Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 148643348

Identifier: 148643348

GI number: 148643348

Start: 1292320

End: 1293795

Strand: Reverse

Name: 148643348

Synonym: Msm_1288

Alternate gene names: NA

Gene position: 1293795-1292320 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148643349

Following gene: 148643347

Centisome position: 69.82

GC content: 28.93

Gene sequence:

>1476_bases
ATGAAAAATTTAAATAAAGAAGACAAATTAGGAAAAATACTTTTTATAATAAGCATAATTACATTGCTTTATGTTTCCTA
TATTGGATTTACAAAATTAGGAATGTGGTATGATGAAATATACTCTTTGGGAATGGTTAAATCTCCATTTAATGATTTTA
TTAATTTTGCTTTTCTTGATGTCCACCCTCCACTTTATTATCTGATTTTTAAAGTATTTTACAAAATCGGAGTCTTTTTA
GGAATAAATCCGATTATAGTAGGTAAATTCACCTCACTGCTTCCATTTTATTTAATACTTGTACTAGCAGCAACGAAAGT
TAGGAAAAACTGGGGATACTTAACTGCAGGTTTATTTGCTTTTTGTATAGTTAGCATGCCTCAGCTAATGAATTTTGCTG
TTGAATTAAGAATGTACAGCTGGGGACTGTTCTTTGTAACAGCAAGTTTTATTTATGCTTATGATATTTTAAATAAAAAC
TCAACATGGAAAAGCTGGGGAATTTTAACTTTACTAACAATAGCTTCTGCTTACACACATTATTTCTCAGCAGTAGCTTC
ATTTGTCATTTATTTATTTTTACTTGCTGATTTAATTAGAAATAATAAAAATGAGCTTAAAAAATACTTCACATCAGCAA
TTATAGCTATTTTAAGTTTTACACCATGGCTGATTATTCTAAAACAACAGGCTGCAAGTGTAAGCAGCAGTTACTGGATA
GCTCCAATTACACTAAATAAGATTTTAGGATATTTCTGGTTTGTTTTATCACCGGATAATCAGGTTATTAATGCAAATCA
GATAGCTGCATTTTCTGTTTTAGGATTATTACTTCTAATTGGAGTTATTGTTCTACTAATTAAAAGTGATAAAAAAGACA
CCTACGGGATTTTAATTGCTGTTTGTGTTCCGATTATCGGAATAATCTTATCTTTAATTATCAAACCTGTTTTTCATCCA
CGTTATTTAATACCTGTTTTAGGATGTTTATGGTTGGGAGTAAGTATTTTACTTGGCAAAAACTTCAGCAATAAAAAGAT
ATTTATTCCAATTTTCGTGATTATCTTACTTGTAGCTTCAGTTGGCTGTGTTAATTTTACACAAACTCAAATTAACGACC
AAATTAATGACAGCAATAAAATACAGTCACTAGAAGAAACCTTTGGTAGTGGAAATCTTATTATTTATGATGCTTTTGTT
CCGTACTTTGAGATGAATTCCTATTATCTGACAGATGACCATAATTTTATGCTGACAGTAACAGAGGATAAAGATTTTAA
TACTACTGCTAATCAGATTAGTGATGTTTTAGCTGACCCAGGTATTCAAAATGAAATATCTCATGGAAGTAAAGTCTTTT
TCATAAATTATAAACATTATGATAATGAAATAACTCTAAATCATGATACATATAATCTTAAAAAGCTTCCAATAGACTTA
GATAAATACACTGCTTATGAAGTTGAAATTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCTGGTCTAAAATTATAGCATCCATTATAGTAATGTTCTGGAATTTCACAGCACGTAGAGTTATGTTTTATGGGAAAAA
ACTTTAAGTTGGAAATTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTTTAATATAAAATTAAACAAATATCAATTATTAATATTTTTTTAGAAGGTATTTTAAAATGACACCAAAAGTAATGAT
AATTCTGGGAAGTGGGTCAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 491; Mature: 491

Protein sequence:

>491_residues
MKNLNKEDKLGKILFIISIITLLYVSYIGFTKLGMWYDEIYSLGMVKSPFNDFINFAFLDVHPPLYYLIFKVFYKIGVFL
GINPIIVGKFTSLLPFYLILVLAATKVRKNWGYLTAGLFAFCIVSMPQLMNFAVELRMYSWGLFFVTASFIYAYDILNKN
STWKSWGILTLLTIASAYTHYFSAVASFVIYLFLLADLIRNNKNELKKYFTSAIIAILSFTPWLIILKQQAASVSSSYWI
APITLNKILGYFWFVLSPDNQVINANQIAAFSVLGLLLLIGVIVLLIKSDKKDTYGILIAVCVPIIGIILSLIIKPVFHP
RYLIPVLGCLWLGVSILLGKNFSNKKIFIPIFVIILLVASVGCVNFTQTQINDQINDSNKIQSLEETFGSGNLIIYDAFV
PYFEMNSYYLTDDHNFMLTVTEDKDFNTTANQISDVLADPGIQNEISHGSKVFFINYKHYDNEITLNHDTYNLKKLPIDL
DKYTAYEVEIK

Sequences:

>Translated_491_residues
MKNLNKEDKLGKILFIISIITLLYVSYIGFTKLGMWYDEIYSLGMVKSPFNDFINFAFLDVHPPLYYLIFKVFYKIGVFL
GINPIIVGKFTSLLPFYLILVLAATKVRKNWGYLTAGLFAFCIVSMPQLMNFAVELRMYSWGLFFVTASFIYAYDILNKN
STWKSWGILTLLTIASAYTHYFSAVASFVIYLFLLADLIRNNKNELKKYFTSAIIAILSFTPWLIILKQQAASVSSSYWI
APITLNKILGYFWFVLSPDNQVINANQIAAFSVLGLLLLIGVIVLLIKSDKKDTYGILIAVCVPIIGIILSLIIKPVFHP
RYLIPVLGCLWLGVSILLGKNFSNKKIFIPIFVIILLVASVGCVNFTQTQINDQINDSNKIQSLEETFGSGNLIIYDAFV
PYFEMNSYYLTDDHNFMLTVTEDKDFNTTANQISDVLADPGIQNEISHGSKVFFINYKHYDNEITLNHDTYNLKKLPIDL
DKYTAYEVEIK
>Mature_491_residues
MKNLNKEDKLGKILFIISIITLLYVSYIGFTKLGMWYDEIYSLGMVKSPFNDFINFAFLDVHPPLYYLIFKVFYKIGVFL
GINPIIVGKFTSLLPFYLILVLAATKVRKNWGYLTAGLFAFCIVSMPQLMNFAVELRMYSWGLFFVTASFIYAYDILNKN
STWKSWGILTLLTIASAYTHYFSAVASFVIYLFLLADLIRNNKNELKKYFTSAIIAILSFTPWLIILKQQAASVSSSYWI
APITLNKILGYFWFVLSPDNQVINANQIAAFSVLGLLLLIGVIVLLIKSDKKDTYGILIAVCVPIIGIILSLIIKPVFHP
RYLIPVLGCLWLGVSILLGKNFSNKKIFIPIFVIILLVASVGCVNFTQTQINDQINDSNKIQSLEETFGSGNLIIYDAFV
PYFEMNSYYLTDDHNFMLTVTEDKDFNTTANQISDVLADPGIQNEISHGSKVFFINYKHYDNEITLNHDTYNLKKLPIDL
DKYTAYEVEIK

Specific function: Unknown

COG id: COG5305

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55935; Mature: 55935

Theoretical pI: Translated: 8.45; Mature: 8.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCEEEEEEEC
>Mature Secondary Structure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CCCEEEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA