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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 148379368

GI number: 148379368

Start: 1517266

End: 1519155

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: CBO1392

Alternate gene names: 148379368

Gene position: 1517266-1519155 (Clockwise)

Preceding gene: 148379367

Following gene: 148379369

Centisome position: 39.04

GC content: 24.39

Gene sequence:

>1890_bases
ATGGGCTTATTTAGTATAGCTTTTAAAAATGTAAAAAGAAATTTTAAAAATTATGCTATGTATTTTATATCTATGATATT
TTCGGTACTTGTATATTTTATGTTTAAATCCATTGAATATAATGATCAAATTGCTAATGTAGCAAATGGTATGAAAACTG
TAAGTAAAGCTTTTTCTGGAGCATCAGTTATAATTGCGTTGTTTGTCTTTATGTTTATATGGTACTCAAATTCCTTTTTT
ATTAAAAAGAGAAAAAGAGAAATAGGTTTATATTCTATGTTAGGTGTAAAAAAGAAAAATATAGCAGCTATGATGTTTTA
TGAAACTATGACTATGGGAATTATAGCTTTAGTTATAGGTGCTTTCCTAGGAACCTTTTTCTCTAAAGGTTTTATATTAA
TTTTTTTAAAGCTTATAGATGCAGAGAATATTATAAAAACTACATTTTCAATTAAAGCTTTAGTTTCTACAATAAAAACT
TTTATATTAATATATTTTATAGTGTCTATAAGTGGAGCTAGCATTATATATAGATATGAATTAATAGATTTATTTATGGC
AGAAAGTAAGAGGGAAAAAGAACCTAAAGCTTCTAAGATAAAAGCTATTTTATCTTTAATATTATTATTAGGTGGATATA
TTATATATATTTCTAGTAAAGGCAGTAGTTTAGGATCAGCTGCTATGGTTACATTAATTACAGTAGTAATAGGAACTTAT
TTATTTTTTAGTTCTTTTACAGTATATTATTTAAAAATAAAAAGAAATAATAAAAAATTTCATTTTAAAGGACTAAATAT
GATTTCAAATTCTCAACTTTTATATAGAATAAAAGGGAATGCTAGAGCTTTAGCTACTATAGCTATACTTATAGCAACAA
CCCTTACAGCTTCAGGAGCTAGCATAAGTTTTTACAAATTTTTTTCACAGAATATGGACAAAGCTAATCCTTTTGATTAT
GTTATAAAAGCAGAAGATAATAAAATTAAGAATGATATAGACAAGCTTATAAAAAATAATACTAAAAATAAATTAAAAGA
AAAAATAGATATTACGGCGCTACAATACAAAAATGACGGTAGTGATATTTATGATGGCAAATCTATTTTATCAGAAAAGG
ATTTTAATAAAATAGCTAAAGCTAAGAATATTGAAGTTAAAAATAAAATAAATGAGGAAAAAGATGCTTATTATTTTCCA
ACTTATGCTGATAAAAATCACAAGATTAATGGCATTAGGATAAAGAGTGAATACTTTAAAATAGTACATTCAGAAGAAAG
ATCATTAGTTAATATGATGATTTTAGACAATACATTAATAGTTAAAGATGAAGAATTTATAAAATTAGAAAAACAATTAA
AGAAAGAAAAATATGTACTTTATTTAGTAGAAAATCATAATAGAAGTGGAGAGTTAACAAAGGATTTTAATAACATAATA
AAAAATCATGAAAAATCTAAAAATGGTCCAGAGCATAAATTAGTTAAATCTAATTACTATGAAAATTATAGGGAAAATGT
ATCTTCAGCTGGTACTATGTTATTTATAGGATGCTTTGTAGGATTAGTTTTCTTAGTATGTACAGCAAGTATAATATTTT
TCAAGCAACTTTCAGAAGCCATGGAGGAAAGACACAGATATAAAATATTAAGAAATATAGGAGTAAGAAATAAGGAGCTT
AAAGCTTCTATATATAAGCAAATGACATTTATATTCTTTGCTCCATTAATAGTAGGTATAGCCCATGGAGGAGTAGCTTT
GACAATATTTGGAGAATTATTAAACTTAGGTATACTGGCTCCAATAATAATAGTAGCTATACCATATACAATAGTATATT
TAATCTATTATTTCTTAACAGCACAATTTTATTACAAAGCAATATCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGATGGAAAATTGTATAAAGAAATAGAAAATAGTTTAAGTAGGAAAGATTTTTTTAGAGAAATATTGGATGTAACATC
TATGCTAGGGGGAGAAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATAGAAATTAGATTTCGGAATATGCTTATTTTCTTAAAACTATTTATTACTAAAAGAAAAGATATAAATATAAAAAT
TCTAAATAAATATAAGTTCT

Product: peptide ABC transporter, Pep4E family, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 629; Mature: 628

Protein sequence:

>629_residues
MGLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSGASVIIALFVFMFIWYSNSFF
IKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIGAFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIKT
FILIYFIVSISGASIIYRYELIDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSAAMVTLITVVIGTY
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIATTLTASGASISFYKFFSQNMDKANPFDY
VIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITALQYKNDGSDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDAYYFP
TYADKNHKINGIRIKSEYFKIVHSEERSLVNMMILDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYVLYLVENHNRSGELTKDFNNII
KNHEKSKNGPEHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEAMEERHRYKILRNIGVRNKEL
KASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALTIFGELLNLGILAPIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS

Sequences:

>Translated_629_residues
MGLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSGASVIIALFVFMFIWYSNSFF
IKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIGAFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIKT
FILIYFIVSISGASIIYRYELIDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSAAMVTLITVVIGTY
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIATTLTASGASISFYKFFSQNMDKANPFDY
VIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITALQYKNDGSDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDAYYFP
TYADKNHKINGIRIKSEYFKIVHSEERSLVNMMILDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYVLYLVENHNRSGELTKDFNNII
KNHEKSKNGPEHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEAMEERHRYKILRNIGVRNKEL
KASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALTIFGELLNLGILAPIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS
>Mature_628_residues
GLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSGASVIIALFVFMFIWYSNSFFI
KKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIGAFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIKTF
ILIYFIVSISGASIIYRYELIDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSAAMVTLITVVIGTYL
FFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIATTLTASGASISFYKFFSQNMDKANPFDYV
IKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITALQYKNDGSDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDAYYFPT
YADKNHKINGIRIKSEYFKIVHSEERSLVNMMILDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYVLYLVENHNRSGELTKDFNNIIK
NHEKSKNGPEHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEAMEERHRYKILRNIGVRNKELK
ASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALTIFGELLNLGILAPIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71985; Mature: 71854

Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18

Prosite motif: PS00599 AA_TRANSFER_CLASS_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ASVIIALFVFMFIWYSNSFFIKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIKTFILIYFIVSISGASIIYRYE
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH
LIDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSAAMVTLITVVIGTY
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIATTLTASGA
HHHHCCEEEEEEEEECCCEEEEECCCEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SISFYKFFSQNMDKANPFDYVIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITALQYKNDG
CHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCEEEEEECCCC
SDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDAYYFPTYADKNHKINGIRIKSEYFK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHH
IVHSEERSLVNMMILDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYVLYLVENHNRSGELTKDFNNII
HHHHHHHHHHHHHEECCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH
KNHEKSKNGPEHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEA
HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MEERHRYKILRNIGVRNKELKASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALTIFGELLNLGILA
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
PIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GLFSIAFKNVKRNFKNYAMYFISMIFSVLVYFMFKSIEYNDQIANVANGMKTVSKAFSG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ASVIIALFVFMFIWYSNSFFIKKRKREIGLYSMLGVKKKNIAAMMFYETMTMGIIALVIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLGTFFSKGFILIFLKLIDAENIIKTTFSIKALVSTIKTFILIYFIVSISGASIIYRYE
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH
LIDLFMAESKREKEPKASKIKAILSLILLLGGYIIYISSKGSSLGSAAMVTLITVVIGTY
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LFFSSFTVYYLKIKRNNKKFHFKGLNMISNSQLLYRIKGNARALATIAILIATTLTASGA
HHHHCCEEEEEEEEECCCEEEEECCCEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SISFYKFFSQNMDKANPFDYVIKAEDNKIKNDIDKLIKNNTKNKLKEKIDITALQYKNDG
CHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCEEEEEECCCC
SDIYDGKSILSEKDFNKIAKAKNIEVKNKINEEKDAYYFPTYADKNHKINGIRIKSEYFK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHH
IVHSEERSLVNMMILDNTLIVKDEEFIKLEKQLKKEKYVLYLVENHNRSGELTKDFNNII
HHHHHHHHHHHHHEECCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH
KNHEKSKNGPEHKLVKSNYYENYRENVSSAGTMLFIGCFVGLVFLVCTASIIFFKQLSEA
HCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MEERHRYKILRNIGVRNKELKASIYKQMTFIFFAPLIVGIAHGGVALTIFGELLNLGILA
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
PIIIVAIPYTIVYLIYYFLTAQFYYKAIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]