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The map label for this gene is yccS [C]

Identifier: 148825776

GI number: 148825776

Start: 739512

End: 741668

Strand: Direct

Name: yccS [C]

Synonym: CGSHiEE_03635

Alternate gene names: 148825776

Gene position: 739512-741668 (Clockwise)

Preceding gene: 148825775

Following gene: 148825780

Centisome position: 40.79

GC content: 37.27

Gene sequence:

>2157_bases
ATGAATATTCGGTTAAATGCTAAAGTAATTTCTACAATTCCTGTTTTTATTGCCGTAAATATTGCGGCAGTGGGAATATG
GTTTTTTGATATTTCTTCGCAATCAATGCCTTTGATTCTAGGGATTATTGCAGGTGGTTTGGTGGATTTGGATAACCGTT
TAACTGGACGATTGAAAAACGTATTTTTTACCCTTATTGCCTTTTCTATTTCTTCCTTTATTGTGCAGTTACATATTGGC
AAGCCTATCCAATATATTGTGTTAATGACGGTGCTGACATTTATTTTCACTATGATTGGTGCCGTGGGGCAGCGTTATAG
CACCATTGCTTTCGGTTCATTAGTGGTTGCGCTTTACACCACATTAACTTATATACCAGAGGTAAATGTATGGTTTATTA
ACCCTGTAATGATTTTATGCGGTACCTTGCTGTATAGCGTGGTGACTCTGATTGTTTACCTGTTTTTCCCAAATCGCCCC
GTGCAAGAAAGTGTCGCTAAAGCGTTTTGTGCGTTGGGCGAATATTTAGATACTAAATCCTGTTTTTTTGATCCTGACGA
AGTGGCTGAGATTGAAAAAAAACACCTCAATTTTGCGATGAAAAATGCGAATGTTGTCACGGCATTTAATATTGTGCGTA
CCGCACTTTTTTACCGTATTAGAGGGCAACATCGCCATCCTCGTACCCAGAGAATGTTACGTTATTATTTTGCTGCGCAA
GATATTCACGAACGCGCCAATTCTACGCATTTTGATTATCAACAAATAACGGAAAAACTAAAAAATACAGATTTGATTTT
CCGTATTCAACGTTTATTAGAGCTACAAGCACAATCCTGTAAAGAAATCACGGCGAGTTTGCGTGAAAATAAACCTTATC
ATTTTAATGAACGTGTCGAACGATCCCTTTTAGGCACCTTGCATTCCTTTGAACTCTATCGAACACAACATCTCAATGAT
CAAGATGAACTGATTGATATTCAAACCTTGTTAGATAATTTACAAAGCATCAACTGGCAACTTCGCCAATTGGCACAAGA
AGCGACGGATACAGAACAATTGGCTCAAATTCATACGGAACAAATCACTGGGTTAAAAAATATAAGTGCGGTGATTTTTA
GCCATTTTACTTTTGAATCGCCGTTGTTCCGTCACGCAGTGCGTTTATCTATTGTGGTATTTTTATGTTGTGCAATTGTT
GAATTTTTCCAATTTAATCTTGGTTATTGGATTTTATTGACCACTGTATTTGTGTGCCAACCAAACTATTCTGCAACTAA
AGTACGTTTGCGTCAGCGCATTATCGGCACGATATTAGGCGTAGTGGTAGGGTCTCTATTACCTTATTTAAATCCAACCT
TAGAATTAAAACAGGGTCTTGTGGTGCTCACAAGTACTTTGTTCTTTTTCTTTCGTAGTAATAATTACAGTTTCTCGACC
TTTTTCATCACACTACAAGTATTGCTCAGTTTTGATGTCATGGGATTTGATACGGCAGCTGCGTTGATGCCTCGTTTACT
CGATACTTTGCTTGGTGCCGCGATTTCATGGTTTGCCGTATCTTACTTATGGCCAGATTGGAAATATTTGCAACTTGATA
AAGTGAGTCATCAAGCATTGCGGAGTGATGCGGTGTATTTATTGCATATTATTAGTCAATTGCAATTTGGTAAAAGCGAC
GATCTTAAATATCGCATAGCACGTCGTAATGCGCATCAATATGCAGCCGCACTGAGTACAACACTTTCTAATATGAATAA
TGAGCCAGTTAAATATAAGGCATATTTACAAAAAGGCTTTGATTTACTCAAACTTAATTATTCTCTATTAAGCTATATTT
CAGCACTGGGAGCTTATCGCGACAGAATGAAAAATTTGCAACAGACCGCACAGTTTTTATCTGGTTTTTATCCTGTGGCA
AAGAAAATTATTTATACCTTAGAACACATTGAAGAAATACCCGAAGCTATTTTTAACCAACAGCAAGAAAGTATCGAAAC
ACATTTAAAAGAATTGGAAAAACAAGACATGACTGCCGAAGAACGCGCCGTCTTTAGTTTACCGTATCAGCAATTAAATT
TGATTACCCAACTATTGCCACAATTTTATGGGTATTTTAAGAAAGAGATAAACTGTGAGCGCGTGGGAGCGTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTTTTTTAAACTGGGCAAAATCCCATAAATAATGACCGCACTTTATATAATAAAAAGTGAGCCTTGTTGCTCACTTTTC
TATTTTGATAAGGATTTGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATAAAAGTGCGGTTGATTTTTGAGAGATTTTAAAACGCCTTGAAAATTAACCGCACTTTTACTTTAATAAACCGTTAT
TTTTTACTCAAGTGCTTTCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 718; Mature: 718

Protein sequence:

>718_residues
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKNVFFTLIAFSISSFIVQLHIG
KPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYTTLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRP
VQESVAKAFCALGEYLDTKSCFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPRTQRMLRYYFAAQ
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNERVERSLLGTLHSFELYRTQHLND
QDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQEATDTEQLAQIHTEQITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIV
EFFQFNLGYWILLTTVFVCQPNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKQGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQALRSDAVYLLHIISQLQFGKSD
DLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGFDLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVA
KKIIYTLEHIEEIPEAIFNQQQESIETHLKELEKQDMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCERVGAL

Sequences:

>Translated_718_residues
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKNVFFTLIAFSISSFIVQLHIG
KPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYTTLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRP
VQESVAKAFCALGEYLDTKSCFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPRTQRMLRYYFAAQ
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNERVERSLLGTLHSFELYRTQHLND
QDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQEATDTEQLAQIHTEQITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIV
EFFQFNLGYWILLTTVFVCQPNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKQGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQALRSDAVYLLHIISQLQFGKSD
DLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGFDLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVA
KKIIYTLEHIEEIPEAIFNQQQESIETHLKELEKQDMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCERVGAL
>Mature_718_residues
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKNVFFTLIAFSISSFIVQLHIG
KPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYTTLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRP
VQESVAKAFCALGEYLDTKSCFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPRTQRMLRYYFAAQ
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNERVERSLLGTLHSFELYRTQHLND
QDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQEATDTEQLAQIHTEQITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIV
EFFQFNLGYWILLTTVFVCQPNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKQGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQALRSDAVYLLHIISQLQFGKSD
DLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGFDLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVA
KKIIYTLEHIEEIPEAIFNQQQESIETHLKELEKQDMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCERVGAL

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=705, Percent_Identity=38.0141843971631, Blast_Score=458, Evalue=1e-130,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=170, Percent_Identity=28.2352941176471, Blast_Score=89, Evalue=1e-18,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82578; Mature: 82578

Theoretical pI: Translated: 8.60; Mature: 8.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKN
CCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
VFFTLIAFSISSFIVQLHIGKPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRPVQESVAKAFCALGEYLDTKS
HHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
CFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPRTQRMLRYYFAAQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNERVE
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
RSLLGTLHSFELYRTQHLNDQDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQEATDTEQLAQIHTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
QITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIVEFFQFNLGYWILLTTVFVCQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCC
PNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKQGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQAL
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHH
RSDAVYLLHIISQLQFGKSDDLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCC
DLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVAKKIIYTLEHIEEIPEAIFNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QQESIETHLKELEKQDMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCERVGAL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MNIRLNAKVISTIPVFIAVNIAAVGIWFFDISSQSMPLILGIIAGGLVDLDNRLTGRLKN
CCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
VFFTLIAFSISSFIVQLHIGKPIQYIVLMTVLTFIFTMIGAVGQRYSTIAFGSLVVALYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TLTYIPEVNVWFINPVMILCGTLLYSVVTLIVYLFFPNRPVQESVAKAFCALGEYLDTKS
HHHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
CFFDPDEVAEIEKKHLNFAMKNANVVTAFNIVRTALFYRIRGQHRHPRTQRMLRYYFAAQ
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
DIHERANSTHFDYQQITEKLKNTDLIFRIQRLLELQAQSCKEITASLRENKPYHFNERVE
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
RSLLGTLHSFELYRTQHLNDQDELIDIQTLLDNLQSINWQLRQLAQEATDTEQLAQIHTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
QITGLKNISAVIFSHFTFESPLFRHAVRLSIVVFLCCAIVEFFQFNLGYWILLTTVFVCQ
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCC
PNYSATKVRLRQRIIGTILGVVVGSLLPYLNPTLELKQGLVVLTSTLFFFFRSNNYSFST
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
FFITLQVLLSFDVMGFDTAAALMPRLLDTLLGAAISWFAVSYLWPDWKYLQLDKVSHQAL
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHH
RSDAVYLLHIISQLQFGKSDDLKYRIARRNAHQYAAALSTTLSNMNNEPVKYKAYLQKGF
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCC
DLLKLNYSLLSYISALGAYRDRMKNLQQTAQFLSGFYPVAKKIIYTLEHIEEIPEAIFNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QQESIETHLKELEKQDMTAEERAVFSLPYQQLNLITQLLPQFYGYFKKEINCERVGAL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]