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The map label for this gene is 148643351

Identifier: 148643351

GI number: 148643351

Start: 1295332

End: 1296837

Strand: Reverse

Name: 148643351

Synonym: Msm_1291

Alternate gene names: NA

Gene position: 1296837-1295332 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148643352

Following gene: 148643349

Centisome position: 69.98

GC content: 31.14

Gene sequence:

>1506_bases
ATGTTTAAATTAGAAAATAAGAAATATTTCATTGGAATATATGCTTTAATATTAAGCTTATTCAGCCTGTATTTCACATA
TAGGGCAAACTTTTCAAATCCTGAATTTGAAGTGCTTATGTTTTGTATATTGCTGATAGCAGGAATATTATCTATTGTAT
ACTATACAAAAAACAATGAGAAGTTACATAAAGTTGCATTGGTACTAATAATAATATTTGGTATAATAAGCCTGTTTTTG
ACACCGATTTATGATGTGTCTGATGAAACTGAACATTTTGTCCGCTCAGAAATAGTTTCAACCGGAGAATTGTCAACCAA
TTATGTGCCAATTCCAAATACAACTGCAAACGGTTATAAAACAATTGCAAGTGTAACCACATTTTTTGATAATGCTGGAG
CAAATGTATTTAATACACATGCAGATGATGATAAAATAGATCATACTCCATCATATTTCAACTCCGCTTTTGCTCAAAAT
CCATTTTATGGTTATTTAGCACAGGGAATTGGAGTGTTTTTAGCAAAATGTCTGGATTTAAATGCAATCTGGATGTTATG
GCTTGGAAGATTCTTTAATTTATTATTATATGCCGGAATAATTGCAGTAGCTATTAAAAAAGCACCAGTCTTTAAGTTTC
CATTACTTATAGTGTCAATACTTCCAATAGCTATTTATCAAGCCGCATCAACAAGCTGTGATGGATTATTCAGCGCACTG
GCCATTCTTGCATTCAGTTATTTTCTATATTTCTATAAAACACCTAAAATTACCTGGACGGATTTAGGGATATTTTATAT
AGCTGTAATTCTATGCGGACTGCTTAAAACCCCTTACTTGGCTTTAAGTTTATTGATTTTTCTGGTTCCAAATACAAATT
TTAGTGATAAAAAGCAAAATATCATATCTAAACTTTGTATTTTAGTTGCTTTAGGTATTGGAATTGCTTGGAGCAGCTAT
GCAACAACACAACTAGCTAATTCCTGGAGAGGAGAATATTTTATCCAAAGAAATGTAAGTGCAAGTGGTCAAATTGATTA
CTTACTGGCCAATCCATTAATTGCACTTCAAAGATTTGGTGAGATCTACAGTACTGCACTGCCAACTGTTATTGACAGAT
TCTTTTATTTCTCAAATAGTGTAAGAGAATATTCATCAACTCTTCTTGCAGGACTTTACTTTGTATTCTTCTGTTTATTT
AGTGTATTTTATTGTAATTTCAAAGATTTAAATTTAAAAACACGTATTAAAGGATTTTTAATAATTATTTTAATTTATAG
TGGTGTAATGGCTATCCAATACTTAACATGGTCTCCAGTTGGAGGGGAAAATGTAACAAGTGGTGTATTCAGTCGTTACT
TCATGCCGTTGCTAATATTTTTACCGTTTGTATTTGGAATAGGCAATAAAAAAATAGATAAGCAAACTTTAAGCTTTTTA
GTGCTGACTGTAGCTATCAGTTTTATTTCCGGAATGTTAATGCTGACAACAGCTGTTAAATATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTAAGTGTCGGAGATATTGTTGATGTTAAGGTTTTAGATGTTGATTTAGCTAGAAATAGAATACAATTATCAATGTTAA
TATAAATAAAGGTTATTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATTTTACCTTTTTTTATTTTGAGCTATTAAATTTAAATGATGTTCAAAGTTTTCATCATGCTGTTTTCTAATAACATGC
AAAACAACACCTGTGAAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 501; Mature: 501

Protein sequence:

>501_residues
MFKLENKKYFIGIYALILSLFSLYFTYRANFSNPEFEVLMFCILLIAGILSIVYYTKNNEKLHKVALVLIIIFGIISLFL
TPIYDVSDETEHFVRSEIVSTGELSTNYVPIPNTTANGYKTIASVTTFFDNAGANVFNTHADDDKIDHTPSYFNSAFAQN
PFYGYLAQGIGVFLAKCLDLNAIWMLWLGRFFNLLLYAGIIAVAIKKAPVFKFPLLIVSILPIAIYQAASTSCDGLFSAL
AILAFSYFLYFYKTPKITWTDLGIFYIAVILCGLLKTPYLALSLLIFLVPNTNFSDKKQNIISKLCILVALGIGIAWSSY
ATTQLANSWRGEYFIQRNVSASGQIDYLLANPLIALQRFGEIYSTALPTVIDRFFYFSNSVREYSSTLLAGLYFVFFCLF
SVFYCNFKDLNLKTRIKGFLIIILIYSGVMAIQYLTWSPVGGENVTSGVFSRYFMPLLIFLPFVFGIGNKKIDKQTLSFL
VLTVAISFISGMLMLTTAVKY

Sequences:

>Translated_501_residues
MFKLENKKYFIGIYALILSLFSLYFTYRANFSNPEFEVLMFCILLIAGILSIVYYTKNNEKLHKVALVLIIIFGIISLFL
TPIYDVSDETEHFVRSEIVSTGELSTNYVPIPNTTANGYKTIASVTTFFDNAGANVFNTHADDDKIDHTPSYFNSAFAQN
PFYGYLAQGIGVFLAKCLDLNAIWMLWLGRFFNLLLYAGIIAVAIKKAPVFKFPLLIVSILPIAIYQAASTSCDGLFSAL
AILAFSYFLYFYKTPKITWTDLGIFYIAVILCGLLKTPYLALSLLIFLVPNTNFSDKKQNIISKLCILVALGIGIAWSSY
ATTQLANSWRGEYFIQRNVSASGQIDYLLANPLIALQRFGEIYSTALPTVIDRFFYFSNSVREYSSTLLAGLYFVFFCLF
SVFYCNFKDLNLKTRIKGFLIIILIYSGVMAIQYLTWSPVGGENVTSGVFSRYFMPLLIFLPFVFGIGNKKIDKQTLSFL
VLTVAISFISGMLMLTTAVKY
>Mature_501_residues
MFKLENKKYFIGIYALILSLFSLYFTYRANFSNPEFEVLMFCILLIAGILSIVYYTKNNEKLHKVALVLIIIFGIISLFL
TPIYDVSDETEHFVRSEIVSTGELSTNYVPIPNTTANGYKTIASVTTFFDNAGANVFNTHADDDKIDHTPSYFNSAFAQN
PFYGYLAQGIGVFLAKCLDLNAIWMLWLGRFFNLLLYAGIIAVAIKKAPVFKFPLLIVSILPIAIYQAASTSCDGLFSAL
AILAFSYFLYFYKTPKITWTDLGIFYIAVILCGLLKTPYLALSLLIFLVPNTNFSDKKQNIISKLCILVALGIGIAWSSY
ATTQLANSWRGEYFIQRNVSASGQIDYLLANPLIALQRFGEIYSTALPTVIDRFFYFSNSVREYSSTLLAGLYFVFFCLF
SVFYCNFKDLNLKTRIKGFLIIILIYSGVMAIQYLTWSPVGGENVTSGVFSRYFMPLLIFLPFVFGIGNKKIDKQTLSFL
VLTVAISFISGMLMLTTAVKY

Specific function: Unknown

COG id: COG4713

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56423; Mature: 56423

Theoretical pI: Translated: 8.92; Mature: 8.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKLENKKYFIGIYALILSLFSLYFTYRANFSNPEFEVLMFCILLIAGILSIVYYTKNNE
CCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
KLHKVALVLIIIFGIISLFLTPIYDVSDETEHFVRSEIVSTGELSTNYVPIPNTTANGYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCHHH
TIASVTTFFDNAGANVFNTHADDDKIDHTPSYFNSAFAQNPFYGYLAQGIGVFLAKCLDL
HHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NAIWMLWLGRFFNLLLYAGIIAVAIKKAPVFKFPLLIVSILPIAIYQAASTSCDGLFSAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
AILAFSYFLYFYKTPKITWTDLGIFYIAVILCGLLKTPYLALSLLIFLVPNTNFSDKKQN
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
IISKLCILVALGIGIAWSSYATTQLANSWRGEYFIQRNVSASGQIDYLLANPLIALQRFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
EIYSTALPTVIDRFFYFSNSVREYSSTLLAGLYFVFFCLFSVFYCNFKDLNLKTRIKGFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
IIILIYSGVMAIQYLTWSPVGGENVTSGVFSRYFMPLLIFLPFVFGIGNKKIDKQTLSFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
VLTVAISFISGMLMLTTAVKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MFKLENKKYFIGIYALILSLFSLYFTYRANFSNPEFEVLMFCILLIAGILSIVYYTKNNE
CCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
KLHKVALVLIIIFGIISLFLTPIYDVSDETEHFVRSEIVSTGELSTNYVPIPNTTANGYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCHHH
TIASVTTFFDNAGANVFNTHADDDKIDHTPSYFNSAFAQNPFYGYLAQGIGVFLAKCLDL
HHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NAIWMLWLGRFFNLLLYAGIIAVAIKKAPVFKFPLLIVSILPIAIYQAASTSCDGLFSAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
AILAFSYFLYFYKTPKITWTDLGIFYIAVILCGLLKTPYLALSLLIFLVPNTNFSDKKQN
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
IISKLCILVALGIGIAWSSYATTQLANSWRGEYFIQRNVSASGQIDYLLANPLIALQRFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
EIYSTALPTVIDRFFYFSNSVREYSSTLLAGLYFVFFCLFSVFYCNFKDLNLKTRIKGFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
IIILIYSGVMAIQYLTWSPVGGENVTSGVFSRYFMPLLIFLPFVFGIGNKKIDKQTLSFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
VLTVAISFISGMLMLTTAVKY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA