Definition Vibrio cholerae O395 chromosome 2, complete sequence.
Accession NC_009457
Length 3,024,069

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The map label for this gene is 147675323

Identifier: 147675323

GI number: 147675323

Start: 1456728

End: 1458848

Strand: Reverse

Name: 147675323

Synonym: VC0395_A1362

Alternate gene names: NA

Gene position: 1458848-1456728 (Counterclockwise)

Preceding gene: 147674712

Following gene: 147673520

Centisome position: 48.24

GC content: 41.35

Gene sequence:

>2121_bases
ATGACCGATAGCCTTAATCTTTCCAGCTTATGGCCAGACTTGAGCAGTCTAAATGTAATGCCACCTCAAACTCCTGAGCA
ATTGAGTGCTTTGTTTGTGGTTATTTTATGGGGTGTCGCTCTATTTTTCTTAATTTGGTCAGTTGCTGCATTTATTCGCG
CAAGACAACGAGTAGTTTGGCTTAACAAATCTTTGGATGATGCGGAGAAATCGACTCTGTCAGGTGTTCGAAATGATTTA
ATTTCTAGAGCTGAACAAAAAAAAGATTCAGTAGGGCATTTATGGCTCGAGTTTGATGAAACATTGCTTGAAGTAAAAGG
TGCTGATGACGTTGTTCGATTGCATAACACATTTGATGCTGACTATTTTTTTAATAGTTCTAGTTTAGCTGGTGGTAGTA
CTGAAAACAGAATGATTGCGGTGGTTCCAGGCTTTTTAACGGCTCTGGGTGTTATTGGTACTTTTGTCGGTTTACAGCTA
GGACTTTCAGATCTCAATATCGCGGGCAACGTTGATGTCAATGAAATGAAAAATGGCGTTGCTGGAGTTATAAATGGTGC
AAAAATCGCATTTATGACATCGGTTTGGGGCGTGCTACTCAGTGTTGCATTTAATTTCATTGAGAAGATACTTGAGCAAA
TTATTAGAAAGAAAATTAAGTCTTTGCAAAACCGTATTGACAGGATGTTCCCTCGATTAAGTGCGGAATATCAACTGCAA
TCTATTGCAAATAACAGCCAGCAATCTCGAGAAAGCCTACAAGGACTTGCTGAGAAAATAGGCGAGAAAATGCAGGAGTC
ACTCATTCAGGCAACTCAGGGTATTCAACAAGGTCTCGAGAGTAGTCTGGAAAAAATCATGGCTCCGGCTATCAATAAGC
TCGTTGACGAAACATCTGACGGGAATCAAAAAGCACTGGAAAGCGTTCTTCAATCTTTCATGGAGGGTTTTGGTCAACAA
GGCGAACAACAACGTGTCGCGATGGACTCTGCGTCTCAAAACGTAAATAAGACGCTAGAATCAATGAGCGTTTCGATGGC
TGCTTTCGTCAATAAGTTGGAAGTTCAGCAAAACGCATCTTCAGAAAGAGAGAAAGAACTGATCTCAACTATTTCAGTTC
AAGTTTCTGAGCTAGTTACTCAGGGTAATGAGCAGAAGCGTGTTCTAACAGAGTTTGTAGAAAAACAAGTCTCAGAGTTA
GGTGAGCAGCTTACTAAAAGAGAATTAGCTGCTTCTGAACGTGAACAGAAATTGGCTTCCTCAATGGAAAGTACGATTAA
AGATTTAGTAGAAAATGTTTCAGCACAAAGCCAAGTCTTGACCGATTTTGTTCAGAATCAAGTTGTCCAACTTACCCAAA
CGTTCTCCGAACGAGATGGAATGGCAAGTCAGATGGAAAAAGAGCGTAATGATATATTTGTGAATCAAACGCAGGCGATG
AAAGCTGGAACGGATGAGCTTCTTGCTCAAGTGAAAGCGGCGACTGAATCACAACAAATCACAACTAATAGTATTATTGA
GCAAGGTAAACAATTACAAAATAGTATCGATTCCTCTGTTTCGGCATCTGCTCGAGCTACGGAGAGTATGCAGCAGTCGG
CGAATGAGTTACGAGTTGCCGCTGATAGTATGAATGTGTTTGGTTCCAACATCAAAGATGCGGGCAACAAACTATCTGGT
GCTGTTACTGAAGCGGTTAACAGCACGAAGGATTTAGCGGAACAAAACCATCTAGGCGCAGTGAAAGTTCAAGCGTTGAG
GGAGCAGTTGCTGGAAGATACAAGTAAGTTTAGCGCGATTGCAGATCAGATAAACAATATGCTGATTAGTGCAGAACAGT
CGTTTAGCACGCTTCGTACTACCCAAAATGAGTTCCTTGCAGAACAAAAAGGTAATCTAAACGAACTCACTTCAGAAATG
AAACGTAATGTGAAAGAGTTGACGGAGCAAATGGCTCAACTGCTTGAAGATTACGCAGAGCAAGCCAATGGACAAACCGC
CGAGCACCTCAAAGTTTGGGCCAATAGTAGCACACAATATGCAGAGAGCATGAATACAGCAGTTAGAGCTATTTCTAGTG
TTGTCGATGAAATTCAAGATAAAGTGAGCCAACATGCGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCCAGCTTTTAAAGCGTCTTGGACGCAGAGCATGCAGCGTATGGTTGGGATGTAAAGTCCCAATATTGAAGAACATATT
TATTAAATAACTAAATTTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGTGTTCGTTCGCATACACAAAACTCAGTAGATGAAGAAAATCCCTACTGGGTTTCATTTTCCGATCTAATGTCTGCTT
TGCTTGTTATATTTATACTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Methyl-Accepting Chemotaxis Sensory Transducer

Number of amino acids: Translated: 706; Mature: 705

Protein sequence:

>706_residues
MTDSLNLSSLWPDLSSLNVMPPQTPEQLSALFVVILWGVALFFLIWSVAAFIRARQRVVWLNKSLDDAEKSTLSGVRNDL
ISRAEQKKDSVGHLWLEFDETLLEVKGADDVVRLHNTFDADYFFNSSSLAGGSTENRMIAVVPGFLTALGVIGTFVGLQL
GLSDLNIAGNVDVNEMKNGVAGVINGAKIAFMTSVWGVLLSVAFNFIEKILEQIIRKKIKSLQNRIDRMFPRLSAEYQLQ
SIANNSQQSRESLQGLAEKIGEKMQESLIQATQGIQQGLESSLEKIMAPAINKLVDETSDGNQKALESVLQSFMEGFGQQ
GEQQRVAMDSASQNVNKTLESMSVSMAAFVNKLEVQQNASSEREKELISTISVQVSELVTQGNEQKRVLTEFVEKQVSEL
GEQLTKRELAASEREQKLASSMESTIKDLVENVSAQSQVLTDFVQNQVVQLTQTFSERDGMASQMEKERNDIFVNQTQAM
KAGTDELLAQVKAATESQQITTNSIIEQGKQLQNSIDSSVSASARATESMQQSANELRVAADSMNVFGSNIKDAGNKLSG
AVTEAVNSTKDLAEQNHLGAVKVQALREQLLEDTSKFSAIADQINNMLISAEQSFSTLRTTQNEFLAEQKGNLNELTSEM
KRNVKELTEQMAQLLEDYAEQANGQTAEHLKVWANSSTQYAESMNTAVRAISSVVDEIQDKVSQHA

Sequences:

>Translated_706_residues
MTDSLNLSSLWPDLSSLNVMPPQTPEQLSALFVVILWGVALFFLIWSVAAFIRARQRVVWLNKSLDDAEKSTLSGVRNDL
ISRAEQKKDSVGHLWLEFDETLLEVKGADDVVRLHNTFDADYFFNSSSLAGGSTENRMIAVVPGFLTALGVIGTFVGLQL
GLSDLNIAGNVDVNEMKNGVAGVINGAKIAFMTSVWGVLLSVAFNFIEKILEQIIRKKIKSLQNRIDRMFPRLSAEYQLQ
SIANNSQQSRESLQGLAEKIGEKMQESLIQATQGIQQGLESSLEKIMAPAINKLVDETSDGNQKALESVLQSFMEGFGQQ
GEQQRVAMDSASQNVNKTLESMSVSMAAFVNKLEVQQNASSEREKELISTISVQVSELVTQGNEQKRVLTEFVEKQVSEL
GEQLTKRELAASEREQKLASSMESTIKDLVENVSAQSQVLTDFVQNQVVQLTQTFSERDGMASQMEKERNDIFVNQTQAM
KAGTDELLAQVKAATESQQITTNSIIEQGKQLQNSIDSSVSASARATESMQQSANELRVAADSMNVFGSNIKDAGNKLSG
AVTEAVNSTKDLAEQNHLGAVKVQALREQLLEDTSKFSAIADQINNMLISAEQSFSTLRTTQNEFLAEQKGNLNELTSEM
KRNVKELTEQMAQLLEDYAEQANGQTAEHLKVWANSSTQYAESMNTAVRAISSVVDEIQDKVSQHA
>Mature_705_residues
TDSLNLSSLWPDLSSLNVMPPQTPEQLSALFVVILWGVALFFLIWSVAAFIRARQRVVWLNKSLDDAEKSTLSGVRNDLI
SRAEQKKDSVGHLWLEFDETLLEVKGADDVVRLHNTFDADYFFNSSSLAGGSTENRMIAVVPGFLTALGVIGTFVGLQLG
LSDLNIAGNVDVNEMKNGVAGVINGAKIAFMTSVWGVLLSVAFNFIEKILEQIIRKKIKSLQNRIDRMFPRLSAEYQLQS
IANNSQQSRESLQGLAEKIGEKMQESLIQATQGIQQGLESSLEKIMAPAINKLVDETSDGNQKALESVLQSFMEGFGQQG
EQQRVAMDSASQNVNKTLESMSVSMAAFVNKLEVQQNASSEREKELISTISVQVSELVTQGNEQKRVLTEFVEKQVSELG
EQLTKRELAASEREQKLASSMESTIKDLVENVSAQSQVLTDFVQNQVVQLTQTFSERDGMASQMEKERNDIFVNQTQAMK
AGTDELLAQVKAATESQQITTNSIIEQGKQLQNSIDSSVSASARATESMQQSANELRVAADSMNVFGSNIKDAGNKLSGA
VTEAVNSTKDLAEQNHLGAVKVQALREQLLEDTSKFSAIADQINNMLISAEQSFSTLRTTQNEFLAEQKGNLNELTSEMK
RNVKELTEQMAQLLEDYAEQANGQTAEHLKVWANSSTQYAESMNTAVRAISSVVDEIQDKVSQHA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77681; Mature: 77550

Theoretical pI: Translated: 4.49; Mature: 4.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TDSLNLSSLWPDLSSLNVMPPQTPEQLSALFVVILWGVALFFLIWSVAAFIRARQRVVW
CCCCCHHHHCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNKSLDDAEKSTLSGVRNDLISRAEQKKDSVGHLWLEFDETLLEVKGADDVVRLHNTFDA
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCC
DYFFNSSSLAGGSTENRMIAVVPGFLTALGVIGTFVGLQLGLSDLNIAGNVDVNEMKNGV
HHEECCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCHHHHHCCH
AGVINGAKIAFMTSVWGVLLSVAFNFIEKILEQIIRKKIKSLQNRIDRMFPRLSAEYQLQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SIANNSQQSRESLQGLAEKIGEKMQESLIQATQGIQQGLESSLEKIMAPAINKLVDETSD
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GNQKALESVLQSFMEGFGQQGEQQRVAMDSASQNVNKTLESMSVSMAAFVNKLEVQQNAS
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SEREKELISTISVQVSELVTQGNEQKRVLTEFVEKQVSELGEQLTKRELAASEREQKLAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SMESTIKDLVENVSAQSQVLTDFVQNQVVQLTQTFSERDGMASQMEKERNDIFVNQTQAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCEEECHHHHH
KAGTDELLAQVKAATESQQITTNSIIEQGKQLQNSIDSSVSASARATESMQQSANELRVA
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ADSMNVFGSNIKDAGNKLSGAVTEAVNSTKDLAEQNHLGAVKVQALREQLLEDTSKFSAI
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ADQINNMLISAEQSFSTLRTTQNEFLAEQKGNLNELTSEMKRNVKELTEQMAQLLEDYAE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QANGQTAEHLKVWANSSTQYAESMNTAVRAISSVVDEIQDKVSQHA
HCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA