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The map label for this gene is ygxB [H]

Identifier: 148654049

GI number: 148654049

Start: 2797078

End: 2798655

Strand: Direct

Name: ygxB [H]

Synonym: PsycPRwf_2252

Alternate gene names: 148654049

Gene position: 2797078-2798655 (Clockwise)

Preceding gene: 148654047

Following gene: 148654050

Centisome position: 93.89

GC content: 42.65

Gene sequence:

>1578_bases
ATGGACAACATGTTTGTTTGGTTTAATAGCAATCTAGGCGGACCAATCGGCTCGATTATCGCAGCCATTTTGGTATTCGT
TATTGGTTGGTTAATTGCTATGGCACTGGCTGGTGTTGTACGCAACTTACTGGCCCGTGTTAATTTAAACCAACGTATGA
ACACCTCAACAGGTAAAGCTTACGACCTTGAAAACATAATTTCTAAGGTCGTTTTTTGGTTTATCTTCTTAATGGCAATC
TCAGGCGCATTAAGTATGTTGAGCCTAAATGCCATTTCAGCCCCATTTGCCAATATGATTGACAACGTACTGTCATTTAT
TCCCACCTTACTAGGCGCTGTGATTATTGGCGTGATTGGTTGGGTCGTGGCGACAGTGGCACGTACCGCTATCAACACCG
CTTTATCTAAGACCACTCTTGATGAAAGACTAAGTGCACAAGCGGGCGTTCAACCTATGAGCAGCACCATTGCTGATATG
GTTTACTGGGTTATCTTGCTGTTTGTACTCGTTATTGTATTAGGCCAGCTACAATTAGATGGCTTATTTGCCCCATTAAC
CAACATGCTAAATAAAGCAGTAAGTTACATCCCGAACCTATTTATGGCAGGTGTGGTGTTCTTTGTGGGTTATATCGTGG
CAAAAATTGTCCGTGGTATCGTAACTAATATGGTTACCAGCTTAAACCTACAAGGTTTTGCTGAGAAAGCCGGTATTAGT
AATAATCGTGAAAATAGCTTACCTAATATCGCCGGTTCATTGGCGTTCTTATTGGTCATTATTCCAACCACGATCATAGC
TTTAGATGCCCTAAACATCGAAGTTATCTCGCGTCCAGCGACTAATATGCTGAACAAAATTATGAGCGCGCTGCCGAATG
TCTTTACTGCAGCAGCCATTTTAATCATCACCTACTACATCATGAAAATGGTCGCGAATGTGGTTAAAGGCTTGCTTGAA
AACACCACAGTTAATGCCCTGCCTGCCAAGGTTGGTCTAGACAGTGCTATGGGTAAAACCCAAGTTTCAGACCTTGTTGG
CCATGCTATCATCTTCTTTGCTATGTTATTTGCAGGTATCTTAGCTGCAGACTTACTAGGCTTTGGACAAATCAGTGGCA
TCATCACTATGTTCATTGCTTTTGGTGCTGACATTATCTTAGGCGCTGTTATCTTGTTCATCGGTTTCTGGTTAGCCAAC
ATCATCGCTGGTGTGGTTGAGCGTTCTGATAAAGGATCACAATTTTTAGCCAATATCGTTCGTGTTCTTATCATGGGCCT
TGTGCTTGCGATGGGTCTAAAAGCGATGGGGATTGCCGATTCTATTGTTAACCTTGCCTTTGGTCTTACTTTGGGTGCTG
TGGCTGTTGCCTTTGCCCTATCTTTCGGTCTTGGTGGTCAAGAGGCTGCTGCTCGCTTCTTACGTAAGCTACAAGACAAG
GCAGAAACTGAAGCTGAAAAAGCGAAAGTTGAAAAAGCCATTGCTGATACTGCTAAACAGACAGATAAAGAGCCTTCAAT
TACTACTGTTTCAGGTGATGAGCCTTCAATTCCTAATGTGGATGTGGATAACAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTAAACTAACCTTTTTAGATAGACAAACTTAAAAATACAAAAGTATATTAGGGTCATCTTTAGATCCACTTATTGAAT
TACATTACAGGAGAAACAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAGCTAACGACTAGCTGTCATTGTCTCTAATCTCAAAAAAGCAGCCTTTTATAGGCTGCTTTTTCTATGCCCCGAATAAG
TGTAATTTTTACACTTTGCC

Product: TM helix repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF1 [H]

Number of amino acids: Translated: 525; Mature: 525

Protein sequence:

>525_residues
MDNMFVWFNSNLGGPIGSIIAAILVFVIGWLIAMALAGVVRNLLARVNLNQRMNTSTGKAYDLENIISKVVFWFIFLMAI
SGALSMLSLNAISAPFANMIDNVLSFIPTLLGAVIIGVIGWVVATVARTAINTALSKTTLDERLSAQAGVQPMSSTIADM
VYWVILLFVLVIVLGQLQLDGLFAPLTNMLNKAVSYIPNLFMAGVVFFVGYIVAKIVRGIVTNMVTSLNLQGFAEKAGIS
NNRENSLPNIAGSLAFLLVIIPTTIIALDALNIEVISRPATNMLNKIMSALPNVFTAAAILIITYYIMKMVANVVKGLLE
NTTVNALPAKVGLDSAMGKTQVSDLVGHAIIFFAMLFAGILAADLLGFGQISGIITMFIAFGADIILGAVILFIGFWLAN
IIAGVVERSDKGSQFLANIVRVLIMGLVLAMGLKAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALSFGLGGQEAAARFLRKLQDK
AETEAEKAKVEKAIADTAKQTDKEPSITTVSGDEPSIPNVDVDNK

Sequences:

>Translated_525_residues
MDNMFVWFNSNLGGPIGSIIAAILVFVIGWLIAMALAGVVRNLLARVNLNQRMNTSTGKAYDLENIISKVVFWFIFLMAI
SGALSMLSLNAISAPFANMIDNVLSFIPTLLGAVIIGVIGWVVATVARTAINTALSKTTLDERLSAQAGVQPMSSTIADM
VYWVILLFVLVIVLGQLQLDGLFAPLTNMLNKAVSYIPNLFMAGVVFFVGYIVAKIVRGIVTNMVTSLNLQGFAEKAGIS
NNRENSLPNIAGSLAFLLVIIPTTIIALDALNIEVISRPATNMLNKIMSALPNVFTAAAILIITYYIMKMVANVVKGLLE
NTTVNALPAKVGLDSAMGKTQVSDLVGHAIIFFAMLFAGILAADLLGFGQISGIITMFIAFGADIILGAVILFIGFWLAN
IIAGVVERSDKGSQFLANIVRVLIMGLVLAMGLKAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALSFGLGGQEAAARFLRKLQDK
AETEAEKAKVEKAIADTAKQTDKEPSITTVSGDEPSIPNVDVDNK
>Mature_525_residues
MDNMFVWFNSNLGGPIGSIIAAILVFVIGWLIAMALAGVVRNLLARVNLNQRMNTSTGKAYDLENIISKVVFWFIFLMAI
SGALSMLSLNAISAPFANMIDNVLSFIPTLLGAVIIGVIGWVVATVARTAINTALSKTTLDERLSAQAGVQPMSSTIADM
VYWVILLFVLVIVLGQLQLDGLFAPLTNMLNKAVSYIPNLFMAGVVFFVGYIVAKIVRGIVTNMVTSLNLQGFAEKAGIS
NNRENSLPNIAGSLAFLLVIIPTTIIALDALNIEVISRPATNMLNKIMSALPNVFTAAAILIITYYIMKMVANVVKGLLE
NTTVNALPAKVGLDSAMGKTQVSDLVGHAIIFFAMLFAGILAADLLGFGQISGIITMFIAFGADIILGAVILFIGFWLAN
IIAGVVERSDKGSQFLANIVRVLIMGLVLAMGLKAMGIADSIVNLAFGLTLGAVAVAFALSFGLGGQEAAARFLRKLQDK
AETEAEKAKVEKAIADTAKQTDKEPSITTVSGDEPSIPNVDVDNK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008910 [H]

Pfam domain/function: PF05552 TM_helix [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55708; Mature: 55708

Theoretical pI: Translated: 7.50; Mature: 7.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 8144469 [H]