Definition Orientia tsutsugamushi Boryong, complete genome.
Accession NC_009488
Length 2,127,051

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The map label for this gene is gdhB [H]

Identifier: 148285156

GI number: 148285156

Start: 2090858

End: 2095783

Strand: Direct

Name: gdhB [H]

Synonym: OTBS_2150

Alternate gene names: 148285156

Gene position: 2090858-2095783 (Clockwise)

Preceding gene: 148285149

Following gene: 148285159

Centisome position: 98.3

GC content: 29.64

Gene sequence:

>4926_bases
ATGAATAATCAAGATTTAGATTTAACGCATTCTCCAACCTTTAGCTGTGATAGTACAGAATTACAAACTGAAGTTGTTAA
CGCAATCAAAAGCGAAGCTAAATATTCTAACGATAAGTTATTAGTTAAATTTATTAAAAGTTTCTATTCATATATTCCAA
TTGACTATATAGAAAATTATAATGCTAACTTTTTTAAAGATACTGCATTAAGTGCATATGAGTTTTTTCTGAAAAAACCT
ATAAATAAAAATTATCTAGTTACAATCTCTCAATCTACTCAATCAAGAGAATTTCCTCCTTTTATTGAATTTAAAATTAT
CAATATAGATGCAGCTTTTATTATTGATTCAATTAAATCTTTGTTAGATAGAATAGGTCTAGAGCCATTTTTCTTTATTC
ATCCTATAGTTATTGCTCAAAGAAGCAAAGATGGTAAATTAGTCGATGTCCATCCTGCTTTACAGAACAGAAAATCTAAT
CATATAACAAATAGTAATATTGAATCTTTAATAGTGTGTAAAATACACGGTACTTTTGATAAAAAATTGCTCGATAATAT
CAAAAACCAGCTTACTACAATCTTAGAACAAATTAATAAAACCTCTGCAGACTGGCAACCTATTTTGCATGAAATAGAAA
AGATTATTATATCGCTATCTTGCTCTTCTGATCAGGAAGAAAAATCCATTATAGATTTTCTTCATTGGCTAAAATCTGAT
AATTTTACTTTTCTAAGTTGTATTAATTACAATATATCAAATAAAAAAAGTAAGCTTATTGCTGGACATAAAGCATTTTT
TCATGAACAAGATGTAGAAAATATTGTTCATCTTGCTTGTAATCAGCATAACGATAAAAAGCTAATACTAATTGGCAAAA
TTAATAAGCCATCCACTGTTCATAAAAGCAGCTTCATTAATTATGTTCTTATAAAGCAACAAGACCAGATCGGAAATTTA
AACTCAGCTATGGTCTTCTTAGGTCTTTACAGTGCTTCAACTAGACAGCAATCTGTACAAAATATTCCTATATTACGGGA
TAAGCTAAAAGATATACTTAGTTTTTCAAAGTTTAGTAGTAGCAGCTATAATGCTAAAAGATTTAATGCAATATTTGAAT
CTTTACCTAGAGAAATGCTATTTGAGGTTAGCTCAGAGAATCTTTATTGTGCATGCTTAAAAGTATTATCAGCAATGCAT
AACAATGCGTTAAGGCTTTGCCTTTTTCCAAATTGTCTTAATAATATTATTGATATCATAGTGTTTTTACCAAGCGCAAG
GTTAACTCCTAACGTGCATGCAAATATTACTGGTCGCCTAATAAAAGCATTTAATACTAAAATTTTAAGCAGTGAATTAA
ATACAGTCCCACCAAATTTCTGTAGTATCTATATTAGCATGTCAGTCGATAATAATATACTTGCTAATTTGAATATTAAA
GAGCTTGAAAGTGATCTTGAAAATTTATCAGCGCAGTGGATAGAGTCATTTAAGGCATCTTTGATTAAATCTTACGGATT
ATTTGAAGGATTAAAACTGTTTAAAGATAATGCATGTATATTTCCTAAAAATTATATTCAAAACTTTAATTCAACTGAAG
CAGTCAGTGATTTACAATATGTTATTAAAGCTCAAAAAAGTGGTAAAAAAGCCTTCAACTTTATAGTGCATTCGCAACAT
ATGTATAGCTTAAAAATATATAATCCTGGTAGCAAACTTCAACTATCTCAAATTTTTCCTTTAATTGAAAATTTAAATTT
TAACATCTTAGACGAGCAAACTTTTAAAATTTCAACTGAGAATGGCAGGCCGCTAATTTCACAACTAGCATTAGATTCTA
ATAAACAAGAGCCAATAGCAATAGGTAATAGTTTAAACGTTCAGCAGGATTTGAATGCTCTGTATTCAATGAATAGCAAT
CAGTCTGATACATGGATATATAATTTCAATTTATCTCCCAAAATTGAATTAACTACTCTAAATTTAGAGCTAATGAAAAA
GAATGTTGAAGCTATATTAGAAAAGATTACTACCGAAGTATTAGAATATGATGTTCTGTATAAACTAACTACATTAATTA
ACATCGATGTTTACCAAGTTAGGCTTTTACAAGCATTAGTACACTATCTTCAACAAATCAAATTTGCTTATAGTAAAGAC
TATGTTAAATCATTACTTATAAAACATTACCAATTTACTAATACACTTTTAAAATTATTTGATTATAGGTTTAATCCTAA
TACAGTTATAAAGCATGATATCGATAACATTGAGCAGGAATTTCTGAAACATTTAAATCTAATTGGAAGCAGCGCAGAAG
ATAAGGTACTAAGAACAATGTTGGCTCTAGTTAAGGCTATTTCCAGAACTAATTATTATCATCTTACTAAAAATGGCAAA
CGCAAAAATTATCTTTCTTTTAAAATTAAGTCACAATTAGTACCAGATTTACCTTTACCAATACCTTACGCTGAGATTTT
TGTGTTCTCTAATGAATTTGAAGGTATTCATTTACGAGGAGGAAAAGTAGCAAGAGGAGGAATTAGGTGGTCAGACCGTG
GAGAAGATTATAGAACTGAAGTTCTTGGATTAATGAAAGCTCAGATGACAAAAAATACTATCATTGTTCCTGTTGGATCT
AAAGGCGGTTTTTTTGTAAAAGTCTCTCCAGAAAATACTACTAATGTATCCTCTTATCAAAAATTAGCTGTAGAATGCTA
CAAAAATTTTCTTAGAGGATTATTAGATATTACAGATAACACAGTAACAGAGAAAATATTATCTCCTGAAAACACTGTAA
TTCAAAATGAAGACTATGATGATCCATATTTAGTAGTAGCAGCAGATAAAGGGACTGCTTCTTTTTCTGACCATGCCAAT
AAAATTTCTCAAGAATATGATTTTTGGTTAAGAGACGCTTTTGCATCAGGAGGTTCTGATGGCTATGACCATAAAAAAAT
GGGAATTACAGCTAAAGGAGCCTGGATATCAGTACAGCACCATTTTAGACATTTAGGTATTAATGTACAAAATGATGCTA
TTACTGTTGTTGGTATTGGGGATATGTCTGGGGATGTATTTGGTAATGGGATGCTTAGATCGGACGCAATAAAACTAGTA
GGAGCTTTTAATCACATGCATATTTTTGTTGATCCAAATCCAGATCCTAAGCAAAGTTATCAAGAACGGTTAAGATTATT
TCAGCTTCCTCATTCGAAATGGTCTGATTATGATCCAAAAGTATTATCTAAAGGTGGTGGAGTATTTTTACGCTCTGCTA
AAATCATTAAATTATCTTCAGAAGCTCAGAAGCTATTTAACCTTAGCAAGAATGAAGTTAAACCAGAAGAGTTGATTAAA
GCATTACTAAAAGCAAAAGTTGATTTAATCTGGAATGGGGGAATAGGAACTTACATTAAAGCATCAGATGAAAGCATGTT
CGATATTGGAGATAAGTCAAATGATGCATTACGCTGTAATGCAAAAGATATATCAGCGAAAGTAATAGCTGAAGGAGGAA
ATTTAGGAATATCACAACGTGGTCGTATTGAGTATGCAAGACAAGGCGGAAGAATTAATACTGACTTCATTGATAATTCA
GCTGGAGTAGAATGTTCTGATCATGAAGTTAATATTAAGATAGCGTTAAATAACGCCATGACTAAAAATAAGCTTACTTT
AAAAGAAAGAAATAAAATCTTAGAGCAAATGTCTCCAATGGTGGAAAAATTAGTTCTTGTTGATAATCATAAACAAAATC
AAGCCATTACTATTACTGAAAAGTCTAAACTATTCACTATGGAAATGTTTACAAATACGATTAAAACTCTTGAGCAAGCT
GGATTGCTAGATCGTACTGTCGAATTTTTACCATCAGATAATGAAATTGCTCAAAGATTACTTTCAAAAGAAAAAATGAC
AAGACCAGAGTTAGCAATTTTGTTATCCTACAGTAAAATGCATACATACGCAGAATTAATCAAAACTGATTTGGCTAGTG
AACCATTTTTAAGTAAGTATTTACTTAACTATTTTCCTGAATTAATGCAAAAAAGATTTTATGATGAAATCTCCACACAT
CCACTAAGAAAAGAGATTATTTTAACTGTATTAAGTAACAAGGTCATTAATCAGATTAGCGGGCCAATTCTTAATATGAT
ACAGAATGATACAAAAGCTACTCTTGATAATATAGTTAAAGCATATGTAATTACTAATGAAATTTTCTCTATAGATGAGT
TATGGCAAAATATTGATGATCTTGGTACTCATATTAATAATGAAGTACAAGTTATAATTTTTAGCGAAATAAATAAACTA
ATTAGAAGGGGTATAAGTTGGTTTATACAAAATACTGCTGAATTAGATATTACTAAAACTATCAATATCTATAAAAAGCC
TACTGTAGCATTGGCTAAGAAAATTTCTTCGTTATCATCTAGTATTACGGCAAAAGCTAAGGATAAATTTGATTATTATA
TTTCTCACAATATTCCTCAGAAGCTTGCTACTCATTTATCTAATATTGAATATCTAATCTCTGTTTTAGATATTATTTTA
GTCTCTGTAAATAGCAACTCAGATTATAATAAAGTTGCTAAAGCCTACTTTGCTGTAGGAGAAGCTTTAAGTTTATATTG
GTTAAGAAAATGTTGTGATCAGTTAATTAGCGATCATTATTGGAATAGACTAGCTATACGTTCTCTTAAAGAGGATTTAT
ATAACAAACAACGTAGATTACTATCTTGTATAATTACAACAAAACAACAGTTAACATTTGATCGCTGGTGGCAAAAAAAT
AAAGCTAATGCTGTAGCTTATCTTGATCTTATCAATGAAATAGCGATGCATAAAACAACAGTAGATTTGCACATGATTGT
TTTAGCTAATAAAAAATGCGAAACATTTTTAAATAAAGTTAGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATATAGTTTTACTAGTCATTTTTAGATATTACTTTATTCTTGCTGAAAGCTATAATATAACATAAACTATCGCTATTTT
AAAAATTATATTTTATATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATCTGTTGTCATAATGGTAGATAGTCGTAACCAAACGTATCAAATGTATACACTTAAAAAGTTTAAAATGACTAAGTTA
TTATAAGCTTTGCAGAGTTG

Product: NAD-glutamate dehydrogenase

Products: NA

Alternate protein names: NAD-GDH; NAD(+)-dependent glutamate dehydrogenase [H]

Number of amino acids: Translated: 1641; Mature: 1641

Protein sequence:

>1641_residues
MNNQDLDLTHSPTFSCDSTELQTEVVNAIKSEAKYSNDKLLVKFIKSFYSYIPIDYIENYNANFFKDTALSAYEFFLKKP
INKNYLVTISQSTQSREFPPFIEFKIINIDAAFIIDSIKSLLDRIGLEPFFFIHPIVIAQRSKDGKLVDVHPALQNRKSN
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NFTFLSCINYNISNKKSKLIAGHKAFFHEQDVENIVHLACNQHNDKKLILIGKINKPSTVHKSSFINYVLIKQQDQIGNL
NSAMVFLGLYSASTRQQSVQNIPILRDKLKDILSFSKFSSSSYNAKRFNAIFESLPREMLFEVSSENLYCACLKVLSAMH
NNALRLCLFPNCLNNIIDIIVFLPSARLTPNVHANITGRLIKAFNTKILSSELNTVPPNFCSIYISMSVDNNILANLNIK
ELESDLENLSAQWIESFKASLIKSYGLFEGLKLFKDNACIFPKNYIQNFNSTEAVSDLQYVIKAQKSGKKAFNFIVHSQH
MYSLKIYNPGSKLQLSQIFPLIENLNFNILDEQTFKISTENGRPLISQLALDSNKQEPIAIGNSLNVQQDLNALYSMNSN
QSDTWIYNFNLSPKIELTTLNLELMKKNVEAILEKITTEVLEYDVLYKLTTLINIDVYQVRLLQALVHYLQQIKFAYSKD
YVKSLLIKHYQFTNTLLKLFDYRFNPNTVIKHDIDNIEQEFLKHLNLIGSSAEDKVLRTMLALVKAISRTNYYHLTKNGK
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KGGFFVKVSPENTTNVSSYQKLAVECYKNFLRGLLDITDNTVTEKILSPENTVIQNEDYDDPYLVVAADKGTASFSDHAN
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GLLDRTVEFLPSDNEIAQRLLSKEKMTRPELAILLSYSKMHTYAELIKTDLASEPFLSKYLLNYFPELMQKRFYDEISTH
PLRKEIILTVLSNKVINQISGPILNMIQNDTKATLDNIVKAYVITNEIFSIDELWQNIDDLGTHINNEVQVIIFSEINKL
IRRGISWFIQNTAELDITKTINIYKKPTVALAKKISSLSSSITAKAKDKFDYYISHNIPQKLATHLSNIEYLISVLDIIL
VSVNSNSDYNKVAKAYFAVGEALSLYWLRKCCDQLISDHYWNRLAIRSLKEDLYNKQRRLLSCIITTKQQLTFDRWWQKN
KANAVAYLDLINEIAMHKTTVDLHMIVLANKKCETFLNKVS

Sequences:

>Translated_1641_residues
MNNQDLDLTHSPTFSCDSTELQTEVVNAIKSEAKYSNDKLLVKFIKSFYSYIPIDYIENYNANFFKDTALSAYEFFLKKP
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NFTFLSCINYNISNKKSKLIAGHKAFFHEQDVENIVHLACNQHNDKKLILIGKINKPSTVHKSSFINYVLIKQQDQIGNL
NSAMVFLGLYSASTRQQSVQNIPILRDKLKDILSFSKFSSSSYNAKRFNAIFESLPREMLFEVSSENLYCACLKVLSAMH
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ELESDLENLSAQWIESFKASLIKSYGLFEGLKLFKDNACIFPKNYIQNFNSTEAVSDLQYVIKAQKSGKKAFNFIVHSQH
MYSLKIYNPGSKLQLSQIFPLIENLNFNILDEQTFKISTENGRPLISQLALDSNKQEPIAIGNSLNVQQDLNALYSMNSN
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KANAVAYLDLINEIAMHKTTVDLHMIVLANKKCETFLNKVS
>Mature_1641_residues
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NSAMVFLGLYSASTRQQSVQNIPILRDKLKDILSFSKFSSSSYNAKRFNAIFESLPREMLFEVSSENLYCACLKVLSAMH
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YVKSLLIKHYQFTNTLLKLFDYRFNPNTVIKHDIDNIEQEFLKHLNLIGSSAEDKVLRTMLALVKAISRTNYYHLTKNGK
RKNYLSFKIKSQLVPDLPLPIPYAEIFVFSNEFEGIHLRGGKVARGGIRWSDRGEDYRTEVLGLMKAQMTKNTIIVPVGS
KGGFFVKVSPENTTNVSSYQKLAVECYKNFLRGLLDITDNTVTEKILSPENTVIQNEDYDDPYLVVAADKGTASFSDHAN
KISQEYDFWLRDAFASGGSDGYDHKKMGITAKGAWISVQHHFRHLGINVQNDAITVVGIGDMSGDVFGNGMLRSDAIKLV
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VSVNSNSDYNKVAKAYFAVGEALSLYWLRKCCDQLISDHYWNRLAIRSLKEDLYNKQRRLLSCIITTKQQLTFDRWWQKN
KANAVAYLDLINEIAMHKTTVDLHMIVLANKKCETFLNKVS

Specific function: Involved in arginine catabolism by converting L- glutamate, into 2-oxoglutarate, which is then channeled into the tricarboxylic acid cycle. Can also utilize other amino acids of the glutamate family [H]

COG id: COG2902

COG function: function code E; NAD-specific glutamate dehydrogenase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenases family [H]

Homologues:

Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6319986, Length=488, Percent_Identity=25, Blast_Score=72, Evalue=1e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR007780 [H]

Pfam domain/function: PF05088 Bac_GDH [H]

EC number: =1.4.1.2 [H]

Molecular weight: Translated: 187046; Mature: 187046

Theoretical pI: Translated: 8.77; Mature: 8.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNQDLDLTHSPTFSCDSTELQTEVVNAIKSEAKYSNDKLLVKFIKSFYSYIPIDYIENY
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC
NANFFKDTALSAYEFFLKKPINKNYLVTISQSTQSREFPPFIEFKIINIDAAFIIDSIKS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHH
LLDRIGLEPFFFIHPIVIAQRSKDGKLVDVHPALQNRKSNHITNSNIESLIVCKIHGTFD
HHHHHCCCCCHHHHHHHEEECCCCCCEEEECHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCHH
KKLLDNIKNQLTTILEQINKTSADWQPILHEIEKIIISLSCSSDQEEKSIIDFLHWLKSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCC
NFTFLSCINYNISNKKSKLIAGHKAFFHEQDVENIVHLACNQHNDKKLILIGKINKPSTV
CEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCH
HKSSFINYVLIKQQDQIGNLNSAMVFLGLYSASTRQQSVQNIPILRDKLKDILSFSKFSS
HHHCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHEEEHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
SSYNAKRFNAIFESLPREMLFEVSSENLYCACLKVLSAMHNNALRLCLFPNCLNNIIDII
CCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
VFLPSARLTPNVHANITGRLIKAFNTKILSSELNTVPPNFCSIYISMSVDNNILANLNIK
HHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCEEECCCHH
ELESDLENLSAQWIESFKASLIKSYGLFEGLKLFKDNACIFPKNYIQNFNSTEAVSDLQY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHCCCCCHHHHHHHHH
VIKAQKSGKKAFNFIVHSQHMYSLKIYNPGSKLQLSQIFPLIENLNFNILDEQTFKISTE
HHHHHHCCHHHHHHEEECCEEEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEEEECC
NGRPLISQLALDSNKQEPIAIGNSLNVQQDLNALYSMNSNQSDTWIYNFNLSPKIELTTL
CCCHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEE
NLELMKKNVEAILEKITTEVLEYDVLYKLTTLINIDVYQVRLLQALVHYLQQIKFAYSKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVKSLLIKHYQFTNTLLKLFDYRFNPNTVIKHDIDNIEQEFLKHLNLIGSSAEDKVLRTM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
LALVKAISRTNYYHLTKNGKRKNYLSFKIKSQLVPDLPLPIPYAEIFVFSNEFEGIHLRG
HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEC
GKVARGGIRWSDRGEDYRTEVLGLMKAQMTKNTIIVPVGSKGGFFVKVSPENTTNVSSYQ
CEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCHHHHH
KLAVECYKNFLRGLLDITDNTVTEKILSPENTVIQNEDYDDPYLVVAADKGTASFSDHAN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHH
KISQEYDFWLRDAFASGGSDGYDHKKMGITAKGAWISVQHHFRHLGINVQNDAITVVGIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHCCEECCCEEEEEEEC
DMSGDVFGNGMLRSDAIKLVGAFNHMHIFVDPNPDPKQSYQERLRLFQLPHSKWSDYDPK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEECEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
VLSKGGGVFLRSAKIIKLSSEAQKLFNLSKNEVKPEELIKALLKAKVDLIWNGGIGTYIK
HHCCCCCEEEECEEEEEECHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCEEE
ASDESMFDIGDKSNDALRCNAKDISAKVIAEGGNLGISQRGRIEYARQGGRINTDFIDNS
ECCCCEEECCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCEECCCCCCC
AGVECSDHEVNIKIALNNAMTKNKLTLKERNKILEQMSPMVEKLVLVDNHKQNQAITITE
CCCEECCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE
KSKLFTMEMFTNTIKTLEQAGLLDRTVEFLPSDNEIAQRLLSKEKMTRPELAILLSYSKM
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHH
HTYAELIKTDLASEPFLSKYLLNYFPELMQKRFYDEISTHPLRKEIILTVLSNKVINQIS
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GPILNMIQNDTKATLDNIVKAYVITNEIFSIDELWQNIDDLGTHINNEVQVIIFSEINKL
CHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHH
IRRGISWFIQNTAELDITKTINIYKKPTVALAKKISSLSSSITAKAKDKFDYYISHNIPQ
HHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHH
KLATHLSNIEYLISVLDIILVSVNSNSDYNKVAKAYFAVGEALSLYWLRKCCDQLISDHY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WNRLAIRSLKEDLYNKQRRLLSCIITTKQQLTFDRWWQKNKANAVAYLDLINEIAMHKTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEE
VDLHMIVLANKKCETFLNKVS
EEEEEEEEECCHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNNQDLDLTHSPTFSCDSTELQTEVVNAIKSEAKYSNDKLLVKFIKSFYSYIPIDYIENY
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCC
NANFFKDTALSAYEFFLKKPINKNYLVTISQSTQSREFPPFIEFKIINIDAAFIIDSIKS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHH
LLDRIGLEPFFFIHPIVIAQRSKDGKLVDVHPALQNRKSNHITNSNIESLIVCKIHGTFD
HHHHHCCCCCHHHHHHHEEECCCCCCEEEECHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCHH
KKLLDNIKNQLTTILEQINKTSADWQPILHEIEKIIISLSCSSDQEEKSIIDFLHWLKSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCC
NFTFLSCINYNISNKKSKLIAGHKAFFHEQDVENIVHLACNQHNDKKLILIGKINKPSTV
CEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCH
HKSSFINYVLIKQQDQIGNLNSAMVFLGLYSASTRQQSVQNIPILRDKLKDILSFSKFSS
HHHCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHEEEHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
SSYNAKRFNAIFESLPREMLFEVSSENLYCACLKVLSAMHNNALRLCLFPNCLNNIIDII
CCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHH
VFLPSARLTPNVHANITGRLIKAFNTKILSSELNTVPPNFCSIYISMSVDNNILANLNIK
HHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCEEECCCHH
ELESDLENLSAQWIESFKASLIKSYGLFEGLKLFKDNACIFPKNYIQNFNSTEAVSDLQY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHCCCCCHHHHHHHHH
VIKAQKSGKKAFNFIVHSQHMYSLKIYNPGSKLQLSQIFPLIENLNFNILDEQTFKISTE
HHHHHHCCHHHHHHEEECCEEEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEEEECC
NGRPLISQLALDSNKQEPIAIGNSLNVQQDLNALYSMNSNQSDTWIYNFNLSPKIELTTL
CCCHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEE
NLELMKKNVEAILEKITTEVLEYDVLYKLTTLINIDVYQVRLLQALVHYLQQIKFAYSKD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVKSLLIKHYQFTNTLLKLFDYRFNPNTVIKHDIDNIEQEFLKHLNLIGSSAEDKVLRTM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
LALVKAISRTNYYHLTKNGKRKNYLSFKIKSQLVPDLPLPIPYAEIFVFSNEFEGIHLRG
HHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEC
GKVARGGIRWSDRGEDYRTEVLGLMKAQMTKNTIIVPVGSKGGFFVKVSPENTTNVSSYQ
CEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCHHHHH
KLAVECYKNFLRGLLDITDNTVTEKILSPENTVIQNEDYDDPYLVVAADKGTASFSDHAN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHH
KISQEYDFWLRDAFASGGSDGYDHKKMGITAKGAWISVQHHFRHLGINVQNDAITVVGIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEHHHHHHHHCCEECCCEEEEEEEC
DMSGDVFGNGMLRSDAIKLVGAFNHMHIFVDPNPDPKQSYQERLRLFQLPHSKWSDYDPK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHEEECEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
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