Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 150401076

Identifier: 150401076

GI number: 150401076

Start: 663150

End: 665000

Strand: Reverse

Name: 150401076

Synonym: Maeo_0646

Alternate gene names: NA

Gene position: 665000-663150 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150401077

Following gene: 150401075

Centisome position: 42.37

GC content: 23.12

Gene sequence:

>1851_bases
ATGGATATAATCTACCCCATAACACTGTTAATATTAATCTATTTTGTAAATCCATTGAAAAATGAAGAAAAATTATTTAC
AACACCGTTTTTAACTGTTTCTTATGTTATAATAATGACCTATATTTTATCGTTATTAAATATTTCAATATATAAATTTT
TATATATTATGCCTTTGCTAATTTTTTCAATATATTATCTTAAAACTAAAAAACTCAATTTCAATAAAGAATATAATGCA
ATAAAACAAGCCTTGAAACGAAAATATATAATATTATCTATAATATTATTATTTACAATTTTTATGGGATACAATATATT
TCCCCCAAATCCAGCAAATACAACAGATACACAATTTCATTCCTATAAATCAAAGGCAATGATTGAAGAAAAAACAATAT
TCTATAAAACTAATGAAATTCCATATAAATATTATGTAAGTTATCCCGCAGGATTTCATTCCCTGGTTTATTATTTATCC
TCTTCGGTAAGTGATATATTAAATTCTATTCAATTTATAAAATTCTATATATTACTATTATTTGTATTGGGATATTATTT
AATAGGGGAAGCAATTAAAAAAGGACTGGGTTGTTGGATTGCCTTGTTTTTGCCATTAACTAATGTAGTTTATAGAATTG
TAGGGGTATTGCTTCCAAATACATTGGGGTATGCCTTAATGCTAATTTGTATTTTCTTTATATTGAAATATAGAACTACA
AAAAATAATATATATTTAATATTATTTTCATTTATTACAATATCATTAGTATATATTCATACATTCCCATTAATTATATT
GGTATTATTTTTAATATCTCTATCTATTTATGATTTATATCTAAAATATTATAAAAATATAGTAAAATATTGGAGCTCCC
TTATATTGTCAATACTATCGGCGGTATTATTGATATATTCAAAAATGGCAGAAAATATTGTATCTTATGGAAAATCTACA
AATTTTACTCCTGAACCTATTTCGGCGATAATACGAAACATTTTAGCAGGAATGGGAATAATTTATTTATATATTTGGAC
AAATTCATCAAAAACAGGTATATTGGATAATACAAATACGGTTTTCATATCCCTTATATTTACGGTTTTATTAATTATTG
GAATATATAATTTAAGTAAAACAAAAAATAATAATTTAAATAACGGAGCTCCGTTTATCTTACTATTAATTTTATTAATT
TTAAATATAATAAATATAAAATTTATCCATATACCTATTCCATTTTTTAGCAGTCAATACGATAGTGCAAGAATGGCAAT
TCATATTCAAATAATTATGCCAATATTTTATGGTGCAGGATTATATGCAATATATAAACTAATAGAATCCAATAAAAAAA
CCAAAATAAGCACATACAATATATTAAAACCACTTTTCATAATTTCTATATTATTATTTTCTACGATTTCAGCATATACA
AATTATGAAATAATATCAGAAAAACAGAAAGATAGTTTCGTAATACACAACAATGATTTAAAAATCTTTGAATATATGAA
CAAACACAACATAACAAACCAAATAATTTTAAACTTTGGTGAAGATGCAGGACAGTTTTTACCAATATATACGAAAAATA
AGCCAGTATTTTATTTTTATAAATTCCAGTCCAACAATGCCACGGTTGGTAATACTTCATTTGACAGCATAATTTCAGCA
ATCGACAATAAAAATTATACAACAATATTAAATAGTTGCAAAAAGGAGAATATTAGTTATATTTATATGCCTGAATACTT
AGGAAAATACGATGGTGGATTTTTTAACAACAGCAAATATTTTAAAATAATCCATATCAAAGGAAATGCAAAATTAGTAA
AAATAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCAGAAAATGCAGGAATATCGGCAAATAAAGCCATAGTAATTTTAGGGAATAAATCTGTTCAATATGCTAATTCCATAAG
TAATCTATAAAAGGGAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTATAGTCAATCTTTGGACAATTTCACTAAATAATTATATATAGTTAAATTAAATTTCTCTAACAAACCACCAAACC
CAAAGAAATCTGGATGATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 616; Mature: 616

Protein sequence:

>616_residues
MDIIYPITLLILIYFVNPLKNEEKLFTTPFLTVSYVIIMTYILSLLNISIYKFLYIMPLLIFSIYYLKTKKLNFNKEYNA
IKQALKRKYIILSIILLFTIFMGYNIFPPNPANTTDTQFHSYKSKAMIEEKTIFYKTNEIPYKYYVSYPAGFHSLVYYLS
SSVSDILNSIQFIKFYILLLFVLGYYLIGEAIKKGLGCWIALFLPLTNVVYRIVGVLLPNTLGYALMLICIFFILKYRTT
KNNIYLILFSFITISLVYIHTFPLIILVLFLISLSIYDLYLKYYKNIVKYWSSLILSILSAVLLIYSKMAENIVSYGKST
NFTPEPISAIIRNILAGMGIIYLYIWTNSSKTGILDNTNTVFISLIFTVLLIIGIYNLSKTKNNNLNNGAPFILLLILLI
LNIINIKFIHIPIPFFSSQYDSARMAIHIQIIMPIFYGAGLYAIYKLIESNKKTKISTYNILKPLFIISILLFSTISAYT
NYEIISEKQKDSFVIHNNDLKIFEYMNKHNITNQIILNFGEDAGQFLPIYTKNKPVFYFYKFQSNNATVGNTSFDSIISA
IDNKNYTTILNSCKKENISYIYMPEYLGKYDGGFFNNSKYFKIIHIKGNAKLVKIK

Sequences:

>Translated_616_residues
MDIIYPITLLILIYFVNPLKNEEKLFTTPFLTVSYVIIMTYILSLLNISIYKFLYIMPLLIFSIYYLKTKKLNFNKEYNA
IKQALKRKYIILSIILLFTIFMGYNIFPPNPANTTDTQFHSYKSKAMIEEKTIFYKTNEIPYKYYVSYPAGFHSLVYYLS
SSVSDILNSIQFIKFYILLLFVLGYYLIGEAIKKGLGCWIALFLPLTNVVYRIVGVLLPNTLGYALMLICIFFILKYRTT
KNNIYLILFSFITISLVYIHTFPLIILVLFLISLSIYDLYLKYYKNIVKYWSSLILSILSAVLLIYSKMAENIVSYGKST
NFTPEPISAIIRNILAGMGIIYLYIWTNSSKTGILDNTNTVFISLIFTVLLIIGIYNLSKTKNNNLNNGAPFILLLILLI
LNIINIKFIHIPIPFFSSQYDSARMAIHIQIIMPIFYGAGLYAIYKLIESNKKTKISTYNILKPLFIISILLFSTISAYT
NYEIISEKQKDSFVIHNNDLKIFEYMNKHNITNQIILNFGEDAGQFLPIYTKNKPVFYFYKFQSNNATVGNTSFDSIISA
IDNKNYTTILNSCKKENISYIYMPEYLGKYDGGFFNNSKYFKIIHIKGNAKLVKIK
>Mature_616_residues
MDIIYPITLLILIYFVNPLKNEEKLFTTPFLTVSYVIIMTYILSLLNISIYKFLYIMPLLIFSIYYLKTKKLNFNKEYNA
IKQALKRKYIILSIILLFTIFMGYNIFPPNPANTTDTQFHSYKSKAMIEEKTIFYKTNEIPYKYYVSYPAGFHSLVYYLS
SSVSDILNSIQFIKFYILLLFVLGYYLIGEAIKKGLGCWIALFLPLTNVVYRIVGVLLPNTLGYALMLICIFFILKYRTT
KNNIYLILFSFITISLVYIHTFPLIILVLFLISLSIYDLYLKYYKNIVKYWSSLILSILSAVLLIYSKMAENIVSYGKST
NFTPEPISAIIRNILAGMGIIYLYIWTNSSKTGILDNTNTVFISLIFTVLLIIGIYNLSKTKNNNLNNGAPFILLLILLI
LNIINIKFIHIPIPFFSSQYDSARMAIHIQIIMPIFYGAGLYAIYKLIESNKKTKISTYNILKPLFIISILLFSTISAYT
NYEIISEKQKDSFVIHNNDLKIFEYMNKHNITNQIILNFGEDAGQFLPIYTKNKPVFYFYKFQSNNATVGNTSFDSIISA
IDNKNYTTILNSCKKENISYIYMPEYLGKYDGGFFNNSKYFKIIHIKGNAKLVKIK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71390; Mature: 71390

Theoretical pI: Translated: 9.84; Mature: 9.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDIIYPITLLILIYFVNPLKNEEKLFTTPFLTVSYVIIMTYILSLLNISIYKFLYIMPLL
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFSIYYLKTKKLNFNKEYNAIKQALKRKYIILSIILLFTIFMGYNIFPPNPANTTDTQFH
HHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHH
SYKSKAMIEEKTIFYKTNEIPYKYYVSYPAGFHSLVYYLSSSVSDILNSIQFIKFYILLL
HHHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLGYYLIGEAIKKGLGCWIALFLPLTNVVYRIVGVLLPNTLGYALMLICIFFILKYRTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEC
KNNIYLILFSFITISLVYIHTFPLIILVLFLISLSIYDLYLKYYKNIVKYWSSLILSILS
CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVLLIYSKMAENIVSYGKSTNFTPEPISAIIRNILAGMGIIYLYIWTNSSKTGILDNTNT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCH
VFISLIFTVLLIIGIYNLSKTKNNNLNNGAPFILLLILLILNIINIKFIHIPIPFFSSQY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCC
DSARMAIHIQIIMPIFYGAGLYAIYKLIESNKKTKISTYNILKPLFIISILLFSTISAYT
CCCEEEEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NYEIISEKQKDSFVIHNNDLKIFEYMNKHNITNQIILNFGEDAGQFLPIYTKNKPVFYFY
CHHHHCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEE
KFQSNNATVGNTSFDSIISAIDNKNYTTILNSCKKENISYIYMPEYLGKYDGGFFNNSKY
EEECCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCE
FKIIHIKGNAKLVKIK
EEEEEEECCEEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MDIIYPITLLILIYFVNPLKNEEKLFTTPFLTVSYVIIMTYILSLLNISIYKFLYIMPLL
CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFSIYYLKTKKLNFNKEYNAIKQALKRKYIILSIILLFTIFMGYNIFPPNPANTTDTQFH
HHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHH
SYKSKAMIEEKTIFYKTNEIPYKYYVSYPAGFHSLVYYLSSSVSDILNSIQFIKFYILLL
HHHHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVLGYYLIGEAIKKGLGCWIALFLPLTNVVYRIVGVLLPNTLGYALMLICIFFILKYRTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEC
KNNIYLILFSFITISLVYIHTFPLIILVLFLISLSIYDLYLKYYKNIVKYWSSLILSILS
CCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVLLIYSKMAENIVSYGKSTNFTPEPISAIIRNILAGMGIIYLYIWTNSSKTGILDNTNT
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCH
VFISLIFTVLLIIGIYNLSKTKNNNLNNGAPFILLLILLILNIINIKFIHIPIPFFSSQY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCC
DSARMAIHIQIIMPIFYGAGLYAIYKLIESNKKTKISTYNILKPLFIISILLFSTISAYT
CCCEEEEEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NYEIISEKQKDSFVIHNNDLKIFEYMNKHNITNQIILNFGEDAGQFLPIYTKNKPVFYFY
CHHHHCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHEEEECCCCCCCEEEEEECCCCEEEEE
KFQSNNATVGNTSFDSIISAIDNKNYTTILNSCKKENISYIYMPEYLGKYDGGFFNNSKY
EEECCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCE
FKIIHIKGNAKLVKIK
EEEEEEECCEEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA