| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146300546
Identifier: 146300546
GI number: 146300546
Start: 3329865
End: 3331607
Strand: Reverse
Name: 146300546
Synonym: Fjoh_2796
Alternate gene names: NA
Gene position: 3331607-3329865 (Counterclockwise)
Preceding gene: 146300547
Following gene: 146300544
Centisome position: 54.64
GC content: 35.86
Gene sequence:
>1743_bases ATGAAAGAAATAATACACAAAAAGTTAAATCAATTGCAGGCAACGGCAATCTGTGGAAACGATATTAGTTCATCCTGTCT TTACGTATCGGCGTTAACGATTTTGTATGCAGGACAATATGCCTGGATTTCTCTTTTAATTGTAGCAGTCGTTTTATTTT TATTCAGAAAAATTTATGGTGAAGTTGTTGGGGCAATTCCTTTAAATGGAGGAGCTTACAATGTCCTATTAAATACATCT ACAAAACGTTTAGCATCTCTGGCTGCCACATTAACCGTTTTGTCTTATATGGCAACAGCTGTAATTTCGGCTTCAGAAGG AATGCATTACCTGCACGGAATTTTTGAAGGATTAAATGTTACCATTGCCACAGTAGTTGTTTTAGTTTTATTTACTTTTC TCGCAATCCTCGGAATTGGTGAATCTGCTTTTGTGGCTGTTATCATTTTTGTAACCCATATCGCCACTTTGAGTTTGCTC GTTCTCGCTTCGATTTGGTTTATTTTAAATCACGGATTAAACGTTTTTCATATTAATTGGGAAACGCCTATTGCATTTGG CAGTATGAAAACTGCTCTTTTTTTGGGTTTTTCTGCAGCAATGCTCGGAATTTCCGGTTTTGAAAGTTCTGCCAACTTTG TAGAAGAACAGCAGCAGGGCGTTTTTCCAAAAACACTGCGCAATATGTGGGCGCTTGTCAGTTTTTTTAATCCCGTAATT GCAATTTTGTTAATAAGCGTAATTCCCCTGGCGCAAGTTGGAGAAAACAAAGAATCACTTTTAGCACATTTAGGAGAAAC AACAGGCGGATCATGGCTGGCGTGGCTTATTTCTATAGATGCCGTTTTAGTTTTATGCGGTGCCGTTTTAACTTCATTTG TGGGTGTCTCAGGATTATTAAACCGAATGACTCTTGACAGAATCTTGCCTAACTTTTTTTTAAAACAAAACAAAAGAGGT TCACATTATAGAATCGTAATCAGCTTTTTGATTCTTTGTATATCAGTGCTTTTTGCTACAAACGGTCATTTAGAATCTTT GGCCGGGGTTTATACTTTTTCATTTTTAGCCGTAATGGCTTTATTCGGAATCGGGAATCTGCTTCTTAAATTTAAAAGAC GAAAATTACCAAGACCAGAGCGCGCGCACGGATTGGCTGTATTTGCTGCCGTTTCTTTTATCATTGCCGCTTTTATCGGA AATATGAAATTAAACATTAATGCTTTTTACACCTTTTTGCAATACATGGTTCCGGCTCTGATTTTCATCGGAATAATGCT CAATCGTGTTATGCTTATAAAAGTGCTTATCGAAATTTTAGAATATTTCTATCAGCCGCTTCGCAAAATGGTAATTCTCA GCAATCGTTACCTTCAAAATTTAAGTGCCGAAATTAATTCTCAGGAATTTGTTTTTTTTACCAAAGGTGATAATATTGCC ATTTTAAACAAAGTTCTTCAATATGTAGAAGGCAACGAAACGACCAAAAAGCTAAAAATTGTTTATGTAAAAAATGATGG TCTTATAAACGAAGCTCTGGTAAAAGATTTAGAAGTTCTGGATCGAGCTTACGACAATATAGATATTGAATACCTTGAAA TTGAAGGTGTTTTTGGTCCCGAAATTATAGACGAATTATCTCAGAAATGGAAAATTCCTAAAAACTTTATGTTTATAGGT TCTCCGGGAAACAAATTTTCGTATCGTGTTTCAGATCTTGGCGGCGTACGTTTGATTATGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAAATACTAAAAGTATTTTTTAGTCTGCTTTCAATATCTGCCTTCGTGTAGATTATAATTTACTTGGTGCTGAATTAATC GTGTTGTAATAATAAAAAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTTTAAGCAGAAAACATCTTTCTCATAAAATAACAAACCCGACAGGTTTTAAAAATCTGTCGGGTTTACTATATATA GGCAATGATAAAGTTAAGAT
Product: amino acid permease-associated protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 580; Mature: 580
Protein sequence:
>580_residues MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYGEVVGAIPLNGGAYNVLLNTS TKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNVTIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLL VLASIWFILNHGLNVFHINWETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLLNRMTLDRILPNFFLKQNKRG SHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMALFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIG NMKLNINAFYTFLQYMVPALIFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGPEIIDELSQKWKIPKNFMFIG SPGNKFSYRVSDLGGVRLIM
Sequences:
>Translated_580_residues MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYGEVVGAIPLNGGAYNVLLNTS TKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNVTIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLL VLASIWFILNHGLNVFHINWETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLLNRMTLDRILPNFFLKQNKRG SHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMALFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIG NMKLNINAFYTFLQYMVPALIFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGPEIIDELSQKWKIPKNFMFIG SPGNKFSYRVSDLGGVRLIM >Mature_580_residues MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYGEVVGAIPLNGGAYNVLLNTS TKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNVTIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLL VLASIWFILNHGLNVFHINWETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLLNRMTLDRILPNFFLKQNKRG SHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMALFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIG NMKLNINAFYTFLQYMVPALIFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGPEIIDELSQKWKIPKNFMFIG SPGNKFSYRVSDLGGVRLIM
Specific function: Unknown
COG id: COG0531
COG function: function code E; Amino acid transporters
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 64251; Mature: 64251
Theoretical pI: Translated: 9.07; Mature: 9.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYG CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVVGAIPLNGGAYNVLLNTSTKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNV HHHCCEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCH TIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLLVLASIWFILNHGLNVFHINW HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC ETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLL HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NRMTLDRILPNFFLKQNKRGSHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIGNMKLNINAFYTFLQYMVPAL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH IFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHH ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGP HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCH EIIDELSQKWKIPKNFMFIGSPGNKFSYRVSDLGGVRLIM HHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCCCEEEEC >Mature Secondary Structure MKEIIHKKLNQLQATAICGNDISSSCLYVSALTILYAGQYAWISLLIVAVVLFLFRKIYG CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVVGAIPLNGGAYNVLLNTSTKRLASLAATLTVLSYMATAVISASEGMHYLHGIFEGLNV HHHCCEECCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCH TIATVVVLVLFTFLAILGIGESAFVAVIIFVTHIATLSLLVLASIWFILNHGLNVFHINW HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEC ETPIAFGSMKTALFLGFSAAMLGISGFESSANFVEEQQQGVFPKTLRNMWALVSFFNPVI CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AILLISVIPLAQVGENKESLLAHLGETTGGSWLAWLISIDAVLVLCGAVLTSFVGVSGLL HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NRMTLDRILPNFFLKQNKRGSHYRIVISFLILCISVLFATNGHLESLAGVYTFSFLAVMA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LFGIGNLLLKFKRRKLPRPERAHGLAVFAAVSFIIAAFIGNMKLNINAFYTFLQYMVPAL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH IFIGIMLNRVMLIKVLIEILEYFYQPLRKMVILSNRYLQNLSAEINSQEFVFFTKGDNIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHH ILNKVLQYVEGNETTKKLKIVYVKNDGLINEALVKDLEVLDRAYDNIDIEYLEIEGVFGP HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCH EIIDELSQKWKIPKNFMFIGSPGNKFSYRVSDLGGVRLIM HHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCCCEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA