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The map label for this gene is hmw2 [H]

Identifier: 13508049

GI number: 13508049

Start: 365468

End: 370924

Strand: Direct

Name: hmw2 [H]

Synonym: MPN310

Alternate gene names: 13508049

Gene position: 365468-370924 (Clockwise)

Preceding gene: 13508048

Following gene: 13508050

Centisome position: 44.77

GC content: 39.47

Gene sequence:

>5457_bases
ATGAATGATACTGACAAGAAGTTCCCCTTGCAACCAGTTTATGACACTGGGTTTGATGATGGGTATTTACAGCGTGATTA
TGAAAAGTGTTTAGAAAGTGCTGCTGCTAATGATGCACAAACAGTGGAACTACAAACCCAGCTGTTAGCAGAGATTAAAA
ACCTTGAAAACGAAATCAAGGCCCTAAAGGCGCAGGAATCACGCCAACCCGATCCGCACAACAATGCCCGGATTCAAAGC
TTAGAAGCTAGCTTAAACCGTTTGGTCAATGAGTACAACAACTTTGAATTCCAAAAGAACTATATGGTTGATCGGGTAGC
AGAGTTAAATAACAAAGCGCGTTTTTTTAAGGACGAATTAAAGCGTCTCCAACAAGAAAACGCCGCTTTTGTTAATTCCC
GTTATGCCAATTGAGCTGACTTTCAATCCAACTATCAGCTCAAATTAGACCAGTTTCAAGCGTTAATTGACCAGCAAAAC
CAAACAATTAAGCAGCTCAACGAACAGATTGCAGCTAACCAGGGCTTAATTGATCAAAACGTACAGCGCTTACAGCAAAA
CCACAGTTTAGACCAACAAGAACGTGACGCCTTACTGTATGAGGTTGACCATTTATACAACGAACTGTACGAACTTGAAA
ACCAAAAACGCTTAGTGGGCATCGAGTATGAAGCCACATACCAGGACTTGGTGAGTGCGGATGCGGAGTTGCAAAACGTT
TATGAAACAATTGCCCAAAACCAGGCCAACTTCCAAAAGCAGTGTGATGCTTATTGAGCACAGCTCAAGCAAGTAGAACA
GCAAATTCAAACGACAAAGCAAGAATTGGTTGATGAAGAATCGACACTTAAGGTGCGTTTAAATGACGCTGATTTTTACA
TTAACTCACGCTTAGCAGAATTAGATGATTTAACTAGCAAGATTAACGAACGTGATTTTGTTTCTAAAGAACAAGCTCAA
GACGTTAAAGCTAGTTTAGCTAACCTCACTAAGGAAAAAGAACGTTTGAGCGCTGAGAAGGATAGCTTTGAAAGGTTAAG
GAACACCGCTTTAAACGACATTAACCGAATGGAGCAGGAAAACGCGTTGTTTGCTAAACACTTAGAACAGCAACAATACG
AGTTTGAAAGAAAGCAACAGGAAAGCTTATTAAAGCTAGAAACAGAGCATAAACAGCTCCAAAAACGAATTGGTGAGTTC
AAAATCGAGAGTGAAGCTAAAAGTGAAGCGTTACTGATACAAGAACGTGAACTGTTGGAAAAACGCCGGGAAATTGATGA
TTTGTTAACCCAAGCCAGCTTGGAGTATGAACAACAACGCCGGACGAATCAGGTCTTAAAGGAAAAGCACCGTCAAGTCC
AACAACACTTCCAAAACCTCGTGCATGCTAAAAAGAAATTGGATCAAAAGCGCCATTATTTAGCGGAACAAAAGCGGATT
GATGAAGAACAGATTTTTAAGTTAAAGGAAAAGATTGCCACTGAACGCCGCGAATTGGAGAAGCTTTATCTAGTTAAAAA
ACAAAAGCAAGACCAAAAGGAAAACGATTTACTGATTTTTGAAAAACAGTTAAGGCAGTACCAAGCTGACTTTGAAAACG
AAATAGAAGAGAAGCAAAACGAGCTGTTTGCATCCCAAAAATCACTCCAAAAATCGTTTACACAACTCAAAAATAAGGAA
GCGGAATTAAACCAAAAGGCACAAAAGATTGCAGAGGATTGAGCACATCTCAAACAAAACAAACACCACCACGCTGATCT
AGAAATCTTTCTGGAGGGTGAATTTAACCACTTACAACAAGAAAAGCACAAGCTGTTGGAAGCACGTACGCAGTTTGACA
ACCGTGTCAGTTTGCTCTCAGCACGCTTTAAACAAAAACAAGCAGAATTAGTTAAACAAAAACAAAGCTTGGAACAACTC
ACCGCTGCCTTTAATAAAGAGCAGGAAGCGGTAGAGCGTGATTGGAAGGATCGCTTAGCTAACTTAGAAAAGCAAAAGGA
AATGCTGGGGGATAAGGTACACCAGTTTGATGAAAATTCGCTCAATATTTCCAAAAAGCTAGCGGAGCGGGAGCTAGCGA
TTAAATTTAAAGAAAAGGAGCTGGAGGCTGCACAAAAACAGCTAAGTTTAGACAACAACAATAACGCTGGGTTAAAGTTG
CAGTTAGATAAATTGAGCGAATCACTCAAAACGGAACGCCTGGAATTAGAAGCATCTAAAGAACGTATTTTGGATTTTTA
CGATGAATCATCACGCCGAATTGCAGATTATGAAAGCGATTTACAAGCACGCTTAGCTGAGGTTAAGACACTAGAAAAAA
ACCAGCAGGAAACAGCGGCTAAAAGTGAGCGCGAACTCAAAGTAGCCTTAGAAAAGTTAAACCAAGCAAAAAAGGCTTTT
TTACAAATTCGCAAACAGCAATTGCTCGAAATTGCTTCTGTAAAACAACAACTAGCACAAAAAGCTAATTTGTTGAAAAA
CCAACAAGCAGAGCTAGATAAGCAAACAGAAGAGTTAGAAGCAGCTTTTTTAGAGCAAGATACGGACAAAAAGGAGTTGG
AAAAAGCACTCCACAGCGTTAAGTCCAAGCAAGAATTATTAGAGCGCGAACGCAGTTTTTTACTGCAAAAACAACGTGAA
TTTGCCGAACATGTAGCCGGCTTTAAGCGCCAAGTGCACTTTAAAACAACGCAAATGCAGCGTTTAAGTGAGTTCAACAA
ACAACAACAAAGTGAACAGATAAAGCGCGAAACGGAGCTCAAAATTGCTTTTGCTGATCTAAAAAAGGATTACCAGCTGT
TTGAATTGCAAAAAAACCAGGAGTTCCAGCAAATCGAACAAAAGCACAAAGAACTAGAACTATTAGCACAAAAACAGGCC
GAACTCAAACAGGAGTTAGAGCAAAAAGCAACAGCTTTAGCTAGCCAAGATCAAGACACAGTACAGGCCAAGCTAGATTT
AGCGCGTCAACAGCATGAATTGGAATTGAGGCAAAATGCCTTTAACCAAGCTAGTCTTTCGCTCAACAAACAACGCGAAC
AGCTCACAAACCAAGTCAAGGTATTGCACGGTGAGTTGAAAAAACGCCATGAAAAGCTAACTTTAAAGGATCGTTTACTA
GCTGAAAAGGAAAAGGATCAGCACAAAAAAGATGCAGAAATTAACCAACGCTTTAAGCAGTTTGAAAATGAATACGCTGA
TTTTGACCAAGCCAAAAAGCGCGAATTGCAAGAGTTAAACCAAATCCGTCGAAACTTGGAGCAGAGCAATGCATCACTGC
TAAAGAAGCGCAACCAACTAACGCTTGATTTTGCTTTACTACGTAAAGTGCAACACAATACGCAAACTAACCGTGTCCAA
CTCAACACGCAAATTAAGGAGTTTTTACTAGAGAAGAAGAACTTTCAAAAGGCGAGTGATGAAGCCGCTTTACAAAAAGC
ACTGTTAATTAAACGCTTACGTAGTTTTGCTTCTAAATTACAGTTGCAACGCGAAGCTTTAGCGATTCAAAAACTGGAAT
TTGATAAGCGTGATGAACAACAAAAGAGTGAGATTAACAACGCTAAGTTACAGTTAGAGCAGTTCAAACTAGAAAAGCAG
AACTTTGATGAAGCGAAACAAAAGCAGTTAATTGAGTTTAAGGATCAGTGCCAACGACTTGATGTTGAAAAACGTCTGTT
AAAGCAAAAGTTAGTGCAGCTCAAAAACCTATCTAAGAGCTATCTTACTTACAAAAACCGTGCTGATCTGTCCCAACAAC
AGCTGCAACACAAGTATGCTAACTTACTGGAGTTGAAGGAAAAGCTGCAAACCGCTAAGCGTGCCTTGGACAAAAAACAC
CGTGCCATTTATGGCAAAATGGCACAGTTTGTCAGTGAGCTCCGCCAAGAAAAGAAGCAGCTTTTAAGTGCGCAAAAACA
AGTTGATGACAAGTCACGTTTACTGGAACAAAACCAACGCCATTTACAAAACCTTTCCAGTGAAACCAAAAAGAAACGCC
AGTCTTTAGAGCATGACATTAATAAGTTTGATCAAAGACGCAAGGAAGCGGTTTCTTCCATTTTAAACTCGCACAAAAAA
CTCAAGCAAAAAGAGGGAGAATTGCAAGGCATTTTGCAAAAGCTTAGCTTGAAAAAAACACAAATTGAACAAGAGTTTTC
CAAGCTTTATCAGCAACGCGAAAAGTTAGATCGCCAACGCACTACGCTCTCTAAACTCCACAGAGAGCTAAAAGCCCAAA
ATGAAGCTACGGCACACAAAAATCGTGAAGTTTTAGAGATTGAGAACTATTACAAGAAGGAGTTGCAACGACTCACCACG
GAAAAGAGTGAGTTTGATAACAACAAAAATCGCTTGTTTGAATACTTCCGTAAAATTCGCAATGAAATTGAAAAGAAGGA
AGCACACATTAAAACCGTTTTAGAAGAAACACAAAAAAAGCGTCACCTAGTCGAAACGGAAGCGGTCAAACTACATTTAC
AAAAGCAATCTATCATTTCTAAGGGTCAAGAACTTAAAGAAATCAAGGAACGGGTTAGCCGTGACATTAGCCACACCAAC
AAACAACGCGAAGAGTTAAACAGCTTATTGCACCAAAACAAACTGTTGCAAAAGAATTTGGCTGAGCGTGAACGTGAAAT
TAATAATAAGGATTCACTGTTAACCCAAAAGATTCAAACAGCTAAACAAAAGTTAAGCGAAAAAGAAGCACGCATCTTAA
AGCTGTTGGAAAAAATGCGTGCGGTAGAACAGCAATACCAAGCGGAAATTACCCGTTTAAAGACACGTAATGCTGATTTG
GAGAAGAATGACAATAAGCACTTATTTCCACCGTTATTTAAAATTAACGGTAATGATATGAACTATCCTTACCCATATCC
TTGATTTTATCCGCAACAAAAACAAGAAGATAGTTCAAACCAAATTCGCCATCTTTTTGAACAACAGTTGCAATTTATGC
AACAGCGTTACGAAAACGAATTAACTGAGTTGCGTCGCCAACGTGCTTTATTGGAAAAAAAACTAGACCAAATTCAACTC
GAATCACAGTTAAGCGCGAAGAAGAACGACTTTGAAAAGGTTGAGCAAATGATGCAAAAGTTGTTGGAAAAAACTGAGCA
AAAACTCAGTGCCTTTGACCAAAAAATTAATGCTTTGGCAGAACAGATTAACACACAAAAAGCAGAGCACGCTGACAGTG
AAAAGCAACAGTTGTTACTAAGGATTGAACAGTTAGAAAAGCAAAACCTAGCTCAAGCTGTTCAAACACCCCAACCAGTA
CAACCAGTGGTACAAGCACCAGCTGTAGTACCCCAAGTGATCCAACCACAGGTAGTGCAGTCCCAACCAGCTTTTTTAGC
AACGCAGCAAAGTATTTCTAAACAGCAACAAATCGCGCAATTAAACGCTGAGATCAATAGTATTAAAAAGCTAATTGCCC
AAAAAGCAGCTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGCCACGTCCAGTGTATGAAGAACCGATCTCCGCTTCGTTCCGCCGTCGTGGTTACCGTGGTGATGAATTTTACGAATA
AACACTGGCTCTTTTAACCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAAGAGATGAAAGATGACTAATGATTACCAACAATTAAATTATTTAGTGGAAACTGATGATGAAGCTGACATCATCATA
GCTAACCTCGTCAAACAACT

Product: cytadherence protein

Products: NA

Alternate protein names: Cytadherence accessory protein 2 [H]

Number of amino acids: Translated: 1818; Mature: 1818

Protein sequence:

>1818_residues
MNDTDKKFPLQPVYDTGFDDGYLQRDYEKCLESAAANDAQTVELQTQLLAEIKNLENEIKALKAQESRQPDPHNNARIQS
LEASLNRLVNEYNNFEFQKNYMVDRVAELNNKARFFKDELKRLQQENAAFVNSRYANWADFQSNYQLKLDQFQALIDQQN
QTIKQLNEQIAANQGLIDQNVQRLQQNHSLDQQERDALLYEVDHLYNELYELENQKRLVGIEYEATYQDLVSADAELQNV
YETIAQNQANFQKQCDAYWAQLKQVEQQIQTTKQELVDEESTLKVRLNDADFYINSRLAELDDLTSKINERDFVSKEQAQ
DVKASLANLTKEKERLSAEKDSFERLRNTALNDINRMEQENALFAKHLEQQQYEFERKQQESLLKLETEHKQLQKRIGEF
KIESEAKSEALLIQERELLEKRREIDDLLTQASLEYEQQRRTNQVLKEKHRQVQQHFQNLVHAKKKLDQKRHYLAEQKRI
DEEQIFKLKEKIATERRELEKLYLVKKQKQDQKENDLLIFEKQLRQYQADFENEIEEKQNELFASQKSLQKSFTQLKNKE
AELNQKAQKIAEDWAHLKQNKHHHADLEIFLEGEFNHLQQEKHKLLEARTQFDNRVSLLSARFKQKQAELVKQKQSLEQL
TAAFNKEQEAVERDWKDRLANLEKQKEMLGDKVHQFDENSLNISKKLAERELAIKFKEKELEAAQKQLSLDNNNNAGLKL
QLDKLSESLKTERLELEASKERILDFYDESSRRIADYESDLQARLAEVKTLEKNQQETAAKSERELKVALEKLNQAKKAF
LQIRKQQLLEIASVKQQLAQKANLLKNQQAELDKQTEELEAAFLEQDTDKKELEKALHSVKSKQELLERERSFLLQKQRE
FAEHVAGFKRQVHFKTTQMQRLSEFNKQQQSEQIKRETELKIAFADLKKDYQLFELQKNQEFQQIEQKHKELELLAQKQA
ELKQELEQKATALASQDQDTVQAKLDLARQQHELELRQNAFNQASLSLNKQREQLTNQVKVLHGELKKRHEKLTLKDRLL
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LNTQIKEFLLEKKNFQKASDEAALQKALLIKRLRSFASKLQLQREALAIQKLEFDKRDEQQKSEINNAKLQLEQFKLEKQ
NFDEAKQKQLIEFKDQCQRLDVEKRLLKQKLVQLKNLSKSYLTYKNRADLSQQQLQHKYANLLELKEKLQTAKRALDKKH
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LKQKEGELQGILQKLSLKKTQIEQEFSKLYQQREKLDRQRTTLSKLHRELKAQNEATAHKNREVLEIENYYKKELQRLTT
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EKNDNKHLFPPLFKINGNDMNYPYPYPWFYPQQKQEDSSNQIRHLFEQQLQFMQQRYENELTELRRQRALLEKKLDQIQL
ESQLSAKKNDFEKVEQMMQKLLEKTEQKLSAFDQKINALAEQINTQKAEHADSEKQQLLLRIEQLEKQNLAQAVQTPQPV
QPVVQAPAVVPQVIQPQVVQSQPAFLATQQSISKQQQIAQLNAEINSIKKLIAQKAAK

Sequences:

>Translated_1818_residues
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QTIKQLNEQIAANQGLIDQNVQRLQQNHSLDQQERDALLYEVDHLYNELYELENQKRLVGIEYEATYQDLVSADAELQNV
YETIAQNQANFQKQCDAY*AQLKQVEQQIQTTKQELVDEESTLKVRLNDADFYINSRLAELDDLTSKINERDFVSKEQAQ
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ELKQELEQKATALASQDQDTVQAKLDLARQQHELELRQNAFNQASLSLNKQREQLTNQVKVLHGELKKRHEKLTLKDRLL
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ESQLSAKKNDFEKVEQMMQKLLEKTEQKLSAFDQKINALAEQINTQKAEHADSEKQQLLLRIEQLEKQNLAQAVQTPQPV
QPVVQAPAVVPQVIQPQVVQSQPAFLATQQSISKQQQIAQLNAEINSIKKLIAQKAAK
>Mature_1818_residues
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AELNQKAQKIAED*AHLKQNKHHHADLEIFLEGEFNHLQQEKHKLLEARTQFDNRVSLLSARFKQKQAELVKQKQSLEQL
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FAEHVAGFKRQVHFKTTQMQRLSEFNKQQQSEQIKRETELKIAFADLKKDYQLFELQKNQEFQQIEQKHKELELLAQKQA
ELKQELEQKATALASQDQDTVQAKLDLARQQHELELRQNAFNQASLSLNKQREQLTNQVKVLHGELKKRHEKLTLKDRLL
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LKQKEGELQGILQKLSLKKTQIEQEFSKLYQQREKLDRQRTTLSKLHRELKAQNEATAHKNREVLEIENYYKKELQRLTT
EKSEFDNNKNRLFEYFRKIRNEIEKKEAHIKTVLEETQKKRHLVETEAVKLHLQKQSIISKGQELKEIKERVSRDISHTN
KQREELNSLLHQNKLLQKNLAEREREINNKDSLLTQKIQTAKQKLSEKEARILKLLEKMRAVEQQYQAEITRLKTRNADL
EKNDNKHLFPPLFKINGNDMNYPYPYP*FYPQQKQEDSSNQIRHLFEQQLQFMQQRYENELTELRRQRALLEKKLDQIQL
ESQLSAKKNDFEKVEQMMQKLLEKTEQKLSAFDQKINALAEQINTQKAEHADSEKQQLLLRIEQLEKQNLAQAVQTPQPV
QPVVQAPAVVPQVIQPQVVQSQPAFLATQQSISKQQQIAQLNAEINSIKKLIAQKAAK

Specific function: Component of the cytoskeleton-like structure which stabilizes the shape of the wall-less Mycoplasma. This cytoskeleton-like network of accessory proteins containing HMW proteins 1 to 5 allows the proper anchoring of cytadhesin proteins in the mycoplasmal

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016430 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 214808; Mature: 214808

Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
0.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
0.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNDTDKKFPLQPVYDTGFDDGYLQRDYEKCLESAAANDAQTVELQTQLLAEIKNLENEIK
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALKAQESRQPDPHNNARIQSLEASLNRLVNEYNNFEFQKNYMVDRVAELNNKARFFKDEL
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRLQQENAAFVNSRYANADFQSNYQLKLDQFQALIDQQNQTIKQLNEQIAANQGLIDQNV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
QRLQQNHSLDQQERDALLYEVDHLYNELYELENQKRLVGIEYEATYQDLVSADAELQNVY
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETIAQNQANFQKQCDAYAQLKQVEQQIQTTKQELVDEESTLKVRLNDADFYINSRLAELD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
DLTSKINERDFVSKEQAQDVKASLANLTKEKERLSAEKDSFERLRNTALNDINRMEQENA
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFAKHLEQQQYEFERKQQESLLKLETEHKQLQKRIGEFKIESEAKSEALLIQERELLEKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REIDDLLTQASLEYEQQRRTNQVLKEKHRQVQQHFQNLVHAKKKLDQKRHYLAEQKRIDE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EQIFKLKEKIATERRELEKLYLVKKQKQDQKENDLLIFEKQLRQYQADFENEIEEKQNEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHH
KLLEARTQFDNRVSLLSARFKQKQAELVKQKQSLEQLTAAFNKEQEAVERDWKDRLANLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQKEMLGDKVHQFDENSLNISKKLAERELAIKFKEKELEAAQKQLSLDNNNNAGLKLQLD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHH
KLSESLKTERLELEASKERILDFYDESSRRIADYESDLQARLAEVKTLEKNQQETAAKSE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RELKVALEKLNQAKKAFLQIRKQQLLEIASVKQQLAQKANLLKNQQAELDKQTEELEAAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEQDTDKKELEKALHSVKSKQELLERERSFLLQKQREFAEHVAGFKRQVHFKTTQMQRLS
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EFNKQQQSEQIKRETELKIAFADLKKDYQLFELQKNQEFQQIEQKHKELELLAQKQAELK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QELEQKATALASQDQDTVQAKLDLARQQHELELRQNAFNQASLSLNKQREQLTNQVKVLH
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GELKKRHEKLTLKDRLLAEKEKDQHKKDAEINQRFKQFENEYADFDQAKKRELQELNQIR
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RNLEQSNASLLKKRNQLTLDFALLRKVQHNTQTNRVQLNTQIKEFLLEKKNFQKASDEAA
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LQKALLIKRLRSFASKLQLQREALAIQKLEFDKRDEQQKSEINNAKLQLEQFKLEKQNFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EAKQKQLIEFKDQCQRLDVEKRLLKQKLVQLKNLSKSYLTYKNRADLSQQQLQHKYANLL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ELKEKLQTAKRALDKKHRAIYGKMAQFVSELRQEKKQLLSAQKQVDDKSRLLEQNQRHLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
NLSSETKKKRQSLEHDINKFDQRRKEAVSSILNSHKKLKQKEGELQGILQKLSLKKTQIE
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QEFSKLYQQREKLDRQRTTLSKLHRELKAQNEATAHKNREVLEIENYYKKELQRLTTEKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFDNNKNRLFEYFRKIRNEIEKKEAHIKTVLEETQKKRHLVETEAVKLHLQKQSIISKGQ
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
ELKEIKERVSRDISHTNKQREELNSLLHQNKLLQKNLAEREREINNKDSLLTQKIQTAKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
KLSEKEARILKLLEKMRAVEQQYQAEITRLKTRNADLEKNDNKHLFPPLFKINGNDMNYP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCC
YPYPFYPQQKQEDSSNQIRHLFEQQLQFMQQRYENELTELRRQRALLEKKLDQIQLESQL
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKKNDFEKVEQMMQKLLEKTEQKLSAFDQKINALAEQINTQKAEHADSEKQQLLLRIEQ
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LEKQNLAQAVQTPQPVQPVVQAPAVVPQVIQPQVVQSQPAFLATQQSISKQQQIAQLNAE
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
INSIKKLIAQKAAK
HHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALKAQESRQPDPHNNARIQSLEASLNRLVNEYNNFEFQKNYMVDRVAELNNKARFFKDEL
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRLQQENAAFVNSRYANADFQSNYQLKLDQFQALIDQQNQTIKQLNEQIAANQGLIDQNV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
QRLQQNHSLDQQERDALLYEVDHLYNELYELENQKRLVGIEYEATYQDLVSADAELQNVY
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETIAQNQANFQKQCDAYAQLKQVEQQIQTTKQELVDEESTLKVRLNDADFYINSRLAELD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHH
DLTSKINERDFVSKEQAQDVKASLANLTKEKERLSAEKDSFERLRNTALNDINRMEQENA
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFAKHLEQQQYEFERKQQESLLKLETEHKQLQKRIGEFKIESEAKSEALLIQERELLEKR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REIDDLLTQASLEYEQQRRTNQVLKEKHRQVQQHFQNLVHAKKKLDQKRHYLAEQKRIDE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EQIFKLKEKIATERRELEKLYLVKKQKQDQKENDLLIFEKQLRQYQADFENEIEEKQNEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FASQKSLQKSFTQLKNKEAELNQKAQKIAEDAHLKQNKHHHADLEIFLEGEFNHLQQEKH
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHH
KLLEARTQFDNRVSLLSARFKQKQAELVKQKQSLEQLTAAFNKEQEAVERDWKDRLANLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQKEMLGDKVHQFDENSLNISKKLAERELAIKFKEKELEAAQKQLSLDNNNNAGLKLQLD
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