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The map label for this gene is trbE [H]

Identifier: 148358311

GI number: 148358311

Start: 187458

End: 189995

Strand: Direct

Name: trbE [H]

Synonym: LPC_0173

Alternate gene names: 148358311

Gene position: 187458-189995 (Clockwise)

Preceding gene: 148358310

Following gene: 148358312

Centisome position: 5.24

GC content: 43.1

Gene sequence:

>2538_bases
ATGATTCCAGTCATTACCTTTTTGCTTAGTCTTACAGGACTTATTTTTTTAAGTTTCCTGTTTTACCAGACGCGCTTAAA
TAGCCAGACCCATCATTTAAAAAAGCATCGCCAGCAAAAAGCAGGATTTGTTGATTTACTCAATTATGCCGCCCTGGTCG
ATGATGGCGTCATTATCGGCAAAAATGGTTCATTTATGGCAGCCTGGCTCTATAGCGGTGAAGATCATGCCAATAGCACC
GATAAAGCACGTGAGATGGTGTCATTTCGAATCAATCAAGCCTTATCTGCTATGGGCAGTGGTTGGATGGTTCATGTTGA
TGCCATACGTCGGGCAGCTCCCAGCTATAGCGAACGAGGATGTTCGCACTTTCCTGATCCCATATCTTTAGCGGTTGATG
AAGAAAGAAGACAGCTTTTTGAGCGTTTAGGCACTTTATATGAAGGTTATTTTGTTATTACTTTGACCTGGTATCCACCT
GTATTGGCGCAAAAACGCTTTGAGGCGTTGATGTTTGATGACAACCAGGCCCGTTTAAGCCAAAAAGCTAAAACGCACCA
GCTTATTGAAGAATTTAAGCAATCTTGTCGTAACTTTGAATCGCGCATGAGTTCTGCACTTAATCTTGAAAGGCTACAGT
CAGAAAAAATCATTAATGAGCAAGGCAGCACTGTAATACAGGATAATTTTTTAAGACACCTGCAGTTTTGTGCCACTGGA
TTAAACCACCCAGTCAATTTACCTAAAAATCCAATATACCTTGATGCCTTAATAGGCGGCCAGGAATTGCTGACCGGAAT
TACCCCAAAAATTGGGAAAAAATTCATTCAGTGCGTAGCAATTGAAGGATTCCCGATGGAATCTTACCCAGGCATTTTAA
CAGCTCTTACTCTCCTGCCGATTGAATATCGCTGGAGTTCACGCTTTATCTTTTTGGATGCTCATGAAGCGGTGGCTCAC
TTCACTAAGTTTCGTAAAAAGTGGAAACAAAAAGTCAGAGGCTTTTTTGACCAGATTTTTCATACCCACTCAGGTGCAAT
TGACGAAGATGCACTGAATATGGTGGAAGATGCACAAGCAGCGATTGCTGAAACCAACTCAGGCTTGGTGGGGCAAGGCT
ATTTCACATCAGTTGTCATTTTAATGGATGAAGACCGTGCCTTAGTGGAAAAAGCAGCCCTTTTTATTGAAAAAAACATC
AATGCACTTGGATTTACGGCACGACTTGAGACCATTAATACCATGGATGCTTTCATGGGCAGCCTTCCAGGTCATGGCGT
CGAAAATATCAGACGGCCTTTGATTAACACCATGAATTTGGCTGACTTATTGCCTACATCCAATATTTGGACGGGTGAAA
ATAAAGCACCTTGCCCGCTCTTTCCGCCATTATCACCGCCTTTAATGCATTGCATCACCAGTGGTAACGCGCCGTTTCGT
TTGAATCTTCATGTAAGAGACTTAGGGCATGGGATTATGTTTGGACCCACGCGCTCTGGAAAATCAACCCATCTTGGCTT
AATTGCACTGTCCTGGCGGCGCTATAAAGACGCGCGCATTTACTCGTTTGATAAAGGCATGTCGATGTATCCGACTTGTA
AAGCGACGGGCGGAGAACATTACACCATTGCGGATAAAGACTCAAAACTTGCCTTTGCGCCCTTACAGTTTTTATCAACC
AGTGCAGACAGGGCTTGGGCGATGGAATGGATTGATACCATTCTTGCTTTAAATGGTTTGAATACCACACCGGCTCAGCG
TAATGAAATCGGGCATGCCGTTATCAGCATGCATAAAAGCGGCTCGAAAACGCTGTCTGAATTTGTGATGACCATTCAGG
ATGAGCAAATTCGTGAAACATTAAAACAATACACCATTGATGGTTTGATGGGACATTTATTGGATGCTGAAAGCGATGGT
TTAGGTTTGTCTTCTTTTATGACGTTTGAAATTGAGCATTTAATGGGATTGGGCGAGAAATTTGCACTTCCCGTATTGCT
GTATTTATTCAGACGAATTGAAACCTCCCTGGATGGACGCCCAACTTTGATTTTATTGGATGAAGCATGGTTGATGCTGG
CGCATCCTGTCTTTAAAAACAAAATTGCCGAGTGGCTGGACTCTATGGCTAAGAAAAATTGTGTGGTATTCATGGCAACC
CAGCATTTATCCCATGCCGCAAACTCCGGCATTTTAGACACCATCGTTGAATCAACCGCTACCAAAATCTTTTTACCTAA
TCTTTATGCAAGAGATCCTGAAACTCGCTTGATTTATGAACGCATGGGCTTAAATCCACGGCAAATCGACATCATAGCAT
CAGCGCAACCTAAGCGTGATTACTACTACGTCAGCGAAAAAGGACAACGCCTCTATCAATTGGCATTGGGTCCTTTGGCC
TTGGCGTTTGTAGGTGCCACCGATCCAGATTCTATTGAGCGTATGAAACAGCTTGAAGATAAGTATGGTGCTGAGTGGGT
CTCTTTCTGGCTTTCAGAAAAAGGAGTTGATATTAAATCACACGGAGTTGCAGCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAGATCCTTTTATGCGTGCGATTTATTTAAGGCAACGAAGTTATCAAGCCTATTATGCGCCTCGCTCAACTCCTTTTAGA
GAAAATAAAAGAGGTTATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAAACTGAAGCAATGGTTAAATCGTTTAAATACGGAATGTAAAAAGTCGAATTTAACCGATAATCCTTACCTTAATGCC
AAACGAGCCTGGAACGTTCA

Product: conjugal transfer protein TrbE

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 845; Mature: 845

Protein sequence:

>845_residues
MIPVITFLLSLTGLIFLSFLFYQTRLNSQTHHLKKHRQQKAGFVDLLNYAALVDDGVIIGKNGSFMAAWLYSGEDHANST
DKAREMVSFRINQALSAMGSGWMVHVDAIRRAAPSYSERGCSHFPDPISLAVDEERRQLFERLGTLYEGYFVITLTWYPP
VLAQKRFEALMFDDNQARLSQKAKTHQLIEEFKQSCRNFESRMSSALNLERLQSEKIINEQGSTVIQDNFLRHLQFCATG
LNHPVNLPKNPIYLDALIGGQELLTGITPKIGKKFIQCVAIEGFPMESYPGILTALTLLPIEYRWSSRFIFLDAHEAVAH
FTKFRKKWKQKVRGFFDQIFHTHSGAIDEDALNMVEDAQAAIAETNSGLVGQGYFTSVVILMDEDRALVEKAALFIEKNI
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LNLHVRDLGHGIMFGPTRSGKSTHLGLIALSWRRYKDARIYSFDKGMSMYPTCKATGGEHYTIADKDSKLAFAPLQFLST
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LGLSSFMTFEIEHLMGLGEKFALPVLLYLFRRIETSLDGRPTLILLDEAWLMLAHPVFKNKIAEWLDSMAKKNCVVFMAT
QHLSHAANSGILDTIVESTATKIFLPNLYARDPETRLIYERMGLNPRQIDIIASAQPKRDYYYVSEKGQRLYQLALGPLA
LAFVGATDPDSIERMKQLEDKYGAEWVSFWLSEKGVDIKSHGVAA

Sequences:

>Translated_845_residues
MIPVITFLLSLTGLIFLSFLFYQTRLNSQTHHLKKHRQQKAGFVDLLNYAALVDDGVIIGKNGSFMAAWLYSGEDHANST
DKAREMVSFRINQALSAMGSGWMVHVDAIRRAAPSYSERGCSHFPDPISLAVDEERRQLFERLGTLYEGYFVITLTWYPP
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LNHPVNLPKNPIYLDALIGGQELLTGITPKIGKKFIQCVAIEGFPMESYPGILTALTLLPIEYRWSSRFIFLDAHEAVAH
FTKFRKKWKQKVRGFFDQIFHTHSGAIDEDALNMVEDAQAAIAETNSGLVGQGYFTSVVILMDEDRALVEKAALFIEKNI
NALGFTARLETINTMDAFMGSLPGHGVENIRRPLINTMNLADLLPTSNIWTGENKAPCPLFPPLSPPLMHCITSGNAPFR
LNLHVRDLGHGIMFGPTRSGKSTHLGLIALSWRRYKDARIYSFDKGMSMYPTCKATGGEHYTIADKDSKLAFAPLQFLST
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QHLSHAANSGILDTIVESTATKIFLPNLYARDPETRLIYERMGLNPRQIDIIASAQPKRDYYYVSEKGQRLYQLALGPLA
LAFVGATDPDSIERMKQLEDKYGAEWVSFWLSEKGVDIKSHGVAA
>Mature_845_residues
MIPVITFLLSLTGLIFLSFLFYQTRLNSQTHHLKKHRQQKAGFVDLLNYAALVDDGVIIGKNGSFMAAWLYSGEDHANST
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FTKFRKKWKQKVRGFFDQIFHTHSGAIDEDALNMVEDAQAAIAETNSGLVGQGYFTSVVILMDEDRALVEKAALFIEKNI
NALGFTARLETINTMDAFMGSLPGHGVENIRRPLINTMNLADLLPTSNIWTGENKAPCPLFPPLSPPLMHCITSGNAPFR
LNLHVRDLGHGIMFGPTRSGKSTHLGLIALSWRRYKDARIYSFDKGMSMYPTCKATGGEHYTIADKDSKLAFAPLQFLST
SADRAWAMEWIDTILALNGLNTTPAQRNEIGHAVISMHKSGSKTLSEFVMTIQDEQIRETLKQYTIDGLMGHLLDAESDG
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QHLSHAANSGILDTIVESTATKIFLPNLYARDPETRLIYERMGLNPRQIDIIASAQPKRDYYYVSEKGQRLYQLALGPLA
LAFVGATDPDSIERMKQLEDKYGAEWVSFWLSEKGVDIKSHGVAA

Specific function: Unknown

COG id: COG3451

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB4 components

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trbE/virB4 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003593
- InterPro:   IPR004346
- InterPro:   IPR018145 [H]

Pfam domain/function: PF03135 CagE_TrbE_VirB [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94997; Mature: 94997

Theoretical pI: Translated: 7.02; Mature: 7.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIPVITFLLSLTGLIFLSFLFYQTRLNSQTHHLKKHRQQKAGFVDLLNYAALVDDGVIIG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEC
KNGSFMAAWLYSGEDHANSTDKAREMVSFRINQALSAMGSGWMVHVDAIRRAAPSYSERG
CCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCCHHHCC
CSHFPDPISLAVDEERRQLFERLGTLYEGYFVITLTWYPPVLAQKRFEALMFDDNQARLS
CCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHEECCCHHHHH
QKAKTHQLIEEFKQSCRNFESRMSSALNLERLQSEKIINEQGSTVIQDNFLRHLQFCATG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
LNHPVNLPKNPIYLDALIGGQELLTGITPKIGKKFIQCVAIEGFPMESYPGILTALTLLP
CCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHC
IEYRWSSRFIFLDAHEAVAHFTKFRKKWKQKVRGFFDQIFHTHSGAIDEDALNMVEDAQA
EEEEECCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AIAETNSGLVGQGYFTSVVILMDEDRALVEKAALFIEKNINALGFTARLETINTMDAFMG
HHHHCCCCCEECCHHEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH
SLPGHGVENIRRPLINTMNLADLLPTSNIWTGENKAPCPLFPPLSPPLMHCITSGNAPFR
CCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEE
LNLHVRDLGHGIMFGPTRSGKSTHLGLIALSWRRYKDARIYSFDKGMSMYPTCKATGGEH
EEEEEHCCCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEEEHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCE
YTIADKDSKLAFAPLQFLSTSADRAWAMEWIDTILALNGLNTTPAQRNEIGHAVISMHKS
EEEECCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
GSKTLSEFVMTIQDEQIRETLKQYTIDGLMGHLLDAESDGLGLSSFMTFEIEHLMGLGEK
CHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FALPVLLYLFRRIETSLDGRPTLILLDEAWLMLAHPVFKNKIAEWLDSMAKKNCVVFMAT
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QHLSHAANSGILDTIVESTATKIFLPNLYARDPETRLIYERMGLNPRQIDIIASAQPKRD
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCC
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EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCC
HGVAA
CCCCC
>Mature Secondary Structure
MIPVITFLLSLTGLIFLSFLFYQTRLNSQTHHLKKHRQQKAGFVDLLNYAALVDDGVIIG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEC
KNGSFMAAWLYSGEDHANSTDKAREMVSFRINQALSAMGSGWMVHVDAIRRAAPSYSERG
CCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHCCCCHHHCC
CSHFPDPISLAVDEERRQLFERLGTLYEGYFVITLTWYPPVLAQKRFEALMFDDNQARLS
CCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHEECCCHHHHH
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CCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHC
IEYRWSSRFIFLDAHEAVAHFTKFRKKWKQKVRGFFDQIFHTHSGAIDEDALNMVEDAQA
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AIAETNSGLVGQGYFTSVVILMDEDRALVEKAALFIEKNINALGFTARLETINTMDAFMG
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LNLHVRDLGHGIMFGPTRSGKSTHLGLIALSWRRYKDARIYSFDKGMSMYPTCKATGGEH
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EEEECCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
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YYYVSEKGQRLYQLALGPLALAFVGATDPDSIERMKQLEDKYGAEWVSFWLSEKGVDIKS
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCC
HGVAA
CCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8763954 [H]