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The map label for this gene is ypnP [H]

Identifier: 153934683

GI number: 153934683

Start: 351087

End: 352415

Strand: Direct

Name: ypnP [H]

Synonym: CLC_0363

Alternate gene names: 153934683

Gene position: 351087-352415 (Clockwise)

Preceding gene: 153937142

Following gene: 153937304

Centisome position: 9.34

GC content: 31.15

Gene sequence:

>1329_bases
ATGGAAACTGACATGACCAAAGGAAAACCAATGGGAATCATTGTAAAGTTCTTTATTCCTATGTTTATCGGAAATTTATT
TCAACAAATATATAATGTAGTAGATTCTATTGTTATAGGGAGATTTGTAGGAAATGAGGCCTTTGCAGCTGTAGGGTCCT
GTTTCCTCATTATGAGTTTTATGACATCTATTTTAATTGGACTAGCTATGGGAGCATCTGCATTCTTTTCACAACTTTAT
GGTGCAAAACAATATGATGAAATGAAAAAAGCTATATCTACTTCATTTTTTTTCATATTATCTATAAGCATTCTGTTAAG
CCTTATAACAAATGTATTTCTTTATGAAATAATTGAATTATTTCAGATGCCGAAAGATACTGTAACATATTCTGCTGAAT
ATTTAAGGTATATCTTAACAGGGCTTATATTCACCGGACTTTATAATATATGCGCTTATTTGCTACGTTCCATTGGAGAT
TCAAAATCTCCACTATATTTTTTGATTGTTTCTTGTATTTTAAATACTATTTTAGATTTAATTTTTGTCTTAGTGTTTAA
CATGGGAGTTTCAGGTGTAGGATTAGCTACATTTATAGCACAAGGATTATCCGCATTATGGTGTGCATTCTATACTGTAA
AACATATGAAATTTCTTGATTTTAAAAGAAAGGATATTGTATTTAGTAGAAAACTTTTTAGAACGATTTTAAGCTACTCT
GTTTTGACAGCAGTGCAGCAATCTCTATCAAGCTTTGGAATGCTAATGATTCAAGGATTAATTAATACATTCGGAACTAC
TGTGATGGCTGCCTTTGCAGCTTGTTCAAAGATTGATGAGTTTGCTAATCGTCCTTTACAGGATTTGAGTAATGCATTTT
CCACTTATGTGGCACAAAATAAGGGAGCAGGAAATATAGAAAGGATTCGCCAAGGGTTTTATGCTATTTTAAAAGTTATT
GCTTTAATCTCTTTTATAATATCAATAGTTGTCTTTATTTTCGCACCTAATTTAATATCAATTTTTGTAAAAAAGGAATC
CATAGATATTATTCAGGTTGGGGTAGGTTATCTTCGGATTGTATGTATTTTTTACATATTACTTGGTTGTATTGTTATGT
TTTATGGATTTTTCCGTGGTATGGGAGAAGTTAATATATCAATTATTTTAACTGTTGTATCTCAAGGAATAAGAGTAGCC
TTGGCCTATGGACTAGCTAGAACATCTATGGGATTTACAGGAATATGCTGGTCCATTGTAATTGGGTGGCTCTTATCCAA
TGCTTTAGGCAGATTTATGTATAAAAAAGTAATGGCAAATCCAATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTGAGATATATACCAATCCTATAACGGGAGAAATGGCTATTGCTTATAAAATGCCTAAATATTAAAGCGTACATATTTG
AAAAAAAGGAGGTTTTTATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATATAGATAGGAGTGTTACATGAACACTCCTACTTTTACTGCACTCAGTACTGGCAATAACTTAGCTTATTGGTGAAA
GTCTTAGATTAGTTTAATAG

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 442; Mature: 442

Protein sequence:

>442_residues
METDMTKGKPMGIIVKFFIPMFIGNLFQQIYNVVDSIVIGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILSISILLSLITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSIGD
SKSPLYFLIVSCILNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCAFYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFRTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIERIRQGFYAILKVI
ALISFIISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWLLSNALGRFMYKKVMANPI

Sequences:

>Translated_442_residues
METDMTKGKPMGIIVKFFIPMFIGNLFQQIYNVVDSIVIGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILSISILLSLITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSIGD
SKSPLYFLIVSCILNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCAFYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFRTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIERIRQGFYAILKVI
ALISFIISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWLLSNALGRFMYKKVMANPI
>Mature_442_residues
METDMTKGKPMGIIVKFFIPMFIGNLFQQIYNVVDSIVIGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILSISILLSLITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSIGD
SKSPLYFLIVSCILNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCAFYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFRTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIERIRQGFYAILKVI
ALISFIISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWLLSNALGRFMYKKVMANPI

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49215; Mature: 49215

Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
6.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
6.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]