Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is lolE [C]

Identifier: 148378587

GI number: 148378587

Start: 682493

End: 684955

Strand: Direct

Name: lolE [C]

Synonym: CBO0586

Alternate gene names: 148378587

Gene position: 682493-684955 (Clockwise)

Preceding gene: 148378586

Following gene: 148378588

Centisome position: 17.56

GC content: 24.2

Gene sequence:

>2463_bases
TTGTTTTTTAAAGTTGCATTTAACAGTATAAGAAAAAATAAGATTAGATATATGTTATTAACTTGTACCTTAATTTTATC
TACAATTATTATGTTATCTACATCTATAATAAAAGATTCTGCAATTAAAATCAGAGAAGATCAGCTAAGAAAAACAACTT
TAAATAGCCAATTGGTGATAACAACTGCAGATGAAGAAAATCCTTTTTTCAATCCTAAAGGTATTATAAATTCTATCAAG
GATATAGATGGAATAAGTCATATTGTACCTAGAATAGGAGGTATGGCAAAAGATGTTAAAACTTTAAAAGATGTAAATAT
TATTGGGGTTGATCTTAATAAACAGAAAGCAGCATTCCCAATAGAGTTGATAGATAAATATAAGGTTAAAGATAAAGAAA
ATGAGATTATAATTAATGAAAGGTATGCAAAGGAAAATTCTTTAAAAGTAGGAGCTAAGATAAAACTACTAATTGGAACT
AAGAATAAAGAGTTTATTATAAGTGGAATATCAAAAAATACAGGGGTATTTGATCCTAGTATGAATACTGCAATGATTAG
TATTGATAATGCCCAGTACCTTTTAGACCAAAAGGATAATGCTTATTCAATTGGAATAACAATAAAAAATTTAGATCATA
TAAATAATATGATTGAGAAAATAAAGCCTAAAGTATCATCAAAATTTATAATCCAACAACGATATGATATGGATTATTTT
AAATCCTATGTAGGAACCATAGATATGGCATTAAAGATAATTGGTGTGTTGTCTATATTTATAACATTGTTTCTAACCTA
TTCAACATTTTCACTTATAATTTATGAAAGGTTGCATCAAATTGGTATATTGAGAAGCTTAGGTATATCAAAGAAGGATA
TTAAAGTAAGTGTTATAGTAGAAAACTTACTTATAGTATTAAGTTCAATAGTTATAGGGAGTATATTAACTATTCCTTTC
GTAAGGCTAATTTTAAACTATATAGTGCAGGATGGATATTTTACTTTAGATTTGAGAAAATTTTTATTCATTGATTTAAT
AATTGTGATTTTTAGTGTACTAGTAATATTAGTTTCTTTAAGGAAGATATTAAATATGTCTGTCATAAATCTTTTAAAAG
GCATTGGGAAAAAATATTATACAAATAAAATAGGAAAAATATTTAAATCTTCTTTTGGAGTTCTGTTATTAATTGTATCC
ATAGCTATTTTAATTAGTGAATATAAAAGAGAAAATGGAACATTCGCATTAATTTTAGGGGCTCTTTTCTTTATTATTTC
TTTTGTATTTTTAGCAAAATTACTACTTATAATGTTTAATTGGATTTACCAAAAAATATTTTCTATATTTAAAGGTTCAG
TTAGGATTCTGTTTAAAGAACTTGTGATGCAATTTTCTAATATAGTAGATATAGTAATAATTACATCAATAATTATTTGT
TCAATTTATGTAAGTGTTACACTTAAAGATATGATAAACAATGGAGTAATGAATGTATATAGTAATGCAGATTTAATGCT
AAGTATTGATGGTACAGTAGAGGAAGATTTTACAGATAAAATAAAGAATATAAAATATATTAAAAATTCTCTACTGCAAT
CAAGAACAACAGAGGTCATAAAAGATACAAAGGTGGATATTGCAGGAATAGATGGATCCCAGTATAAGAAAGATTTTTCA
ACAGAAATTATTAAAAAAGGTGAAAAGAATATATTTGATAAGCTTGATGATGGAAAAAACATTATAATAACAACAACATT
TAGTAAGAATACTGGCATTAATTTAAATGATTCATTAAAAATTAATGAAGTGAATTACAAGGTAATTGGAGTTGTTAGTA
GTTTTGAAAATATGGGAAAAGTATTATTCCTATCCAAAGATAACTTCAATAAGGACATAAAGGTAAAGGATAAGGATTTA
TGTCTTATAAAAGTTAATAATAAACAAATAAAGTCTACAACAAATGAAATAGAAAAATTGTTTAAAGACAAATATGAAAA
TAAATATTCTATACAAGAATTAACTGTTCTTAATGAAGAAAACAATAATAATAACAAAAAAACATTTACTATAGTAAATG
TCTTAATATGTATCTCAACAATTATATGCATAATTAGTATGAGCAACAATGTTACTATAAATCTTTTATCTAGAAAAAAG
GTATATGCAACTAAAGGAGCTTTAGGCATATCTAAAGGTTATTTGAGTAAATGTATTTTATTCGAAGCTATAGTCTTAGG
TTCTTATAGTGGAATATTTGGATTAGGTTTAGGAGTTACATTAAGTAATTATATTAATAAAATCTTATCTTATTATATTG
GAGATATGGTGTTTATTAAGGATTACAAAATAATGGTGATTTTAGTTCTGATTTCTATAGGTATTACTGTTATTAGCTAT
ATTTATCCTATGAGAAAAATATATAGGATAAATATAATAGATGAAATAAAGTCAGATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTCGGATGCTTTTGAACATAATGAGAGAATAGTTAAATTTTTAAGGAGAGTAGGAGTATCTAAATATAAAACACGA
ATGGTGAGAAAGATATGAGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGGTGATTGATTATGAGTATATTAAAAGGTATTAATATTAAAAAGAAAATTAATATAGGAGATAATTCCTATGATATA
TTAAAGGGTATTAATTTAGG

Product: ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein

Number of amino acids: Translated: 820; Mature: 820

Protein sequence:

>820_residues
MFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEENPFFNPKGIINSIK
DIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLIGT
KNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMDYF
KSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLSSIVIGSILTIPF
VRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLIVS
IAILISEYKRENGTFALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSIIIC
SIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGSQYKKDFS
TEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDKDL
CLIKVNNKQIKSTTNEIEKLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSRKK
VYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVISY
IYPMRKIYRINIIDEIKSDE

Sequences:

>Translated_820_residues
MFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEENPFFNPKGIINSIK
DIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLIGT
KNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMDYF
KSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLSSIVIGSILTIPF
VRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLIVS
IAILISEYKRENGTFALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSIIIC
SIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGSQYKKDFS
TEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDKDL
CLIKVNNKQIKSTTNEIEKLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSRKK
VYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVISY
IYPMRKIYRINIIDEIKSDE
>Mature_820_residues
MFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVITTADEENPFFNPKGIINSIK
DIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFPIELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLIGT
KNKEFIISGISKNTGVFDPSMNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMDYF
KSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIVENLLIVLSSIVIGSILTIPF
VRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSLRKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLIVS
IAILISEYKRENGTFALILGALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSIIIC
SIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVIKDTKVDIAGIDGSQYKKDFS
TEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLKINEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDKDL
CLIKVNNKQIKSTTNEIEKLFKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSRKK
VYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIKDYKIMVILVLISIGITVISY
IYPMRKIYRINIIDEIKSDE

Specific function: Part Of An ATP-Dependent Transport System Lolcde Responsible For The Release Of Lipoproteins Targeted To The Outer Membrane From The Inner Membrane. Such A Release Is Dependent Of The Sorting-Signal (Absence Of An Asp At Position 2 Of The Mature Lipoprot

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92930; Mature: 92930

Theoretical pI: Translated: 9.96; Mature: 9.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVI
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
TTADEENPFFNPKGIINSIKDIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFP
EECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCC
IELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLIGTKNKEFIISGISKNTGVFDPS
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEECCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCC
MNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMDYF
CCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHH
KSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHH
ENLLIVLSSIVIGSILTIPFVRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLIVSIAILISEYKRENGTFALILG
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
ALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSIIIC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVI
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDTKVDIAGIDGSQYKKDFSTEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLK
HHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEE
INEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDKDLCLIKVNNKQIKSTTNEIEKL
EEECCEEEEEEHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
FKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSRKK
HHHHCCCCCCHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECCCE
VYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIK
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
DYKIMVILVLISIGITVISYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFFKVAFNSIRKNKIRYMLLTCTLILSTIIMLSTSIIKDSAIKIREDQLRKTTLNSQLVI
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
TTADEENPFFNPKGIINSIKDIDGISHIVPRIGGMAKDVKTLKDVNIIGVDLNKQKAAFP
EECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCC
IELIDKYKVKDKENEIIINERYAKENSLKVGAKIKLLIGTKNKEFIISGISKNTGVFDPS
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEECCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCC
MNTAMISIDNAQYLLDQKDNAYSIGITIKNLDHINNMIEKIKPKVSSKFIIQQRYDMDYF
CCEEEEEECCCCEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHH
KSYVGTIDMALKIIGVLSIFITLFLTYSTFSLIIYERLHQIGILRSLGISKKDIKVSVIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHH
ENLLIVLSSIVIGSILTIPFVRLILNYIVQDGYFTLDLRKFLFIDLIIVIFSVLVILVSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKILNMSVINLLKGIGKKYYTNKIGKIFKSSFGVLLLIVSIAILISEYKRENGTFALILG
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
ALFFIISFVFLAKLLLIMFNWIYQKIFSIFKGSVRILFKELVMQFSNIVDIVIITSIIIC
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIYVSVTLKDMINNGVMNVYSNADLMLSIDGTVEEDFTDKIKNIKYIKNSLLQSRTTEVI
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KDTKVDIAGIDGSQYKKDFSTEIIKKGEKNIFDKLDDGKNIIITTTFSKNTGINLNDSLK
HHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEE
INEVNYKVIGVVSSFENMGKVLFLSKDNFNKDIKVKDKDLCLIKVNNKQIKSTTNEIEKL
EEECCEEEEEEHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
FKDKYENKYSIQELTVLNEENNNNNKKTFTIVNVLICISTIICIISMSNNVTINLLSRKK
HHHHCCCCCCHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEECCCE
VYATKGALGISKGYLSKCILFEAIVLGSYSGIFGLGLGVTLSNYINKILSYYIGDMVFIK
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
DYKIMVILVLISIGITVISYIYPMRKIYRINIIDEIKSDE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA