| Definition | Legionella pneumophila str. Corby chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009494 |
| Length | 3,576,470 |
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The map label for this gene is yjeP [H]
Identifier: 148359008
GI number: 148359008
Start: 1694657
End: 1697551
Strand: Direct
Name: yjeP [H]
Synonym: LPC_0893
Alternate gene names: 148359008
Gene position: 1694657-1697551 (Clockwise)
Preceding gene: 148359007
Following gene: 148359009
Centisome position: 47.38
GC content: 34.06
Gene sequence:
>2895_bases TTGTGGTGCTTTTTCCTGCCTCTGGTTTTATTATTTTTTAGTTTTTCACTCTTTTCAGCATCGGTTAAAGAAAACAATGC CACGCTAGTAGAATATTTGGCACATGAAAAAACTCATTTGACCATTGCTATCAATGAAATTAAACAAAAGAGCGCTCCCA AAAATGAGCAAGAGTACAATGAGAAGTTAAGACAAATTAGAACTATTCTTTCAATGAATAAAGCAAAAATTGAGAGTTTG AATGGTTTTAGTGAAAATCAAAAGAAAGAAGAAGTCAATTTGAATGAGCAACTAAAGCGTTTGCAACAAATGCCGCTTGC CAATGCTGAAGTAACTATTCAGGAAAAAGTAGGTAAAATCGAGACCTTGCTTACTGTTAATAAAAAAACCACTGAGTTAA TTGCAGAAACTTTGGATTTGGCCAAACAATATCAATTACTTTTAAATGATGTTTTGAATGAATTAAAACTTTGGAAAGCC AACTTCGATTTGAAAGAAAAGCTTAAGTCAATTAAAGCCATTAGAGCTAAATTGAATAAAGAACTGAATATCCTTTATGA GAATGCAGTATCCAGCCAAGATAAAAAGCAACCGGAACTAACGATTAGCGAACAGATTCAATATGAAGCTAATTTGTACA TCAATAATCAAAGAATTGCAGTTATTCATCAAAAGTTGAATGCATTGGAGTTACAGAAAAAGATAATTAAAACGAATATC CTGTTATTAAATAACTTGGATACTAAAGCCTTGCAATCAGCGATTGATAATTACAGAGAGGTTATTAATCAATATTCGGC TATAGAGAGTTCTTTGCAAACAATTCTGAATTCTCTTACAAATCAGGCCAATCTTTTTGTTGAGCCAGGGTTACAAAAAT CCGTTAGCTTATTGCAGAATGACGTTAAAACAGAATTAAAGGAAACCTCTAATCAAAAACTTATCTTATCCAAAAATTTA GAGGATTATCAAAATCAATTAAAGAAACAGATTTCAACAAGACAAAGCTTAAGCGAATACAATATAGACAGTTGGGCAGT CATTCTCAAGAAGCTAATTGATATCCCCAATTTGTTTTATAAATACATCAAAACACTAACCATAAAGGTTTACGATAGTT ATACCTGGCTAGATACTTTTCCCGCTATTTTTTTATGGACAGTTCTTATTTTTATCCTGAGCCTGTTTTATATTTTAAAT CATGTTTTGAAGACTTTAGCAAGAGATAAAGAACGCTCAAGATTTACTGGTTATCTTTATGGTGGAATACTCGTTTTACT GCAAAGAAACATACCTCATCTTTGCTTCTTCGCTATGTTATCCTTCATTTTATACTTCACCAGTATTTCTTATGCTAACT CTCAATTATTAATTAAACTCATTATCGTGTGGCTTACCTTTAGAGTTTTAATTTTAATAGCCCGTTTGATTTTGTTAGAA AGTATATCGGATTCATCAGGAAAGGACGTTAAATTATATTATCGACTAAAATGGTTGTTGCTTTTTGGTGGATGGACAAC CGCGTTGATGACATTTAGTCACTTGTTACCTTTATCAATTCTACTGCAAGATATATTTAATCGATTATTCATGCTTTTTA TGTTAACGGTATCCTTGGTCGCATGGAAAAGTAAAGATGTAATTCCTTATCTCATTAGACCATTACTGAAATCAAAGAAA AGATATTTTAAAAATGCAATTTCTTTATTGGTCATTTTAGTTCCTATAACCTTATTTACAACCGCAATTATTGGTTTAAT TGGCTTTGTGAATCTGGCATGGACTATGAGTCGTTATCAAGCTTATATTCTATTGGTTTTAGTAGGTTATATTCTCGTAA GAGGTTTGATATTTGATGCACTAGAGCTTTTCTCTGAGTGGATGATCTCTTCATTGAAAAATGGTTGGTTATGGATAGAG GTTTTCCTCAAACCAATCGATAAAATCTTGCGTATTGTCTTGTTTTTAACAAGTGTGTTAATTTTATTTCAGTTGTTTGG TTGGTACTCTGATTCACTGGTTGTGACTAGCCTCGAAAAAGTAGTTCAATACAGTATTCTTAATATTACAGGCATACATA TTACAGTCGCCAGTATCATTGAATTTCTTATTCTGCTTGCTGTTTTAGTATGGGCAGCAAAGTGGACAAGAGAGTTTTGC TTTCGATGGCTATATAAGAATACCAAAGATGTGGGTATACGCCATAGTTTATCTGTATTTACACAGTATGCGATCATATT ACTGGGTACATTCATAACTCTTCATGTTCTGGGACTGGATTTTAGCGGTATGTCGATGATACTTGGAGGGCTTGCTGTCG GTATGGGGTTCGGTTTGAGAGATTTTGCTTCAAATATTGTTGGAGGCATTATGCTTTTAATTGAACGACCCGTAAGGGAA GGCGATTTGATCACCATAGGTGAATACGAAGGGCAAGTGGCTCACATAGGCATTCGCTCGATGCGCGTATCTTCATGGGA TAATACTCAGGTTTTGATTCCGAATGCTGAAACGTTCAATAAACCTTTTACAAACTGGACTCATCAAGATGGTATTATTC GTACGGTCATACCAATAAAGGTAAGCAGAGCCGATGATCCTGTGATGATTCAACAGTTAATACTTGATGTATTGGCAATT ATTCCGGAAATTGTTCCAGATCCTCCCGCACAAGTTTTTTTAAAGAAAATCGATACAGCTTTAATAGAATTTGAAGCACG GTATTTTATTAACATCCAGAATCATAACCGGGTTGAAGTAAGGTCAAAAGTCTTGTTTGCCATAACTGCACAGTTTAAAG CGGCAGGAATACAGCCGCCAATTGAGCCTATTACTGTTGAACTAAAAGAGAGCTCCAGTGATTTTAGCCTTAAAAAGCAA ACCACCGAAGAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCGCCTGCGGGCAATGCACAATTAACTGAACTGGGTATAAGACTTGCGCCAACTATTACGACAAAGTAGTTTAAATTTAA GCACCACAAGTTTAAAATAC
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAGAACTTTTGGAGCAATGCCAGCGAATTGAAGGGTTGAGTTTCGCTCAGTTAGCTCTTGAATTGGGTCTATTTACCC CTTTAAACCCTGTTCATCGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 964; Mature: 964
Protein sequence:
>964_residues MWCFFLPLVLLFFSFSLFSASVKENNATLVEYLAHEKTHLTIAINEIKQKSAPKNEQEYNEKLRQIRTILSMNKAKIESL NGFSENQKKEEVNLNEQLKRLQQMPLANAEVTIQEKVGKIETLLTVNKKTTELIAETLDLAKQYQLLLNDVLNELKLWKA NFDLKEKLKSIKAIRAKLNKELNILYENAVSSQDKKQPELTISEQIQYEANLYINNQRIAVIHQKLNALELQKKIIKTNI LLLNNLDTKALQSAIDNYREVINQYSAIESSLQTILNSLTNQANLFVEPGLQKSVSLLQNDVKTELKETSNQKLILSKNL EDYQNQLKKQISTRQSLSEYNIDSWAVILKKLIDIPNLFYKYIKTLTIKVYDSYTWLDTFPAIFLWTVLIFILSLFYILN HVLKTLARDKERSRFTGYLYGGILVLLQRNIPHLCFFAMLSFILYFTSISYANSQLLIKLIIVWLTFRVLILIARLILLE SISDSSGKDVKLYYRLKWLLLFGGWTTALMTFSHLLPLSILLQDIFNRLFMLFMLTVSLVAWKSKDVIPYLIRPLLKSKK RYFKNAISLLVILVPITLFTTAIIGLIGFVNLAWTMSRYQAYILLVLVGYILVRGLIFDALELFSEWMISSLKNGWLWIE VFLKPIDKILRIVLFLTSVLILFQLFGWYSDSLVVTSLEKVVQYSILNITGIHITVASIIEFLILLAVLVWAAKWTREFC FRWLYKNTKDVGIRHSLSVFTQYAIILLGTFITLHVLGLDFSGMSMILGGLAVGMGFGLRDFASNIVGGIMLLIERPVRE GDLITIGEYEGQVAHIGIRSMRVSSWDNTQVLIPNAETFNKPFTNWTHQDGIIRTVIPIKVSRADDPVMIQQLILDVLAI IPEIVPDPPAQVFLKKIDTALIEFEARYFINIQNHNRVEVRSKVLFAITAQFKAAGIQPPIEPITVELKESSSDFSLKKQ TTEE
Sequences:
>Translated_964_residues MWCFFLPLVLLFFSFSLFSASVKENNATLVEYLAHEKTHLTIAINEIKQKSAPKNEQEYNEKLRQIRTILSMNKAKIESL NGFSENQKKEEVNLNEQLKRLQQMPLANAEVTIQEKVGKIETLLTVNKKTTELIAETLDLAKQYQLLLNDVLNELKLWKA NFDLKEKLKSIKAIRAKLNKELNILYENAVSSQDKKQPELTISEQIQYEANLYINNQRIAVIHQKLNALELQKKIIKTNI LLLNNLDTKALQSAIDNYREVINQYSAIESSLQTILNSLTNQANLFVEPGLQKSVSLLQNDVKTELKETSNQKLILSKNL EDYQNQLKKQISTRQSLSEYNIDSWAVILKKLIDIPNLFYKYIKTLTIKVYDSYTWLDTFPAIFLWTVLIFILSLFYILN HVLKTLARDKERSRFTGYLYGGILVLLQRNIPHLCFFAMLSFILYFTSISYANSQLLIKLIIVWLTFRVLILIARLILLE SISDSSGKDVKLYYRLKWLLLFGGWTTALMTFSHLLPLSILLQDIFNRLFMLFMLTVSLVAWKSKDVIPYLIRPLLKSKK RYFKNAISLLVILVPITLFTTAIIGLIGFVNLAWTMSRYQAYILLVLVGYILVRGLIFDALELFSEWMISSLKNGWLWIE VFLKPIDKILRIVLFLTSVLILFQLFGWYSDSLVVTSLEKVVQYSILNITGIHITVASIIEFLILLAVLVWAAKWTREFC FRWLYKNTKDVGIRHSLSVFTQYAIILLGTFITLHVLGLDFSGMSMILGGLAVGMGFGLRDFASNIVGGIMLLIERPVRE GDLITIGEYEGQVAHIGIRSMRVSSWDNTQVLIPNAETFNKPFTNWTHQDGIIRTVIPIKVSRADDPVMIQQLILDVLAI IPEIVPDPPAQVFLKKIDTALIEFEARYFINIQNHNRVEVRSKVLFAITAQFKAAGIQPPIEPITVELKESSSDFSLKKQ TTEE >Mature_964_residues MWCFFLPLVLLFFSFSLFSASVKENNATLVEYLAHEKTHLTIAINEIKQKSAPKNEQEYNEKLRQIRTILSMNKAKIESL NGFSENQKKEEVNLNEQLKRLQQMPLANAEVTIQEKVGKIETLLTVNKKTTELIAETLDLAKQYQLLLNDVLNELKLWKA NFDLKEKLKSIKAIRAKLNKELNILYENAVSSQDKKQPELTISEQIQYEANLYINNQRIAVIHQKLNALELQKKIIKTNI LLLNNLDTKALQSAIDNYREVINQYSAIESSLQTILNSLTNQANLFVEPGLQKSVSLLQNDVKTELKETSNQKLILSKNL EDYQNQLKKQISTRQSLSEYNIDSWAVILKKLIDIPNLFYKYIKTLTIKVYDSYTWLDTFPAIFLWTVLIFILSLFYILN HVLKTLARDKERSRFTGYLYGGILVLLQRNIPHLCFFAMLSFILYFTSISYANSQLLIKLIIVWLTFRVLILIARLILLE SISDSSGKDVKLYYRLKWLLLFGGWTTALMTFSHLLPLSILLQDIFNRLFMLFMLTVSLVAWKSKDVIPYLIRPLLKSKK RYFKNAISLLVILVPITLFTTAIIGLIGFVNLAWTMSRYQAYILLVLVGYILVRGLIFDALELFSEWMISSLKNGWLWIE VFLKPIDKILRIVLFLTSVLILFQLFGWYSDSLVVTSLEKVVQYSILNITGIHITVASIIEFLILLAVLVWAAKWTREFC FRWLYKNTKDVGIRHSLSVFTQYAIILLGTFITLHVLGLDFSGMSMILGGLAVGMGFGLRDFASNIVGGIMLLIERPVRE GDLITIGEYEGQVAHIGIRSMRVSSWDNTQVLIPNAETFNKPFTNWTHQDGIIRTVIPIKVSRADDPVMIQQLILDVLAI IPEIVPDPPAQVFLKKIDTALIEFEARYFINIQNHNRVEVRSKVLFAITAQFKAAGIQPPIEPITVELKESSSDFSLKKQ TTEE
Specific function: Unknown
COG id: COG3264
COG function: function code M; Small-conductance mechanosensitive channel
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mscS (TC 1.A.23) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI2367355, Length=218, Percent_Identity=27.5229357798165, Blast_Score=124, Evalue=2e-29, Organism=Escherichia coli, GI1786670, Length=179, Percent_Identity=29.608938547486, Blast_Score=113, Evalue=6e-26, Organism=Escherichia coli, GI1789291, Length=284, Percent_Identity=23.5915492957746, Blast_Score=75, Evalue=2e-14,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR010920 - InterPro: IPR011066 - InterPro: IPR006685 - InterPro: IPR006686 - InterPro: IPR011014 [H]
Pfam domain/function: PF00924 MS_channel [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 110789; Mature: 110789
Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MWCFFLPLVLLFFSFSLFSASVKENNATLVEYLAHEKTHLTIAINEIKQKSAPKNEQEYN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHCCCCCCHHHHH EKLRQIRTILSMNKAKIESLNGFSENQKKEEVNLNEQLKRLQQMPLANAEVTIQEKVGKI HHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHCHH ETLLTVNKKTTELIAETLDLAKQYQLLLNDVLNELKLWKANFDLKEKLKSIKAIRAKLNK HHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC ELNILYENAVSSQDKKQPELTISEQIQYEANLYINNQRIAVIHQKLNALELQKKIIKTNI HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHEEEEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLNNLDTKALQSAIDNYREVINQYSAIESSLQTILNSLTNQANLFVEPGLQKSVSLLQN HEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHH DVKTELKETSNQKLILSKNLEDYQNQLKKQISTRQSLSEYNIDSWAVILKKLIDIPNLFY HHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH KYIKTLTIKVYDSYTWLDTFPAIFLWTVLIFILSLFYILNHVLKTLARDKERSRFTGYLY HHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH GGILVLLQRNIPHLCFFAMLSFILYFTSISYANSQLLIKLIIVWLTFRVLILIARLILLE HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SISDSSGKDVKLYYRLKWLLLFGGWTTALMTFSHLLPLSILLQDIFNRLFMLFMLTVSLV HCCCCCCCCEEEEHHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AWKSKDVIPYLIRPLLKSKKRYFKNAISLLVILVPITLFTTAIIGLIGFVNLAWTMSRYQ HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYILLVLVGYILVRGLIFDALELFSEWMISSLKNGWLWIEVFLKPIDKILRIVLFLTSVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILFQLFGWYSDSLVVTSLEKVVQYSILNITGIHITVASIIEFLILLAVLVWAAKWTREFC HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FRWLYKNTKDVGIRHSLSVFTQYAIILLGTFITLHVLGLDFSGMSMILGGLAVGMGFGLR HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHH DFASNIVGGIMLLIERPVREGDLITIGEYEGQVAHIGIRSMRVSSWDNTQVLIPNAETFN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEHHHEEECCCCCCEEEECCCHHCC KPFTNWTHQDGIIRTVIPIKVSRADDPVMIQQLILDVLAIIPEIVPDPPAQVFLKKIDTA CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH LIEFEARYFINIQNHNRVEVRSKVLFAITAQFKAAGIQPPIEPITVELKESSSDFSLKKQ HHHEECEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCC TTEE CCCC >Mature Secondary Structure MWCFFLPLVLLFFSFSLFSASVKENNATLVEYLAHEKTHLTIAINEIKQKSAPKNEQEYN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHCCCCCCHHHHH EKLRQIRTILSMNKAKIESLNGFSENQKKEEVNLNEQLKRLQQMPLANAEVTIQEKVGKI HHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHCHH ETLLTVNKKTTELIAETLDLAKQYQLLLNDVLNELKLWKANFDLKEKLKSIKAIRAKLNK HHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC ELNILYENAVSSQDKKQPELTISEQIQYEANLYINNQRIAVIHQKLNALELQKKIIKTNI HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHEEEEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLNNLDTKALQSAIDNYREVINQYSAIESSLQTILNSLTNQANLFVEPGLQKSVSLLQN HEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHH DVKTELKETSNQKLILSKNLEDYQNQLKKQISTRQSLSEYNIDSWAVILKKLIDIPNLFY HHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHH KYIKTLTIKVYDSYTWLDTFPAIFLWTVLIFILSLFYILNHVLKTLARDKERSRFTGYLY HHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH GGILVLLQRNIPHLCFFAMLSFILYFTSISYANSQLLIKLIIVWLTFRVLILIARLILLE HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SISDSSGKDVKLYYRLKWLLLFGGWTTALMTFSHLLPLSILLQDIFNRLFMLFMLTVSLV HCCCCCCCCEEEEHHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AWKSKDVIPYLIRPLLKSKKRYFKNAISLLVILVPITLFTTAIIGLIGFVNLAWTMSRYQ HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYILLVLVGYILVRGLIFDALELFSEWMISSLKNGWLWIEVFLKPIDKILRIVLFLTSVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILFQLFGWYSDSLVVTSLEKVVQYSILNITGIHITVASIIEFLILLAVLVWAAKWTREFC HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FRWLYKNTKDVGIRHSLSVFTQYAIILLGTFITLHVLGLDFSGMSMILGGLAVGMGFGLR HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHH DFASNIVGGIMLLIERPVREGDLITIGEYEGQVAHIGIRSMRVSSWDNTQVLIPNAETFN HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEHHHEEECCCCCCEEEECCCHHCC KPFTNWTHQDGIIRTVIPIKVSRADDPVMIQQLILDVLAIIPEIVPDPPAQVFLKKIDTA CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH LIEFEARYFINIQNHNRVEVRSKVLFAITAQFKAAGIQPPIEPITVELKESSSDFSLKKQ HHHEECEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCC TTEE CCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7610040; 9278503; 3042771 [H]