| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146299110
Identifier: 146299110
GI number: 146299110
Start: 1545505
End: 1546584
Strand: Direct
Name: 146299110
Synonym: Fjoh_1350
Alternate gene names: NA
Gene position: 1545505-1546584 (Clockwise)
Preceding gene: 146299109
Following gene: 146299111
Centisome position: 25.35
GC content: 24.44
Gene sequence:
>1080_bases ATGATTAACAGCCGAAATTTTGATAATATTCGTACAGTTGCACTTTTGTCTATTCTTTTAATTCATACTGGTCTAAACAA TATTGGATTTAAAACTTTTGAGAAAGAGCTAACAGATAGTTCTTTTTATTTAAATTTTAATCAACTACTTATGGATGTTC TTTATTTGAATTTATTCAAAGCGGGAACCATTTTGTTTTTTATTATTTCTGGTTTTCTTTTCGAAATGCAATATTTGAAG TTTAATGATTTTTCAGTTTTTATAAGAAAAAAAGCTAAAAGTTTGTTGCGTCCTTACTTGGTTATATTTGTTATTCCTAC TGTTATTTTGATTGGTATAATAGAACCTAATGTTGGAGTGAAAGAAAATTTGAACTTAGTGACTTTTCTTATTAAGGCTT TCTCAAATATATTTCTTACTAGTTATTGGTTTGTACCAGCTCTATTTGTTACTTTGGTGATAAATTATTTTATAGAGTCA AAAAATCTTTTCAAATCTTTGTATTTGTTTATTTTGATCTGGCTTATTTCTTATCTAAATATATACTTAAAGTTTACAGT TTCTTCTCATACAGTTTGGTTCATTGCATTTTTATTTGTGTTTACACTAGGTAGGATTATGTTTTTGTATAATGAGAAAA TATCAAGCTGGAGAATACTAAAGGATCCTAAAAAATTAACTTTTTTAATGATTTTATTTTATATTATTTCAAATGTAGAA TCTATTTTAATACTTCGTTTTGCTCATAATCCTGACTGTGTTAACACAATGAGGATAGGAAATGTATTTTATTCTTTTTG TTTATTTTATCTATTAAATGCTTATTTTAATAAATTCAAGTTTGAATTGCCAATTGACATTTCATTTTATTTTGTTTATC TAATTCATCCATTTGTAGTAAAAATTACAGCGAAACTTTTAGCGGATAATAATCTATTTCTTTTTGAATACCCTTACCAG TTCTTATTTAATTTTATACATTTTTTGATTGTTTTAACAATTTGTATTGGATTTCAGCAAGTTTTTTTTAAACTTCGCTT TAAATCTAAAACGTTGTCAGGATATGTTTTTAAAAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CGAGTCCCGTCCAGACCGCCTAAGTTGTTAAAAGCCTTTCTTAACGGAAGGCTTTTTTTTGTAAAAAAAAAATAAAAAGT AATAATTTTAATACAAACAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTTTTTGGTGCTTTATTTTGTTTTTTGGGAATATTGTTATTAAGTTGTGATGGTTCTAATAAGAAGTTTTCAGAAATTG ATGAAGGAAAAAACTTAGTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 359; Mature: 359
Protein sequence:
>359_residues MINSRNFDNIRTVALLSILLIHTGLNNIGFKTFEKELTDSSFYLNFNQLLMDVLYLNLFKAGTILFFIISGFLFEMQYLK FNDFSVFIRKKAKSLLRPYLVIFVIPTVILIGIIEPNVGVKENLNLVTFLIKAFSNIFLTSYWFVPALFVTLVINYFIES KNLFKSLYLFILIWLISYLNIYLKFTVSSHTVWFIAFLFVFTLGRIMFLYNEKISSWRILKDPKKLTFLMILFYIISNVE SILILRFAHNPDCVNTMRIGNVFYSFCLFYLLNAYFNKFKFELPIDISFYFVYLIHPFVVKITAKLLADNNLFLFEYPYQ FLFNFIHFLIVLTICIGFQQVFFKLRFKSKTLSGYVFKK
Sequences:
>Translated_359_residues MINSRNFDNIRTVALLSILLIHTGLNNIGFKTFEKELTDSSFYLNFNQLLMDVLYLNLFKAGTILFFIISGFLFEMQYLK FNDFSVFIRKKAKSLLRPYLVIFVIPTVILIGIIEPNVGVKENLNLVTFLIKAFSNIFLTSYWFVPALFVTLVINYFIES KNLFKSLYLFILIWLISYLNIYLKFTVSSHTVWFIAFLFVFTLGRIMFLYNEKISSWRILKDPKKLTFLMILFYIISNVE SILILRFAHNPDCVNTMRIGNVFYSFCLFYLLNAYFNKFKFELPIDISFYFVYLIHPFVVKITAKLLADNNLFLFEYPYQ FLFNFIHFLIVLTICIGFQQVFFKLRFKSKTLSGYVFKK >Mature_359_residues MINSRNFDNIRTVALLSILLIHTGLNNIGFKTFEKELTDSSFYLNFNQLLMDVLYLNLFKAGTILFFIISGFLFEMQYLK FNDFSVFIRKKAKSLLRPYLVIFVIPTVILIGIIEPNVGVKENLNLVTFLIKAFSNIFLTSYWFVPALFVTLVINYFIES KNLFKSLYLFILIWLISYLNIYLKFTVSSHTVWFIAFLFVFTLGRIMFLYNEKISSWRILKDPKKLTFLMILFYIISNVE SILILRFAHNPDCVNTMRIGNVFYSFCLFYLLNAYFNKFKFELPIDISFYFVYLIHPFVVKITAKLLADNNLFLFEYPYQ FLFNFIHFLIVLTICIGFQQVFFKLRFKSKTLSGYVFKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42614; Mature: 42614
Theoretical pI: Translated: 10.02; Mature: 10.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MINSRNFDNIRTVALLSILLIHTGLNNIGFKTFEKELTDSSFYLNFNQLLMDVLYLNLFK CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH AGTILFFIISGFLFEMQYLKFNDFSVFIRKKAKSLLRPYLVIFVIPTVILIGIIEPNVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC KENLNLVTFLIKAFSNIFLTSYWFVPALFVTLVINYFIESKNLFKSLYLFILIWLISYLN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYLKFTVSSHTVWFIAFLFVFTLGRIMFLYNEKISSWRILKDPKKLTFLMILFYIISNVE HHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCHH SILILRFAHNPDCVNTMRIGNVFYSFCLFYLLNAYFNKFKFELPIDISFYFVYLIHPFVV HEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH KITAKLLADNNLFLFEYPYQFLFNFIHFLIVLTICIGFQQVFFKLRFKSKTLSGYVFKK HHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECC >Mature Secondary Structure MINSRNFDNIRTVALLSILLIHTGLNNIGFKTFEKELTDSSFYLNFNQLLMDVLYLNLFK CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHH AGTILFFIISGFLFEMQYLKFNDFSVFIRKKAKSLLRPYLVIFVIPTVILIGIIEPNVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC KENLNLVTFLIKAFSNIFLTSYWFVPALFVTLVINYFIESKNLFKSLYLFILIWLISYLN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYLKFTVSSHTVWFIAFLFVFTLGRIMFLYNEKISSWRILKDPKKLTFLMILFYIISNVE HHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCHH SILILRFAHNPDCVNTMRIGNVFYSFCLFYLLNAYFNKFKFELPIDISFYFVYLIHPFVV HEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH KITAKLLADNNLFLFEYPYQFLFNFIHFLIVLTICIGFQQVFFKLRFKSKTLSGYVFKK HHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA