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The map label for this gene is perM [H]

Identifier: 134302443

GI number: 134302443

Start: 1494222

End: 1495328

Strand: Direct

Name: perM [H]

Synonym: FTW_1591

Alternate gene names: 134302443

Gene position: 1494222-1495328 (Clockwise)

Preceding gene: 134302442

Following gene: 134302444

Centisome position: 78.71

GC content: 30.17

Gene sequence:

>1107_bases
ATGATTTTAAAAACTATAAAAGATTGGTACCAAAACAGATATCAAAATAATGAACCAATAGTATTTGTTGGTTTAATGTT
GTTTTTCTATCTAGTTTTAACTTTTTTAGGTGATTATATAGCTCCAATATTAGCTGCACTAGTCATTGCGTATTTACTAG
ATACTCTTGTAAATATTTTACAAAAATTCACCAAGCTTAAGCGTATAGTTTTAGTATATATTGTTTATATTTTATTTTTG
ATAGCACTTCTATCACTAATATTTGTACTATTACCTATTATCATTAATCAGCTTATTGATTTTGTAAAACAAGCTTCACA
TATATTATCAAGCTTAAAAACTAGTTTAGAGGAACTATCAATAAAGTATCCTACGATCCTTACAGAAGATCGAATTAATT
CTATCGTAAGCTGGTTTGATAGTATCGACTGGAAAAAAATTAGCTCAAACGTTGGTTCTTTTATTTTACAAAATACCGCT
ACAACATTACCAGTTTTATTTTCTGTACTAATTTACTTATTTCTAGTACCATTAATGGTTTTTTACTTTCTCAAAGACAA
AGAAAAAATGATTAATTGGTTTAAATCATTCTTACCAGAAGAAAATGGTGCTTTATATTATGTTTGGAATGATCTAAAGC
CAAAACTAGCTGACTATGTAAGAGGAAAAGCAATCGAGCTTATCATCGTTTCTACTCTTACTTATATTGGTTTTGCCTAC
TTTAATCTAAACTATGCGGTCCTTTTAGCTGTTGGAGTTGGCTTATCGGTAATAATTCCTTATGTTGGCATGGTGATTAT
TACTATTCCAGTTATAATGGTAGGAATTTTGCAGTTTGGCTTAAATGGTACTTTTGTATCAATGTTGATAGTGTTTTTTG
TAATTCAAGCACTTGATGGTAATCTGCTTGTACCTCTACTTTTCTCAGAGGTTCTAGATATGCATCCTGTAGGTGTTGTT
TCGGCAATTCTTATATTTGGGGGAATATGGGGGCTATGGGGAATATTCTTTGCAATACCACTAGGTCTACTATTTATCTC
CGGCGTAAATATGTTTAGAAATCATCTCAATGGTAAAAAAACTCAAGCTGATATAAATCTATGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTAATTATCTCTAAAAACTTTGACACTCTAAAAATATTCAAATATTGTGTAAAACTGTTACAATATCAACACTTTAAT
TAATAATTTTTTTATATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAAACAAAAAAAAATTGATAACAATATCTTTAGTACTCTACTAGCTAAAGGCTATGATTCTTTTACAGCAAAAATAATC
TCTGCTAGAGTACGTAAAAT

Product: PerM family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 368; Mature: 368

Protein sequence:

>368_residues
MILKTIKDWYQNRYQNNEPIVFVGLMLFFYLVLTFLGDYIAPILAALVIAYLLDTLVNILQKFTKLKRIVLVYIVYILFL
IALLSLIFVLLPIIINQLIDFVKQASHILSSLKTSLEELSIKYPTILTEDRINSIVSWFDSIDWKKISSNVGSFILQNTA
TTLPVLFSVLIYLFLVPLMVFYFLKDKEKMINWFKSFLPEENGALYYVWNDLKPKLADYVRGKAIELIIVSTLTYIGFAY
FNLNYAVLLAVGVGLSVIIPYVGMVIITIPVIMVGILQFGLNGTFVSMLIVFFVIQALDGNLLVPLLFSEVLDMHPVGVV
SAILIFGGIWGLWGIFFAIPLGLLFISGVNMFRNHLNGKKTQADINLC

Sequences:

>Translated_368_residues
MILKTIKDWYQNRYQNNEPIVFVGLMLFFYLVLTFLGDYIAPILAALVIAYLLDTLVNILQKFTKLKRIVLVYIVYILFL
IALLSLIFVLLPIIINQLIDFVKQASHILSSLKTSLEELSIKYPTILTEDRINSIVSWFDSIDWKKISSNVGSFILQNTA
TTLPVLFSVLIYLFLVPLMVFYFLKDKEKMINWFKSFLPEENGALYYVWNDLKPKLADYVRGKAIELIIVSTLTYIGFAY
FNLNYAVLLAVGVGLSVIIPYVGMVIITIPVIMVGILQFGLNGTFVSMLIVFFVIQALDGNLLVPLLFSEVLDMHPVGVV
SAILIFGGIWGLWGIFFAIPLGLLFISGVNMFRNHLNGKKTQADINLC
>Mature_368_residues
MILKTIKDWYQNRYQNNEPIVFVGLMLFFYLVLTFLGDYIAPILAALVIAYLLDTLVNILQKFTKLKRIVLVYIVYILFL
IALLSLIFVLLPIIINQLIDFVKQASHILSSLKTSLEELSIKYPTILTEDRINSIVSWFDSIDWKKISSNVGSFILQNTA
TTLPVLFSVLIYLFLVPLMVFYFLKDKEKMINWFKSFLPEENGALYYVWNDLKPKLADYVRGKAIELIIVSTLTYIGFAY
FNLNYAVLLAVGVGLSVIIPYVGMVIITIPVIMVGILQFGLNGTFVSMLIVFFVIQALDGNLLVPLLFSEVLDMHPVGVV
SAILIFGGIWGLWGIFFAIPLGLLFISGVNMFRNHLNGKKTQADINLC

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=347, Percent_Identity=38.6167146974063, Blast_Score=244, Evalue=8e-66,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41712; Mature: 41712

Theoretical pI: Translated: 8.72; Mature: 8.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MILKTIKDWYQNRYQNNEPIVFVGLMLFFYLVLTFLGDYIAPILAALVIAYLLDTLVNIL
CCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKFTKLKRIVLVYIVYILFLIALLSLIFVLLPIIINQLIDFVKQASHILSSLKTSLEELS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKYPTILTEDRINSIVSWFDSIDWKKISSNVGSFILQNTATTLPVLFSVLIYLFLVPLMV
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYFLKDKEKMINWFKSFLPEENGALYYVWNDLKPKLADYVRGKAIELIIVSTLTYIGFAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNLNYAVLLAVGVGLSVIIPYVGMVIITIPVIMVGILQFGLNGTFVSMLIVFFVIQALDG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NLLVPLLFSEVLDMHPVGVVSAILIFGGIWGLWGIFFAIPLGLLFISGVNMFRNHLNGKK
CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TQADINLC
CCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MILKTIKDWYQNRYQNNEPIVFVGLMLFFYLVLTFLGDYIAPILAALVIAYLLDTLVNIL
CCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKFTKLKRIVLVYIVYILFLIALLSLIFVLLPIIINQLIDFVKQASHILSSLKTSLEELS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKYPTILTEDRINSIVSWFDSIDWKKISSNVGSFILQNTATTLPVLFSVLIYLFLVPLMV
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYFLKDKEKMINWFKSFLPEENGALYYVWNDLKPKLADYVRGKAIELIIVSTLTYIGFAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNLNYAVLLAVGVGLSVIIPYVGMVIITIPVIMVGILQFGLNGTFVSMLIVFFVIQALDG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NLLVPLLFSEVLDMHPVGVVSAILIFGGIWGLWGIFFAIPLGLLFISGVNMFRNHLNGKK
CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
TQADINLC
CCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]