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The map label for this gene is ybaL [H]

Identifier: 146302743

GI number: 146302743

Start: 6053635

End: 6055872

Strand: Direct

Name: ybaL [H]

Synonym: Fjoh_5016

Alternate gene names: 146302743

Gene position: 6053635-6055872 (Clockwise)

Preceding gene: 146302742

Following gene: 146302746

Centisome position: 99.29

GC content: 36.15

Gene sequence:

>2238_bases
ATGATTGCCTTAAATGCCGCTGCCGAATCGACACACCATTTGCAACCCCTTATCAGTGATCTGGGATTAATTTTGATGAC
TGCCGGAATCGCAGTTCTTATATTTAAAAAAATGAAACAGCCCTTGGTTTTGGGTTACCTGATTGCAGGTTTTTTAGCCG
GAAACCATTTTGATTTTTTCCCTTCAATAACCGACATGAAAAGTGTTGAAGTTTGGGCAGAAATTGGGGTTATATTTTTA
TTATTCAGTTTAGGACTCGAATTCAGCTTTAAAAAATTAATGAAAGTCGGCGGGACATCTTCCGTCACCGCAATAACCCA
GATTTTATTCATGACACTTATTGGATATTGTGTGGGCCAATGGATGGGCTGGGGACAAATGGATAGTATTTTTCTTGGTG
CAACACTTTCGATTTCCTCAACAACTATTATTATCAGAGCTTTTGACGAATTAGGTGTAAAGGGAAAAAAGTTCGTTGGG
ATTGTATTTGGAGCCCTGATTGTTGAAGATATCGTAGCCATTTTAATGCTCGTATTATTATCGACCATTGCAGTGAGCGA
CCAGGTATCTGGAGGCGAATTATTACAATCCGTTTTAAAATTAGTTTTCTTTTTAATTATATGGTTTTTGGGCGGAATCT
TTATTATTCCTACCATTTTGAAAAAAGCCAAACATCTTTTAACCGATGAAATGCTGCTTATTATTTCATTGGCATTATGT
TTAATGATGGTGATTTTTGCAGCAAATGTTGGTTTCTCTCCCGCTTTAGGAGCCTTTATAATGGGTTCTATTATTGCTGA
AACTACAATGGCAGAAAAAATCGAACATTTAATTCAGCCCGTAAAAGATTTATTTGGTGCTGTTTTCTTTGTATCCGTGG
GAATGTTAATTAACCCGGAAACATTGGTAACTTATGCCCTTCCGGTGGCTTTAATTACACTTTTAACCATTTTCGGAAAA
GCGTTCAGTTCTTCTATCGGAGCTTTAATTTCCGGACAGCCTTTAAAACAATCTGTTCAAACCGGAATGAGTTTAGCACA
AATTGGAGAGTTTTCTTTTATTATTGCAACACTGGGTATGACCTTAAAAGTTACAAGCGATTTCTTGTATCCTATAATAG
TTGCCGTATCTGCTATTACAACTTTTACTACACCATTTTTAATTAAATATTCCGAATCTTTTGCCCAGTTTCTGGAACAA
AAAATGCCAAAAAGATGGGTTAAAAACATTAACCGTTACAGCGTAAATGCGCAGGCTATTAAATCTGTAAGCACCTGGCA
GATTGTATTAAGATCATCAATTACACAAATTATACTGCACACTATAATTATTACGGCTATAATTTTATTATCGTCAAAAT
TTGTAGCACCATTAGTAGCCGATACACGATTTGGAAATACATTGGCCGCTTTATTGACATTGGTTGTAATTGCTCCGTTT
TTATGGGCGCTTTCACTACGCCGTGTAAAAGTTGACGAAGTCGAAGCACTTTGGGAAGAACGTAAATACAGAGGCGCACT
TTTAATGCTTATTTTAATTCGAATGAGCCTTGGATTATTTTTCGTTGGATTCTTATTGAATATTTTCTTCTCACCTTTAG
TGGCTTTTGTAGCCTTGATTATTGCAATTGGAGCGTATCAAATTTTCCCTAAAAAACTAAACGAACAATACCACCGAATT
GAAAATCACTTTTTGAAAAACCTAAACGATCGTGAAAACAAAAAGATCGACAGACGATATGCTAATTTAATGCCATGGGA
CGGTCACATGTCATTTTTTGATATTGGAAAAGAATCTAATTTAGCAGGCAAAACATTAGAAGAATTAAAGATTCGTGAAC
AATTAGGAATCAATATTGCCTACATTAAACGAGGTGAAGTAACCATTCCGATTCCTATGAAAACTGAACGTTTGTTTCCC
GGAGATGAAATCTGTGTTATTGGTACTGATGCCCAAATTACTGAGTTTACCAAGTATTTAAACCACAATGAAACGGAAGC
TCCGCCAAAAGTAGAGGAAACCGACATTGTACTGCGTCAGCTTGAAGTTTCTCAGGAAGAATTTATTCAAAAAAGCATCG
GCCAGTTTAGAGCCAAAACAAACGGAATGGTTGTGGGAATTGAACGAAACGGAAATCGTATCTTAAATCCTGAATCTAGT
TTAATTTTAGAGAAAAACGACATTCTTTGGGTTGTAGGAGACAAAAAAAGAATGACCGCTTTGTTGACGGCAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTATCTTTATCGAGATAGCTTTTTTTATTTAACCGGAACAGTTCAGTGAATCTATTTGAGATTAAAAACTGAATAGACTC
CTGAAAACAAATACCACTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGTGCTGAGATGCGCTAAGGTGCTAAGGTTCTGAGACACTAAGGTTCTGAGGGACTAAGTTTTTTTTATATAAAAGCGC
AAGATTTCAATTTTGAAATC

Product: sodium/hydrogen exchanger

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 745; Mature: 745

Protein sequence:

>745_residues
MIALNAAAESTHHLQPLISDLGLILMTAGIAVLIFKKMKQPLVLGYLIAGFLAGNHFDFFPSITDMKSVEVWAEIGVIFL
LFSLGLEFSFKKLMKVGGTSSVTAITQILFMTLIGYCVGQWMGWGQMDSIFLGATLSISSTTIIIRAFDELGVKGKKFVG
IVFGALIVEDIVAILMLVLLSTIAVSDQVSGGELLQSVLKLVFFLIIWFLGGIFIIPTILKKAKHLLTDEMLLIISLALC
LMMVIFAANVGFSPALGAFIMGSIIAETTMAEKIEHLIQPVKDLFGAVFFVSVGMLINPETLVTYALPVALITLLTIFGK
AFSSSIGALISGQPLKQSVQTGMSLAQIGEFSFIIATLGMTLKVTSDFLYPIIVAVSAITTFTTPFLIKYSESFAQFLEQ
KMPKRWVKNINRYSVNAQAIKSVSTWQIVLRSSITQIILHTIIITAIILLSSKFVAPLVADTRFGNTLAALLTLVVIAPF
LWALSLRRVKVDEVEALWEERKYRGALLMLILIRMSLGLFFVGFLLNIFFSPLVAFVALIIAIGAYQIFPKKLNEQYHRI
ENHFLKNLNDRENKKIDRRYANLMPWDGHMSFFDIGKESNLAGKTLEELKIREQLGINIAYIKRGEVTIPIPMKTERLFP
GDEICVIGTDAQITEFTKYLNHNETEAPPKVEETDIVLRQLEVSQEEFIQKSIGQFRAKTNGMVVGIERNGNRILNPESS
LILEKNDILWVVGDKKRMTALLTAK

Sequences:

>Translated_745_residues
MIALNAAAESTHHLQPLISDLGLILMTAGIAVLIFKKMKQPLVLGYLIAGFLAGNHFDFFPSITDMKSVEVWAEIGVIFL
LFSLGLEFSFKKLMKVGGTSSVTAITQILFMTLIGYCVGQWMGWGQMDSIFLGATLSISSTTIIIRAFDELGVKGKKFVG
IVFGALIVEDIVAILMLVLLSTIAVSDQVSGGELLQSVLKLVFFLIIWFLGGIFIIPTILKKAKHLLTDEMLLIISLALC
LMMVIFAANVGFSPALGAFIMGSIIAETTMAEKIEHLIQPVKDLFGAVFFVSVGMLINPETLVTYALPVALITLLTIFGK
AFSSSIGALISGQPLKQSVQTGMSLAQIGEFSFIIATLGMTLKVTSDFLYPIIVAVSAITTFTTPFLIKYSESFAQFLEQ
KMPKRWVKNINRYSVNAQAIKSVSTWQIVLRSSITQIILHTIIITAIILLSSKFVAPLVADTRFGNTLAALLTLVVIAPF
LWALSLRRVKVDEVEALWEERKYRGALLMLILIRMSLGLFFVGFLLNIFFSPLVAFVALIIAIGAYQIFPKKLNEQYHRI
ENHFLKNLNDRENKKIDRRYANLMPWDGHMSFFDIGKESNLAGKTLEELKIREQLGINIAYIKRGEVTIPIPMKTERLFP
GDEICVIGTDAQITEFTKYLNHNETEAPPKVEETDIVLRQLEVSQEEFIQKSIGQFRAKTNGMVVGIERNGNRILNPESS
LILEKNDILWVVGDKKRMTALLTAK
>Mature_745_residues
MIALNAAAESTHHLQPLISDLGLILMTAGIAVLIFKKMKQPLVLGYLIAGFLAGNHFDFFPSITDMKSVEVWAEIGVIFL
LFSLGLEFSFKKLMKVGGTSSVTAITQILFMTLIGYCVGQWMGWGQMDSIFLGATLSISSTTIIIRAFDELGVKGKKFVG
IVFGALIVEDIVAILMLVLLSTIAVSDQVSGGELLQSVLKLVFFLIIWFLGGIFIIPTILKKAKHLLTDEMLLIISLALC
LMMVIFAANVGFSPALGAFIMGSIIAETTMAEKIEHLIQPVKDLFGAVFFVSVGMLINPETLVTYALPVALITLLTIFGK
AFSSSIGALISGQPLKQSVQTGMSLAQIGEFSFIIATLGMTLKVTSDFLYPIIVAVSAITTFTTPFLIKYSESFAQFLEQ
KMPKRWVKNINRYSVNAQAIKSVSTWQIVLRSSITQIILHTIIITAIILLSSKFVAPLVADTRFGNTLAALLTLVVIAPF
LWALSLRRVKVDEVEALWEERKYRGALLMLILIRMSLGLFFVGFLLNIFFSPLVAFVALIIAIGAYQIFPKKLNEQYHRI
ENHFLKNLNDRENKKIDRRYANLMPWDGHMSFFDIGKESNLAGKTLEELKIREQLGINIAYIKRGEVTIPIPMKTERLFP
GDEICVIGTDAQITEFTKYLNHNETEAPPKVEETDIVLRQLEVSQEEFIQKSIGQFRAKTNGMVVGIERNGNRILNPESS
LILEKNDILWVVGDKKRMTALLTAK

Specific function: Unknown

COG id: COG0475

COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 RCK N-terminal domain [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI157388921, Length=404, Percent_Identity=26.7326732673267, Blast_Score=105, Evalue=1e-22,
Organism=Escherichia coli, GI1786685, Length=392, Percent_Identity=33.4183673469388, Blast_Score=166, Evalue=6e-42,
Organism=Escherichia coli, GI1786232, Length=368, Percent_Identity=27.7173913043478, Blast_Score=96, Evalue=6e-21,
Organism=Escherichia coli, GI1789749, Length=393, Percent_Identity=26.2086513994911, Blast_Score=93, Evalue=7e-20,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR004771
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR003148 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger; PF02254 TrkA_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82671; Mature: 82671

Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIALNAAAESTHHLQPLISDLGLILMTAGIAVLIFKKMKQPLVLGYLIAGFLAGNHFDFF
CEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PSITDMKSVEVWAEIGVIFLLFSLGLEFSFKKLMKVGGTSSVTAITQILFMTLIGYCVGQ
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WMGWGQMDSIFLGATLSISSTTIIIRAFDELGVKGKKFVGIVFGALIVEDIVAILMLVLL
HCCCCCCCCEEECEEEEECCCEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
STIAVSDQVSGGELLQSVLKLVFFLIIWFLGGIFIIPTILKKAKHLLTDEMLLIISLALC
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMMVIFAANVGFSPALGAFIMGSIIAETTMAEKIEHLIQPVKDLFGAVFFVSVGMLINPE
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
TLVTYALPVALITLLTIFGKAFSSSIGALISGQPLKQSVQTGMSLAQIGEFSFIIATLGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
TLKVTSDFLYPIIVAVSAITTFTTPFLIKYSESFAQFLEQKMPKRWVKNINRYSVNAQAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCHHHH
KSVSTWQIVLRSSITQIILHTIIITAIILLSSKFVAPLVADTRFGNTLAALLTLVVIAPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LWALSLRRVKVDEVEALWEERKYRGALLMLILIRMSLGLFFVGFLLNIFFSPLVAFVALI
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAIGAYQIFPKKLNEQYHRIENHFLKNLNDRENKKIDRRYANLMPWDGHMSFFDIGKESN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCC
LAGKTLEELKIREQLGINIAYIKRGEVTIPIPMKTERLFPGDEICVIGTDAQITEFTKYL
CCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHH
NHNETEAPPKVEETDIVLRQLEVSQEEFIQKSIGQFRAKTNGMVVGIERNGNRILNPESS
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEECCCCC
LILEKNDILWVVGDKKRMTALLTAK
EEEECCCEEEEECCCHHHHEEEECC
>Mature Secondary Structure
MIALNAAAESTHHLQPLISDLGLILMTAGIAVLIFKKMKQPLVLGYLIAGFLAGNHFDFF
CEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
PSITDMKSVEVWAEIGVIFLLFSLGLEFSFKKLMKVGGTSSVTAITQILFMTLIGYCVGQ
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WMGWGQMDSIFLGATLSISSTTIIIRAFDELGVKGKKFVGIVFGALIVEDIVAILMLVLL
HCCCCCCCCEEECEEEEECCCEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
STIAVSDQVSGGELLQSVLKLVFFLIIWFLGGIFIIPTILKKAKHLLTDEMLLIISLALC
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMMVIFAANVGFSPALGAFIMGSIIAETTMAEKIEHLIQPVKDLFGAVFFVSVGMLINPE
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
TLVTYALPVALITLLTIFGKAFSSSIGALISGQPLKQSVQTGMSLAQIGEFSFIIATLGM
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TLKVTSDFLYPIIVAVSAITTFTTPFLIKYSESFAQFLEQKMPKRWVKNINRYSVNAQAI
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KSVSTWQIVLRSSITQIILHTIIITAIILLSSKFVAPLVADTRFGNTLAALLTLVVIAPF
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LWALSLRRVKVDEVEALWEERKYRGALLMLILIRMSLGLFFVGFLLNIFFSPLVAFVALI
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IAIGAYQIFPKKLNEQYHRIENHFLKNLNDRENKKIDRRYANLMPWDGHMSFFDIGKESN
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LAGKTLEELKIREQLGINIAYIKRGEVTIPIPMKTERLFPGDEICVIGTDAQITEFTKYL
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NHNETEAPPKVEETDIVLRQLEVSQEEFIQKSIGQFRAKTNGMVVGIERNGNRILNPESS
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEECCCCC
LILEKNDILWVVGDKKRMTALLTAK
EEEECCCEEEEECCCHHHHEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503; 7721718 [H]