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The map label for this gene is ydaM [H]

Identifier: 148284621

GI number: 148284621

Start: 1093163

End: 1094914

Strand: Direct

Name: ydaM [H]

Synonym: OTBS_1111

Alternate gene names: 148284621

Gene position: 1093163-1094914 (Clockwise)

Preceding gene: 148284620

Following gene: 148284622

Centisome position: 51.39

GC content: 28.25

Gene sequence:

>1752_bases
ATGGATAAAGAATTAGATTTATTAGTTATATCAATTGATAATTTTATTTGTAATATTCAAGATGGTGATATAGATAGCTT
AGAATCCTTGTTAGTTAAAGGCCTAACTACTGAGACTGAGGTATTAGATACAATTCAAAAAGAATGCAAGCTTGAGCTAA
TTAACACTAAGCAACTCATAAAATATAATGTACTTGACCACATCAGGCAAAGCGAATATTGCCAAAAACGATATTTGTTG
TGTACTGATATTGATCAAAATAAGATAATAGTATTAAACAATTATAACCCTTTAAAAATAAAATTAATTGCTCAACATTT
CTCAACTTATCTAGTTAAATTAGTTAGCAAACAAGATTTTTTTTCTCTGATCGATCACTCTTTTAAAAGACTAAATGTTG
CAAGATCTAAATATTTGCTTGATTTGCATAATGATAAGGTCAATGCTAAAAATATTAACTATGTTTTACTTACTGGAAAA
ATTATCTTAACACTAAGTTTTTTTCATCAGTTTTCTAGAGAAGGGTTTTTATTCATTATGCATTTACTATACTTTGCGCA
TGGTGTTTTAAAGTTATTATTATTTAAAGTAGCTATGTTAAGATATCAACTTCATTTAAGTAGTTTATATTATAGTGTAG
AGCTTTTTCCATTTTATACTATTTTAGTACCTTTATATCATGAAGTAGAGAAGCTTAGAGACATAGTTAAAGCAATAGAG
TTACTTAATTATCCTAAAAACAGAATTGAGGTAAAAATTATTATTGAGGAAGATGATGTATATACTATGCTTGAGCTGAC
TACAATGCATCTAGCTCATTATTTTCATGTTATTAAAGTACCTTTCTCATTTCCTCAAACTAAGCCTAAAGCATTAAATT
ATGCAATGAATTATATTGTCGGAGAGTATATCACTGTCTATGATGCTGAAGACAGTCCAGAACCTGATCAATTATTAAAA
GTAATATATCATTTTCAAAATTTGCAACCTGATTATCAATGTATACAAGCTAGAATTAACTTTTATAACAAAAATGAAAA
TGTATTAACTAAGTTAATGAGCATAGAATATTGCTTATGGTTTGATTTTTTTTTGTATGGATTAACATGTTTAGGGCTGC
CTGTAACTTTAGGCGGAACTAGCAATCATTGTAGAGCAAAGATGCTAAAATCTTTAGGTTACTGGGATGCTTATAATGTT
ACTGAAGATGCTGACTTAGGATTAAGAATTTATATTGCTGGATTTAAAACTGCAGTTATTGATTCTTATACTTATGGTGA
AGCTGTGATTGATTGTAAAGGATGGTTGCATCAAAGATCAAGATGGATTAAAGGGTTTATTCAAACTTCCTTTGTTTTTA
TGAGTTATAATAAAAATATAAGAAATAGATTGGGGTTATGTGCTAATATTTGTATCTGCCTTTTTATATTGTTCTCGCCT
CTTATGTTTTTATTTATTCCGCTATGGCTTATTAGTGGTATAATTGATAATGACTGTACATTAGGAACAATATTGTGGTA
TAATATGCTTTTTGCGTTAGCTTATATGCATGTGATGTCTTGGATAGCATTGTGTAGGATTAAAGGTCATTGGAGCAATT
TGACATTACAAGACTTATTATGTTTTATAATTTGGCCGCTATATTCTATGTTACATGTAATAGCAAGCTATAAAGCAATT
TTTGAACTATGTGTTAAACCGTTTAAATGGAATAAGACAAAACATGGAGTTAGTCGCATTAATATTAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAAAAAAGATCAATTAGAATTAACAGTCCAGTTTGGCATTTTTATGGAACGTTATAGAGCATATAAAGGACCTAATAGC
AAAGGAATAGTAGTAGGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGTTAAATCAAAGGTTTGTTACTATAAAAAGTAAGTTATTATGAGAATTAGTATTATTTGCAAGTATGTATTTAAGTAT
TTATTGCTAGGAATAAATAT

Product: putative glycosyl transferase, group 2

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 583; Mature: 583

Protein sequence:

>583_residues
MDKELDLLVISIDNFICNIQDGDIDSLESLLVKGLTTETEVLDTIQKECKLELINTKQLIKYNVLDHIRQSEYCQKRYLL
CTDIDQNKIIVLNNYNPLKIKLIAQHFSTYLVKLVSKQDFFSLIDHSFKRLNVARSKYLLDLHNDKVNAKNINYVLLTGK
IILTLSFFHQFSREGFLFIMHLLYFAHGVLKLLLFKVAMLRYQLHLSSLYYSVELFPFYTILVPLYHEVEKLRDIVKAIE
LLNYPKNRIEVKIIIEEDDVYTMLELTTMHLAHYFHVIKVPFSFPQTKPKALNYAMNYIVGEYITVYDAEDSPEPDQLLK
VIYHFQNLQPDYQCIQARINFYNKNENVLTKLMSIEYCLWFDFFLYGLTCLGLPVTLGGTSNHCRAKMLKSLGYWDAYNV
TEDADLGLRIYIAGFKTAVIDSYTYGEAVIDCKGWLHQRSRWIKGFIQTSFVFMSYNKNIRNRLGLCANICICLFILFSP
LMFLFIPLWLISGIIDNDCTLGTILWYNMLFALAYMHVMSWIALCRIKGHWSNLTLQDLLCFIIWPLYSMLHVIASYKAI
FELCVKPFKWNKTKHGVSRININ

Sequences:

>Translated_583_residues
MDKELDLLVISIDNFICNIQDGDIDSLESLLVKGLTTETEVLDTIQKECKLELINTKQLIKYNVLDHIRQSEYCQKRYLL
CTDIDQNKIIVLNNYNPLKIKLIAQHFSTYLVKLVSKQDFFSLIDHSFKRLNVARSKYLLDLHNDKVNAKNINYVLLTGK
IILTLSFFHQFSREGFLFIMHLLYFAHGVLKLLLFKVAMLRYQLHLSSLYYSVELFPFYTILVPLYHEVEKLRDIVKAIE
LLNYPKNRIEVKIIIEEDDVYTMLELTTMHLAHYFHVIKVPFSFPQTKPKALNYAMNYIVGEYITVYDAEDSPEPDQLLK
VIYHFQNLQPDYQCIQARINFYNKNENVLTKLMSIEYCLWFDFFLYGLTCLGLPVTLGGTSNHCRAKMLKSLGYWDAYNV
TEDADLGLRIYIAGFKTAVIDSYTYGEAVIDCKGWLHQRSRWIKGFIQTSFVFMSYNKNIRNRLGLCANICICLFILFSP
LMFLFIPLWLISGIIDNDCTLGTILWYNMLFALAYMHVMSWIALCRIKGHWSNLTLQDLLCFIIWPLYSMLHVIASYKAI
FELCVKPFKWNKTKHGVSRININ
>Mature_583_residues
MDKELDLLVISIDNFICNIQDGDIDSLESLLVKGLTTETEVLDTIQKECKLELINTKQLIKYNVLDHIRQSEYCQKRYLL
CTDIDQNKIIVLNNYNPLKIKLIAQHFSTYLVKLVSKQDFFSLIDHSFKRLNVARSKYLLDLHNDKVNAKNINYVLLTGK
IILTLSFFHQFSREGFLFIMHLLYFAHGVLKLLLFKVAMLRYQLHLSSLYYSVELFPFYTILVPLYHEVEKLRDIVKAIE
LLNYPKNRIEVKIIIEEDDVYTMLELTTMHLAHYFHVIKVPFSFPQTKPKALNYAMNYIVGEYITVYDAEDSPEPDQLLK
VIYHFQNLQPDYQCIQARINFYNKNENVLTKLMSIEYCLWFDFFLYGLTCLGLPVTLGGTSNHCRAKMLKSLGYWDAYNV
TEDADLGLRIYIAGFKTAVIDSYTYGEAVIDCKGWLHQRSRWIKGFIQTSFVFMSYNKNIRNRLGLCANICICLFILFSP
LMFLFIPLWLISGIIDNDCTLGTILWYNMLFALAYMHVMSWIALCRIKGHWSNLTLQDLLCFIIWPLYSMLHVIASYKAI
FELCVKPFKWNKTKHGVSRININ

Specific function: Unknown

COG id: COG1215

COG function: function code M; Glycosyltransferases, probably involved in cell wall biogenesis

Gene ontology:

Cell location: Membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the glycosyltransferase 2 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001173 [H]

Pfam domain/function: PF00535 Glycos_transf_2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68323; Mature: 68323

Theoretical pI: Translated: 8.02; Mature: 8.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.7 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
5.1 %Cys+Met (Translated Protein)
2.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
5.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDKELDLLVISIDNFICNIQDGDIDSLESLLVKGLTTETEVLDTIQKECKLELINTKQLI
CCCCEEEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEEHCCHHHHH
KYNVLDHIRQSEYCQKRYLLCTDIDQNKIIVLNNYNPLKIKLIAQHFSTYLVKLVSKQDF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSLIDHSFKRLNVARSKYLLDLHNDKVNAKNINYVLLTGKIILTLSFFHQFSREGFLFIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
HLLYFAHGVLKLLLFKVAMLRYQLHLSSLYYSVELFPFYTILVPLYHEVEKLRDIVKAIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNYPKNRIEVKIIIEEDDVYTMLELTTMHLAHYFHVIKVPFSFPQTKPKALNYAMNYIV
HHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
GEYITVYDAEDSPEPDQLLKVIYHFQNLQPDYQCIQARINFYNKNENVLTKLMSIEYCLW
HCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FDFFLYGLTCLGLPVTLGGTSNHCRAKMLKSLGYWDAYNVTEDADLGLRIYIAGFKTAVI
HHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHH
DSYTYGEAVIDCKGWLHQRSRWIKGFIQTSFVFMSYNKNIRNRLGLCANICICLFILFSP
CCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMFLFIPLWLISGIIDNDCTLGTILWYNMLFALAYMHVMSWIALCRIKGHWSNLTLQDLL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
CFIIWPLYSMLHVIASYKAIFELCVKPFKWNKTKHGVSRININ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCC
>Mature Secondary Structure
MDKELDLLVISIDNFICNIQDGDIDSLESLLVKGLTTETEVLDTIQKECKLELINTKQLI
CCCCEEEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEEHCCHHHHH
KYNVLDHIRQSEYCQKRYLLCTDIDQNKIIVLNNYNPLKIKLIAQHFSTYLVKLVSKQDF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSLIDHSFKRLNVARSKYLLDLHNDKVNAKNINYVLLTGKIILTLSFFHQFSREGFLFIM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
HLLYFAHGVLKLLLFKVAMLRYQLHLSSLYYSVELFPFYTILVPLYHEVEKLRDIVKAIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNYPKNRIEVKIIIEEDDVYTMLELTTMHLAHYFHVIKVPFSFPQTKPKALNYAMNYIV
HHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
GEYITVYDAEDSPEPDQLLKVIYHFQNLQPDYQCIQARINFYNKNENVLTKLMSIEYCLW
HCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
FDFFLYGLTCLGLPVTLGGTSNHCRAKMLKSLGYWDAYNVTEDADLGLRIYIAGFKTAVI
HHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHH
DSYTYGEAVIDCKGWLHQRSRWIKGFIQTSFVFMSYNKNIRNRLGLCANICICLFILFSP
CCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMFLFIPLWLISGIIDNDCTLGTILWYNMLFALAYMHVMSWIALCRIKGHWSNLTLQDLL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
CFIIWPLYSMLHVIASYKAIFELCVKPFKWNKTKHGVSRININ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9341680; 9384377 [H]