Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is yceL [C]

Identifier: 150401480

GI number: 150401480

Start: 1090829

End: 1092019

Strand: Direct

Name: yceL [C]

Synonym: Maeo_1056

Alternate gene names: 150401480

Gene position: 1090829-1092019 (Clockwise)

Preceding gene: 150401479

Following gene: 150401481

Centisome position: 69.5

GC content: 30.65

Gene sequence:

>1191_bases
ATGAACAACCCCAAAAAACCCAAAAAAGAATATTTTGGAATTGATAAAGATGTTTTATTACTTACCACAGTTAGTTTTAT
AAATGATTTAAGTAGTGAAATGATTATGCCAATTCTTCCATTATTTATAACTTCATTGGGGGGTTCAAGTGTAGTTGTTG
GTCTAATAGGGGGATTAAAAGATAGTATATCAAGTATTTTAAAGGTAATATCTGGATATTATTCTGATAAAACAGGCAGG
AGAAAAGTTTTTGTTTTTGCAGGTTATTTAACCTCATCCATTTTTAAATTATTACTTTCATTTTCAACTACTTGGTTTGG
AGTTTTATTTTTTTCGGCATTTGAAAGGGTTGGAAAAGGTGTAAGAACAGCCCCACGAGATGCCATTATATCAGATTTAA
TGGCCGAAAAAAGAGGAATGGGATTTGGAATTCAACGGGCAGGAGATACATTTGGGGCAATACTTGGGTCTGTGGGCGTA
CTCATACTTTTCTGGTACTTATATTATGATTTTAGGGAAATTATATTAATATCGGCGTCCCTTTCATTTTTAGCACTGGT
TCCTCTTTATTTTCTTAAAGAGAAAAAAAAGATTAAAAGGCAAAATTTATCGCTAAAAATAGGTTTAAAAAATTTATCAA
CTCCATTAAAACTATTTATATTGATATCTGGTATATTTACATTGGCCAATTTTAGTTATATGTTTTATATCCTAAAAGCC
CAGACAATTTTTACTGGTCGGTTGGCTATCGGAGCTCCCATAATATTATATATTTTGTTTAATATATTTTATGGCATATT
TGCTCTTCCTTTTGGAGTTCTTTCGGATAAAATAGGGAGAAAAAAAGTTATTATTTTTGGATACCTCATATATGCCATAA
CTGCCTTTGGATTTGCATTATTTAATTCTTTAAATTATTTCATAATATTATTTGCACTATATGGAATATCCTATGCCATA
ATTGAAGGAAACCAGAGAGCTTATGTATCCGATTTATCATCAGAATATATAAGGGGAACTGCATTGGGAACATTTCATAC
CATTGTTGGTTTAATGGCATTGCCTTCAAGTTTAATAGCTGGGTATTTATGGAGTATCGACCCCAACATACCTTTTATAT
ATGGGGGAATTGTGGCATTAATTTCAAGCATGTTATTTATAATATTTGCAATAAAGTTTAAGTTAAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCAAAATGTCGTGAAAAAATAGATATTATAATATAAAATTAATATATGAATATTATTAATTTTATTATAATTTTATTTTT
ATATTTTAATCGGTGCATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGTGATAAAATATACAGATATAGAAAATACCAATTAATGTGAAAATATGTTTAAAGAAGATAAAAAAAGAACGCTAA
ATAAATTAAATGAGGCCATA

Product: major facilitator transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 396; Mature: 396

Protein sequence:

>396_residues
MNNPKKPKKEYFGIDKDVLLLTTVSFINDLSSEMIMPILPLFITSLGGSSVVVGLIGGLKDSISSILKVISGYYSDKTGR
RKVFVFAGYLTSSIFKLLLSFSTTWFGVLFFSAFERVGKGVRTAPRDAIISDLMAEKRGMGFGIQRAGDTFGAILGSVGV
LILFWYLYYDFREIILISASLSFLALVPLYFLKEKKKIKRQNLSLKIGLKNLSTPLKLFILISGIFTLANFSYMFYILKA
QTIFTGRLAIGAPIILYILFNIFYGIFALPFGVLSDKIGRKKVIIFGYLIYAITAFGFALFNSLNYFIILFALYGISYAI
IEGNQRAYVSDLSSEYIRGTALGTFHTIVGLMALPSSLIAGYLWSIDPNIPFIYGGIVALISSMLFIIFAIKFKLS

Sequences:

>Translated_396_residues
MNNPKKPKKEYFGIDKDVLLLTTVSFINDLSSEMIMPILPLFITSLGGSSVVVGLIGGLKDSISSILKVISGYYSDKTGR
RKVFVFAGYLTSSIFKLLLSFSTTWFGVLFFSAFERVGKGVRTAPRDAIISDLMAEKRGMGFGIQRAGDTFGAILGSVGV
LILFWYLYYDFREIILISASLSFLALVPLYFLKEKKKIKRQNLSLKIGLKNLSTPLKLFILISGIFTLANFSYMFYILKA
QTIFTGRLAIGAPIILYILFNIFYGIFALPFGVLSDKIGRKKVIIFGYLIYAITAFGFALFNSLNYFIILFALYGISYAI
IEGNQRAYVSDLSSEYIRGTALGTFHTIVGLMALPSSLIAGYLWSIDPNIPFIYGGIVALISSMLFIIFAIKFKLS
>Mature_396_residues
MNNPKKPKKEYFGIDKDVLLLTTVSFINDLSSEMIMPILPLFITSLGGSSVVVGLIGGLKDSISSILKVISGYYSDKTGR
RKVFVFAGYLTSSIFKLLLSFSTTWFGVLFFSAFERVGKGVRTAPRDAIISDLMAEKRGMGFGIQRAGDTFGAILGSVGV
LILFWYLYYDFREIILISASLSFLALVPLYFLKEKKKIKRQNLSLKIGLKNLSTPLKLFILISGIFTLANFSYMFYILKA
QTIFTGRLAIGAPIILYILFNIFYGIFALPFGVLSDKIGRKKVIIFGYLIYAITAFGFALFNSLNYFIILFALYGISYAI
IEGNQRAYVSDLSSEYIRGTALGTFHTIVGLMALPSSLIAGYLWSIDPNIPFIYGGIVALISSMLFIIFAIKFKLS

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43996; Mature: 43996

Theoretical pI: Translated: 10.25; Mature: 10.25

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNPKKPKKEYFGIDKDVLLLTTVSFINDLSSEMIMPILPLFITSLGGSSVVVGLIGGLK
CCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
DSISSILKVISGYYSDKTGRRKVFVFAGYLTSSIFKLLLSFSTTWFGVLFFSAFERVGKG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VRTAPRDAIISDLMAEKRGMGFGIQRAGDTFGAILGSVGVLILFWYLYYDFREIILISAS
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSFLALVPLYFLKEKKKIKRQNLSLKIGLKNLSTPLKLFILISGIFTLANFSYMFYILKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTIFTGRLAIGAPIILYILFNIFYGIFALPFGVLSDKIGRKKVIIFGYLIYAITAFGFAL
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNSLNYFIILFALYGISYAIIEGNQRAYVSDLSSEYIRGTALGTFHTIVGLMALPSSLIA
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYLWSIDPNIPFIYGGIVALISSMLFIIFAIKFKLS
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNNPKKPKKEYFGIDKDVLLLTTVSFINDLSSEMIMPILPLFITSLGGSSVVVGLIGGLK
CCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
DSISSILKVISGYYSDKTGRRKVFVFAGYLTSSIFKLLLSFSTTWFGVLFFSAFERVGKG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
VRTAPRDAIISDLMAEKRGMGFGIQRAGDTFGAILGSVGVLILFWYLYYDFREIILISAS
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSFLALVPLYFLKEKKKIKRQNLSLKIGLKNLSTPLKLFILISGIFTLANFSYMFYILKA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTIFTGRLAIGAPIILYILFNIFYGIFALPFGVLSDKIGRKKVIIFGYLIYAITAFGFAL
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNSLNYFIILFALYGISYAIIEGNQRAYVSDLSSEYIRGTALGTFHTIVGLMALPSSLIA
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYLWSIDPNIPFIYGGIVALISSMLFIIFAIKFKLS
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]