| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009495 |
| Length | 3,886,916 |
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The map label for this gene is 148379696
Identifier: 148379696
GI number: 148379696
Start: 1851804
End: 1853966
Strand: Direct
Name: 148379696
Synonym: CBO1737
Alternate gene names: NA
Gene position: 1851804-1853966 (Clockwise)
Preceding gene: 148379695
Following gene: 148379697
Centisome position: 47.64
GC content: 32.59
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGTATAAAATGTATTTAGGAATTAATGATGGTGAAGAAGGATTTATACTCCCAGTGTTACCAGAGAAAATTGAATTTGAT GAAGATGGAAATAATAAGAC
Product: phage protein
Products: NA
Alternate protein names: Phage Tail Tape Measure Protein; Tail Length Tape Measure Protein; Phage Membrane Protein; Tape Measure Domain Protein
Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 719
Protein sequence:
>720_residues MATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRASAGLQELVNEQDRAQNNQNRL NESFNRGSSEANGLTSKVKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIGGGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGL KEFNTITRSFIQFTKNTDKLMDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAVAQLNNLKSNIETAFAQASETALEIMKPLLSRINEGFKNGSFEGFFNGISVGLDI IVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAYNATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQD GLNAALLACPLTWIIIAIIILIALFYAAVAGVNHLAGTSVSATGIIAGSFMVALAFIGNLFVAFYNLVVDIIALFYNHFS AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQSGLQGAVDKLVGKPKIQFQKMDSSA MHLDRFEYGKAYDSGYTVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDMGKMPDMAAWNKAQGPGTLGTAGDSGKNKGGKLPNAGNKGL KDANNHLKNIDDKIDISNEHLEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELANSAEGVYA
Sequences:
>Translated_720_residues MATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRASAGLQELVNEQDRAQNNQNRL NESFNRGSSEANGLTSKVKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIGGGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGL KEFNTITRSFIQFTKNTDKLMDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAVAQLNNLKSNIETAFAQASETALEIMKPLLSRINEGFKNGSFEGFFNGISVGLDI IVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAYNATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQD GLNAALLACPLTWIIIAIIILIALFYAAVAGVNHLAGTSVSATGIIAGSFMVALAFIGNLFVAFYNLVVDIIALFYNHFS AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQSGLQGAVDKLVGKPKIQFQKMDSSA MHLDRFEYGKAYDSGYTVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDMGKMPDMAAWNKAQGPGTLGTAGDSGKNKGGKLPNAGNKGL KDANNHLKNIDDKIDISNEHLEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELANSAEGVYA >Mature_719_residues ATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRASAGLQELVNEQDRAQNNQNRLN ESFNRGSSEANGLTSKVKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIGGGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGLK EFNTITRSFIQFTKNTDKLMDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEFI SKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAVAQLNNLKSNIETAFAQASETALEIMKPLLSRINEGFKNGSFEGFFNGISVGLDII VNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAYNATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQDG LNAALLACPLTWIIIAIIILIALFYAAVAGVNHLAGTSVSATGIIAGSFMVALAFIGNLFVAFYNLVVDIIALFYNHFSA FAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQSGLQGAVDKLVGKPKIQFQKMDSSAM HLDRFEYGKAYDSGYTVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDMGKMPDMAAWNKAQGPGTLGTAGDSGKNKGGKLPNAGNKGLK DANNHLKNIDDKIDISNEHLEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELANSAEGVYA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 77646; Mature: 77515
Theoretical pI: Translated: 5.12; Mature: 5.12
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRAS CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH AGLQELVNEQDRAQNNQNRLNESFNRGSSEANGLTSKVKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIG HHHHHHHCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC GGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGLKEFNTITRSFIQFTKNTDKL CCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH MDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAVAQLNNLKSNIETAFAQASETALEIMKPLLSRINE HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFKNGSFEGFFNGISVGLDIIVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAY HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQDGLNAALLACPLTWIIIAIII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LIALFYAAVAGVNHLAGTSVSATGIIAGSFMVALAFIGNLFVAFYNLVVDIIALFYNHFS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQSGLQG HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH AVDKLVGKPKIQFQKMDSSAMHLDRFEYGKAYDSGYTVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDM HHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC GKMPDMAAWNKAQGPGTLGTAGDSGKNKGGKLPNAGNKGLKDANNHLKNIDDKIDISNEH CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH LEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELANSAEGVYA HHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure ATVSTALKMFDQMTRPLQQVTQALNLTISAMDQMNNAANKDIRITNSLNTARGAIQRAS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHH AGLQELVNEQDRAQNNQNRLNESFNRGSSEANGLTSKVKNLVGAYLGFQAAKKGLDLTIG HHHHHHHCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC GGARLEQQLITISGMLGNKDIGKAFFGGLNKYANESVYGLKEFNTITRSFIQFTKNTDKL CCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH MDLNKTAEKLAFLDPTQGLEGAGFALKEALGGDFMSLKSRFGFGKADAEILKASKSMDEF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ISKFDELLAKKGASDKALEEFNQSAVAQLNNLKSNIETAFAQASETALEIMKPLLSRINE HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFKNGSFEGFFNGISVGLDIIVNLTMEAMDIITSLSQTFIDNWSIISPIIWGIVFAMIAY HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NATMGIAWLTTIQTTIAKIAHTIASWAETAAILALIIAQDGLNAALLACPLTWIIIAIII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LIALFYAAVAGVNHLAGTSVSATGIIAGSFMVALAFIGNLFVAFYNLVVDIIALFYNHFS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFAEFFANVFNDPIGSIIRLFAAMADEVLGILKSIASAIDTIFGSNLANAVGNWQSGLQG HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH AVDKLVGKPKIQFQKMDSSAMHLDRFEYGKAYDSGYTVGKNIGDKFDLGNIFNKGNIPDM HHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC GKMPDMAAWNKAQGPGTLGTAGDSGKNKGGKLPNAGNKGLKDANNHLKNIDDKIDISNEH CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHH LEMMRDLAEMESIQNFVTLTPTVQVTTGDIKEEADINKIISKIENYMENELANSAEGVYA HHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA