Definition Bacteroides vulgatus ATCC 8482 chromosome, complete genome.
Accession NC_009614
Length 5,163,189

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The map label for this gene is 150005953

Identifier: 150005953

GI number: 150005953

Start: 4299409

End: 4300971

Strand: Reverse

Name: 150005953

Synonym: BVU_3451

Alternate gene names: NA

Gene position: 4300971-4299409 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150005955

Following gene: 150005952

Centisome position: 83.3

GC content: 30.45

Gene sequence:

>1563_bases
ATGTCTGCTTTATCTCAGCAAAATAATAAAAGAATAGCTAAAAATACTCTATTACTTTATTTTCGTATGCTTTTCAGTAT
GGGAATAGGTTTGTTTACAAGTCGTATTGTACTTGAAAGTTTGGGAATAGAGGATTATGGCATATACAATCTTGTTGGTG
GTATTGTTACAATATTTGCTTTCTTAAATTCGGCTATGATTGCAACTTCACAACGTTTTATTTCATATGAGTTAGGAAAG
GGAAATTTACATAAACTTAAAGATGTTTTTTGTACGACTTTAACTATACACATAGCTATTGCGTTTATTATTGTTGTTTT
ATCGGAAGTAATAGGAGTTTGGTTCCTCAATACCAAACTGAATATTCCATCAGATAGAATGATGGCTGCCAATTGGACAC
TCCAATTATCTATATTCGTATTTGCTGTGAATGTAATCAGTGTTCCTTATAATGCTTCTATTGTGGCACACGAAAAAATG
AGCGCATTTGCATATATTAGTATCTTCGAAGTTAGTTTGAAGTTAGCAATAGCCTATTTGCTGTTATTTATATCTTATGA
TAAATTGATTGTATATTCAATTTTGGTATTTTGCGTTGCATTGCTTTTACGTTCCTTATATTGCTTTTATTGTAAAAGGC
ATTTTGAGGAGTGTCATTATACTTTTAGCTTTAATATTGAACAATTTAGGGAAATGTTTGCCTTTGCTGGTTGGAGTTTG
GTTGGGAATTTAGGATTTTCTTTTAAAGATCAATTATCTAATATTCTCTTGAATCTATTTTTTGGTACAGTTGTTAATGC
TGCACGCGGAATATCAGTTCAGGTAGGTTCGCTAATAAATAGTTTTTCTGCTAATTTTATGATGGCGATGAATCCACAAA
TAACAAAATCGTATGCAGTAGGAGACTTATACAGATCTAAAGAGTTAGTATATGCAGGTTGTAGATTTTCATTTTATTTG
TTAGCTGTCATTTCCCTGCCTATAATGATTAATATTACCTATATATTAAATTTATGGTTGGTAGAAGTTCCACAATATAC
GGATATTTTTCTGATATTAACGATTGTATGCAATCTTTTGTATGCTATATCTAGTCCATTAACAACAGCCATGCAAGCCA
CGGGAAGAATCAAATGGTTTCAAGTAATAATTTGTATTGTTATGCTGACAGAATTACCGATAGCTTATTTATTGTTATCA
ATTGGATATCCGCCATATTCAGTTCTCTATGCATCATTATTTGTTACATTATTGGGGGTACTTATTCGGATAGTTTTAAT
AAGTAGAATCTTGCCCATCTATGAAATTAGATACTATGTGACACATATTTTTAGCAAAAATATACTTATTGTGTTTATCA
CCTATTGTATAGCTTATATCTTACATAAAAAGATGGAACAGGATAGTTTTTTTACAGCTGTTCTTTCAAGTTTTATATTA
GAACTTATTTTATTTTCTCTTGCCTATTTATGCGGTCTTTCATCAACAGAAAGATATGTGGTAAACCAAAAGTTAGTGAC
CATTTTAGAATCAAAGCGGAGAAAAAATAAACAAAAAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTCAAGTGATTTGAATATATTAATAGAATTAGGATACATATTACGGGACTTGTCTATTATAGACATAATATTTTAAT
GTGCTTTTTTATAATTGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAATATTTAGTTTGTATTAGTGCGTATGGAAATAGAAATTAATTATTCTTTTATAATACCTCATAGGAATGTACCACA
TCTTCTTCAACGATGTATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 520; Mature: 519

Protein sequence:

>520_residues
MSALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFAFLNSAMIATSQRFISYELGK
GNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKLNIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKM
SAFAYISIFEVSLKLAIAYLLLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL
VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAVGDLYRSKELVYAGCRFSFYL
LAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLLYAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLS
IGYPPYSVLYASLFVTLLGVLIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL
ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK

Sequences:

>Translated_520_residues
MSALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFAFLNSAMIATSQRFISYELGK
GNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKLNIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKM
SAFAYISIFEVSLKLAIAYLLLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL
VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAVGDLYRSKELVYAGCRFSFYL
LAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLLYAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLS
IGYPPYSVLYASLFVTLLGVLIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL
ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK
>Mature_519_residues
SALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFAFLNSAMIATSQRFISYELGKG
NLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKLNIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKMS
AFAYISIFEVSLKLAIAYLLLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSLV
GNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAVGDLYRSKELVYAGCRFSFYLL
AVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLLYAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLSI
GYPPYSVLYASLFVTLLGVLIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFILE
LILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59243; Mature: 59111

Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFA
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FLNSAMIATSQRFISYELGKGNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKL
HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
NIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKMSAFAYISIFEVSLKLAIAYL
CCCCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAV
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHH
GDLYRSKELVYAGCRFSFYLLAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLL
HHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLSIGYPPYSVLYASLFVTLLGV
HHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFA
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FLNSAMIATSQRFISYELGKGNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKL
HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
NIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKMSAFAYISIFEVSLKLAIAYL
CCCCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAV
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHH
GDLYRSKELVYAGCRFSFYLLAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLL
HHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLSIGYPPYSVLYASLFVTLLGV
HHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA