Definition Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome.
Accession NC_009515
Length 1,853,160

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The map label for this gene is pcrA [H]

Identifier: 148642118

GI number: 148642118

Start: 54271

End: 58788

Strand: Reverse

Name: pcrA [H]

Synonym: Msm_0058

Alternate gene names: 148642118

Gene position: 58788-54271 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148642119

Following gene: 148642117

Centisome position: 3.17

GC content: 24.79

Gene sequence:

>4518_bases
ATGCCAACAAATTTTGAATTTTTAAAAGAAGACTATCCTGATTTATTTGATTGGGCTCATGACATGGAAAAAAAAGTTAA
ACAAGACCCTAATGGAGCTATTAATTCAGGTTCTAAATTTTTTGAAAGAATTTTAAATATATTACTTGAAAATGCCAGAA
TTCATCCTAAAGAAACATATGTTGAAAAAATAATTGATTTAAAAAATAAGAAAGTCATTGATTCCAAATCAGAGAAATTG
CTTCAAAAAGCAAGAAAATACCGTAATGATGATAGACATAGTGATTCTTCGTCAAATGAAAGAGTGGCATTAGCTTTTTT
AAAAGTTATATTTAATATATCTGTATGGTTTATGGAGGATTATAATAATGAAATTATTCATAATTCTGATTTTGATACAA
ATATTTTAACCCAGATTGAAAAAGAAAGTCAAGTATCTAAAGAAGACATAGAAAAATTTGAAAATAAATTGTTGAATATG
TTAGAATTTAAGATGGAACAAATAAATCGTAAAAAAGAAGAGGTAGTTAATCTTGTTGAAGATAATTATATTCTTAAGGA
GGATGTCGGTAAAATAGTTAATGATGCTGTGAATTTGGCTATGATACAATCTAGTGAAGATAAAGCTAGTCTTGAAAATA
AAATACTTAATCTTTCAAAAGAAAACGAAGAATTAAAAAGAGGTTTTGAATCTAAATTTAATGATCTTAAAATCAATTAT
TCTGAAAATAATAAAGAAGAATTGGTAAATTTTATTGCAGATAATTATTATTCTAAAGAAGATGTCGGTAAAATAGTTAA
TGATGCTGTGAATTTGGCTATGATACAATCTAGTGAAGATAAAGCTAATTTTAAAAAAGAACTACTTAATCTTTCAAAAA
AATATGATTCTTCAAGAAAAAATCTTGAAGATAAAATTGACAATTTAACAATGGAATATTCTAATGCTGATTTAAGCAAG
TTTGTTACAGATAATTATGCTCCAAAAGATGAAATTTATAAGATAGTTTCTAATGAAATTGAAAATTTAAAAAAAGAATC
AGATGAGGATAAACTTAATTTAGAAAAAATGATGTTAATTATTAATGAGGAAAATGAATTAATGAGAAAAGATTTTGAAT
CTAAATTAAATAGTATTAACGAGCAAACATCGGATAAAAGTAATAAAGAGCTTGAAAATTTAATTATTAAGGATTATGTT
CCTAAAAGTGATTTAAAAAAGCATATTGATTTAGCAATTAAAGAATTTGCAAAAACTCATAATATAGAAATTAGTGAAAT
TTACAATCCTCCTGAAGAAATTTTAATTGAAAATCAACCTAAATTTGTTCCATCTAAACCTAAAAAACAAAAAATAAAAC
CTAAAAAATTAAATGAAGATCAAGAAGCAGCTGTTATGTATGATGGTAAAAAACCTCTTTTAATTGAAGCAGGCCCAGGT
TCTGGTAAAACTACAGTTTTAATTGAAAGGGTAAAATATCTTTTAAATAATAAAGGTATTGATCCTGAAAGTTTACTTGT
TATTACTTTTACAAAAAAAGCAGCTAATGAATTAAAAACAAGATTAAGTGAAGAAACAGATAATATATCAGAATTAGATG
TTCAAAAAATGCAGATATCTACTATTCATGGTTTTTGTGCTAAAATTTTAGAAAAAGCAGGGTATGTTAATTTAAGTATT
ATTGGTGATGATTTAGGTGAAAAAATTAATATGTTTGTTAGAAAACATCTTGAAGAGTTAGGATTCACTGGAATAGCTTA
TGCTTCTAAAAGGGATGCTAAAAACATTATTAATAAATATGAGGAATATTGTACTTTTGGTGTTGATTCACAAAATCTTA
TAAAATATATTCAAGATAATTATCCAATTAGTCAAGATTACATTGATTTTGTAGAACAATATATGGAAGAAAATGAAGGT
AAATTTCCTAAAATGGAAGTTAAGGAAAATAAGGAATTTAAACAATCTTATTACAATGCCTTGTATTTACAAGTAGCTAA
ATCTTATCCAATTTATAAAGAATTAATGGAAAAAGAAAATGTTATTGATTTTGGTCATATGCAACTAAAAGCACTGGAAT
ATCTTAGAGAAAATCCAGATTCTGTTTTTAAAAATATTTTAATTGATGAATTCCAGGATACTGATCCTATTCAAATGGAA
ATTTTTAAAATTTTAATGAAAAATTGTGATAGTGCTACTTTTGTAGGAGATATTGATCAAAGTATTTATGGTTTTAGAGG
TTCTTATGACAATTACTTTGAACAGTTATCTAATGAATATGATGTTAAAAGAATAAGTTTAAATACAAATTATCGTTCAA
CTAATCAGATAATTGATGTGTCTGAAGCACTTATTAAACCTCAAAGAGATGTTCATTCTGAAAAGGATTTAAAAGGTAAT
AGGGACATTGATTTCCCGATTTATTATATTTCTAATGAAGATAAAGATAATGAAGCAGAAAATATCTGCGAATTTATTAA
ATATTTAAAAGAAACTGGTAAAATTGATAATTATAATGAAATAGCTGTTTTAACAAGGTCTGTTACTAGTAATGGTAATT
GTATTAAACCATTAATGAATTTACTTAATGAAAATAATATTCCTTATGCTATTAAAGGAAATAAAGATTTACTGGATAAA
GATGAAATTAAATCTATTTTAACATTGATTTATTATGTTATTTCAGAAGATAAAGATCATCATATAATGAACTCCTGGGA
AAAGAAATGGCTTAACTTAAAGGCATTTACTGACACTGATTTTAAAATGAAGCTCTGTAATTTGTCTGATGAAACAAAAG
AAATTCTTTTTAATATTCAGGAACAGTATGAAAATGATGTTGTTGCAGCTGAAAAAGATGTGAGTATTGAAGTCACTGGT
AAAAAAAGTAGAGTTAGAAGTTTTGGTGGAGTATTTAAAAAATATAATAAACCTGAATTTGAAAATGGTCAAGAAATATT
AAAAGATATTGTAAATAAAGTCAGTTTTCCTTATTTAAATGTTCAAAACTTAGAAAAGTGGGGAATTAAGAATAAAGATG
ATTTGGCTTTTTTTGATAAATTATTTGAAATTCGTGAAAATATTTTATCTGAAGATATTGAATATAAAAACAAATTAACT
ATTTTGGAAATTTATATGCGATTATTAGAGATAAATGATTATTTTAATGCAGATTTCATCAATAATCCTAATAATCAAGA
TGAAATTAGTAATTTAGCTTTTATATCAAATACATTATATAATTATGAGCAAATGTATTATAATAAAGCTATTCGTGGTG
CTTTTTGGTTTTTATATACTAATATTGAGGATTATGGATCTTCAAATGTGGATCCTAATGGTGTTCAATTAATGACTGTT
CATAAAGCTAAAGGATTGGAGTTTCCAGTTGTTATTGTAGCTTCATTTTCTGATAAAAAATTCCCATCTAAATTTATAAG
TCCAAATCCTGATAATGGTTATATTCATGGAAAACCTGCTTTTTTTACTCCATATGAGTTTTTAAAATATAAAGATTTTG
AAAATGAGTCAGAAGAAGTTTTAATTCATGAAGAAGAAGAAAATAGGATAATTTATGTTGCAATGACAAGAGCTCAAGAC
ATTTTAGTTTTATCTTCACTTGTTCCTCCATCAGATAAAGAAAATGAAATTACTTATAAAGGTTCTTCTTTAGTTGAAGA
TTTACTTATAAATAAGAATTATGCTATGTCTCTTCAAGCAAAAGAAATTGAAATTCCAAAAACCGTTTGTAAAAAACCAG
ATTTTGAAGAGGAATTATTAGAGTTAAGTTTCACTTCTTTAAAATCATATCTTCAATGTCCGTTTAGAAACAAATTATTA
AATCATTTTCATTTTAAAATTTCTGATAAAACTCAAATTACTTATGGTAAAGTAATTCATAAAGCTTTAGAAGTAATTAA
TAAACGCATAAAAGCTACTGGTGAATATTTGGGTGATGATGAGGTTAAAAACATTGTTGAAAACTTGTTCTACACAAATC
CCAACATTGCTTATGATAGAAAACAGAAATTAAAAACAGATAAATTAGATGATATTGTTGATAATGTTATTCATTATTAT
CATACATTTGGAAATAAAATAAAAGTAATTGATTCTGAAGTTCAATTTAATGTAAAAAATAAAGATTATGGTATAACCGG
AGCTATTGATTTAATATATGAAACTGATGATGGTAAAATTGGTTTATTGGATTATAAATATACTAGTTCTGAAGCTAAAT
ATATGAAATGGCATAAAAAACAGTTGTATGTTTATGTTGGTGTTTTAAAATCATTAGAGGAATGGAAAAATAAAGAAATT
AGTGAACTAAAAGTTTATGCAATTAAATCAAGGAAATTAGTGGGCATTCCTGTGGATTATGATAAGATTAATGAGATTAT
GCAAGAAATGGATACTGTGGCAAAGAATATTGATGAAAATAAATATCCTCGTCAAAAAGATCAACATTGTAATAAATGTG
CGTTTAAAAGAATTTGTGGAATAGATTATGTAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAGCTAATTATAAATAATTTATTAACAAAAGTATATTTATTGATTAATAAGTAAATTTTTACTTGATTTTTTAAAT
AGGTTATTTATAGGTGCAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGAAATTCATTAATTTGGATTTCTTTTTATTTTTTTGGCTTTGTAGAAATTGTAATCTTCATTGAATGAATTAATATCA
TCTTCATAGTTGCATATATT

Product: DNA helicase II

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1505; Mature: 1504

Protein sequence:

>1505_residues
MPTNFEFLKEDYPDLFDWAHDMEKKVKQDPNGAINSGSKFFERILNILLENARIHPKETYVEKIIDLKNKKVIDSKSEKL
LQKARKYRNDDRHSDSSSNERVALAFLKVIFNISVWFMEDYNNEIIHNSDFDTNILTQIEKESQVSKEDIEKFENKLLNM
LEFKMEQINRKKEEVVNLVEDNYILKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKASLENKILNLSKENEELKRGFESKFNDLKINY
SENNKEELVNFIADNYYSKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKANFKKELLNLSKKYDSSRKNLEDKIDNLTMEYSNADLSK
FVTDNYAPKDEIYKIVSNEIENLKKESDEDKLNLEKMMLIINEENELMRKDFESKLNSINEQTSDKSNKELENLIIKDYV
PKSDLKKHIDLAIKEFAKTHNIEISEIYNPPEEILIENQPKFVPSKPKKQKIKPKKLNEDQEAAVMYDGKKPLLIEAGPG
SGKTTVLIERVKYLLNNKGIDPESLLVITFTKKAANELKTRLSEETDNISELDVQKMQISTIHGFCAKILEKAGYVNLSI
IGDDLGEKINMFVRKHLEELGFTGIAYASKRDAKNIINKYEEYCTFGVDSQNLIKYIQDNYPISQDYIDFVEQYMEENEG
KFPKMEVKENKEFKQSYYNALYLQVAKSYPIYKELMEKENVIDFGHMQLKALEYLRENPDSVFKNILIDEFQDTDPIQME
IFKILMKNCDSATFVGDIDQSIYGFRGSYDNYFEQLSNEYDVKRISLNTNYRSTNQIIDVSEALIKPQRDVHSEKDLKGN
RDIDFPIYYISNEDKDNEAENICEFIKYLKETGKIDNYNEIAVLTRSVTSNGNCIKPLMNLLNENNIPYAIKGNKDLLDK
DEIKSILTLIYYVISEDKDHHIMNSWEKKWLNLKAFTDTDFKMKLCNLSDETKEILFNIQEQYENDVVAAEKDVSIEVTG
KKSRVRSFGGVFKKYNKPEFENGQEILKDIVNKVSFPYLNVQNLEKWGIKNKDDLAFFDKLFEIRENILSEDIEYKNKLT
ILEIYMRLLEINDYFNADFINNPNNQDEISNLAFISNTLYNYEQMYYNKAIRGAFWFLYTNIEDYGSSNVDPNGVQLMTV
HKAKGLEFPVVIVASFSDKKFPSKFISPNPDNGYIHGKPAFFTPYEFLKYKDFENESEEVLIHEEEENRIIYVAMTRAQD
ILVLSSLVPPSDKENEITYKGSSLVEDLLINKNYAMSLQAKEIEIPKTVCKKPDFEEELLELSFTSLKSYLQCPFRNKLL
NHFHFKISDKTQITYGKVIHKALEVINKRIKATGEYLGDDEVKNIVENLFYTNPNIAYDRKQKLKTDKLDDIVDNVIHYY
HTFGNKIKVIDSEVQFNVKNKDYGITGAIDLIYETDDGKIGLLDYKYTSSEAKYMKWHKKQLYVYVGVLKSLEEWKNKEI
SELKVYAIKSRKLVGIPVDYDKINEIMQEMDTVAKNIDENKYPRQKDQHCNKCAFKRICGIDYVN

Sequences:

>Translated_1505_residues
MPTNFEFLKEDYPDLFDWAHDMEKKVKQDPNGAINSGSKFFERILNILLENARIHPKETYVEKIIDLKNKKVIDSKSEKL
LQKARKYRNDDRHSDSSSNERVALAFLKVIFNISVWFMEDYNNEIIHNSDFDTNILTQIEKESQVSKEDIEKFENKLLNM
LEFKMEQINRKKEEVVNLVEDNYILKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKASLENKILNLSKENEELKRGFESKFNDLKINY
SENNKEELVNFIADNYYSKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKANFKKELLNLSKKYDSSRKNLEDKIDNLTMEYSNADLSK
FVTDNYAPKDEIYKIVSNEIENLKKESDEDKLNLEKMMLIINEENELMRKDFESKLNSINEQTSDKSNKELENLIIKDYV
PKSDLKKHIDLAIKEFAKTHNIEISEIYNPPEEILIENQPKFVPSKPKKQKIKPKKLNEDQEAAVMYDGKKPLLIEAGPG
SGKTTVLIERVKYLLNNKGIDPESLLVITFTKKAANELKTRLSEETDNISELDVQKMQISTIHGFCAKILEKAGYVNLSI
IGDDLGEKINMFVRKHLEELGFTGIAYASKRDAKNIINKYEEYCTFGVDSQNLIKYIQDNYPISQDYIDFVEQYMEENEG
KFPKMEVKENKEFKQSYYNALYLQVAKSYPIYKELMEKENVIDFGHMQLKALEYLRENPDSVFKNILIDEFQDTDPIQME
IFKILMKNCDSATFVGDIDQSIYGFRGSYDNYFEQLSNEYDVKRISLNTNYRSTNQIIDVSEALIKPQRDVHSEKDLKGN
RDIDFPIYYISNEDKDNEAENICEFIKYLKETGKIDNYNEIAVLTRSVTSNGNCIKPLMNLLNENNIPYAIKGNKDLLDK
DEIKSILTLIYYVISEDKDHHIMNSWEKKWLNLKAFTDTDFKMKLCNLSDETKEILFNIQEQYENDVVAAEKDVSIEVTG
KKSRVRSFGGVFKKYNKPEFENGQEILKDIVNKVSFPYLNVQNLEKWGIKNKDDLAFFDKLFEIRENILSEDIEYKNKLT
ILEIYMRLLEINDYFNADFINNPNNQDEISNLAFISNTLYNYEQMYYNKAIRGAFWFLYTNIEDYGSSNVDPNGVQLMTV
HKAKGLEFPVVIVASFSDKKFPSKFISPNPDNGYIHGKPAFFTPYEFLKYKDFENESEEVLIHEEEENRIIYVAMTRAQD
ILVLSSLVPPSDKENEITYKGSSLVEDLLINKNYAMSLQAKEIEIPKTVCKKPDFEEELLELSFTSLKSYLQCPFRNKLL
NHFHFKISDKTQITYGKVIHKALEVINKRIKATGEYLGDDEVKNIVENLFYTNPNIAYDRKQKLKTDKLDDIVDNVIHYY
HTFGNKIKVIDSEVQFNVKNKDYGITGAIDLIYETDDGKIGLLDYKYTSSEAKYMKWHKKQLYVYVGVLKSLEEWKNKEI
SELKVYAIKSRKLVGIPVDYDKINEIMQEMDTVAKNIDENKYPRQKDQHCNKCAFKRICGIDYVN
>Mature_1504_residues
PTNFEFLKEDYPDLFDWAHDMEKKVKQDPNGAINSGSKFFERILNILLENARIHPKETYVEKIIDLKNKKVIDSKSEKLL
QKARKYRNDDRHSDSSSNERVALAFLKVIFNISVWFMEDYNNEIIHNSDFDTNILTQIEKESQVSKEDIEKFENKLLNML
EFKMEQINRKKEEVVNLVEDNYILKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKASLENKILNLSKENEELKRGFESKFNDLKINYS
ENNKEELVNFIADNYYSKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKANFKKELLNLSKKYDSSRKNLEDKIDNLTMEYSNADLSKF
VTDNYAPKDEIYKIVSNEIENLKKESDEDKLNLEKMMLIINEENELMRKDFESKLNSINEQTSDKSNKELENLIIKDYVP
KSDLKKHIDLAIKEFAKTHNIEISEIYNPPEEILIENQPKFVPSKPKKQKIKPKKLNEDQEAAVMYDGKKPLLIEAGPGS
GKTTVLIERVKYLLNNKGIDPESLLVITFTKKAANELKTRLSEETDNISELDVQKMQISTIHGFCAKILEKAGYVNLSII
GDDLGEKINMFVRKHLEELGFTGIAYASKRDAKNIINKYEEYCTFGVDSQNLIKYIQDNYPISQDYIDFVEQYMEENEGK
FPKMEVKENKEFKQSYYNALYLQVAKSYPIYKELMEKENVIDFGHMQLKALEYLRENPDSVFKNILIDEFQDTDPIQMEI
FKILMKNCDSATFVGDIDQSIYGFRGSYDNYFEQLSNEYDVKRISLNTNYRSTNQIIDVSEALIKPQRDVHSEKDLKGNR
DIDFPIYYISNEDKDNEAENICEFIKYLKETGKIDNYNEIAVLTRSVTSNGNCIKPLMNLLNENNIPYAIKGNKDLLDKD
EIKSILTLIYYVISEDKDHHIMNSWEKKWLNLKAFTDTDFKMKLCNLSDETKEILFNIQEQYENDVVAAEKDVSIEVTGK
KSRVRSFGGVFKKYNKPEFENGQEILKDIVNKVSFPYLNVQNLEKWGIKNKDDLAFFDKLFEIRENILSEDIEYKNKLTI
LEIYMRLLEINDYFNADFINNPNNQDEISNLAFISNTLYNYEQMYYNKAIRGAFWFLYTNIEDYGSSNVDPNGVQLMTVH
KAKGLEFPVVIVASFSDKKFPSKFISPNPDNGYIHGKPAFFTPYEFLKYKDFENESEEVLIHEEEENRIIYVAMTRAQDI
LVLSSLVPPSDKENEITYKGSSLVEDLLINKNYAMSLQAKEIEIPKTVCKKPDFEEELLELSFTSLKSYLQCPFRNKLLN
HFHFKISDKTQITYGKVIHKALEVINKRIKATGEYLGDDEVKNIVENLFYTNPNIAYDRKQKLKTDKLDDIVDNVIHYYH
TFGNKIKVIDSEVQFNVKNKDYGITGAIDLIYETDDGKIGLLDYKYTSSEAKYMKWHKKQLYVYVGVLKSLEEWKNKEIS
ELKVYAIKSRKLVGIPVDYDKINEIMQEMDTVAKNIDENKYPRQKDQHCNKCAFKRICGIDYVN

Specific function: Essential helicase [H]

COG id: COG0210

COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 uvrD-like helicase C-terminal domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48994965, Length=454, Percent_Identity=26.2114537444934, Blast_Score=112, Evalue=1e-25,
Organism=Escherichia coli, GI2367296, Length=460, Percent_Identity=25.6521739130435, Blast_Score=110, Evalue=5e-25,
Organism=Escherichia coli, GI1787196, Length=352, Percent_Identity=26.4204545454545, Blast_Score=100, Evalue=8e-22,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322369, Length=472, Percent_Identity=28.3898305084746, Blast_Score=170, Evalue=1e-42,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005751
- InterPro:   IPR013986
- InterPro:   IPR014017
- InterPro:   IPR000212
- InterPro:   IPR014016 [H]

Pfam domain/function: PF00580 UvrD-helicase [H]

EC number: =3.6.4.12 [H]

Molecular weight: Translated: 175683; Mature: 175552

Theoretical pI: Translated: 4.94; Mature: 4.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPTNFEFLKEDYPDLFDWAHDMEKKVKQDPNGAINSGSKFFERILNILLENARIHPKETY
CCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VEKIIDLKNKKVIDSKSEKLLQKARKYRNDDRHSDSSSNERVALAFLKVIFNISVWFMED
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEC
YNNEIIHNSDFDTNILTQIEKESQVSKEDIEKFENKLLNMLEFKMEQINRKKEEVVNLVE
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
DNYILKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKASLENKILNLSKENEELKRGFESKFNDLKINY
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
SENNKEELVNFIADNYYSKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKANFKKELLNLSKKYDSSRK
CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
NLEDKIDNLTMEYSNADLSKFVTDNYAPKDEIYKIVSNEIENLKKESDEDKLNLEKMMLI
HHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHHEEEE
INEENELMRKDFESKLNSINEQTSDKSNKELENLIIKDYVPKSDLKKHIDLAIKEFAKTH
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NIEISEIYNPPEEILIENQPKFVPSKPKKQKIKPKKLNEDQEAAVMYDGKKPLLIEAGPG
CCEEHHHCCCHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCC
SGKTTVLIERVKYLLNNKGIDPESLLVITFTKKAANELKTRLSEETDNISELDVQKMQIS
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
TIHGFCAKILEKAGYVNLSIIGDDLGEKINMFVRKHLEELGFTGIAYASKRDAKNIINKY
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
EEYCTFGVDSQNLIKYIQDNYPISQDYIDFVEQYMEENEGKFPKMEVKENKEFKQSYYNA
HHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LYLQVAKSYPIYKELMEKENVIDFGHMQLKALEYLRENPDSVFKNILIDEFQDTDPIQME
HHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
IFKILMKNCDSATFVGDIDQSIYGFRGSYDNYFEQLSNEYDVKRISLNTNYRSTNQIIDV
HHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHH
SEALIKPQRDVHSEKDLKGNRDIDFPIYYISNEDKDNEAENICEFIKYLKETGKIDNYNE
HHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
IAVLTRSVTSNGNCIKPLMNLLNENNIPYAIKGNKDLLDKDEIKSILTLIYYVISEDKDH
EEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
HIMNSWEKKWLNLKAFTDTDFKMKLCNLSDETKEILFNIQEQYENDVVAAEKDVSIEVTG
HHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEEECC
KKSRVRSFGGVFKKYNKPEFENGQEILKDIVNKVSFPYLNVQNLEKWGIKNKDDLAFFDK
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHH
LFEIRENILSEDIEYKNKLTILEIYMRLLEINDYFNADFINNPNNQDEISNLAFISNTLY
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NYEQMYYNKAIRGAFWFLYTNIEDYGSSNVDPNGVQLMTVHKAKGLEFPVVIVASFSDKK
HHHHHHHHHHHHHEEEEEEECHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCC
FPSKFISPNPDNGYIHGKPAFFTPYEFLKYKDFENESEEVLIHEEEENRIIYVAMTRAQD
CCHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCH
ILVLSSLVPPSDKENEITYKGSSLVEDLLINKNYAMSLQAKEIEIPKTVCKKPDFEEELL
HHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHCCCCHHHHHH
ELSFTSLKSYLQCPFRNKLLNHFHFKISDKTQITYGKVIHKALEVINKRIKATGEYLGDD
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EVKNIVENLFYTNPNIAYDRKQKLKTDKLDDIVDNVIHYYHTFGNKIKVIDSEVQFNVKN
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEECC
KDYGITGAIDLIYETDDGKIGLLDYKYTSSEAKYMKWHKKQLYVYVGVLKSLEEWKNKEI
CCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
SELKVYAIKSRKLVGIPVDYDKINEIMQEMDTVAKNIDENKYPRQKDQHCNKCAFKRICG
HHEEEEEEECCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
IDYVN
CCCCC
>Mature Secondary Structure 
PTNFEFLKEDYPDLFDWAHDMEKKVKQDPNGAINSGSKFFERILNILLENARIHPKETY
CCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
VEKIIDLKNKKVIDSKSEKLLQKARKYRNDDRHSDSSSNERVALAFLKVIFNISVWFMED
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEC
YNNEIIHNSDFDTNILTQIEKESQVSKEDIEKFENKLLNMLEFKMEQINRKKEEVVNLVE
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
DNYILKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKASLENKILNLSKENEELKRGFESKFNDLKINY
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEE
SENNKEELVNFIADNYYSKEDVGKIVNDAVNLAMIQSSEDKANFKKELLNLSKKYDSSRK
CCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
NLEDKIDNLTMEYSNADLSKFVTDNYAPKDEIYKIVSNEIENLKKESDEDKLNLEKMMLI
HHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHHEEEE
INEENELMRKDFESKLNSINEQTSDKSNKELENLIIKDYVPKSDLKKHIDLAIKEFAKTH
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NIEISEIYNPPEEILIENQPKFVPSKPKKQKIKPKKLNEDQEAAVMYDGKKPLLIEAGPG
CCEEHHHCCCHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCC
SGKTTVLIERVKYLLNNKGIDPESLLVITFTKKAANELKTRLSEETDNISELDVQKMQIS
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
TIHGFCAKILEKAGYVNLSIIGDDLGEKINMFVRKHLEELGFTGIAYASKRDAKNIINKY
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
EEYCTFGVDSQNLIKYIQDNYPISQDYIDFVEQYMEENEGKFPKMEVKENKEFKQSYYNA
HHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LYLQVAKSYPIYKELMEKENVIDFGHMQLKALEYLRENPDSVFKNILIDEFQDTDPIQME
HHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
IFKILMKNCDSATFVGDIDQSIYGFRGSYDNYFEQLSNEYDVKRISLNTNYRSTNQIIDV
HHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHH
SEALIKPQRDVHSEKDLKGNRDIDFPIYYISNEDKDNEAENICEFIKYLKETGKIDNYNE
HHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
IAVLTRSVTSNGNCIKPLMNLLNENNIPYAIKGNKDLLDKDEIKSILTLIYYVISEDKDH
EEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
HIMNSWEKKWLNLKAFTDTDFKMKLCNLSDETKEILFNIQEQYENDVVAAEKDVSIEVTG
HHHHHHHHHHEEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCEEEECC
KKSRVRSFGGVFKKYNKPEFENGQEILKDIVNKVSFPYLNVQNLEKWGIKNKDDLAFFDK
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHH
LFEIRENILSEDIEYKNKLTILEIYMRLLEINDYFNADFINNPNNQDEISNLAFISNTLY
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NYEQMYYNKAIRGAFWFLYTNIEDYGSSNVDPNGVQLMTVHKAKGLEFPVVIVASFSDKK
HHHHHHHHHHHHHEEEEEEECHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCC
FPSKFISPNPDNGYIHGKPAFFTPYEFLKYKDFENESEEVLIHEEEENRIIYVAMTRAQD
CCHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCH
ILVLSSLVPPSDKENEITYKGSSLVEDLLINKNYAMSLQAKEIEIPKTVCKKPDFEEELL
HHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHCCCCHHHHHH
ELSFTSLKSYLQCPFRNKLLNHFHFKISDKTQITYGKVIHKALEVINKRIKATGEYLGDD
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EVKNIVENLFYTNPNIAYDRKQKLKTDKLDDIVDNVIHYYHTFGNKIKVIDSEVQFNVKN
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEECC
KDYGITGAIDLIYETDDGKIGLLDYKYTSSEAKYMKWHKKQLYVYVGVLKSLEEWKNKEI
CCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
SELKVYAIKSRKLVGIPVDYDKINEIMQEMDTVAKNIDENKYPRQKDQHCNKCAFKRICG
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IDYVN
CCCCC

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