAGGAAGATGAAGTTTTAAATTTACTCAAGGGCACACA
AAAACCAAAGAGTGAGCCAAAGACTTCAAATATTATTGCAATATTGTGTGTAGTATTATTGCTTGGAGGATATTATTTTT
CTATTACATCAACTATGAATAATATAGCCTATAGAATTATACCTGTAACAGTAGTAGTTATAATTGGAACATATTTGTTG
TTTTCACAATTAAGTGTTTTTGTAATAAAGATTTTAAAAAAGAATAGAGAATTCTATATGAATAAAACAAAGGTATTATG
GATTTCAACCCTTTTATATAGGATAAAGGATAATACTAGAATGTTCTTTTTAATCACCATAACTTCTGCCATGGCATTTA
CATCTATTGGAGCTGTATCAGCTTTTTGGATCAATAAGGAGGCTGAAGTTGATAAAAATTTTCCTCAAGCATTTTTTTAC
GCATCTTACAAAAAAGATTATAACGAATTAGACTTTATAGAAGGTTCTTTAAAAAAAGAAGGTTATAACTATACAAAAGT
TCAAGGGCATATTAAGTCTTTAGTATCTAAGAAAAATACTATCCCTATAAATATAATTAATGAAAGTACCTATAATAGTA
TAGCTGAATCACTTGGACAAGAAAAAATACATATTAAAAGTAATGAAGCAATAGCAGGGACACCATTAATGGGTAATAAG
AGAGATAATATTTTAGTAAATAATATGGATATAAAAGTCATCACAACGTTAGAAGAAAGAATAATTCCTGCATTATATGA
TTATGTATATATTGTAAAAGATGATGTATATGATAAAATTAGTGGTTCAACATCTTCATTTTGCGCATTTAATGTAGAAA
GTTATAAAGATACTTTGAATATTTGTAAAAACTATGAGGCAAAATTTGGAGAAAGCAATAATAAGAAAGATCATATTATT
TTAATGAAAGCGAATATACTAGAATCACATAAAATAGGATATGGAGTGATTATGTTCTTAACTATATTCATAGGAATAAT
TTTCTTTGTAACTACGGGGAGCTTTTTATATAACAAATATTATATGGATGTTCAACAAGATAGAATGAAGTATGAACAGC
TAAATAAAATTGGGATAACCTTTAAAGAAATAAAAAAAGTATCAACTATTGAAATTGGAGTACTATTTTTGTTCCCTTAT
ATTGTTTCAGTAATACATTCACTATTTGCATTGTCAGCATTAAAAAATGCCTTTGAAATGGATGTTAACTTAGTAGCATT
TTTTGTAATGGGTAGTTTCTTCATTATTCAAATAATATATTTCTTTATTATAAGAGGGAACTATCTATTAGATATAAAAA
AAAGTTTAGCAAATAGAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGATGGAGTTATATACAATGAAATTTATAAGGGGGAGAGTAGGCAGCAATTTTATCAAGAAATAATAGATTTACTTGCT
TTATTAGGAGGTGCTAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACTGTATTTCACTCACAAATAGTGGGTAACAAAGAGATTCTTTATAGCCTAGATGAAAATTTAAGAGTCCAGTATAAT
ATGAGAGCTTTTAAAGATTA

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 620; Mature: 620

Protein sequence:

>620_residues
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGVILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVNNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEAKFGESNNKKDHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIYFFIIRGNYLLDIKKSLANRI

Sequences:

>Translated_620_residues
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGVILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVNNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEAKFGESNNKKDHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIYFFIIRGNYLLDIKKSLANRI
>Mature_620_residues
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNITTIIAYLFLCLFIFYSVSVFI
KSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGVILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFV
LMGILISIFTTYMIKEDEVLNLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVSAFWINKEAEVDKNFPQAFFY
ASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNTIPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNK
RDNILVNNMDIKVITTLEERIIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEAKFGESNNKKDHII
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGITFKEIKKVSTIEIGVLFLFPY
IVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIYFFIIRGNYLLDIKKSLANRI

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70942; Mature: 70942

Theoretical pI: Translated: 9.83; Mature: 9.83

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNIT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TIIAYLFLCLFIFYSVSVFIKSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFVLMGILISIFTTYMIKEDEVL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
NLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
HHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVS
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
AFWINKEAEVDKNFPQAFFYASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNT
EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNKRDNILVNNMDIKVITTLEER
CEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEECCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHH
IIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEAKFGESNNKKDHII
HHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCEEE
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGIT
EEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEIKKVSTIEIGVLFLFPYIVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIIRGNYLLDIKKSLANRI
HHHHCCCEEEEEHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNFREFSTKNVVRNIRAYFAYLLSSTISAALLFSFTMLVLHPNLDVTTFPIYLQKAFNIT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TIIAYLFLCLFIFYSVSVFIKSRFKEFGILYILGSSDKQIKKMIAIENVLISSLSGIFGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGLVFSKIFLILSGRLLGYNALRFYLPVKAIIITFLAFVLMGILISIFTTYMIKEDEVL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
NLLKGTQKPKSEPKTSNIIAILCVVLLLGGYYFSITSTMNNIAYRIIPVTVVVIIGTYLL
HHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSQLSVFVIKILKKNREFYMNKTKVLWISTLLYRIKDNTRMFFLITITSAMAFTSIGAVS
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
AFWINKEAEVDKNFPQAFFYASYKKDYNELDFIEGSLKKEGYNYTKVQGHIKSLVSKKNT
EEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
IPINIINESTYNSIAESLGQEKIHIKSNEAIAGTPLMGNKRDNILVNNMDIKVITTLEER
CEEEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEECCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEHHHHH
IIPALYDYVYIVKDDVYDKISGSTSSFCAFNVESYKDTLNICKNYEAKFGESNNKKDHII
HHHHHHHHHEEEEHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCCEEE
LMKANILESHKIGYGVIMFLTIFIGIIFFVTTGSFLYNKYYMDVQQDRMKYEQLNKIGIT
EEEECHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEIKKVSTIEIGVLFLFPYIVSVIHSLFALSALKNAFEMDVNLVAFFVMGSFFIIQIIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIIRGNYLLDIKKSLANRI
HHHHCCCEEEEEHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]