Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is 146300546

Identifier: 146300546

GI number: 146300546

Start: 3329865

End: 3331607

Strand: Reverse

Name: 146300546

Synonym: Fjoh_2796

Alternate gene names: NA

Gene position: 3331607-3329865 (Counterclockwise)

Preceding gene: 146300547

Following gene: 146300544

Centisome position: 54.64

GC content: 35.86

Gene sequence:

>1743_bases
ATGAAAGAAATAATACACAAAAAGTTAAATCAATTGCAGGCAACGGCAATCTGTGGAAACGATATTAGTTCATCCTGTCT
TTACGTATCGGCGTTAACGATTTTGTATGCAGGACAATATGCCTGGATTTCTCTTTTAATTGTAGCAGTCGTTTTATTTT
TATTCAGAAAAATTTATGGTGAAGTTGTTGGGGCAATTCCTTTAAATGGAGGAGCTTACAATGTCCTATTAAATACATCT
ACAAAACGTTTAGCATCTCTGGCTGCCACATTAACCGTTTTGTCTTATATGGCAACAGCTGTAATTTCGGCTTCAGAAGG
AATGCATTACCTGCACGGAATTTTTGAAGGATTAAATGTTACCATTGCCACAGTAGTTGTTTTAGTTTTATTTACTTTTC
TCGCAATCCTCGGAATTGGTGAATCTGCTTTTGTGGCTGTTATCATTTTTGTAACCCATATCGCCACTTTGAGTTTGCTC
GTTCTCGCTTCGATTTGGTTTATTTTAAATCACGGATTAAACGTTTTTCATATTAATTGGGAAACGCCTATTGCATTTGG
CAGTATGAAAACTGCTCTTTTTTTGGGTTTTTCTGCAGCAATGCTCGGAATTTCCGGTTTTGAAAGTTCTGCCAACTTTG
TAGAAGAACAGCAGCAGGGCGTTTTTCCAAAAACACTGCGCAATATGTGGGCGCTTGTCAGTTTTTTTAATCCCGTAATT
GCAATTTTGTTAATAAGCGTAATTCCCCTGGCGCAAGTTGGAGAAAACAAAGAATCACTTTTAGCACATTTAGGAGAAAC
AACAGGCGGATCATGGCTGGCGTGGCTTATTTCTATAGATGCCGTTTTAGTTTTATGCGGTGCCGTTTTAACTTCATTTG
TGGGTGTCTCAGGATTATTAAACCGAATGACTCTTGACAGAATCTTGCCTAACTTTTTTTTAAAACAAAACAAAAGAGGT
TCACATTATAGAATCGTAATCAGCTTTTTGATTCTTTGTATATCAGTGCTTTTTGCTACAAACGGTCATTTAGAATCTTT
GGCCGGGGTTTATACTTTTTCATTTTTAGCCGTAATGGCTTTATTCGGAATCGGGAATCTGCTTCTTAAATTTAAAAGAC
GAAAATTACCAAGACCAGAGCGCGCGCACGGATTGGCTGTATTTGCTGCCGTTTCTTTTATCATTGCCGCTTTTATCGGA
AATATGAAATTAAACATTAATGCTTTTTACACCTTTTTGCAATACATGGTTCCGGCTCTGATTTTCATCGGAATAATGCT
CAATCGTGTTATGCTTATAAAAGTGCTTATCGAAATTTTAGAATATTTCTATCAGCCGCTTCGCAAAATGGTAATTCTCA
GCAATCGTTACCTTCAAAATTTAAGTGCCGAAATTAATTCTCAGGAATTTGTTTTTTTTACCAAAGGTGATAATATTGCC
ATTTTAAACAAAGTTCTTCAATATGTAGAAGGCAACGAAACGACCAAAAAGCTAAAAATTGTTTATGTAAAAAATGATGG
TCTTATAAACGAAGCTCTGGTAAAAGATTTAGAAGTTCTGGATCGAGCTTACGACAATATAGATATTGAATACCTTGAAA
TTGAAGGTGTTTTTGGTCCCGAAATTATAGACGAATTATCTCAGAAATGGAAAATTCCTAAAAACTTTATGTTTATAGGT
TCTCCGGGAAACAAATTTTCGTATCGTGTTTCAGATCTTGGCGGCGTACGTTTGATTATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAATACTAAAAGTATTTTTTAGTCTGCTTTCAATATCTGCCTTCGTGTAGATTATAATTTACTTGGTGCTGAATTAATC
GTGTTGTAATAATAAAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTTAAGCAGAAAACATCTTTCTCATAAAATAACAAACCCGACAGGTTTTAAAAATCTGTCGGGTTTACTATATATA
GGCAATGATAAAGTTAAGAT

Product: amino acid permease-associated protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 580; Mature: 580

Protein sequence:

>580_residues
MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYGEVVGAIPLNGGAYNVLLNTS
TKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNVTIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLL
VLASIWFILNHGLNVFHINWETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI
AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLLNRMTLDRILPNFFLKQNKRG
SHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMALFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIG
NMKLNINAFYTFLQYMVPALIFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA
ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGPEIIDELSQKWKIPKNFMFIG
SPGNKFSYRVSDLGGVRLIM

Sequences:

>Translated_580_residues
MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYGEVVGAIPLNGGAYNVLLNTS
TKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNVTIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLL
VLASIWFILNHGLNVFHINWETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI
AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLLNRMTLDRILPNFFLKQNKRG
SHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMALFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIG
NMKLNINAFYTFLQYMVPALIFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA
ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGPEIIDELSQKWKIPKNFMFIG
SPGNKFSYRVSDLGGVRLIM
>Mature_580_residues
MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYGEVVGAIPLNGGAYNVLLNTS
TKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNVTIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLL
VLASIWFILNHGLNVFHINWETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI
AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLLNRMTLDRILPNFFLKQNKRG
SHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMALFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIG
NMKLNINAFYTFLQYMVPALIFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA
ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGPEIIDELSQKWKIPKNFMFIG
SPGNKFSYRVSDLGGVRLIM

Specific function: Unknown

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64251; Mature: 64251

Theoretical pI: Translated: 9.07; Mature: 9.07

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVVGAIPLNGGAYNVLLNTSTKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNV
HHHCCEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCH
TIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLLVLASIWFILNHGLNVFHINW
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC
ETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRMTLDRILPNFFLKQNKRGSHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIGNMKLNINAFYTFLQYMVPAL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH
IFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHH
ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGP
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCH
EIIDELSQKWKIPKNFMFIGSPGNKFSYRVSDLGGVRLIM
HHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCCCEEEEC
>Mature Secondary Structure
MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYG
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVVGAIPLNGGAYNVLLNTSTKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNV
HHHCCEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCH
TIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLLVLASIWFILNHGLNVFHINW
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC
ETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRMTLDRILPNFFLKQNKRGSHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIGNMKLNINAFYTFLQYMVPAL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH
IFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHH
ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGP
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCH
EIIDELSQKWKIPKNFMFIGSPGNKFSYRVSDLGGVRLIM
HHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCCCEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA