| Definition | Bacillus cereus subsp. cytotoxis NVH 391-98, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009674 |
| Length | 4,087,024 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 152974193
GI number: 152974193
Start: 407753
End: 410575
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: Bcer98_0357
Alternate gene names: 152974193
Gene position: 407753-410575 (Clockwise)
Preceding gene: 152974192
Following gene: 152974195
Centisome position: 9.98
GC content: 34.61
Gene sequence:
>2823_bases ATGAAACAAATATGGCGTATTTATACGACAGATGTACGGAATGTAGCTAAACATTGGGCTGCGATTGTTATTGTACTAGG ATTAATGATTTTGCCATCGTTATATGCATGGTTTAACATTAAGGCTTCTTGGGATCCATACGGGAATACAAACGAGGTGC CAATTGCAGTTTCTAACCAAGATGCTGGTTCGAATATAAGGGGGAAAGATATTAACATCGGGGACGAAATTGTCAATTCA CTCAAGAAAAACAAAAATCTAGGTTGGAAGTTTGTTGATGAGAAACAAGCAATCTACGGGGTTGAACATGGAGATTACTA TGCAAGTATTACAATTCCAAAAGATTTCTCTGAAAAAATTGCGACGGTTATTAGTGATAATCCGCAAAAACCAGAACTAG ATTATTTCGTAAACGAAAAAGTAAATGCGATTGCACCGAAAATTACAGCAAAAGGTGCATCAGGTATTACAGAAGAAATT AGTAAGAACTTTGTTAAAACAGCAAACGGAGAGATTTTTAAAATTTTCAATAGCCTTGGAATCGATTTAGAAACAAACTT GCCAAGTATTGAAAAAGTAAAAGATCTTGTATTTAAGTTAGAAGCGCAATTTCCAAAAATGAATAAACTTATGGATACAG CACTAGATGATGCAACTAGAGCGCAAGATATTGTAAAAGTAGCGCAAGAGGATCTGCCAGTTGTACAGAGCGTTATTAAT GATGGGCAGGAAACTTTGAACAACTTAGATAAATTCTTTGCACGAAATGATGAGACATTACAGAATGCACCAGGAACAAT AAAGAGAGATTTAACGGCTCTAAAAAGCGGAATGGATGGTGCAGCGGCTATAACAGATTTCTTAATGGGACCTGGGGCGA ATTTGAATATTCCTGATATTTCTCAGTTACCTACGCTGCCGGACCTTCCAAAAATTAATGATGAAGGTTACAAAAATATA GCAAGAAACATTAATCAAACAGTGAATAGTGTTTTAAACTCAGCACGTACAGGTACTGCATATGCACAGAGTGTGATGGA TGGGTTACAAAATGGAAGTATTGATCCTGAAATAGCAAAGAAAAATATCACTACTATTTCTAATAATCTCCAGACTCATA TAGACAATCTTTCTTCAATCATTACCATGATGTCTACACTTCAGCAGAATGCAACAACTGATTTTGGTAAGAAGTTTTTC GGTGATAGAGTAGCACATTTAACAGCTATTCGAGAAGGACAGCAAGATTTGAACAATCGATTTAAACGTCTTAATGACTT AATTAGTTCAGGACAAGAAGTAAAACAAGATGTGAGAGATGCAATTAATCAAAAATTAGACGCAACAAACGCTTTAATTG ATCAAGCGGAAAAGGATTATAATGAAACGTTTGTAGCGGATTATAAAAAAGCAGTCAGTACTTTGGAGCAGACTAGTGAT AAAGTGAATGAAGAGTATAATAAGGTAAGACAGCAATATGAACAAACTAAATCTATCCTTCAAAAAGCAAAAGAAGACTT TGAAAATAAAGGGATTAATGGATTAGATTCAACAAAAGTAGCTTTAAATAGTTTAAACAGTCAATTCCAAGCAGCTTCAA ATATGATTACTGATATGATACCTGTCTTAGAGAGTGCGAATAAAGTTTTTGCTGATGTCAATAGTGATAAAAACTTTAAT AATCAAATTGCGAAGCTGAAAAAAGCACAAAGTCTTCTACAAAAAGGTATAAAATTAACTGATAAAGGAATTGAAGCGAT TAATAAAGGACAACAACCTGCGAAAGATATTATTGAAAGTATTAATGAAGTATCCAAAAATACTTCAGCACAATTAGGTG ATATTTTAGCAAGGTACGATTCCGAAATCGTTCCAAACTTCAATGCAGCAATTGCACGTACAAAAGAGATGTCAAAAAAT ACATCTAAAATTTTAAGTGATGCGAATAAAAAGCTTCCAGATGTGAAGAAGTTGCTAGAAGACTCCTCAAAAGGATTGGT AGAAGGCACAAAGAAACTGAAAGATATTAAAGCGCAGATGCCAGCTACTCAGCAAAAAATAAAGGAACTAGCAGATAAAA TTCGTCAGTTTGAATCGGAAGAGGATATAAAAGATATTATTCGTTTATTGAAAAATGATGTTGAAAAGCAAAGTGATTTC TTTGCCAATCCTGTGAAATTAAAAGAAAATAAATTATTTGCAATGCCAAACTATGGCTCAGCAATGTCACCGTTTTATAC AGTGCTTGCATTATGGGTAGGAGCATTGTTAATGGTTTCATTATTAACAGTAGAAGTGCATGAACCGGGGACGGAATATA AGAGTCATGAAATTTATTTTGGACGCTTCTTAACGTTTTTAACGATAGGGCTTGCACAAGCGTTTATCGTATCGATGGGA GATATGTTCTTACTTGGTACGTACGTAGTTGATAAATTCTGGTTTGTGGTATTCAGTTTATTTAGCAGTGCAGTCTTTGT TTGCATCGTATACTCTCTCGTTTCTGTTTTCGGAAACGTTGGGAAATCAATGGCAATCATTTTACTCGTACTACAAGTAG CTGGGTCGGGAGGAACGTTCCCAATTCAAATGTTACCGAAATTCTTCCAAGCAATGTATCCATTCTTGCCGTTCACATAT GCGATTAGTGCAATTCGTGAAACAGTAGGTGGAATGCTTTGGGATATTGTCATTAGAGATTTACTTGTATTGAGTGTGTT CGTTGTAATCATGTTAATTCTTGCATTATTACTGAAAACACCAATTAATAAATCGAGTGAAAAGTTTGTTGAGAATGCAA AAGGAAGTAAAATTATTCACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGTATTTTCGTTTAATTCGGGTGGTGGAAAATGATATAATTGCAAAATGCATGTATCGTTTTTGGAATAAGGAAAAATAT ATAATTAGGTGATTGCTTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATAAAGGTTTCTACCGAATTTGGTAGGAACCTTTTGTTTGATTAATATGGCGTTTTAGAAATGATAAAGTAATCGAAA AATGTATAGCAGTTTTAAAT
Product: ABC-2 type transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 940; Mature: 940
Protein sequence:
>940_residues MKQIWRIYTTDVRNVAKHWAAIVIVLGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTNEVPIAVSNQDAGSNIRGKDINIGDEIVNS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVEHGDYYASITIPKDFSEKIATVISDNPQKPELDYFVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNSLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPKMNKLMDTALDDATRAQDIVKVAQEDLPVVQSVIN DGQETLNNLDKFFARNDETLQNAPGTIKRDLTALKSGMDGAAAITDFLMGPGANLNIPDISQLPTLPDLPKINDEGYKNI ARNINQTVNSVLNSARTGTAYAQSVMDGLQNGSIDPEIAKKNITTISNNLQTHIDNLSSIITMMSTLQQNATTDFGKKFF GDRVAHLTAIREGQQDLNNRFKRLNDLISSGQEVKQDVRDAINQKLDATNALIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTLEQTSD KVNEEYNKVRQQYEQTKSILQKAKEDFENKGINGLDSTKVALNSLNSQFQAASNMITDMIPVLESANKVFADVNSDKNFN NQIAKLKKAQSLLQKGIKLTDKGIEAINKGQQPAKDIIESINEVSKNTSAQLGDILARYDSEIVPNFNAAIARTKEMSKN TSKILSDANKKLPDVKKLLEDSSKGLVEGTKKLKDIKAQMPATQQKIKELADKIRQFESEEDIKDIIRLLKNDVEKQSDF FANPVKLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEPGTEYKSHEIYFGRFLTFLTIGLAQAFIVSMG DMFLLGTYVVDKFWFVVFSLFSSAVFVCIVYSLVSVFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMLPKFFQAMYPFLPFTY AISAIRETVGGMLWDIVIRDLLVLSVFVVIMLILALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Sequences:
>Translated_940_residues MKQIWRIYTTDVRNVAKHWAAIVIVLGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTNEVPIAVSNQDAGSNIRGKDINIGDEIVNS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVEHGDYYASITIPKDFSEKIATVISDNPQKPELDYFVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNSLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPKMNKLMDTALDDATRAQDIVKVAQEDLPVVQSVIN DGQETLNNLDKFFARNDETLQNAPGTIKRDLTALKSGMDGAAAITDFLMGPGANLNIPDISQLPTLPDLPKINDEGYKNI ARNINQTVNSVLNSARTGTAYAQSVMDGLQNGSIDPEIAKKNITTISNNLQTHIDNLSSIITMMSTLQQNATTDFGKKFF GDRVAHLTAIREGQQDLNNRFKRLNDLISSGQEVKQDVRDAINQKLDATNALIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTLEQTSD KVNEEYNKVRQQYEQTKSILQKAKEDFENKGINGLDSTKVALNSLNSQFQAASNMITDMIPVLESANKVFADVNSDKNFN NQIAKLKKAQSLLQKGIKLTDKGIEAINKGQQPAKDIIESINEVSKNTSAQLGDILARYDSEIVPNFNAAIARTKEMSKN TSKILSDANKKLPDVKKLLEDSSKGLVEGTKKLKDIKAQMPATQQKIKELADKIRQFESEEDIKDIIRLLKNDVEKQSDF FANPVKLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEPGTEYKSHEIYFGRFLTFLTIGLAQAFIVSMG DMFLLGTYVVDKFWFVVFSLFSSAVFVCIVYSLVSVFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMLPKFFQAMYPFLPFTY AISAIRETVGGMLWDIVIRDLLVLSVFVVIMLILALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH >Mature_940_residues MKQIWRIYTTDVRNVAKHWAAIVIVLGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTNEVPIAVSNQDAGSNIRGKDINIGDEIVNS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVEHGDYYASITIPKDFSEKIATVISDNPQKPELDYFVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNSLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPKMNKLMDTALDDATRAQDIVKVAQEDLPVVQSVIN DGQETLNNLDKFFARNDETLQNAPGTIKRDLTALKSGMDGAAAITDFLMGPGANLNIPDISQLPTLPDLPKINDEGYKNI ARNINQTVNSVLNSARTGTAYAQSVMDGLQNGSIDPEIAKKNITTISNNLQTHIDNLSSIITMMSTLQQNATTDFGKKFF GDRVAHLTAIREGQQDLNNRFKRLNDLISSGQEVKQDVRDAINQKLDATNALIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTLEQTSD KVNEEYNKVRQQYEQTKSILQKAKEDFENKGINGLDSTKVALNSLNSQFQAASNMITDMIPVLESANKVFADVNSDKNFN NQIAKLKKAQSLLQKGIKLTDKGIEAINKGQQPAKDIIESINEVSKNTSAQLGDILARYDSEIVPNFNAAIARTKEMSKN TSKILSDANKKLPDVKKLLEDSSKGLVEGTKKLKDIKAQMPATQQKIKELADKIRQFESEEDIKDIIRLLKNDVEKQSDF FANPVKLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEPGTEYKSHEIYFGRFLTFLTIGLAQAFIVSMG DMFLLGTYVVDKFWFVVFSLFSSAVFVCIVYSLVSVFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMLPKFFQAMYPFLPFTY AISAIRETVGGMLWDIVIRDLLVLSVFVVIMLILALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 104455; Mature: 104455
Theoretical pI: Translated: 6.67; Mature: 6.67
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQIWRIYTTDVRNVAKHWAAIVIVLGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTNEVPIAVSNQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCC DAGSNIRGKDINIGDEIVNSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVEHGDYYASITIPKDFSEKI CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH ATVISDNPQKPELDYFVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIFNSLG HHHHCCCCCCCCCHHHHHCHHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC IDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPKMNKLMDTALDDATRAQDIVKVAQEDLPVVQSVIN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DGQETLNNLDKFFARNDETLQNAPGTIKRDLTALKSGMDGAAAITDFLMGPGANLNIPDI CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC SQLPTLPDLPKINDEGYKNIARNINQTVNSVLNSARTGTAYAQSVMDGLQNGSIDPEIAK HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH KNITTISNNLQTHIDNLSSIITMMSTLQQNATTDFGKKFFGDRVAHLTAIREGQQDLNNR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKRLNDLISSGQEVKQDVRDAINQKLDATNALIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTLEQTSD HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVNEEYNKVRQQYEQTKSILQKAKEDFENKGINGLDSTKVALNSLNSQFQAASNMITDMI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PVLESANKVFADVNSDKNFNNQIAKLKKAQSLLQKGIKLTDKGIEAINKGQQPAKDIIES HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH INEVSKNTSAQLGDILARYDSEIVPNFNAAIARTKEMSKNTSKILSDANKKLPDVKKLLE HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH DSSKGLVEGTKKLKDIKAQMPATQQKIKELADKIRQFESEEDIKDIIRLLKNDVEKQSDF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FANPVKLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEPGTEYKSHEIYF CCCCCEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHH GRFLTFLTIGLAQAFIVSMGDMFLLGTYVVDKFWFVVFSLFSSAVFVCIVYSLVSVFGNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMLPKFFQAMYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVIRD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVLSVFVVIMLILALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKQIWRIYTTDVRNVAKHWAAIVIVLGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTNEVPIAVSNQ CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCC DAGSNIRGKDINIGDEIVNSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVEHGDYYASITIPKDFSEKI CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH ATVISDNPQKPELDYFVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIFNSLG HHHHCCCCCCCCCHHHHHCHHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC IDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPKMNKLMDTALDDATRAQDIVKVAQEDLPVVQSVIN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DGQETLNNLDKFFARNDETLQNAPGTIKRDLTALKSGMDGAAAITDFLMGPGANLNIPDI CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC SQLPTLPDLPKINDEGYKNIARNINQTVNSVLNSARTGTAYAQSVMDGLQNGSIDPEIAK HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH KNITTISNNLQTHIDNLSSIITMMSTLQQNATTDFGKKFFGDRVAHLTAIREGQQDLNNR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FKRLNDLISSGQEVKQDVRDAINQKLDATNALIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTLEQTSD HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KVNEEYNKVRQQYEQTKSILQKAKEDFENKGINGLDSTKVALNSLNSQFQAASNMITDMI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PVLESANKVFADVNSDKNFNNQIAKLKKAQSLLQKGIKLTDKGIEAINKGQQPAKDIIES HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH INEVSKNTSAQLGDILARYDSEIVPNFNAAIARTKEMSKNTSKILSDANKKLPDVKKLLE HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH DSSKGLVEGTKKLKDIKAQMPATQQKIKELADKIRQFESEEDIKDIIRLLKNDVEKQSDF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FANPVKLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEPGTEYKSHEIYF CCCCCEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHH GRFLTFLTIGLAQAFIVSMGDMFLLGTYVVDKFWFVVFSLFSSAVFVCIVYSLVSVFGNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMLPKFFQAMYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVIRD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVLSVFVVIMLILALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]