Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yiaN [C]

Identifier: 148828195

GI number: 148828195

Start: 1623298

End: 1624575

Strand: Reverse

Name: yiaN [C]

Synonym: CGSHiGG_08765

Alternate gene names: 148828195

Gene position: 1624575-1623298 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148828196

Following gene: 148828194

Centisome position: 86.08

GC content: 37.4

Gene sequence:

>1278_bases
ATGACAGTGATTATTTTTCTTTCCGTCTTGCTTGGTACCATTATTCTTGGTGTACCTGTTGCCTTTGCCTTGCTAATTTG
TGGAATAGCACTAATGCTCCATCTAGACTTTTTTAATGCACAAATACTTGCCCAACAACTTGTCAGTGGCGCAGATAGTT
TTTCTCTAATGGCTATTCCCTTTTTTATCCTTGCTGGTGAAATAATGAATGAGGGAGGACTTTCTAAACGTATTATTGAT
TTACCTATGAAACTTGTAGGTCATAAACGAGGAGGGCTGGGATTTGTTGCTATTTTAAGTGCAATGATTATGGCAAGCTT
ATCTGGTTCGGCTGTTGCTGATACTGCTGCTGTAGCTGCTATGTTACTACCAATGATGAAAACCACAGGCTATCCAATAC
ATCGTTCTGCAGGTTTAATCGGCACTGCTGGTATCATTGCGCCTATAATTCCTCCATCAATTCCTTTTATTGTCTTTGGC
GTTGCCAGTGGTGTATCTATCACTAAATTATTTTTAGCAGGTATTTTTCCTGGCGTGATGATGGGATGTTGCCTAGCTAT
TTTATGGTGGTGGCAAGCTAAACGCCTTAATTTAATGACATTTTCAAAAGCGACGAAACAAGATCTTTGCTTTTCTTTTA
AAAATAGTATTTGGGCATTAATGCTACCAGTAATCATTATAGGAGGATTTCGTTCAGGTATATTTACACCTACAGAAGCT
GGTGTAGTTGCGACATTTTATGCATTAATTGTTTCTCTCTTTATATATCGTGAATTGCCCTTAAAACATTTGCCAAAAGT
ATTGTTAGCTGCAGCAAAAACTACCGCAGTTGTTATGTTTTTGGTTGCCGCAGCCAATGTAACTGGCTACTTAATTACTG
TTGCTGAACTTCCCACAATACTGACAATATTGCTTGAACCTTTAATTGAAAATCCAACTATTTTACTTTTGGTCATTATG
CTTGCTGTATTTGTGATAGGAATGGTAATGGATTTAACACCAACAGTCTTAATTTTAACCCCCGTTTTAATGCCACTTGT
GGAAGAAGCTGGAATTGATCCAGTTTATTTCGGCGTATTGTTTATCTTAAATACCTCAATTGGCTTAATTACACCGCCGG
TGGGCAATGTGTTGAACGTTATCACTGGAGTATCAAAGCTTCCTTTTGATCAGGCTGCGAAAGGTATTATGCCCTATTTA
GGGATGATGATTATGTTATTACTTACCTTTATTTTTATTCCAGAACTAATTTTAATGCCACTACAATGGATCCAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAACTTACTTTGCAAGTGTAATCGCAGGCATTTTAGTTAGCGCACTACTGATTACTCGCTTGATAAGCACAATATTCTTT
ATATTCAGAGGAGAAGTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAGACTTTCTTAACACAAGGAGACTTTTATGAAACTTTTCAACTTCAAAAAGCTTAGCATGCTAATCGCTGGTTTTAC
GTTAGTTACTTCTCCAGCAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 425; Mature: 424

Protein sequence:

>425_residues
MTVIIFLSVLLGTIILGVPVAFALLICGIALMLHLDFFNAQILAQQLVSGADSFSLMAIPFFILAGEIMNEGGLSKRIID
LPMKLVGHKRGGLGFVAILSAMIMASLSGSAVADTAAVAAMLLPMMKTTGYPIHRSAGLIGTAGIIAPIIPPSIPFIVFG
VASGVSITKLFLAGIFPGVMMGCCLAILWWWQAKRLNLMTFSKATKQDLCFSFKNSIWALMLPVIIIGGFRSGIFTPTEA
GVVATFYALIVSLFIYRELPLKHLPKVLLAAAKTTAVVMFLVAAANVTGYLITVAELPTILTILLEPLIENPTILLLVIM
LAVFVIGMVMDLTPTVLILTPVLMPLVEEAGIDPVYFGVLFILNTSIGLITPPVGNVLNVITGVSKLPFDQAAKGIMPYL
GMMIMLLLTFIFIPELILMPLQWIQ

Sequences:

>Translated_425_residues
MTVIIFLSVLLGTIILGVPVAFALLICGIALMLHLDFFNAQILAQQLVSGADSFSLMAIPFFILAGEIMNEGGLSKRIID
LPMKLVGHKRGGLGFVAILSAMIMASLSGSAVADTAAVAAMLLPMMKTTGYPIHRSAGLIGTAGIIAPIIPPSIPFIVFG
VASGVSITKLFLAGIFPGVMMGCCLAILWWWQAKRLNLMTFSKATKQDLCFSFKNSIWALMLPVIIIGGFRSGIFTPTEA
GVVATFYALIVSLFIYRELPLKHLPKVLLAAAKTTAVVMFLVAAANVTGYLITVAELPTILTILLEPLIENPTILLLVIM
LAVFVIGMVMDLTPTVLILTPVLMPLVEEAGIDPVYFGVLFILNTSIGLITPPVGNVLNVITGVSKLPFDQAAKGIMPYL
GMMIMLLLTFIFIPELILMPLQWIQ
>Mature_424_residues
TVIIFLSVLLGTIILGVPVAFALLICGIALMLHLDFFNAQILAQQLVSGADSFSLMAIPFFILAGEIMNEGGLSKRIIDL
PMKLVGHKRGGLGFVAILSAMIMASLSGSAVADTAAVAAMLLPMMKTTGYPIHRSAGLIGTAGIIAPIIPPSIPFIVFGV
ASGVSITKLFLAGIFPGVMMGCCLAILWWWQAKRLNLMTFSKATKQDLCFSFKNSIWALMLPVIIIGGFRSGIFTPTEAG
VVATFYALIVSLFIYRELPLKHLPKVLLAAAKTTAVVMFLVAAANVTGYLITVAELPTILTILLEPLIENPTILLLVIML
AVFVIGMVMDLTPTVLILTPVLMPLVEEAGIDPVYFGVLFILNTSIGLITPPVGNVLNVITGVSKLPFDQAAKGIMPYLG
MMIMLLLTFIFIPELILMPLQWIQ

Specific function: Unknown

COG id: COG1593

COG function: function code G; TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the TRAP transporter large permease family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48994950, Length=425, Percent_Identity=68, Blast_Score=530, Evalue=1e-152,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010656
- InterPro:   IPR004681 [H]

Pfam domain/function: PF06808 DctM [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45516; Mature: 45384

Theoretical pI: Translated: 8.31; Mature: 8.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
5.6 %Met     (Translated Protein)
6.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
5.4 %Met     (Mature Protein)
6.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHCC
>Mature Secondary Structure 
TVIIFLSVLLGTIILGVPVAFALLICGIALMLHLDFFNAQILAQQLVSGADSFSLMAIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH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HHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]