| Definition | Bacteroides vulgatus ATCC 8482 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009614 |
| Length | 5,163,189 |
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The map label for this gene is 150005953
Identifier: 150005953
GI number: 150005953
Start: 4299409
End: 4300971
Strand: Reverse
Name: 150005953
Synonym: BVU_3451
Alternate gene names: NA
Gene position: 4300971-4299409 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150005955
Following gene: 150005952
Centisome position: 83.3
GC content: 30.45
Gene sequence:
>1563_bases ATGTCTGCTTTATCTCAGCAAAATAATAAAAGAATAGCTAAAAATACTCTATTACTTTATTTTCGTATGCTTTTCAGTAT GGGAATAGGTTTGTTTACAAGTCGTATTGTACTTGAAAGTTTGGGAATAGAGGATTATGGCATATACAATCTTGTTGGTG GTATTGTTACAATATTTGCTTTCTTAAATTCGGCTATGATTGCAACTTCACAACGTTTTATTTCATATGAGTTAGGAAAG GGAAATTTACATAAACTTAAAGATGTTTTTTGTACGACTTTAACTATACACATAGCTATTGCGTTTATTATTGTTGTTTT ATCGGAAGTAATAGGAGTTTGGTTCCTCAATACCAAACTGAATATTCCATCAGATAGAATGATGGCTGCCAATTGGACAC TCCAATTATCTATATTCGTATTTGCTGTGAATGTAATCAGTGTTCCTTATAATGCTTCTATTGTGGCACACGAAAAAATG AGCGCATTTGCATATATTAGTATCTTCGAAGTTAGTTTGAAGTTAGCAATAGCCTATTTGCTGTTATTTATATCTTATGA TAAATTGATTGTATATTCAATTTTGGTATTTTGCGTTGCATTGCTTTTACGTTCCTTATATTGCTTTTATTGTAAAAGGC ATTTTGAGGAGTGTCATTATACTTTTAGCTTTAATATTGAACAATTTAGGGAAATGTTTGCCTTTGCTGGTTGGAGTTTG GTTGGGAATTTAGGATTTTCTTTTAAAGATCAATTATCTAATATTCTCTTGAATCTATTTTTTGGTACAGTTGTTAATGC TGCACGCGGAATATCAGTTCAGGTAGGTTCGCTAATAAATAGTTTTTCTGCTAATTTTATGATGGCGATGAATCCACAAA TAACAAAATCGTATGCAGTAGGAGACTTATACAGATCTAAAGAGTTAGTATATGCAGGTTGTAGATTTTCATTTTATTTG TTAGCTGTCATTTCCCTGCCTATAATGATTAATATTACCTATATATTAAATTTATGGTTGGTAGAAGTTCCACAATATAC GGATATTTTTCTGATATTAACGATTGTATGCAATCTTTTGTATGCTATATCTAGTCCATTAACAACAGCCATGCAAGCCA CGGGAAGAATCAAATGGTTTCAAGTAATAATTTGTATTGTTATGCTGACAGAATTACCGATAGCTTATTTATTGTTATCA ATTGGATATCCGCCATATTCAGTTCTCTATGCATCATTATTTGTTACATTATTGGGGGTACTTATTCGGATAGTTTTAAT AAGTAGAATCTTGCCCATCTATGAAATTAGATACTATGTGACACATATTTTTAGCAAAAATATACTTATTGTGTTTATCA CCTATTGTATAGCTTATATCTTACATAAAAAGATGGAACAGGATAGTTTTTTTACAGCTGTTCTTTCAAGTTTTATATTA GAACTTATTTTATTTTCTCTTGCCTATTTATGCGGTCTTTCATCAACAGAAAGATATGTGGTAAACCAAAAGTTAGTGAC CATTTTAGAATCAAAGCGGAGAAAAAATAAACAAAAAAAATGA
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TTTAATATTTAGTTTGTATTAGTGCGTATGGAAATAGAAATTAATTATTCTTTTATAATACCTCATAGGAATGTACCACA TCTTCTTCAACGATGTATTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 520; Mature: 519
Protein sequence:
>520_residues MSALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFAFLNSAMIATSQRFISYELGK GNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKLNIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKM SAFAYISIFEVSLKLAIAYLLLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAVGDLYRSKELVYAGCRFSFYL LAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLLYAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLS IGYPPYSVLYASLFVTLLGVLIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK
Sequences:
>Translated_520_residues MSALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFAFLNSAMIATSQRFISYELGK GNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKLNIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKM SAFAYISIFEVSLKLAIAYLLLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAVGDLYRSKELVYAGCRFSFYL LAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLLYAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLS IGYPPYSVLYASLFVTLLGVLIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK >Mature_519_residues SALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFAFLNSAMIATSQRFISYELGKG NLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKLNIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKMS AFAYISIFEVSLKLAIAYLLLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSLV GNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAVGDLYRSKELVYAGCRFSFYLL AVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLLYAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLSI GYPPYSVLYASLFVTLLGVLIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFILE LILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59243; Mature: 59111
Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 4.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 4.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFA CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FLNSAMIATSQRFISYELGKGNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKL HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC NIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKMSAFAYISIFEVSLKLAIAYL CCCCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAV HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHH GDLYRSKELVYAGCRFSFYLLAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLL HHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLSIGYPPYSVLYASLFVTLLGV HHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure SALSQQNNKRIAKNTLLLYFRMLFSMGIGLFTSRIVLESLGIEDYGIYNLVGGIVTIFA CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FLNSAMIATSQRFISYELGKGNLHKLKDVFCTTLTIHIAIAFIIVVLSEVIGVWFLNTKL HHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC NIPSDRMMAANWTLQLSIFVFAVNVISVPYNASIVAHEKMSAFAYISIFEVSLKLAIAYL CCCCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLFISYDKLIVYSILVFCVALLLRSLYCFYCKRHFEECHYTFSFNIEQFREMFAFAGWSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH VGNLGFSFKDQLSNILLNLFFGTVVNAARGISVQVGSLINSFSANFMMAMNPQITKSYAV HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHH GDLYRSKELVYAGCRFSFYLLAVISLPIMINITYILNLWLVEVPQYTDIFLILTIVCNLL HHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YAISSPLTTAMQATGRIKWFQVIICIVMLTELPIAYLLLSIGYPPYSVLYASLFVTLLGV HHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LIRIVLISRILPIYEIRYYVTHIFSKNILIVFITYCIAYILHKKMEQDSFFTAVLSSFIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELILFSLAYLCGLSSTERYVVNQKLVTILESKRRKNKQKK HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA