| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009495 |
| Length | 3,886,916 |
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The map label for this gene is bceB [H]
Identifier: 148380102
GI number: 148380102
Start: 2288568
End: 2290571
Strand: Reverse
Name: bceB [H]
Synonym: CBO2146
Alternate gene names: 148380102
Gene position: 2290571-2288568 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148380103
Following gene: 148380101
Centisome position: 58.93
GC content: 24.85
Gene sequence:
>2004_bases ATGATAATAATGTATTCTAAGATAGCTCTTAAAAATATAAAGAAAAGTTATAAGGATTATACTATATATTTCTTAACACT AATACTAGCTGTTTGTATATTTTATAGCTTTAACTCTATAGATTCACAAAAGGCACTTACTGATATAAAATCTTCAGGTG GAAGTTATGTATCTAAATTAATGGGTTTTATGTCTGCTGTATCAGTATTTGTATCAATAATATTAGGCAGTTTAATATTA TATGCAAATAATTTTTTAATAAAGAAACGTAAAAAAGAATTGGGAATATATATGATTTTAGGTATGGGAAAAAGAAAAAT ATCTAAAATCTTAGTAACAGAGACCTCTATAGTAGGAGTTATATCCTTAATTGCAGGTCTTATAATAGGAATAGGAGCAT CGCAGGGGCTATCTGTTTTCACATTAAAATTATTTGAGGTTTCTATAAAGGAATATAGATTTGCTGTTTCAACAAGAGCT ATAGGTAAAACTATATTATACTTTGGAATAATGTTTTTACTTGTTATGATATTTAATGCATTTGTTATTTCCAAATACAA GATAATTGATTTGTTAACATCAGGTAGAAAAAATGAAAATATAAAATTTAAAAATACATTTATATATTTATTATCATTTC TTCTATGTGTAGTATTACTTGGATTTGCATATAAATCTATACTAAAAATAGGGCTGGATTTAAGAGAGCCTATGCTTTTT AAGCTATCCATAGCTTTTGTAATAGTAGGTACGGTGTTGTTTTTCTTTAGTTTAGCTGGAGTTATATTATATGTAGTAAA TAAAAATAAAAAGATATATTTTAAAAGACTAAATATGTTTGTGGTAAAACAAATAAATAGTAAGGTTAATACAAACTTTT TATCCATGTCTTTAATTTGTTTAATGTTATTTATCACAATACTTGTATTATCTACAGGAATAAGTTTTAAAAATGGCTTG GAAGAAGGGTTTAAAAGACAAGCACCTTTTGATGCTAGTATAAGAATAGAAAATAATGGTAAAAAAGATAATTTAGAAGA TGTATTAGATAAGATTAATTTTAAAAGGAGTAAAAATGAAAAATATGCAACTTGCAATGAATATTTTCCAGGGATAAAGC TAGAGAGCTTGTTATCAATTACAGATAAAGATTATAAAGATGCTGGGGTAGCTTTTGTTAAAATATCTGATTATAATAAA ATGTTAAAACTAAAGGGAAAAAAAGAAATAAATTTAAATAAAAATGAGATTTTAGTTATGTCTACCAATGATGCCGTGGT GAAGCAGGCTAATGAAAAGCTAAAGAATGGTAAAAAAATTAATATTAAAGGAAAAGAGTATTTAGTGAAAAATAATAAAA TAATAGATGAAAATCTTTCAACTTATCTTTTTCCAGATAATATTTTCACAATAATTATAAGTGATGAATTTTTATATGAT TACAATGGAATTAGCTTCTCTATACTCAATGTAATGTATTCAGATAAAAATAGAGAAGAAAATAATAAAAAATATAACGA AATAAATAAGAATTATTTAGATGGTAAATACAAAAGTTTAAATATTTCATATATGGGTGCTTTTTCAAAGGATGATATTT ATTCTGGCATTAAGGGAGGAACAACATCAATATTATTTGTTGCAATATATTTAGGACTAGTATTTTTAATAACTAGCATG GCAGTACTCGCTCTTCAACAGTTATCAGAAGCCAGTGATAGTATAGAAAGATATAAAGCTTTAAAGAAAATTGGTGCAAA CTCAAAAATGATAGATAAAACAATTTTCCTTCAAACCCTAATATATTTTACTCTCCCAATGATTCTTGCATTAATTCACT CAGTGATTGGAATTAAGGTGATTAATGATGGTATAAGTCCATTTACTAAGATTGATATTAGCTTTTCAGCTTTAATAACA GCTTTAATATTTAGTGTAGTTTATGCAGGATATTTTTATACAACATATATAGGATATAAAAATATAGTGGAAAGTAATAT TTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTAAGGATGGGAAAATCTTTAATGAATTAGTAAGAGGCAATGATACTAGGAAAGAATTTTTTAATAGAATTATAGAAGT TACATCTCTTCTTGGAGGTG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTATAAACAGATTTCTAAGCTTCAGAGGGAATTTTTACTCATACTAAAGCTTAGAAATTTTTATCTAGAGATCTATACA ATTTTAGCTGCTGATTTGAA
Product: ABC transporter, permease protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 667; Mature: 667
Protein sequence:
>667_residues MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALTDIKSSGGSYVSKLMGFMSAVSVFVSIILGSLIL YANNFLIKKRKKELGIYMILGMGKRKISKILVTETSIVGVISLIAGLIIGIGASQGLSVFTLKLFEVSIKEYRFAVSTRA IGKTILYFGIMFLLVMIFNAFVISKYKIIDLLTSGRKNENIKFKNTFIYLLSFLLCVVLLGFAYKSILKIGLDLREPMLF KLSIAFVIVGTVLFFFSLAGVILYVVNKNKKIYFKRLNMFVVKQINSKVNTNFLSMSLICLMLFITILVLSTGISFKNGL EEGFKRQAPFDASIRIENNGKKDNLEDVLDKINFKRSKNEKYATCNEYFPGIKLESLLSITDKDYKDAGVAFVKISDYNK MLKLKGKKEINLNKNEILVMSTNDAVVKQANEKLKNGKKINIKGKEYLVKNNKIIDENLSTYLFPDNIFTIIISDEFLYD YNGISFSILNVMYSDKNREENNKKYNEINKNYLDGKYKSLNISYMGAFSKDDIYSGIKGGTTSILFVAIYLGLVFLITSM AVLALQQLSEASDSIERYKALKKIGANSKMIDKTIFLQTLIYFTLPMILALIHSVIGIKVINDGISPFTKIDISFSALIT ALIFSVVYAGYFYTTYIGYKNIVESNI
Sequences:
>Translated_667_residues MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALTDIKSSGGSYVSKLMGFMSAVSVFVSIILGSLIL YANNFLIKKRKKELGIYMILGMGKRKISKILVTETSIVGVISLIAGLIIGIGASQGLSVFTLKLFEVSIKEYRFAVSTRA IGKTILYFGIMFLLVMIFNAFVISKYKIIDLLTSGRKNENIKFKNTFIYLLSFLLCVVLLGFAYKSILKIGLDLREPMLF KLSIAFVIVGTVLFFFSLAGVILYVVNKNKKIYFKRLNMFVVKQINSKVNTNFLSMSLICLMLFITILVLSTGISFKNGL EEGFKRQAPFDASIRIENNGKKDNLEDVLDKINFKRSKNEKYATCNEYFPGIKLESLLSITDKDYKDAGVAFVKISDYNK MLKLKGKKEINLNKNEILVMSTNDAVVKQANEKLKNGKKINIKGKEYLVKNNKIIDENLSTYLFPDNIFTIIISDEFLYD YNGISFSILNVMYSDKNREENNKKYNEINKNYLDGKYKSLNISYMGAFSKDDIYSGIKGGTTSILFVAIYLGLVFLITSM AVLALQQLSEASDSIERYKALKKIGANSKMIDKTIFLQTLIYFTLPMILALIHSVIGIKVINDGISPFTKIDISFSALIT ALIFSVVYAGYFYTTYIGYKNIVESNI >Mature_667_residues MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALTDIKSSGGSYVSKLMGFMSAVSVFVSIILGSLIL YANNFLIKKRKKELGIYMILGMGKRKISKILVTETSIVGVISLIAGLIIGIGASQGLSVFTLKLFEVSIKEYRFAVSTRA IGKTILYFGIMFLLVMIFNAFVISKYKIIDLLTSGRKNENIKFKNTFIYLLSFLLCVVLLGFAYKSILKIGLDLREPMLF KLSIAFVIVGTVLFFFSLAGVILYVVNKNKKIYFKRLNMFVVKQINSKVNTNFLSMSLICLMLFITILVLSTGISFKNGL EEGFKRQAPFDASIRIENNGKKDNLEDVLDKINFKRSKNEKYATCNEYFPGIKLESLLSITDKDYKDAGVAFVKISDYNK MLKLKGKKEINLNKNEILVMSTNDAVVKQANEKLKNGKKINIKGKEYLVKNNKIIDENLSTYLFPDNIFTIIISDEFLYD YNGISFSILNVMYSDKNREENNKKYNEINKNYLDGKYKSLNISYMGAFSKDDIYSGIKGGTTSILFVAIYLGLVFLITSM AVLALQQLSEASDSIERYKALKKIGANSKMIDKTIFLQTLIYFTLPMILALIHSVIGIKVINDGISPFTKIDISFSALIT ALIFSVVYAGYFYTTYIGYKNIVESNI
Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75377; Mature: 75377
Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALTDIKSSGGSYVSKL CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHH MGFMSAVSVFVSIILGSLILYANNFLIKKRKKELGIYMILGMGKRKISKILVTETSIVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLIAGLIIGIGASQGLSVFTLKLFEVSIKEYRFAVSTRAIGKTILYFGIMFLLVMIFNA HHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVISKYKIIDLLTSGRKNENIKFKNTFIYLLSFLLCVVLLGFAYKSILKIGLDLREPMLF HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH KLSIAFVIVGTVLFFFSLAGVILYVVNKNKKIYFKRLNMFVVKQINSKVNTNFLSMSLIC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH LMLFITILVLSTGISFKNGLEEGFKRQAPFDASIRIENNGKKDNLEDVLDKINFKRSKNE HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC KYATCNEYFPGIKLESLLSITDKDYKDAGVAFVKISDYNKMLKLKGKKEINLNKNEILVM CCEEHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEE STNDAVVKQANEKLKNGKKINIKGKEYLVKNNKIIDENLSTYLFPDNIFTIIISDEFLYD ECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEECCEEECCCCCEEEECCCEEEEEEECCEEEE YNGISFSILNVMYSDKNREENNKKYNEINKNYLDGKYKSLNISYMGAFSKDDIYSGIKGG CCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHCCCCCC TTSILFVAIYLGLVFLITSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKKIGANSKMIDKTIFLQTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH IYFTLPMILALIHSVIGIKVINDGISPFTKIDISFSALITALIFSVVYAGYFYTTYIGYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIVESNI HHHHCCC >Mature Secondary Structure MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALTDIKSSGGSYVSKL CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHH MGFMSAVSVFVSIILGSLILYANNFLIKKRKKELGIYMILGMGKRKISKILVTETSIVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLIAGLIIGIGASQGLSVFTLKLFEVSIKEYRFAVSTRAIGKTILYFGIMFLLVMIFNA HHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVISKYKIIDLLTSGRKNENIKFKNTFIYLLSFLLCVVLLGFAYKSILKIGLDLREPMLF HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH KLSIAFVIVGTVLFFFSLAGVILYVVNKNKKIYFKRLNMFVVKQINSKVNTNFLSMSLIC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH LMLFITILVLSTGISFKNGLEEGFKRQAPFDASIRIENNGKKDNLEDVLDKINFKRSKNE HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC KYATCNEYFPGIKLESLLSITDKDYKDAGVAFVKISDYNKMLKLKGKKEINLNKNEILVM CCEEHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEE STNDAVVKQANEKLKNGKKINIKGKEYLVKNNKIIDENLSTYLFPDNIFTIIISDEFLYD ECCHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEEECCEEECCCCCEEEECCCEEEEEEECCEEEE YNGISFSILNVMYSDKNREENNKKYNEINKNYLDGKYKSLNISYMGAFSKDDIYSGIKGG CCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHCCCCCC TTSILFVAIYLGLVFLITSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKKIGANSKMIDKTIFLQTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH IYFTLPMILALIHSVIGIKVINDGISPFTKIDISFSALITALIFSVVYAGYFYTTYIGYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIVESNI HHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]