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The map label for this gene is 150005938

Identifier: 150005938

GI number: 150005938

Start: 4279442

End: 4281754

Strand: Reverse

Name: 150005938

Synonym: BVU_3436

Alternate gene names: NA

Gene position: 4281754-4279442 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150005939

Following gene: 150005934

Centisome position: 82.93

GC content: 40.64

Gene sequence:

>2313_bases
ATGAAACAAATCTATTATGCAATACAATCGACATTACACGGCCGTGGAAGCAATGTGACAAAAGTCATATCGCTTTCATT
AGGCTTGACTATTGGTGTTCTGCTTTTTTCACAAATAGCATTTGAACTCAATTATGAAAAATGTTACCCTGATGCCGACC
GATTGGTGTTGGTACGTGGAGGAGGAGAGAATGTAAAGACTGGAGAGAAAGGAGAAGGATATGATGATAGCTTGTTTGCT
CCGATGGCAGAAGCATTCCGCAGTGATTTGTCACAATGGATTGAAAATGCTACAGTCATTTTCAATTTTGAGACATTAAA
TGTATTCAAGGATGGTCATAAGCTGAAAGACGTAAACTACGCTTATGTAGATACTTGCTATTTCCGTACTTTCGGCATCA
AAGTATTGAAAGGGAATCCTGAGGAATTGCAAAGGGCAGGGAGCATATTCGTTTCTGAAACTTTTGTTCGTGATGTCTTT
GGTGGACAGGACCCTGTGGGACAAAAATTATCTTTGGATAAACAGCATGAACTGACAGTCCGTGGTGTTTATCAGGATAC
TCCGGAAAATACGGCCTATCATTTTGATTTTGTAGCTCCCATTTATGCCGGAGGTGGTTATATAGGGGGTGGAACATGGG
GGCGTAATGACATTTATTATACTATTCTCCGTTTGCGCGATGGGGTGGACAGGGAAGAAATCAATCGTCAGATATACAAG
GCTATGCAAAAATATTATCCTGATTCTGCTGATGATGAATGGAGAAATTTTTATGATGCACAGCCATTGCCCGAAATTCA
TCTGGATGACTCAAATACCCGCACTCGCCTTTACATTTATGGTTTTTTGGGCTTTGCCATATTTTTTGTGGCAATCATGA
ACTATGTATTAGTAGCTATTGCTACCATGAGCCGCAGGGCAAAAAGTATAGGTGTGCATAAGTGTAGTGGTGCCAGTGCA
ATCAATATTTTCAGTATGTTCCTTTTTGAGACGGGGATTGTGGTATTGATGTCCGTTATAGTGGCCCTCTTTATTATTTT
CAATACCAAAGATCTGATAGAAGATTTACTTTCGGTGCAGTTGTCCTCACTCTTTACATTGGAAACTTTATGGGTTCCGA
TGCTCATTGTTTTTGTACTGTTCATAGTAGCCGGAGTGCTGCCGGGAAGATTGTTTTCACGCATTCCTGTCACTCAAGTT
TTTCGTCGTTACACAGATGGGAAAAAGGGGTGGAAGCGTTCTCTTTTATTTGTACAATTTATGGGGGTATCTTTTGTGAT
GGGGATTTTGTTAGTATCTTTGATGCAGTATCATCATCTGATTAATAGTGATATGGGTATCCGTACTCCAGGATTGGTGG
AGGCGGAAACATGGATGTCACCCGAAGAAGCAGAGAATATGGTTAACGATCTTCGTCGTCAACCCATGGTGGAAAATGCC
ACCCGTTCTATGCATGGTGTTCTGGGAGAATATTGGACTCGTGGGCTGATTGATAATAGTGGCAAGCGAATAGAAACCTT
GATGTATAATCCTTGTGATAAGAATTATGCTGAAACCATGGGGATTACTATTATTGAAGGGAAAGATATGCAGAATGAGG
GAGATGTATTGGTCAACGAAGAAGTAGTGCGGCTGATGAAATGGACAGATGGGGCAGTAGGCAAACGGTTGAATGATTTT
GATAAAGCCGGAACCATTGTTGGTGTATTCCGTAATGTGCGCAATACGTCTTTTCTTTATAAGCAGTTTCCCGTGGCTTT
GGTTTATAGTCATAATACCAGTCACACTTTTGATGTACGTTTAAAGCAGCCATACGATGAGAGTTTGAAAAAGCTGAACG
AATACATGGAGCAGGTGCATTCCACTAAGGCATTGGAATTTATTCCGATAGATACCATGCTGAAGGAAATCTATCGCAAT
GTATATCGTTTTCGTAATTCTGTATGGATTACTTCTACTTTTATTTTGCTTATTGTTGTTATGGGGTTGATAGGTTACGT
GAATGATGAAACACAACGTCGCAGTAAGGAAATAGCTATCCGTAAGGTGAATGGTGCTGAAGCTTCGACTATTCTTCGGT
TGCTGTCCCGTGATATATTATATGTTGCTGTCCCATCGGTCTTGATGGGAATTGTAGTATCGTACTTTACAGGAAAGGCT
TGGTTGGATCAATTTGCCGAAACGATAGATATGAATGCGTTGTATTTTGTCGGAACAGCATTGGTGATTATCGCTCTGAT
AGTGGTGTGTGTCGTTGTTAGAGCTTGGCGTATTGCTAATGAGAATCCGGTAAAGAGTATTAAAGTTGAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CACTCTCAGCATGATGCCGGATTTGCTCATCGTGTCATTCATTTGTTTGACGGTAGTGTAGTGGCGAACATTAAAGAATA
ATAATGAAAGGGTGGTTGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTATTTGGAAAAAGGAGAGCGGGATGATATGTGTTGGGTATCATCCCGCTTTTTTTTTTTTACCTGATTCCTGTGAAAT
TTACATTGACACCATCCAAT

Product: ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 770; Mature: 770

Protein sequence:

>770_residues
MKQIYYAIQSTLHGRGSNVTKVISLSLGLTIGVLLFSQIAFELNYEKCYPDADRLVLVRGGGENVKTGEKGEGYDDSLFA
PMAEAFRSDLSQWIENATVIFNFETLNVFKDGHKLKDVNYAYVDTCYFRTFGIKVLKGNPEELQRAGSIFVSETFVRDVF
GGQDPVGQKLSLDKQHELTVRGVYQDTPENTAYHFDFVAPIYAGGGYIGGGTWGRNDIYYTILRLRDGVDREEINRQIYK
AMQKYYPDSADDEWRNFYDAQPLPEIHLDDSNTRTRLYIYGFLGFAIFFVAIMNYVLVAIATMSRRAKSIGVHKCSGASA
INIFSMFLFETGIVVLMSVIVALFIIFNTKDLIEDLLSVQLSSLFTLETLWVPMLIVFVLFIVAGVLPGRLFSRIPVTQV
FRRYTDGKKGWKRSLLFVQFMGVSFVMGILLVSLMQYHHLINSDMGIRTPGLVEAETWMSPEEAENMVNDLRRQPMVENA
TRSMHGVLGEYWTRGLIDNSGKRIETLMYNPCDKNYAETMGITIIEGKDMQNEGDVLVNEEVVRLMKWTDGAVGKRLNDF
DKAGTIVGVFRNVRNTSFLYKQFPVALVYSHNTSHTFDVRLKQPYDESLKKLNEYMEQVHSTKALEFIPIDTMLKEIYRN
VYRFRNSVWITSTFILLIVVMGLIGYVNDETQRRSKEIAIRKVNGAEASTILRLLSRDILYVAVPSVLMGIVVSYFTGKA
WLDQFAETIDMNALYFVGTALVIIALIVVCVVVRAWRIANENPVKSIKVE

Sequences:

>Translated_770_residues
MKQIYYAIQSTLHGRGSNVTKVISLSLGLTIGVLLFSQIAFELNYEKCYPDADRLVLVRGGGENVKTGEKGEGYDDSLFA
PMAEAFRSDLSQWIENATVIFNFETLNVFKDGHKLKDVNYAYVDTCYFRTFGIKVLKGNPEELQRAGSIFVSETFVRDVF
GGQDPVGQKLSLDKQHELTVRGVYQDTPENTAYHFDFVAPIYAGGGYIGGGTWGRNDIYYTILRLRDGVDREEINRQIYK
AMQKYYPDSADDEWRNFYDAQPLPEIHLDDSNTRTRLYIYGFLGFAIFFVAIMNYVLVAIATMSRRAKSIGVHKCSGASA
INIFSMFLFETGIVVLMSVIVALFIIFNTKDLIEDLLSVQLSSLFTLETLWVPMLIVFVLFIVAGVLPGRLFSRIPVTQV
FRRYTDGKKGWKRSLLFVQFMGVSFVMGILLVSLMQYHHLINSDMGIRTPGLVEAETWMSPEEAENMVNDLRRQPMVENA
TRSMHGVLGEYWTRGLIDNSGKRIETLMYNPCDKNYAETMGITIIEGKDMQNEGDVLVNEEVVRLMKWTDGAVGKRLNDF
DKAGTIVGVFRNVRNTSFLYKQFPVALVYSHNTSHTFDVRLKQPYDESLKKLNEYMEQVHSTKALEFIPIDTMLKEIYRN
VYRFRNSVWITSTFILLIVVMGLIGYVNDETQRRSKEIAIRKVNGAEASTILRLLSRDILYVAVPSVLMGIVVSYFTGKA
WLDQFAETIDMNALYFVGTALVIIALIVVCVVVRAWRIANENPVKSIKVE
>Mature_770_residues
MKQIYYAIQSTLHGRGSNVTKVISLSLGLTIGVLLFSQIAFELNYEKCYPDADRLVLVRGGGENVKTGEKGEGYDDSLFA
PMAEAFRSDLSQWIENATVIFNFETLNVFKDGHKLKDVNYAYVDTCYFRTFGIKVLKGNPEELQRAGSIFVSETFVRDVF
GGQDPVGQKLSLDKQHELTVRGVYQDTPENTAYHFDFVAPIYAGGGYIGGGTWGRNDIYYTILRLRDGVDREEINRQIYK
AMQKYYPDSADDEWRNFYDAQPLPEIHLDDSNTRTRLYIYGFLGFAIFFVAIMNYVLVAIATMSRRAKSIGVHKCSGASA
INIFSMFLFETGIVVLMSVIVALFIIFNTKDLIEDLLSVQLSSLFTLETLWVPMLIVFVLFIVAGVLPGRLFSRIPVTQV
FRRYTDGKKGWKRSLLFVQFMGVSFVMGILLVSLMQYHHLINSDMGIRTPGLVEAETWMSPEEAENMVNDLRRQPMVENA
TRSMHGVLGEYWTRGLIDNSGKRIETLMYNPCDKNYAETMGITIIEGKDMQNEGDVLVNEEVVRLMKWTDGAVGKRLNDF
DKAGTIVGVFRNVRNTSFLYKQFPVALVYSHNTSHTFDVRLKQPYDESLKKLNEYMEQVHSTKALEFIPIDTMLKEIYRN
VYRFRNSVWITSTFILLIVVMGLIGYVNDETQRRSKEIAIRKVNGAEASTILRLLSRDILYVAVPSVLMGIVVSYFTGKA
WLDQFAETIDMNALYFVGTALVIIALIVVCVVVRAWRIANENPVKSIKVE

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 87524; Mature: 87524

Theoretical pI: Translated: 6.80; Mature: 6.80

Prosite motif: PS00589 PTS_HPR_SER

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKQIYYAIQSTLHGRGSNVTKVISLSLGLTIGVLLFSQIAFELNYEKCYPDADRLVLVRG
CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEC
GGENVKTGEKGEGYDDSLFAPMAEAFRSDLSQWIENATVIFNFETLNVFKDGHKLKDVNY
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHCCCCCCCCCC
AYVDTCYFRTFGIKVLKGNPEELQRAGSIFVSETFVRDVFGGQDPVGQKLSLDKQHELTV
HHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
RGVYQDTPENTAYHFDFVAPIYAGGGYIGGGTWGRNDIYYTILRLRDGVDREEINRQIYK
EEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
AMQKYYPDSADDEWRNFYDAQPLPEIHLDDSNTRTRLYIYGFLGFAIFFVAIMNYVLVAI
HHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATMSRRAKSIGVHKCSGASAINIFSMFLFETGIVVLMSVIVALFIIFNTKDLIEDLLSVQ
HHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LSSLFTLETLWVPMLIVFVLFIVAGVLPGRLFSRIPVTQVFRRYTDGKKGWKRSLLFVQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
MGVSFVMGILLVSLMQYHHLINSDMGIRTPGLVEAETWMSPEEAENMVNDLRRQPMVENA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
TRSMHGVLGEYWTRGLIDNSGKRIETLMYNPCDKNYAETMGITIIEGKDMQNEGDVLVNE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCEEECH
EVVRLMKWTDGAVGKRLNDFDKAGTIVGVFRNVRNTSFLYKQFPVALVYSHNTSHTFDVR
HHHHHHHHCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCEEEEEECCCCEEEEEE
LKQPYDESLKKLNEYMEQVHSTKALEFIPIDTMLKEIYRNVYRFRNSVWITSTFILLIVV
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
MGLIGYVNDETQRRSKEIAIRKVNGAEASTILRLLSRDILYVAVPSVLMGIVVSYFTGKA
HHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
WLDQFAETIDMNALYFVGTALVIIALIVVCVVVRAWRIANENPVKSIKVE
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKQIYYAIQSTLHGRGSNVTKVISLSLGLTIGVLLFSQIAFELNYEKCYPDADRLVLVRG
CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEC
GGENVKTGEKGEGYDDSLFAPMAEAFRSDLSQWIENATVIFNFETLNVFKDGHKLKDVNY
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEHHHHCCCCCCCCCC
AYVDTCYFRTFGIKVLKGNPEELQRAGSIFVSETFVRDVFGGQDPVGQKLSLDKQHELTV
HHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
RGVYQDTPENTAYHFDFVAPIYAGGGYIGGGTWGRNDIYYTILRLRDGVDREEINRQIYK
EEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
AMQKYYPDSADDEWRNFYDAQPLPEIHLDDSNTRTRLYIYGFLGFAIFFVAIMNYVLVAI
HHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATMSRRAKSIGVHKCSGASAINIFSMFLFETGIVVLMSVIVALFIIFNTKDLIEDLLSVQ
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LSSLFTLETLWVPMLIVFVLFIVAGVLPGRLFSRIPVTQVFRRYTDGKKGWKRSLLFVQF
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MGVSFVMGILLVSLMQYHHLINSDMGIRTPGLVEAETWMSPEEAENMVNDLRRQPMVENA
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCEEECH
EVVRLMKWTDGAVGKRLNDFDKAGTIVGVFRNVRNTSFLYKQFPVALVYSHNTSHTFDVR
HHHHHHHHCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCEEEEEECCCCEEEEEE
LKQPYDESLKKLNEYMEQVHSTKALEFIPIDTMLKEIYRNVYRFRNSVWITSTFILLIVV
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
MGLIGYVNDETQRRSKEIAIRKVNGAEASTILRLLSRDILYVAVPSVLMGIVVSYFTGKA
HHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
WLDQFAETIDMNALYFVGTALVIIALIVVCVVVRAWRIANENPVKSIKVE
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA