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The map label for this gene is 148643268

Identifier: 148643268

GI number: 148643268

Start: 1207817

End: 1209373

Strand: Reverse

Name: 148643268

Synonym: Msm_1208

Alternate gene names: NA

Gene position: 1209373-1207817 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148643269

Following gene: 148643267

Centisome position: 65.26

GC content: 35.77

Gene sequence:

>1557_bases
ATGGCAAATAAGTTAGTTAGAGGTAGCTTTATTATTTTTATAGGTAATATTATCTTCCGTATTGGAGGGTATCTGTACCG
TTTTTTAATGGCTGCTCTTTTAGGCCCAACTAGTTGGGGTATTTTAGCTACTACTTTGCCATTTCAGGGAATATTCCAAA
CATTGTCTGCTGGTGGACTCCCTCCGGCAATAGCTAAGTATGTTGCAGAATATGAAGTTGTAAATGAACATGACATGGCC
CGTAAAACGATTTATGTAGCTTTAAAAATCATGGTATTTCTGGGAATATTCTTTGGAGTAATTATGGTTTTCATTGTTGC
TCCATGGCTTGCTTACGATTATTTGGGAAAACCGGAAACACTTGTTCCCCTGCAGATTGTAGGTCTTATTACTCCGTTTA
GTGTTATTGTCGGTGCTTTTAGAGGAGCATTCCAGGGAGTATATAAAATGGAGTATATTGTATATACTCGTGCTGTAGAG
CAGTTAGGAATGATTTTATTTGCAACTGCATTTGTTTTAATTGGATTTTCTGTTACTGGTGCACTGTGGGGTACTGTAAT
AGGTTTTGCAGCGGCAGCGGTTTCTGCAGTATATATATTCAGACATCATATGGCAAAATATATTCCTCCTGCCAGTGTAG
ATTTTAAGTTTACCTGGAGAGATGAATTGAATTTGGCTACTACTTTAGTTAAATTCTCCATTCCTGTAATTATTACAGCT
ATTGCTGAAATGCTTATTTACAATATCTGTACTATGGTTATGGGTAAATTTTTAGCTTTAGAAGCTGTCGGATTTTTTGC
AGCTGCTGATCCTATATCCAGATTGCCATTAATGATTTCTATTTCAATAGCTACAACAATTTTGCCGGCTTCTTCTGAGG
CATTCAGGGCGGGAAATAAGGTAGCACTGGAAAAATATGTTTCTGAAGCATATAAATTTTCTTTACTGTTCGTTGTTCCA
ATGTGTATAGGATTGGCTTGTTTTGCAGCTCCTATTTTAAGATTGCTTTATTTCACTAATCCGGCTTATGTTGCAGGTGC
ATCTGCATTAGCTATTTTGTCTATTGGTATGACATTCTACTCAATATTTTCAATTTCAACAAGTATTGTTCAGGGTATTG
GTAATCCGAGAATTCCTATGTACATATTAGTATTTGGAGCTATTTTGACAGCTGTTTTAAATTGGGTTATGGTTCCAACT
TTAGGTATTGCAGGCGGTGCTGCAGCTACTTCAATAGCCTGTTTTGCAATGATGGTGCCTATACTTTATATGGTATTCAA
ATTAACTCAGGTTAAAGCCCCTAAAGTTTCAGTAATTAAAATATTTGCTGCTTCAATGATAATGGGTGTTGTTGCATATA
TTATGCCTAAGACAACATCCTGGTTGTTTGTAGGAATTATTGTCTGTATGATTGTGTACTTCTTTGCATTAATACTTGTA
AGATTCTTCACTCAGGAGGATATTGTGGGTTTAAGAGCATTATCCTCTAAATTCGGACCTTTGTCTAAAGTTATGGGTAA
AATGTTGGATTTAGTTGAAAAAATCGAATTCAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGATTAAGTTATTGCAATGAGTATATTTATATAGTAAAATTAATTTATATTAGTATAGTTTTTTTATTTTAATCAAAT
TTTTTTTATTAGGTTATGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTTGCACGATTATATTTTTCAAATCCTTTTTTTATTTATTTATATTTCTTAAAATAACTAAAAATTAATATAACAACT
TTTATTTTGATTATTATGAT

Product: teichoic acid transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 518; Mature: 517

Protein sequence:

>518_residues
MANKLVRGSFIIFIGNIIFRIGGYLYRFLMAALLGPTSWGILATTLPFQGIFQTLSAGGLPPAIAKYVAEYEVVNEHDMA
RKTIYVALKIMVFLGIFFGVIMVFIVAPWLAYDYLGKPETLVPLQIVGLITPFSVIVGAFRGAFQGVYKMEYIVYTRAVE
QLGMILFATAFVLIGFSVTGALWGTVIGFAAAAVSAVYIFRHHMAKYIPPASVDFKFTWRDELNLATTLVKFSIPVIITA
IAEMLIYNICTMVMGKFLALEAVGFFAAADPISRLPLMISISIATTILPASSEAFRAGNKVALEKYVSEAYKFSLLFVVP
MCIGLACFAAPILRLLYFTNPAYVAGASALAILSIGMTFYSIFSISTSIVQGIGNPRIPMYILVFGAILTAVLNWVMVPT
LGIAGGAAATSIACFAMMVPILYMVFKLTQVKAPKVSVIKIFAASMIMGVVAYIMPKTTSWLFVGIIVCMIVYFFALILV
RFFTQEDIVGLRALSSKFGPLSKVMGKMLDLVEKIEFR

Sequences:

>Translated_518_residues
MANKLVRGSFIIFIGNIIFRIGGYLYRFLMAALLGPTSWGILATTLPFQGIFQTLSAGGLPPAIAKYVAEYEVVNEHDMA
RKTIYVALKIMVFLGIFFGVIMVFIVAPWLAYDYLGKPETLVPLQIVGLITPFSVIVGAFRGAFQGVYKMEYIVYTRAVE
QLGMILFATAFVLIGFSVTGALWGTVIGFAAAAVSAVYIFRHHMAKYIPPASVDFKFTWRDELNLATTLVKFSIPVIITA
IAEMLIYNICTMVMGKFLALEAVGFFAAADPISRLPLMISISIATTILPASSEAFRAGNKVALEKYVSEAYKFSLLFVVP
MCIGLACFAAPILRLLYFTNPAYVAGASALAILSIGMTFYSIFSISTSIVQGIGNPRIPMYILVFGAILTAVLNWVMVPT
LGIAGGAAATSIACFAMMVPILYMVFKLTQVKAPKVSVIKIFAASMIMGVVAYIMPKTTSWLFVGIIVCMIVYFFALILV
RFFTQEDIVGLRALSSKFGPLSKVMGKMLDLVEKIEFR
>Mature_517_residues
ANKLVRGSFIIFIGNIIFRIGGYLYRFLMAALLGPTSWGILATTLPFQGIFQTLSAGGLPPAIAKYVAEYEVVNEHDMAR
KTIYVALKIMVFLGIFFGVIMVFIVAPWLAYDYLGKPETLVPLQIVGLITPFSVIVGAFRGAFQGVYKMEYIVYTRAVEQ
LGMILFATAFVLIGFSVTGALWGTVIGFAAAAVSAVYIFRHHMAKYIPPASVDFKFTWRDELNLATTLVKFSIPVIITAI
AEMLIYNICTMVMGKFLALEAVGFFAAADPISRLPLMISISIATTILPASSEAFRAGNKVALEKYVSEAYKFSLLFVVPM
CIGLACFAAPILRLLYFTNPAYVAGASALAILSIGMTFYSIFSISTSIVQGIGNPRIPMYILVFGAILTAVLNWVMVPTL
GIAGGAAATSIACFAMMVPILYMVFKLTQVKAPKVSVIKIFAASMIMGVVAYIMPKTTSWLFVGIIVCMIVYFFALILVR
FFTQEDIVGLRALSSKFGPLSKVMGKMLDLVEKIEFR

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56579; Mature: 56448

Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
4.8 %Met     (Translated Protein)
5.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
4.6 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
ANKLVRGSFIIFIGNIIFRIGGYLYRFLMAALLGPTSWGILATTLPFQGIFQTLSAGGL
CCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCC
PPAIAKYVAEYEVVNEHDMARKTIYVALKIMVFLGIFFGVIMVFIVAPWLAYDYLGKPET
CHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LVPLQIVGLITPFSVIVGAFRGAFQGVYKMEYIVYTRAVEQLGMILFATAFVLIGFSVTG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALWGTVIGFAAAAVSAVYIFRHHMAKYIPPASVDFKFTWRDELNLATTLVKFSIPVIITA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAEMLIYNICTMVMGKFLALEAVGFFAAADPISRLPLMISISIATTILPASSEAFRAGNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCEEEEHHHHHHCCCCCHHHHCCCH
VALEKYVSEAYKFSLLFVVPMCIGLACFAAPILRLLYFTNPAYVAGASALAILSIGMTFY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIFSISTSIVQGIGNPRIPMYILVFGAILTAVLNWVMVPTLGIAGGAAATSIACFAMMVP
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ILYMVFKLTQVKAPKVSVIKIFAASMIMGVVAYIMPKTTSWLFVGIIVCMIVYFFALILV
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RFFTQEDIVGLRALSSKFGPLSKVMGKMLDLVEKIEFR
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]